MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Stanieria cyanosphaera PCC 7437 plasmid pSTA7437.01

Total Repeats: 294

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019765	AG	3	6	528	533	50 %	0 %	50 %	0 %	434408265
2	NC_019765	AT	3	6	787	792	50 %	50 %	0 %	0 %	434408265
3	NC_019765	CT	3	6	826	831	0 %	50 %	0 %	50 %	434408265
4	NC_019765	TG	3	6	940	945	0 %	50 %	50 %	0 %	434408265
5	NC_019765	GT	3	6	1016	1021	0 %	50 %	50 %	0 %	434408265
6	NC_019765	TC	3	6	1732	1737	0 %	50 %	0 %	50 %	434408266
7	NC_019765	TC	3	6	1763	1768	0 %	50 %	0 %	50 %	434408266
8	NC_019765	GA	3	6	4510	4515	50 %	0 %	50 %	0 %	434408269
9	NC_019765	CT	3	6	8472	8477	0 %	50 %	0 %	50 %	434408271
10	NC_019765	CT	3	6	13126	13131	0 %	50 %	0 %	50 %	434408275
11	NC_019765	TA	3	6	15066	15071	50 %	50 %	0 %	0 %	434408277
12	NC_019765	CT	3	6	15276	15281	0 %	50 %	0 %	50 %	434408277
13	NC_019765	TC	3	6	15311	15316	0 %	50 %	0 %	50 %	434408277
14	NC_019765	AG	3	6	16290	16295	50 %	0 %	50 %	0 %	434408279
15	NC_019765	AT	3	6	16459	16464	50 %	50 %	0 %	0 %	434408279
16	NC_019765	AG	3	6	18701	18706	50 %	0 %	50 %	0 %	434408281
17	NC_019765	CT	3	6	22137	22142	0 %	50 %	0 %	50 %	434408284
18	NC_019765	GA	3	6	22894	22899	50 %	0 %	50 %	0 %	434408285
19	NC_019765	TA	3	6	23420	23425	50 %	50 %	0 %	0 %	434408285
20	NC_019765	TC	3	6	23833	23838	0 %	50 %	0 %	50 %	434408286
21	NC_019765	GA	3	6	27882	27887	50 %	0 %	50 %	0 %	434408289
22	NC_019765	AG	3	6	31026	31031	50 %	0 %	50 %	0 %	434408290
23	NC_019765	TC	3	6	31105	31110	0 %	50 %	0 %	50 %	434408290
24	NC_019765	AG	3	6	31137	31142	50 %	0 %	50 %	0 %	434408290
25	NC_019765	AT	3	6	35675	35680	50 %	50 %	0 %	0 %	434408291
26	NC_019765	GA	3	6	36249	36254	50 %	0 %	50 %	0 %	434408292
27	NC_019765	GA	3	6	36563	36568	50 %	0 %	50 %	0 %	434408292
28	NC_019765	GA	3	6	39238	39243	50 %	0 %	50 %	0 %	434408296
29	NC_019765	TA	3	6	40447	40452	50 %	50 %	0 %	0 %	434408297
30	NC_019765	TA	3	6	41503	41508	50 %	50 %	0 %	0 %	434408297
31	NC_019765	AT	3	6	41979	41984	50 %	50 %	0 %	0 %	434408297
32	NC_019765	AT	3	6	43507	43512	50 %	50 %	0 %	0 %	434408297
33	NC_019765	AT	3	6	43622	43627	50 %	50 %	0 %	0 %	434408298
34	NC_019765	AT	3	6	43660	43665	50 %	50 %	0 %	0 %	434408298
35	NC_019765	TA	3	6	45023	45028	50 %	50 %	0 %	0 %	434408299
36	NC_019765	AT	3	6	46199	46204	50 %	50 %	0 %	0 %	434408299
37	NC_019765	CA	3	6	46305	46310	50 %	0 %	0 %	50 %	434408300
38	NC_019765	AG	3	6	46356	46361	50 %	0 %	50 %	0 %	434408300
39	NC_019765	AT	3	6	47082	47087	50 %	50 %	0 %	0 %	434408301
40	NC_019765	TA	3	6	47114	47119	50 %	50 %	0 %	0 %	434408301
41	NC_019765	TC	3	6	49586	49591	0 %	50 %	0 %	50 %	434408303
42	NC_019765	TC	4	8	49821	49828	0 %	50 %	0 %	50 %	434408303
43	NC_019765	CT	3	6	51007	51012	0 %	50 %	0 %	50 %	434408303
44	NC_019765	TC	3	6	51209	51214	0 %	50 %	0 %	50 %	434408303
45	NC_019765	AT	3	6	52633	52638	50 %	50 %	0 %	0 %	434408305
46	NC_019765	TC	3	6	54141	54146	0 %	50 %	0 %	50 %	434408306
47	NC_019765	GA	3	6	54806	54811	50 %	0 %	50 %	0 %	434408307
48	NC_019765	CT	3	6	55805	55810	0 %	50 %	0 %	50 %	434408307
49	NC_019765	GA	3	6	57546	57551	50 %	0 %	50 %	0 %	434408309
50	NC_019765	AG	3	6	58648	58653	50 %	0 %	50 %	0 %	434408309
51	NC_019765	GA	3	6	64784	64789	50 %	0 %	50 %	0 %	434408313
52	NC_019765	AT	3	6	65080	65085	50 %	50 %	0 %	0 %	434408313
53	NC_019765	CT	3	6	67375	67380	0 %	50 %	0 %	50 %	434408316
54	NC_019765	TC	3	6	67782	67787	0 %	50 %	0 %	50 %	434408317
55	NC_019765	AT	3	6	70043	70048	50 %	50 %	0 %	0 %	434408318
56	NC_019765	CT	3	6	70186	70191	0 %	50 %	0 %	50 %	434408318
