MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Sinorhizobium meliloti GR4 plasmid pRmeGR4c

Total Repeats: 25374

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_019848	TCA	2	6	247539	247544	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433615777
4502	NC_019848	CGGG	2	8	247566	247573	0 %	0 %	75 %	25 %	433615777
4503	NC_019848	TTTG	2	8	247784	247791	0 %	75 %	25 %	0 %	433615777
4504	NC_019848	GCG	2	6	247852	247857	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433615777
4505	NC_019848	AGC	2	6	247895	247900	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433615777
4506	NC_019848	AGC	2	6	247949	247954	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433615777
4507	NC_019848	ACG	2	6	248070	248075	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433615777
4508	NC_019848	CG	3	6	248085	248090	0 %	0 %	50 %	50 %	433615777
4509	NC_019848	AGCC	2	8	248104	248111	25 %	0 %	25 %	50 %	433615777
4510	NC_019848	GCA	2	6	248124	248129	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433615777
4511	NC_019848	TCG	2	6	248171	248176	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433615777
4512	NC_019848	CGTT	2	8	248208	248215	0 %	50 %	25 %	25 %	433615777
4513	NC_019848	TCT	2	6	248268	248273	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433615777
4514	NC_019848	CTTC	2	8	248307	248314	0 %	50 %	0 %	50 %	433615777
4515	NC_019848	GAG	2	6	248347	248352	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	433615777
4516	NC_019848	CG	3	6	248414	248419	0 %	0 %	50 %	50 %	433615777
4517	NC_019848	CGA	2	6	248427	248432	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433615777
4518	NC_019848	TGC	2	6	248436	248441	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433615777
4519	NC_019848	TCT	2	6	248447	248452	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433615777
4520	NC_019848	AGC	2	6	248483	248488	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433615777
4521	NC_019848	GCG	2	6	248502	248507	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433615777
4522	NC_019848	GC	3	6	248562	248567	0 %	0 %	50 %	50 %	433615777
4523	NC_019848	CTCGGC	2	12	248602	248613	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	433615777
4524	NC_019848	GTC	2	6	248721	248726	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433615778
4525	NC_019848	GTC	2	6	248877	248882	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433615778
4526	NC_019848	CCT	2	6	248891	248896	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	433615778
4527	NC_019848	GCA	2	6	248993	248998	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433615778
4528	NC_019848	TCA	2	6	249061	249066	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433615778
4529	NC_019848	CTC	2	6	249102	249107	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	433615778
4530	NC_019848	GCG	3	9	249117	249125	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433615778
4531	NC_019848	GC	3	6	249128	249133	0 %	0 %	50 %	50 %	433615778
4532	NC_019848	GAG	2	6	249138	249143	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	433615778
4533	NC_019848	CCA	2	6	249299	249304	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433615778
4534	NC_019848	TCG	2	6	249352	249357	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433615778
4535	NC_019848	GCGTGC	2	12	249390	249401	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	433615778
4536	NC_019848	TGC	2	6	249443	249448	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433615778
4537	NC_019848	CGA	2	6	249476	249481	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433615778
4538	NC_019848	TGG	2	6	249502	249507	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433615778
4539	NC_019848	TCA	2	6	249566	249571	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433615778
4540	NC_019848	GGC	2	6	249595	249600	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433615778
4541	NC_019848	AGC	2	6	249651	249656	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433615778
4542	NC_019848	TCA	2	6	249661	249666	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433615778
4543	NC_019848	G	6	6	249690	249695	0 %	0 %	100 %	0 %	433615778
4544	NC_019848	GCTT	2	8	249731	249738	0 %	50 %	25 %	25 %	433615778
4545	NC_019848	GAT	2	6	249754	249759	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433615778
4546	NC_019848	TCGA	2	8	249820	249827	25 %	25 %	25 %	25 %	433615778
4547	NC_019848	CGT	2	6	249867	249872	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433615778
4548	NC_019848	CGA	2	6	249944	249949	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433615778
4549	NC_019848	TGG	2	6	249957	249962	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433615778
4550	NC_019848	CG	3	6	249998	250003	0 %	0 %	50 %	50 %	433615778
4551	NC_019848	TCG	2	6	250007	250012	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433615778
4552	NC_019848	GGC	2	6	250056	250061	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433615778
4553	NC_019848	GC	3	6	250201	250206	0 %	0 %	50 %	50 %	433615778
