MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Stanieria cyanosphaera PCC 7437 plasmid pSTA7437.02

Total Repeats: 118

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019749	CT	3	6	157	162	0 %	50 %	0 %	50 %	434401064
2	NC_019749	CT	3	6	898	903	0 %	50 %	0 %	50 %	434401065
3	NC_019749	TC	3	6	1131	1136	0 %	50 %	0 %	50 %	434401065
4	NC_019749	CT	3	6	1391	1396	0 %	50 %	0 %	50 %	434401065
5	NC_019749	TG	3	6	1965	1970	0 %	50 %	50 %	0 %	434401066
6	NC_019749	TA	3	6	2954	2959	50 %	50 %	0 %	0 %	434401068
7	NC_019749	GA	3	6	2994	2999	50 %	0 %	50 %	0 %	434401068
8	NC_019749	AG	3	6	3050	3055	50 %	0 %	50 %	0 %	434401068
9	NC_019749	AT	3	6	4475	4480	50 %	50 %	0 %	0 %	434401070
10	NC_019749	TA	4	8	4907	4914	50 %	50 %	0 %	0 %	434401070
11	NC_019749	TC	3	6	6066	6071	0 %	50 %	0 %	50 %	434401071
12	NC_019749	TC	3	6	6132	6137	0 %	50 %	0 %	50 %	434401071
13	NC_019749	CG	3	6	10201	10206	0 %	0 %	50 %	50 %	434401075
14	NC_019749	TG	3	6	10477	10482	0 %	50 %	50 %	0 %	434401075
15	NC_019749	TC	3	6	11992	11997	0 %	50 %	0 %	50 %	434401077
16	NC_019749	TC	4	8	12851	12858	0 %	50 %	0 %	50 %	434401078
17	NC_019749	TC	3	6	14021	14026	0 %	50 %	0 %	50 %	434401079
18	NC_019749	GA	3	6	14441	14446	50 %	0 %	50 %	0 %	434401079
19	NC_019749	GA	3	6	16616	16621	50 %	0 %	50 %	0 %	434401081
20	NC_019749	CT	3	6	16649	16654	0 %	50 %	0 %	50 %	434401081
21	NC_019749	TC	3	6	17975	17980	0 %	50 %	0 %	50 %	434401082
22	NC_019749	GA	3	6	18127	18132	50 %	0 %	50 %	0 %	434401082
23	NC_019749	AG	3	6	18397	18402	50 %	0 %	50 %	0 %	434401082
24	NC_019749	TA	3	6	20067	20072	50 %	50 %	0 %	0 %	434401083
25	NC_019749	CT	3	6	20234	20239	0 %	50 %	0 %	50 %	434401083
26	NC_019749	AT	3	6	20636	20641	50 %	50 %	0 %	0 %	434401083
27	NC_019749	TA	3	6	20688	20693	50 %	50 %	0 %	0 %	434401083
28	NC_019749	TC	3	6	20697	20702	0 %	50 %	0 %	50 %	434401083
29	NC_019749	CT	3	6	21376	21381	0 %	50 %	0 %	50 %	434401083
30	NC_019749	CA	4	8	22696	22703	50 %	0 %	0 %	50 %	434401084
31	NC_019749	AC	3	6	22853	22858	50 %	0 %	0 %	50 %	434401084
32	NC_019749	AT	3	6	25217	25222	50 %	50 %	0 %	0 %	434401087
33	NC_019749	TA	3	6	29222	29227	50 %	50 %	0 %	0 %	434401091
34	NC_019749	GA	3	6	30734	30739	50 %	0 %	50 %	0 %	434401091
35	NC_019749	AT	3	6	32664	32669	50 %	50 %	0 %	0 %	434401091
36	NC_019749	AG	3	6	35302	35307	50 %	0 %	50 %	0 %	434401095
37	NC_019749	AT	3	6	36325	36330	50 %	50 %	0 %	0 %	434401097
38	NC_019749	AT	3	6	37195	37200	50 %	50 %	0 %	0 %	434401099
