MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Sinorhizobium meliloti GR4 plasmid pRmeGR4b

Total Repeats: 291

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019847	TG	3	6	812	817	0 %	50 %	50 %	0 %	433615301
2	NC_019847	CA	3	6	1294	1299	50 %	0 %	0 %	50 %	433615302
3	NC_019847	CT	3	6	1717	1722	0 %	50 %	0 %	50 %	433615302
4	NC_019847	CA	3	6	2146	2151	50 %	0 %	0 %	50 %	433615302
5	NC_019847	GC	4	8	2840	2847	0 %	0 %	50 %	50 %	433615303
6	NC_019847	CG	3	6	3685	3690	0 %	0 %	50 %	50 %	433615304
7	NC_019847	CT	3	6	3705	3710	0 %	50 %	0 %	50 %	433615304
8	NC_019847	CT	3	6	4970	4975	0 %	50 %	0 %	50 %	433615306
9	NC_019847	CG	3	6	5437	5442	0 %	0 %	50 %	50 %	433615307
10	NC_019847	GC	3	6	5645	5650	0 %	0 %	50 %	50 %	433615307
11	NC_019847	GC	3	6	5795	5800	0 %	0 %	50 %	50 %	433615307
12	NC_019847	GC	3	6	5846	5851	0 %	0 %	50 %	50 %	433615307
13	NC_019847	CG	3	6	5977	5982	0 %	0 %	50 %	50 %	433615307
14	NC_019847	GC	3	6	6730	6735	0 %	0 %	50 %	50 %	433615308
15	NC_019847	CG	3	6	7848	7853	0 %	0 %	50 %	50 %	433615308
16	NC_019847	GA	3	6	10084	10089	50 %	0 %	50 %	0 %	433615310
17	NC_019847	AT	3	6	13284	13289	50 %	50 %	0 %	0 %	433615311
18	NC_019847	TC	3	6	13522	13527	0 %	50 %	0 %	50 %	433615311
19	NC_019847	CG	3	6	13591	13596	0 %	0 %	50 %	50 %	433615311
20	NC_019847	AC	3	6	13903	13908	50 %	0 %	0 %	50 %	433615311
21	NC_019847	GC	3	6	14545	14550	0 %	0 %	50 %	50 %	433615311
22	NC_019847	GC	4	8	15109	15116	0 %	0 %	50 %	50 %	433615311
23	NC_019847	CG	3	6	15139	15144	0 %	0 %	50 %	50 %	433615311
24	NC_019847	TG	3	6	16530	16535	0 %	50 %	50 %	0 %	433615312
25	NC_019847	AG	3	6	17279	17284	50 %	0 %	50 %	0 %	433615312
26	NC_019847	CT	3	6	18292	18297	0 %	50 %	0 %	50 %	433615313
27	NC_019847	CG	3	6	18322	18327	0 %	0 %	50 %	50 %	433615313
28	NC_019847	CG	3	6	18522	18527	0 %	0 %	50 %	50 %	433615313
29	NC_019847	TG	3	6	18846	18851	0 %	50 %	50 %	0 %	433615313
30	NC_019847	CG	3	6	19999	20004	0 %	0 %	50 %	50 %	433615315
31	NC_019847	GC	3	6	21891	21896	0 %	0 %	50 %	50 %	433615316
32	NC_019847	GC	3	6	21989	21994	0 %	0 %	50 %	50 %	433615316
33	NC_019847	GC	3	6	22012	22017	0 %	0 %	50 %	50 %	433615316
34	NC_019847	AG	3	6	22363	22368	50 %	0 %	50 %	0 %	433615316
35	NC_019847	CG	3	6	22863	22868	0 %	0 %	50 %	50 %	433615317
36	NC_019847	GC	3	6	22965	22970	0 %	0 %	50 %	50 %	433615317
37	NC_019847	CG	3	6	23071	23076	0 %	0 %	50 %	50 %	433615317
38	NC_019847	CG	3	6	23117	23122	0 %	0 %	50 %	50 %	433615317
39	NC_019847	GC	3	6	23133	23138	0 %	0 %	50 %	50 %	433615317
40	NC_019847	TA	3	6	23921	23926	50 %	50 %	0 %	0 %	433615318
41	NC_019847	CG	3	6	24391	24396	0 %	0 %	50 %	50 %	433615319
42	NC_019847	GA	3	6	26352	26357	50 %	0 %	50 %	0 %	433615320
43	NC_019847	AG	3	6	26415	26420	50 %	0 %	50 %	0 %	433615320
44	NC_019847	GC	3	6	28832	28837	0 %	0 %	50 %	50 %	433615323
45	NC_019847	AG	3	6	31739	31744	50 %	0 %	50 %	0 %	433615327
46	NC_019847	GC	3	6	31856	31861	0 %	0 %	50 %	50 %	433615327
47	NC_019847	CG	3	6	32075	32080	0 %	0 %	50 %	50 %	433615328
