MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Stanieria cyanosphaera PCC 7437 plasmid pSTA7437.01

Total Repeats: 177

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019765	GATAG	2	10	1867	1876	40 %	20 %	40 %	0 %	434408266
2	NC_019765	AGATT	2	10	1885	1894	40 %	40 %	20 %	0 %	434408266
3	NC_019765	AGAAA	2	10	2158	2167	80 %	0 %	20 %	0 %	434408266
4	NC_019765	ACTAA	2	10	3742	3751	60 %	20 %	0 %	20 %	434408268
5	NC_019765	GATGA	2	10	4688	4697	40 %	20 %	40 %	0 %	434408269
6	NC_019765	GAACG	2	10	5294	5303	40 %	0 %	40 %	20 %	434408269
7	NC_019765	ACCTA	2	10	6784	6793	40 %	20 %	0 %	40 %	434408271
8	NC_019765	TGGGG	2	10	7112	7121	0 %	20 %	80 %	0 %	434408271
9	NC_019765	GGGAT	2	10	7270	7279	20 %	20 %	60 %	0 %	434408271
10	NC_019765	AATTC	2	10	9505	9514	40 %	40 %	0 %	20 %	434408271
11	NC_019765	GATTG	2	10	10526	10535	20 %	40 %	40 %	0 %	434408272
12	NC_019765	AGTTT	2	10	13434	13443	20 %	60 %	20 %	0 %	434408275
13	NC_019765	TTAAA	2	10	15851	15860	60 %	40 %	0 %	0 %	434408278
14	NC_019765	ATTCG	2	10	16920	16929	20 %	40 %	20 %	20 %	434408280
15	NC_019765	AGAAA	2	10	18258	18267	80 %	0 %	20 %	0 %	434408281
16	NC_019765	GAAAA	2	10	21471	21480	80 %	0 %	20 %	0 %	434408283
17	NC_019765	TGCTT	2	10	21967	21976	0 %	60 %	20 %	20 %	434408284
18	NC_019765	AGTGA	2	10	22489	22498	40 %	20 %	40 %	0 %	434408285
19	NC_019765	TAAAT	2	10	25800	25809	60 %	40 %	0 %	0 %	434408287
20	NC_019765	AAGTT	2	10	30110	30119	40 %	40 %	20 %	0 %	434408290
21	NC_019765	CATCT	2	10	36711	36720	20 %	40 %	0 %	40 %	434408292
22	NC_019765	GTATT	2	10	37966	37975	20 %	60 %	20 %	0 %	434408294
23	NC_019765	TGTAA	2	10	39022	39031	40 %	40 %	20 %	0 %	434408296
24	NC_019765	AATAG	2	10	39583	39592	60 %	20 %	20 %	0 %	434408296
25	NC_019765	GTTGT	2	10	41858	41867	0 %	60 %	40 %	0 %	434408297
26	NC_019765	TCAAA	2	10	43429	43438	60 %	20 %	0 %	20 %	434408297
27	NC_019765	TTTAA	2	10	46209	46218	40 %	60 %	0 %	0 %	434408299
28	NC_019765	AGATT	2	10	47842	47851	40 %	40 %	20 %	0 %	434408302
29	NC_019765	TGGCA	2	10	50414	50423	20 %	20 %	40 %	20 %	434408303
30	NC_019765	AGGAA	2	10	50612	50621	60 %	0 %	40 %	0 %	434408303
31	NC_019765	AAACT	2	10	53777	53786	60 %	20 %	0 %	20 %	434408306
32	NC_019765	CAAAT	2	10	54193	54202	60 %	20 %	0 %	20 %	434408306
33	NC_019765	GATTA	2	10	55905	55914	40 %	40 %	20 %	0 %	434408307
34	NC_019765	CCCAA	2	10	56236	56245	40 %	0 %	0 %	60 %	434408308
35	NC_019765	GACGG	2	10	56564	56573	20 %	0 %	60 %	20 %	434408308
