MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Stanieria cyanosphaera PCC 7437 plasmid pSTA7437.05

Total Repeats: 67

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019766	ACT	2	6	267	272	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434408557
2	NC_019766	ATT	2	6	430	435	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434408557
3	NC_019766	ACA	2	6	440	445	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	434408557
4	NC_019766	TAA	2	6	448	453	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434408557
5	NC_019766	AGA	2	6	470	475	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	434408557
6	NC_019766	GAA	2	6	671	676	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	434408557
7	NC_019766	AGA	2	6	712	717	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	434408557
8	NC_019766	TTA	2	6	761	766	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434408557
9	NC_019766	ATT	2	6	816	821	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434408557
10	NC_019766	AAT	2	6	862	867	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434408557
11	NC_019766	TAA	2	6	880	885	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434408557
12	NC_019766	CAC	2	6	897	902	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	434408557
13	NC_019766	TAA	2	6	922	927	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434408557
14	NC_019766	TAC	2	6	970	975	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434408557
15	NC_019766	TGG	2	6	1000	1005	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	434408557
16	NC_019766	TAC	2	6	1150	1155	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434408557
17	NC_019766	TAA	2	6	1156	1161	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434408557
18	NC_019766	ATA	2	6	1194	1199	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434408557
19	NC_019766	ATT	2	6	1248	1253	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434408557
20	NC_019766	CAA	2	6	1265	1270	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	434408557
21	NC_019766	ATT	2	6	1272	1277	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434408557
22	NC_019766	ACC	2	6	1291	1296	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	434408557
23	NC_019766	TGG	2	6	1349	1354	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	434408557
24	NC_019766	TGA	2	6	1360	1365	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434408557
25	NC_019766	ACA	2	6	1373	1378	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	434408557
26	NC_019766	TAA	2	6	1491	1496	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434408557
27	NC_019766	GAA	2	6	1538	1543	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	434408557
28	NC_019766	TAC	2	6	1579	1584	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434408557
29	NC_019766	GAA	2	6	1631	1636	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	434408557
30	NC_019766	TTA	2	6	1688	1693	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434408557
31	NC_019766	GTA	2	6	1802	1807	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434408557
32	NC_019766	TAA	2	6	1810	1815	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434408557
33	NC_019766	TGG	2	6	1888	1893	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	434408557
34	NC_019766	TGA	2	6	1984	1989	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434408557
35	NC_019766	TTA	2	6	1990	1995	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434408557
36	NC_019766	AAG	2	6	2121	2126	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	434408557
37	NC_019766	ACA	2	6	2139	2144	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	434408557
38	NC_019766	GTT	2	6	2274	2279	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	434408557
39	NC_019766	AAC	2	6	2397	2402	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	434408557
40	NC_019766	GTA	2	6	2460	2465	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434408557
41	NC_019766	ATT	2	6	2572	2577	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434408557
42	NC_019766	CAA	2	6	2618	2623	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	434408557
43	NC_019766	TTA	2	6	2654	2659	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434408557
44	NC_019766	ATG	2	6	2700	2705	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434408557
45	NC_019766	CAA	2	6	2720	2725	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	434408557
46	NC_019766	AGA	2	6	2731	2736	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	434408557
47	NC_019766	GAA	2	6	2741	2746	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	434408557
48	NC_019766	AAG	2	6	2856	2861	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	434408557
49	NC_019766	CTT	2	6	3149	3154	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	434408558
50	NC_019766	AGG	2	6	3197	3202	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	434408558
51	NC_019766	CTT	2	6	3479	3484	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	434408558
52	NC_019766	CTT	2	6	3488	3493	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	434408558
53	NC_019766	ATA	2	6	3530	3535	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434408558
54	NC_019766	GTT	2	6	3625	3630	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	434408558
55	NC_019766	AAC	2	6	3673	3678	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	434408558
56	NC_019766	CGA	2	6	3687	3692	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	434408558
57	NC_019766	ACC	2	6	3743	3748	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	434408558
58	NC_019766	TCT	2	6	3793	3798	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	434408558
59	NC_019766	TCT	2	6	3892	3897	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	434408558
60	NC_019766	AGT	2	6	4004	4009	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434408558
61	NC_019766	CTG	2	6	4118	4123	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	434408558
62	NC_019766	TTA	2	6	4125	4130	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434408558
63	NC_019766	ATG	2	6	4422	4427	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434408559
64	NC_019766	TAA	2	6	4484	4489	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434408559
65	NC_019766	GAA	2	6	4593	4598	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	434408559
66	NC_019766	CAC	2	6	4627	4632	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	434408559
67	NC_019766	GAA	2	6	4668	4673	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	434408559

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.