48	NC_019847	GC	3	6	33050	33055	0 %	0 %	50 %	50 %	433615329
49	NC_019847	GC	3	6	33643	33648	0 %	0 %	50 %	50 %	433615329
50	NC_019847	GC	3	6	33700	33705	0 %	0 %	50 %	50 %	433615330
51	NC_019847	GC	3	6	33932	33937	0 %	0 %	50 %	50 %	433615330
52	NC_019847	GC	3	6	33997	34002	0 %	0 %	50 %	50 %	433615330
53	NC_019847	GC	3	6	35616	35621	0 %	0 %	50 %	50 %	433615332
54	NC_019847	CG	3	6	35857	35862	0 %	0 %	50 %	50 %	433615333
55	NC_019847	GC	3	6	35866	35871	0 %	0 %	50 %	50 %	433615333
56	NC_019847	GC	3	6	38191	38196	0 %	0 %	50 %	50 %	433615337
57	NC_019847	TC	3	6	38926	38931	0 %	50 %	0 %	50 %	433615338
58	NC_019847	GC	3	6	38936	38941	0 %	0 %	50 %	50 %	433615338
59	NC_019847	GC	4	8	40783	40790	0 %	0 %	50 %	50 %	433615340
60	NC_019847	GC	3	6	41943	41948	0 %	0 %	50 %	50 %	433615341
61	NC_019847	GA	3	6	42002	42007	50 %	0 %	50 %	0 %	433615341
62	NC_019847	GA	5	10	42069	42078	50 %	0 %	50 %	0 %	433615341
63	NC_019847	CG	3	6	42803	42808	0 %	0 %	50 %	50 %	433615341
64	NC_019847	CT	3	6	43009	43014	0 %	50 %	0 %	50 %	433615341
65	NC_019847	AG	3	6	43259	43264	50 %	0 %	50 %	0 %	433615341
66	NC_019847	CT	3	6	43356	43361	0 %	50 %	0 %	50 %	433615341
67	NC_019847	GC	3	6	43848	43853	0 %	0 %	50 %	50 %	433615341
68	NC_019847	GA	3	6	44184	44189	50 %	0 %	50 %	0 %	433615342
69	NC_019847	GC	3	6	44621	44626	0 %	0 %	50 %	50 %	433615342
70	NC_019847	CG	3	6	44923	44928	0 %	0 %	50 %	50 %	433615343
71	NC_019847	GC	3	6	45587	45592	0 %	0 %	50 %	50 %	433615343
72	NC_019847	GC	3	6	45845	45850	0 %	0 %	50 %	50 %	433615343
73	NC_019847	GC	3	6	45918	45923	0 %	0 %	50 %	50 %	433615343
74	NC_019847	GC	3	6	46416	46421	0 %	0 %	50 %	50 %	433615344
75	NC_019847	GC	3	6	47003	47008	0 %	0 %	50 %	50 %	433615345
76	NC_019847	GA	3	6	48128	48133	50 %	0 %	50 %	0 %	433615347
77	NC_019847	GA	3	6	49046	49051	50 %	0 %	50 %	0 %	433615348
78	NC_019847	GC	3	6	49494	49499	0 %	0 %	50 %	50 %	433615348
79	NC_019847	TC	3	6	49533	49538	0 %	50 %	0 %	50 %	433615348
80	NC_019847	CG	3	6	49600	49605	0 %	0 %	50 %	50 %	433615348
81	NC_019847	CG	3	6	49691	49696	0 %	0 %	50 %	50 %	433615348
82	NC_019847	GC	3	6	49770	49775	0 %	0 %	50 %	50 %	433615348
83	NC_019847	GC	3	6	51209	51214	0 %	0 %	50 %	50 %	433615349
84	NC_019847	GC	3	6	51278	51283	0 %	0 %	50 %	50 %	433615349
85	NC_019847	AT	3	6	51957	51962	50 %	50 %	0 %	0 %	433615349
86	NC_019847	GC	3	6	52326	52331	0 %	0 %	50 %	50 %	433615350
87	NC_019847	AG	3	6	54859	54864	50 %	0 %	50 %	0 %	433615352
88	NC_019847	CG	3	6	55046	55051	0 %	0 %	50 %	50 %	433615353
89	NC_019847	GA	3	6	57737	57742	50 %	0 %	50 %	0 %	433615357
90	NC_019847	TC	3	6	58019	58024	0 %	50 %	0 %	50 %	433615357
91	NC_019847	GC	3	6	59928	59933	0 %	0 %	50 %	50 %	433615360
92	NC_019847	GC	3	6	61397	61402	0 %	0 %	50 %	50 %	433615362
93	NC_019847	GA	3	6	61438	61443	50 %	0 %	50 %	0 %	433615362
94	NC_019847	AG	3	6	61501	61506	50 %	0 %	50 %	0 %	433615362
95	NC_019847	GC	3	6	61592	61597	0 %	0 %	50 %	50 %	433615362
96	NC_019847	CG	3	6	62232	62237	0 %	0 %	50 %	50 %	433615363