36	NC_019765	CTCAA	2	10	61031	61040	40 %	20 %	0 %	40 %	434408311
37	NC_019765	CTGGT	2	10	64869	64878	0 %	40 %	40 %	20 %	434408313
38	NC_019765	TTTAC	2	10	66476	66485	20 %	60 %	0 %	20 %	434408314
39	NC_019765	GCAGA	2	10	67298	67307	40 %	0 %	40 %	20 %	434408316
40	NC_019765	TCTCG	2	10	67426	67435	0 %	40 %	20 %	40 %	434408316
41	NC_019765	AAATT	2	10	68008	68017	60 %	40 %	0 %	0 %	434408317
42	NC_019765	AACTA	2	10	69085	69094	60 %	20 %	0 %	20 %	434408318
43	NC_019765	CTAAA	2	10	70095	70104	60 %	20 %	0 %	20 %	434408318
44	NC_019765	AAAAG	2	10	71241	71250	80 %	0 %	20 %	0 %	434408319
45	NC_019765	AAAAT	2	10	71897	71906	80 %	20 %	0 %	0 %	434408319
46	NC_019765	CATCT	2	10	73486	73495	20 %	40 %	0 %	40 %	434408321
47	NC_019765	GTATC	2	10	73898	73907	20 %	40 %	20 %	20 %	434408321
48	NC_019765	TAACT	2	10	74555	74564	40 %	40 %	0 %	20 %	434408322
49	NC_019765	TTCCA	2	10	75166	75175	20 %	40 %	0 %	40 %	434408323
50	NC_019765	ATGTT	2	10	75701	75710	20 %	60 %	20 %	0 %	434408323
51	NC_019765	TAAAT	2	10	76907	76916	60 %	40 %	0 %	0 %	434408324
52	NC_019765	TTTTC	2	10	78457	78466	0 %	80 %	0 %	20 %	434408325
53	NC_019765	ATTCA	2	10	79204	79213	40 %	40 %	0 %	20 %	434408326
54	NC_019765	TTTTA	2	10	81148	81157	20 %	80 %	0 %	0 %	434408329
55	NC_019765	TCAAC	2	10	85704	85713	40 %	20 %	0 %	40 %	434408334
56	NC_019765	CTTCT	2	10	89476	89485	0 %	60 %	0 %	40 %	434408337
57	NC_019765	GTTAG	2	10	90807	90816	20 %	40 %	40 %	0 %	434408338
58	NC_019765	TCGGT	2	10	96922	96931	0 %	40 %	40 %	20 %	434408345
59	NC_019765	AACTC	2	10	97521	97530	40 %	20 %	0 %	40 %	434408346
60	NC_019765	CCAAT	2	10	97531	97540	40 %	20 %	0 %	40 %	434408346
61	NC_019765	TAAAA	2	10	98347	98356	80 %	20 %	0 %	0 %	434408347
62	NC_019765	TAAAG	2	10	98508	98517	60 %	20 %	20 %	0 %	434408347
63	NC_019765	TTTTA	2	10	99378	99387	20 %	80 %	0 %	0 %	434408348
64	NC_019765	TTTAA	2	10	101200	101209	40 %	60 %	0 %	0 %	434408349
65	NC_019765	TCATC	2	10	101337	101346	20 %	40 %	0 %	40 %	434408350
66	NC_019765	AAGCA	2	10	107000	107009	60 %	0 %	20 %	20 %	434408355
67	NC_019765	TTTAG	2	10	107635	107644	20 %	60 %	20 %	0 %	434408355
68	NC_019765	GACAA	2	10	108350	108359	60 %	0 %	20 %	20 %	434408355
69	NC_019765	AGGCA	2	10	108877	108886	40 %	0 %	40 %	20 %	434408355
70	NC_019765	AGTTA	2	10	117948	117957	40 %	40 %	20 %	0 %	434408365
71	NC_019765	TTTAC	2	10	118651	118660	20 %	60 %	0 %	20 %	434408365