39	NC_019749	AT	3	6	37484	37489	50 %	50 %	0 %	0 %	434401099
40	NC_019749	GA	3	6	38265	38270	50 %	0 %	50 %	0 %	434401099
41	NC_019749	TA	3	6	38488	38493	50 %	50 %	0 %	0 %	434401099
42	NC_019749	TA	3	6	39694	39699	50 %	50 %	0 %	0 %	434401099
43	NC_019749	AC	3	6	41090	41095	50 %	0 %	0 %	50 %	434401099
44	NC_019749	CA	3	6	41907	41912	50 %	0 %	0 %	50 %	434401099
45	NC_019749	CA	3	6	42140	42145	50 %	0 %	0 %	50 %	434401099
46	NC_019749	CT	3	6	42381	42386	0 %	50 %	0 %	50 %	434401100
47	NC_019749	TA	3	6	44059	44064	50 %	50 %	0 %	0 %	434401101
48	NC_019749	TC	3	6	44322	44327	0 %	50 %	0 %	50 %	434401101
49	NC_019749	AG	3	6	46271	46276	50 %	0 %	50 %	0 %	434401105
50	NC_019749	GA	3	6	46657	46662	50 %	0 %	50 %	0 %	434401105
51	NC_019749	CT	3	6	47921	47926	0 %	50 %	0 %	50 %	434401106
52	NC_019749	TC	3	6	48475	48480	0 %	50 %	0 %	50 %	434401107
53	NC_019749	AC	3	6	49346	49351	50 %	0 %	0 %	50 %	434401109
54	NC_019749	TA	3	6	49771	49776	50 %	50 %	0 %	0 %	434401110
55	NC_019749	TC	3	6	52494	52499	0 %	50 %	0 %	50 %	434401114
56	NC_019749	TA	3	6	52844	52849	50 %	50 %	0 %	0 %	434401114
57	NC_019749	TC	3	6	55977	55982	0 %	50 %	0 %	50 %	434401115
58	NC_019749	GA	3	6	56397	56402	50 %	0 %	50 %	0 %	434401115
59	NC_019749	TA	4	8	57802	57809	50 %	50 %	0 %	0 %	434401116
60	NC_019749	AT	3	6	58314	58319	50 %	50 %	0 %	0 %	434401116
61	NC_019749	AT	3	6	60452	60457	50 %	50 %	0 %	0 %	434401117
62	NC_019749	TC	3	6	60621	60626	0 %	50 %	0 %	50 %	434401117
63	NC_019749	TC	3	6	62574	62579	0 %	50 %	0 %	50 %	434401120
64	NC_019749	AT	3	6	62741	62746	50 %	50 %	0 %	0 %	434401120
65	NC_019749	TA	3	6	63050	63055	50 %	50 %	0 %	0 %	434401120
66	NC_019749	AT	3	6	63160	63165	50 %	50 %	0 %	0 %	434401121
67	NC_019749	CT	3	6	63220	63225	0 %	50 %	0 %	50 %	434401121
68	NC_019749	AT	3	6	63534	63539	50 %	50 %	0 %	0 %	434401121
69	NC_019749	TC	3	6	63938	63943	0 %	50 %	0 %	50 %	434401121
70	NC_019749	AT	3	6	66999	67004	50 %	50 %	0 %	0 %	434401123
71	NC_019749	AT	3	6	67155	67160	50 %	50 %	0 %	0 %	434401123
72	NC_019749	AC	3	6	68541	68546	50 %	0 %	0 %	50 %	434401124
73	NC_019749	CG	3	6	68645	68650	0 %	0 %	50 %	50 %	434401124
74	NC_019749	GC	3	6	69601	69606	0 %	0 %	50 %	50 %	434401125
75	NC_019749	CT	3	6	70072	70077	0 %	50 %	0 %	50 %	434401125
76	NC_019749	AG	3	6	74228	74233	50 %	0 %	50 %	0 %	434401129
77	NC_019749	TG	3	6	75222	75227	0 %	50 %	50 %	0 %	434401130
78	NC_019749	GT	3	6	75641	75646	0 %	50 %	50 %	0 %	434401130
79	NC_019749	GA	3	6	76061	76066	50 %	0 %	50 %	0 %	434401131