97	NC_019847	GC	3	6	64200	64205	0 %	0 %	50 %	50 %	433615364
98	NC_019847	GC	3	6	64458	64463	0 %	0 %	50 %	50 %	433615364
99	NC_019847	GC	3	6	64531	64536	0 %	0 %	50 %	50 %	433615364
100	NC_019847	TC	3	6	66779	66784	0 %	50 %	0 %	50 %	433615366
101	NC_019847	GC	3	6	66801	66806	0 %	0 %	50 %	50 %	433615366
102	NC_019847	CG	4	8	66977	66984	0 %	0 %	50 %	50 %	433615366
103	NC_019847	GC	3	6	67341	67346	0 %	0 %	50 %	50 %	433615366
104	NC_019847	CG	3	6	67768	67773	0 %	0 %	50 %	50 %	433615366
105	NC_019847	GC	3	6	68779	68784	0 %	0 %	50 %	50 %	433615367
106	NC_019847	GA	3	6	69533	69538	50 %	0 %	50 %	0 %	433615368
107	NC_019847	CG	3	6	71403	71408	0 %	0 %	50 %	50 %	433615369
108	NC_019847	GA	3	6	71710	71715	50 %	0 %	50 %	0 %	433615369
109	NC_019847	TC	3	6	71789	71794	0 %	50 %	0 %	50 %	433615369
110	NC_019847	CG	4	8	77842	77849	0 %	0 %	50 %	50 %	433615372
111	NC_019847	GC	3	6	82077	82082	0 %	0 %	50 %	50 %	433615380
112	NC_019847	CG	3	6	82163	82168	0 %	0 %	50 %	50 %	433615380
113	NC_019847	GA	3	6	82720	82725	50 %	0 %	50 %	0 %	433615382
114	NC_019847	GC	3	6	82787	82792	0 %	0 %	50 %	50 %	433615382
115	NC_019847	GC	3	6	85076	85081	0 %	0 %	50 %	50 %	433615385
116	NC_019847	GA	3	6	85906	85911	50 %	0 %	50 %	0 %	433615388
117	NC_019847	CG	3	6	86058	86063	0 %	0 %	50 %	50 %	433615388
118	NC_019847	CA	3	6	87747	87752	50 %	0 %	0 %	50 %	433615391
119	NC_019847	TG	3	6	89319	89324	0 %	50 %	50 %	0 %	433615395
120	NC_019847	GA	3	6	89769	89774	50 %	0 %	50 %	0 %	433615395
121	NC_019847	AG	3	6	90327	90332	50 %	0 %	50 %	0 %	433615396
122	NC_019847	GC	3	6	90338	90343	0 %	0 %	50 %	50 %	433615396
123	NC_019847	GC	3	6	90351	90356	0 %	0 %	50 %	50 %	433615396
124	NC_019847	GA	3	6	90962	90967	50 %	0 %	50 %	0 %	433615397
125	NC_019847	GC	3	6	92099	92104	0 %	0 %	50 %	50 %	433615398
126	NC_019847	TC	3	6	93633	93638	0 %	50 %	0 %	50 %	433615400
127	NC_019847	CG	3	6	93759	93764	0 %	0 %	50 %	50 %	433615400
128	NC_019847	AC	3	6	95068	95073	50 %	0 %	0 %	50 %	433615402
129	NC_019847	GC	3	6	95145	95150	0 %	0 %	50 %	50 %	433615402
130	NC_019847	CT	3	6	95733	95738	0 %	50 %	0 %	50 %	433615403
131	NC_019847	GC	3	6	96823	96828	0 %	0 %	50 %	50 %	433615405
132	NC_019847	GC	3	6	98295	98300	0 %	0 %	50 %	50 %	433615406
133	NC_019847	CT	3	6	98431	98436	0 %	50 %	0 %	50 %	433615406
134	NC_019847	CT	3	6	98913	98918	0 %	50 %	0 %	50 %	433615406
135	NC_019847	GC	3	6	99002	99007	0 %	0 %	50 %	50 %	433615406
136	NC_019847	GC	4	8	99503	99510	0 %	0 %	50 %	50 %	433615407
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139	NC_019847	AG	3	6	103609	103614	50 %	0 %	50 %	0 %	433615412
140	NC_019847	GC	3	6	104370	104375	0 %	0 %	50 %	50 %	433615414
141	NC_019847	GC	3	6	104541	104546	0 %	0 %	50 %	50 %	433615414
142	NC_019847	CG	5	10	105018	105027	0 %	0 %	50 %	50 %	433615415
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291	NC_019847	GC	3	6	225247	225252	0 %	0 %	50 %	50 %	433615546

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.