72	NC_019765	TTATT	2	10	119365	119374	20 %	80 %	0 %	0 %	434408366
73	NC_019765	TTTGT	2	10	119970	119979	0 %	80 %	20 %	0 %	434408366
74	NC_019765	AGCAA	2	10	122809	122818	60 %	0 %	20 %	20 %	434408369
75	NC_019765	AGTTA	2	10	128453	128462	40 %	40 %	20 %	0 %	434408377
76	NC_019765	AAATA	2	10	128567	128576	80 %	20 %	0 %	0 %	434408377
77	NC_019765	ATTGA	2	10	128586	128595	40 %	40 %	20 %	0 %	434408377
78	NC_019765	TTTGT	2	10	130301	130310	0 %	80 %	20 %	0 %	434408379
79	NC_019765	AGTTT	2	10	131146	131155	20 %	60 %	20 %	0 %	434408380
80	NC_019765	TATTT	2	10	132915	132924	20 %	80 %	0 %	0 %	434408382
81	NC_019765	CCCCG	2	10	134112	134121	0 %	0 %	20 %	80 %	434408383
82	NC_019765	CCCAA	2	10	136077	136086	40 %	0 %	0 %	60 %	434408384
83	NC_019765	CACTC	2	10	136256	136265	20 %	20 %	0 %	60 %	434408384
84	NC_019765	GAATG	2	10	136458	136467	40 %	20 %	40 %	0 %	434408385
85	NC_019765	AATCC	2	10	140412	140421	40 %	20 %	0 %	40 %	434408389
86	NC_019765	TTGCT	2	10	140776	140785	0 %	60 %	20 %	20 %	434408389
87	NC_019765	AATTC	2	10	141350	141359	40 %	40 %	0 %	20 %	434408390
88	NC_019765	TACTT	2	10	146430	146439	20 %	60 %	0 %	20 %	434408395
89	NC_019765	ATCTC	2	10	148504	148513	20 %	40 %	0 %	40 %	434408398
90	NC_019765	AATTC	2	10	148734	148743	40 %	40 %	0 %	20 %	434408398
91	NC_019765	GATTT	2	10	148795	148804	20 %	60 %	20 %	0 %	434408398
92	NC_019765	AGTTA	2	10	148884	148893	40 %	40 %	20 %	0 %	434408398
93	NC_019765	ACCCG	2	10	149173	149182	20 %	0 %	20 %	60 %	434408399
94	NC_019765	CCAAT	2	10	151198	151207	40 %	20 %	0 %	40 %	434408403
95	NC_019765	TTTAA	2	10	151861	151870	40 %	60 %	0 %	0 %	434408404
96	NC_019765	CTTCT	2	10	151937	151946	0 %	60 %	0 %	40 %	434408405
97	NC_019765	ATGCC	2	10	152584	152593	20 %	20 %	20 %	40 %	434408405
98	NC_019765	TAGTT	2	10	155235	155244	20 %	60 %	20 %	0 %	434408409
99	NC_019765	TAATT	2	10	156896	156905	40 %	60 %	0 %	0 %	434408411
100	NC_019765	TGTGG	2	10	156932	156941	0 %	40 %	60 %	0 %	434408411
101	NC_019765	CCATT	2	10	156976	156985	20 %	40 %	0 %	40 %	434408411
102	NC_019765	TGTCC	2	10	157726	157735	0 %	40 %	20 %	40 %	434408413
103	NC_019765	GGTAA	2	10	158245	158254	40 %	20 %	40 %	0 %	434408413
104	NC_019765	AAGTT	2	10	160901	160910	40 %	40 %	20 %	0 %	434408413
105	NC_019765	AGTTT	2	10	161758	161767	20 %	60 %	20 %	0 %	434408414
106	NC_019765	TAGAT	2	10	162180	162189	40 %	40 %	20 %	0 %	434408414
107	NC_019765	CGACC	2	10	162902	162911	20 %	0 %	20 %	60 %	434408414