4554	NC_019848	CGAT	2	8	250222	250229	25 %	25 %	25 %	25 %	433615778
4555	NC_019848	GGT	2	6	250233	250238	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433615778
4556	NC_019848	GC	3	6	250374	250379	0 %	0 %	50 %	50 %	433615778
4557	NC_019848	GCT	2	6	250389	250394	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433615778
4558	NC_019848	CAGC	2	8	250395	250402	25 %	0 %	25 %	50 %	433615778
4559	NC_019848	GGA	2	6	250424	250429	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	433615778
4560	NC_019848	GGTG	2	8	250505	250512	0 %	25 %	75 %	0 %	433615778
4561	NC_019848	GCCGA	2	10	250528	250537	20 %	0 %	40 %	40 %	433615778
4562	NC_019848	GTC	2	6	250554	250559	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433615778
4563	NC_019848	TCG	2	6	250585	250590	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433615778
4564	NC_019848	AGACC	2	10	250599	250608	40 %	0 %	20 %	40 %	433615778
4565	NC_019848	GGC	2	6	250632	250637	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433615778
4566	NC_019848	AGC	3	9	250657	250665	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433615778
4567	NC_019848	GAC	2	6	250711	250716	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433615778
4568	NC_019848	GGAAA	2	10	250734	250743	60 %	0 %	40 %	0 %	433615778
4569	NC_019848	TCGCCT	2	12	250744	250755	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	433615778
4570	NC_019848	TCG	2	6	250780	250785	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433615778
4571	NC_019848	TCG	2	6	250789	250794	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433615778
4572	NC_019848	CGC	2	6	250866	250871	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433615778
4573	NC_019848	CG	3	6	250922	250927	0 %	0 %	50 %	50 %	433615778
4574	NC_019848	AGG	2	6	251718	251723	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	433615779
4575	NC_019848	GGA	2	6	251801	251806	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	433615779
4576	NC_019848	GGC	2	6	252131	252136	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433615779
4577	NC_019848	GGA	2	6	252162	252167	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	433615779
4578	NC_019848	TCG	2	6	252175	252180	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433615779
4579	NC_019848	GCA	2	6	252211	252216	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433615779
4580	NC_019848	TG	3	6	252295	252300	0 %	50 %	50 %	0 %	433615779
4581	NC_019848	ATC	2	6	252361	252366	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433615779
4582	NC_019848	GAC	2	6	252630	252635	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433615780
4583	NC_019848	AGC	2	6	252773	252778	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433615780
4584	NC_019848	GAC	2	6	252818	252823	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433615780
4585	NC_019848	ACG	2	6	252991	252996	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433615781
4586	NC_019848	CCCT	2	8	253047	253054	0 %	25 %	0 %	75 %	433615781
4587	NC_019848	GCG	2	6	253588	253593	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433615782
4588	NC_019848	T	7	7	253637	253643	0 %	100 %	0 %	0 %	433615782
4589	NC_019848	CAT	2	6	253682	253687	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433615782
4590	NC_019848	CGA	2	6	253718	253723	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433615782
4591	NC_019848	AGC	2	6	253822	253827	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433615782
4592	NC_019848	CGT	2	6	253878	253883	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433615782
4593	NC_019848	AGA	2	6	254119	254124	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	433615783
4594	NC_019848	TGGTT	2	10	254162	254171	0 %	60 %	40 %	0 %	433615783
4595	NC_019848	CTG	2	6	254263	254268	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433615783
4596	NC_019848	TCG	2	6	254330	254335	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433615783
4597	NC_019848	TCG	2	6	254345	254350	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433615783
4598	NC_019848	TGC	2	6	254388	254393	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433615783
4599	NC_019848	TCG	2	6	254441	254446	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433615783
4600	NC_019848	TC	3	6	254451	254456	0 %	50 %	0 %	50 %	433615783
4601	NC_019848	CGG	2	6	254499	254504	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433615783
4602	NC_019848	ACT	2	6	254505	254510	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433615783
4603	NC_019848	GCA	2	6	254518	254523	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433615783
4604	NC_019848	ACG	2	6	254557	254562	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433615783
4605	NC_019848	GGC	2	6	254601	254606	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433615783
4606	NC_019848	GTT	2	6	254652	254657	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433615783
4607	NC_019848	GCCA	2	8	254779	254786	25 %	0 %	25 %	50 %	433615783
4608	NC_019848	TTG	2	6	254804	254809	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433615783