80	NC_019749	GT	3	6	76510	76515	0 %	50 %	50 %	0 %	434401132
81	NC_019749	GA	3	6	76585	76590	50 %	0 %	50 %	0 %	434401132
82	NC_019749	CA	3	6	76846	76851	50 %	0 %	0 %	50 %	434401133
83	NC_019749	GA	3	6	78285	78290	50 %	0 %	50 %	0 %	434401134
84	NC_019749	AG	3	6	78724	78729	50 %	0 %	50 %	0 %	434401135
85	NC_019749	GA	3	6	78975	78980	50 %	0 %	50 %	0 %	434401135
86	NC_019749	GA	3	6	81049	81054	50 %	0 %	50 %	0 %	434401136
87	NC_019749	AT	3	6	81379	81384	50 %	50 %	0 %	0 %	434401136
88	NC_019749	AT	3	6	81806	81811	50 %	50 %	0 %	0 %	434401136
89	NC_019749	TA	4	8	84983	84990	50 %	50 %	0 %	0 %	434401137
90	NC_019749	AT	3	6	86295	86300	50 %	50 %	0 %	0 %	434401140
91	NC_019749	AG	3	6	87303	87308	50 %	0 %	50 %	0 %	434401141
92	NC_019749	AG	4	8	87844	87851	50 %	0 %	50 %	0 %	434401142
93	NC_019749	AG	3	6	88157	88162	50 %	0 %	50 %	0 %	434401142
94	NC_019749	AT	3	6	88168	88173	50 %	50 %	0 %	0 %	434401142
95	NC_019749	TC	3	6	88505	88510	0 %	50 %	0 %	50 %	434401142
96	NC_019749	GA	5	10	88826	88835	50 %	0 %	50 %	0 %	434401142
97	NC_019749	AT	3	6	89649	89654	50 %	50 %	0 %	0 %	434401142
98	NC_019749	TA	3	6	90593	90598	50 %	50 %	0 %	0 %	434401143
99	NC_019749	AT	3	6	91029	91034	50 %	50 %	0 %	0 %	434401144
100	NC_019749	CT	3	6	91077	91082	0 %	50 %	0 %	50 %	434401144
101	NC_019749	CT	3	6	93632	93637	0 %	50 %	0 %	50 %	434401147
102	NC_019749	AG	3	6	94062	94067	50 %	0 %	50 %	0 %	434401147
103	NC_019749	AT	4	8	94190	94197	50 %	50 %	0 %	0 %	434401147
104	NC_019749	AG	3	6	94311	94316	50 %	0 %	50 %	0 %	434401147
105	NC_019749	TA	3	6	95278	95283	50 %	50 %	0 %	0 %	434401148
106	NC_019749	AT	3	6	98254	98259	50 %	50 %	0 %	0 %	434401149
107	NC_019749	TA	4	8	99838	99845	50 %	50 %	0 %	0 %	434401150
108	NC_019749	AT	3	6	100327	100332	50 %	50 %	0 %	0 %	434401150
109	NC_019749	TA	3	6	101426	101431	50 %	50 %	0 %	0 %	434401151
110	NC_019749	AT	3	6	101764	101769	50 %	50 %	0 %	0 %	434401151
111	NC_019749	AG	3	6	101878	101883	50 %	0 %	50 %	0 %	434401151
112	NC_019749	AT	3	6	102366	102371	50 %	50 %	0 %	0 %	434401151
113	NC_019749	AG	3	6	104618	104623	50 %	0 %	50 %	0 %	434401154
114	NC_019749	AT	3	6	106644	106649	50 %	50 %	0 %	0 %	434401157
115	NC_019749	TA	3	6	107360	107365	50 %	50 %	0 %	0 %	434401157
116	NC_019749	CT	3	6	107415	107420	0 %	50 %	0 %	50 %	434401157
117	NC_019749	AC	3	6	107442	107447	50 %	0 %	0 %	50 %	434401157
118	NC_019749	TC	4	8	107537	107544	0 %	50 %	0 %	50 %	434401157

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.