108	NC_019765	TAATT	2	10	165453	165462	40 %	60 %	0 %	0 %	434408417
109	NC_019765	TTTTA	2	10	167827	167836	20 %	80 %	0 %	0 %	434408418
110	NC_019765	CCAAA	2	10	170129	170138	60 %	0 %	0 %	40 %	434408420
111	NC_019765	GTTGG	2	10	170504	170513	0 %	40 %	60 %	0 %	434408420
112	NC_019765	CTCAA	2	10	172244	172253	40 %	20 %	0 %	40 %	434408421
113	NC_019765	CAAAA	2	10	176145	176154	80 %	0 %	0 %	20 %	434408426
114	NC_019765	GAAAA	2	10	176856	176865	80 %	0 %	20 %	0 %	434408426
115	NC_019765	CTATG	2	10	178434	178443	20 %	40 %	20 %	20 %	434408428
116	NC_019765	TCCTC	2	10	180109	180118	0 %	40 %	0 %	60 %	434408429
117	NC_019765	CAATT	2	10	180513	180522	40 %	40 %	0 %	20 %	434408430
118	NC_019765	TTACT	2	10	181151	181160	20 %	60 %	0 %	20 %	434408430
119	NC_019765	AATTG	2	10	183217	183226	40 %	40 %	20 %	0 %	434408434
120	NC_019765	AACGA	2	10	190258	190267	60 %	0 %	20 %	20 %	434408441
121	NC_019765	TTTAA	2	10	196334	196343	40 %	60 %	0 %	0 %	434408448
122	NC_019765	ATTTT	2	10	197478	197487	20 %	80 %	0 %	0 %	434408450
123	NC_019765	GAACT	2	10	201805	201814	40 %	20 %	20 %	20 %	434408452
124	NC_019765	AAGGT	2	10	202081	202090	40 %	20 %	40 %	0 %	434408452
125	NC_019765	GGTTC	2	10	205160	205169	0 %	40 %	40 %	20 %	434408455
126	NC_019765	CGCTG	2	10	209921	209930	0 %	20 %	40 %	40 %	434408456
127	NC_019765	AAACC	2	10	216288	216297	60 %	0 %	0 %	40 %	434408464
128	NC_019765	CAAGC	2	10	220729	220738	40 %	0 %	20 %	40 %	434408468
129	NC_019765	AATTA	2	10	226747	226756	60 %	40 %	0 %	0 %	434408470
130	NC_019765	TTTAC	2	10	228830	228839	20 %	60 %	0 %	20 %	434408470
131	NC_019765	TGGAT	2	10	229009	229018	20 %	40 %	40 %	0 %	434408470
132	NC_019765	CGTTA	2	10	230253	230262	20 %	40 %	20 %	20 %	434408470
133	NC_019765	TTTAG	2	10	230648	230657	20 %	60 %	20 %	0 %	434408470
134	NC_019765	GGTTG	2	10	230975	230984	0 %	40 %	60 %	0 %	434408470
135	NC_019765	AACCC	2	10	233458	233467	40 %	0 %	0 %	60 %	434408470
136	NC_019765	ATTTA	2	10	237127	237136	40 %	60 %	0 %	0 %	434408470
137	NC_019765	AAACC	2	10	237962	237971	60 %	0 %	0 %	40 %	434408470
138	NC_019765	CTCGT	2	10	240894	240903	0 %	40 %	20 %	40 %	434408471
139	NC_019765	GGTTG	2	10	241969	241978	0 %	40 %	60 %	0 %	434408473
140	NC_019765	AAAAT	2	10	242896	242905	80 %	20 %	0 %	0 %	434408473
141	NC_019765	TTAAA	2	10	243070	243079	60 %	40 %	0 %	0 %	434408473
142	NC_019765	TAATT	2	10	243299	243308	40 %	60 %	0 %	0 %	434408473
143	NC_019765	TTAAT	2	10	247691	247700	40 %	60 %	0 %	0 %	434408477