4609	NC_019848	ACG	2	6	254819	254824	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433615783
4610	NC_019848	ACG	2	6	254878	254883	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433615783
4611	NC_019848	GCG	2	6	254906	254911	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433615783
4612	NC_019848	CGC	2	6	254934	254939	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433615783
4613	NC_019848	TGC	2	6	254973	254978	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433615783
4614	NC_019848	TGT	2	6	255042	255047	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433615783
4615	NC_019848	CGT	2	6	255054	255059	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433615783
4616	NC_019848	GAA	2	6	255066	255071	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	433615783
4617	NC_019848	TTC	2	6	255073	255078	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433615783
4618	NC_019848	ATG	2	6	255080	255085	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433615783
4619	NC_019848	GTCGC	2	10	255106	255115	0 %	20 %	40 %	40 %	433615783
4620	NC_019848	CCGG	2	8	255137	255144	0 %	0 %	50 %	50 %	433615783
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4742	NC_019848	GCG	2	6	262430	262435	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433615790
4743	NC_019848	CGC	2	6	262451	262456	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433615790
4744	NC_019848	GCTG	2	8	262480	262487	0 %	25 %	50 %	25 %	433615790
4745	NC_019848	CG	3	6	262502	262507	0 %	0 %	50 %	50 %	433615790
4746	NC_019848	GAC	2	6	262535	262540	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433615790
4747	NC_019848	TCG	2	6	262548	262553	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433615790
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4749	NC_019848	GGC	2	6	262617	262622	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433615790
4750	NC_019848	TGA	2	6	262628	262633	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433615790
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4773	NC_019848	TCG	2	6	264085	264090	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433615793
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4842	NC_019848	CTG	2	6	271025	271030	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433615801
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4849	NC_019848	CGGA	2	8	272338	272345	25 %	0 %	50 %	25 %	433615802
4850	NC_019848	GACCT	2	10	272428	272437	20 %	20 %	20 %	40 %	433615802
4851	NC_019848	CTG	2	6	272455	272460	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433615802
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4854	NC_019848	CGT	2	6	272521	272526	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433615802
4855	NC_019848	TGT	2	6	272532	272537	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433615802
4856	NC_019848	TGG	2	6	272589	272594	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433615802
4857	NC_019848	GGCC	2	8	272628	272635	0 %	0 %	50 %	50 %	433615802
4858	NC_019848	GGA	2	6	272638	272643	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	433615802
4859	NC_019848	GCG	2	6	272693	272698	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433615802
4860	NC_019848	TGACGT	2	12	272718	272729	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	433615802
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4983	NC_019848	TCG	2	6	279460	279465	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433615811
4984	NC_019848	TCA	2	6	280200	280205	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433615812
4985	NC_019848	CT	3	6	280282	280287	0 %	50 %	0 %	50 %	433615812
4986	NC_019848	ACGCC	2	10	280307	280316	20 %	0 %	20 %	60 %	433615812
4987	NC_019848	GAC	2	6	280350	280355	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433615812
4988	NC_019848	GAAAC	2	10	280372	280381	60 %	0 %	20 %	20 %	433615812
4989	NC_019848	CTTC	2	8	280427	280434	0 %	50 %	0 %	50 %	433615812
4990	NC_019848	GGA	2	6	280480	280485	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	433615812
4991	NC_019848	CCT	2	6	280538	280543	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	433615812
4992	NC_019848	CTG	2	6	280556	280561	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433615812
4993	NC_019848	ATAC	2	8	280569	280576	50 %	25 %	0 %	25 %	433615812
4994	NC_019848	CGTT	2	8	280769	280776	0 %	50 %	25 %	25 %	433615813
4995	NC_019848	CTT	2	6	280811	280816	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433615813
4996	NC_019848	ATG	2	6	280818	280823	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433615813
4997	NC_019848	GCAA	2	8	280830	280837	50 %	0 %	25 %	25 %	433615813
4998	NC_019848	CCG	2	6	280923	280928	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433615813
4999	NC_019848	CGA	2	6	280930	280935	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433615813
5000	NC_019848	GAA	2	6	280942	280947	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	433615813

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