57	NC_019765	AG	3	6	71064	71069	50 %	0 %	50 %	0 %	434408319
58	NC_019765	AT	3	6	71912	71917	50 %	50 %	0 %	0 %	434408319
59	NC_019765	AG	4	8	72530	72537	50 %	0 %	50 %	0 %	434408320
60	NC_019765	TA	3	6	72629	72634	50 %	50 %	0 %	0 %	434408320
61	NC_019765	AT	3	6	75676	75681	50 %	50 %	0 %	0 %	434408323
62	NC_019765	TA	3	6	75978	75983	50 %	50 %	0 %	0 %	434408323
63	NC_019765	TA	3	6	76521	76526	50 %	50 %	0 %	0 %	434408323
64	NC_019765	AT	3	6	76569	76574	50 %	50 %	0 %	0 %	434408323
65	NC_019765	AT	3	6	76576	76581	50 %	50 %	0 %	0 %	434408323
66	NC_019765	AT	3	6	76614	76619	50 %	50 %	0 %	0 %	434408323
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68	NC_019765	TC	3	6	80702	80707	0 %	50 %	0 %	50 %	434408329
69	NC_019765	AG	3	6	81136	81141	50 %	0 %	50 %	0 %	434408329
70	NC_019765	CT	3	6	82010	82015	0 %	50 %	0 %	50 %	434408329
71	NC_019765	AG	3	6	82279	82284	50 %	0 %	50 %	0 %	434408330
72	NC_019765	AG	3	6	83717	83722	50 %	0 %	50 %	0 %	434408332
73	NC_019765	TC	3	6	83772	83777	0 %	50 %	0 %	50 %	434408332
74	NC_019765	TC	3	6	83902	83907	0 %	50 %	0 %	50 %	434408332
75	NC_019765	TC	3	6	84288	84293	0 %	50 %	0 %	50 %	434408332
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79	NC_019765	TC	3	6	93172	93177	0 %	50 %	0 %	50 %	434408341
80	NC_019765	TC	3	6	94501	94506	0 %	50 %	0 %	50 %	434408343
81	NC_019765	AG	3	6	94824	94829	50 %	0 %	50 %	0 %	434408343
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83	NC_019765	GA	3	6	95870	95875	50 %	0 %	50 %	0 %	434408345
84	NC_019765	AG	3	6	95895	95900	50 %	0 %	50 %	0 %	434408345
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90	NC_019765	AT	3	6	107678	107683	50 %	50 %	0 %	0 %	434408355
91	NC_019765	AG	3	6	110379	110384	50 %	0 %	50 %	0 %	434408358
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94	NC_019765	CT	3	6	114577	114582	0 %	50 %	0 %	50 %	434408363
95	NC_019765	GA	3	6	115065	115070	50 %	0 %	50 %	0 %	434408363
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101	NC_019765	AT	3	6	118790	118795	50 %	50 %	0 %	0 %	434408365
102	NC_019765	TA	5	10	118884	118893	50 %	50 %	0 %	0 %	434408365
103	NC_019765	TA	3	6	120044	120049	50 %	50 %	0 %	0 %	434408366
104	NC_019765	AT	3	6	120152	120157	50 %	50 %	0 %	0 %	434408366
105	NC_019765	AT	3	6	121063	121068	50 %	50 %	0 %	0 %	434408367
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108	NC_019765	AG	3	6	122980	122985	50 %	0 %	50 %	0 %	434408369
109	NC_019765	CT	3	6	124065	124070	0 %	50 %	0 %	50 %	434408371
110	NC_019765	TC	3	6	124795	124800	0 %	50 %	0 %	50 %	434408372
111	NC_019765	TA	3	6	125483	125488	50 %	50 %	0 %	0 %	434408373
112	NC_019765	CT	3	6	127263	127268	0 %	50 %	0 %	50 %	434408377
113	NC_019765	AT	3	6	128366	128371	50 %	50 %	0 %	0 %	434408377
114	NC_019765	AG	3	6	128994	128999	50 %	0 %	50 %	0 %	434408378
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118	NC_019765	AG	4	8	133353	133360	50 %	0 %	50 %	0 %	434408382
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121	NC_019765	GC	3	6	134491	134496	0 %	0 %	50 %	50 %	434408383
122	NC_019765	AG	3	6	138012	138017	50 %	0 %	50 %	0 %	434408386
123	NC_019765	GA	3	6	138350	138355	50 %	0 %	50 %	0 %	434408386
124	NC_019765	TC	4	8	138740	138747	0 %	50 %	0 %	50 %	434408386
125	NC_019765	AG	3	6	138874	138879	50 %	0 %	50 %	0 %	434408386
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133	NC_019765	GA	3	6	142602	142607	50 %	0 %	50 %	0 %	434408391
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140	NC_019765	TA	3	6	148241	148246	50 %	50 %	0 %	0 %	434408398
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.