144	NC_019765	CCTCG	2	10	248370	248379	0 %	20 %	20 %	60 %	434408477
145	NC_019765	TTAAA	2	10	248975	248984	60 %	40 %	0 %	0 %	434408477
146	NC_019765	GCTTG	2	10	250478	250487	0 %	40 %	40 %	20 %	434408477
147	NC_019765	GCATA	2	10	255439	255448	40 %	20 %	20 %	20 %	434408487
148	NC_019765	GATTA	2	10	255986	255995	40 %	40 %	20 %	0 %	434408488
149	NC_019765	TGATT	2	10	256053	256062	20 %	60 %	20 %	0 %	434408488
150	NC_019765	ATTCG	2	10	256396	256405	20 %	40 %	20 %	20 %	434408488
151	NC_019765	ACTTA	2	10	262585	262594	40 %	40 %	0 %	20 %	434408496
152	NC_019765	TACAT	2	10	263749	263758	40 %	40 %	0 %	20 %	434408497
153	NC_019765	TAATT	2	10	266212	266221	40 %	60 %	0 %	0 %	434408500
154	NC_019765	TGTGG	2	10	266248	266257	0 %	40 %	60 %	0 %	434408500
155	NC_019765	CCATT	2	10	266292	266301	20 %	40 %	0 %	40 %	434408500
156	NC_019765	TTGGT	2	10	270399	270408	0 %	60 %	40 %	0 %	434408502
157	NC_019765	ACTCG	2	10	272326	272335	20 %	20 %	20 %	40 %	434408503
158	NC_019765	AGCAA	2	10	273279	273288	60 %	0 %	20 %	20 %	434408505
159	NC_019765	AAAAG	2	10	273811	273820	80 %	0 %	20 %	0 %	434408506
160	NC_019765	AGTCC	2	10	275909	275918	20 %	20 %	20 %	40 %	434408507
161	NC_019765	ATGCC	2	10	276344	276353	20 %	20 %	20 %	40 %	434408507
162	NC_019765	TTCCT	2	10	283716	283725	0 %	60 %	0 %	40 %	434408515
163	NC_019765	TCAAA	2	10	287253	287262	60 %	20 %	0 %	20 %	434408517
164	NC_019765	TTATT	2	10	289795	289804	20 %	80 %	0 %	0 %	434408521
165	NC_019765	TTTAC	2	10	289854	289863	20 %	60 %	0 %	20 %	434408521
166	NC_019765	TTGCC	2	10	290106	290115	0 %	40 %	20 %	40 %	434408521
167	NC_019765	TACTT	2	10	297820	297829	20 %	60 %	0 %	20 %	434408530
168	NC_019765	ATTCC	2	10	297867	297876	20 %	40 %	0 %	40 %	434408530
169	NC_019765	GAAAT	2	10	300735	300744	60 %	20 %	20 %	0 %	434408532
170	NC_019765	GCCCT	2	10	301842	301851	0 %	20 %	20 %	60 %	434408533
171	NC_019765	AAAAT	2	10	302488	302497	80 %	20 %	0 %	0 %	434408533
172	NC_019765	TTAAG	2	10	304860	304869	40 %	40 %	20 %	0 %	434408535
173	NC_019765	AGTTA	2	10	305434	305443	40 %	40 %	20 %	0 %	434408536
174	NC_019765	CTTTG	2	10	306763	306772	0 %	60 %	20 %	20 %	434408538
175	NC_019765	TAAGA	2	10	307828	307837	60 %	20 %	20 %	0 %	434408539
176	NC_019765	TAACC	2	10	308513	308522	40 %	20 %	0 %	40 %	434408540
177	NC_019765	ACTTA	2	10	308732	308741	40 %	40 %	0 %	20 %	434408540

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.