MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Synechococcus sp. PCC 7502 chromosome

Total Repeats: 50837

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_019702	G	6	6	228234	228239	0 %	0 %	100 %	0 %	428220362
3502	NC_019702	T	6	6	228361	228366	0 %	100 %	0 %	0 %	428220362
3503	NC_019702	TAG	2	6	228682	228687	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428220362
3504	NC_019702	AAT	2	6	228706	228711	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428220362
3505	NC_019702	CTAA	2	8	228748	228755	50 %	25 %	0 %	25 %	428220362
3506	NC_019702	TGAT	2	8	228918	228925	25 %	50 %	25 %	0 %	428220363
3507	NC_019702	AGT	2	6	228932	228937	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428220363
3508	NC_019702	CAC	2	6	228954	228959	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428220363
3509	NC_019702	TGT	2	6	229020	229025	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428220363
3510	NC_019702	AT	3	6	229058	229063	50 %	50 %	0 %	0 %	428220363
3511	NC_019702	TG	3	6	229089	229094	0 %	50 %	50 %	0 %	428220363
3512	NC_019702	CCA	2	6	229143	229148	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428220363
3513	NC_019702	TGG	2	6	229188	229193	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428220363
3514	NC_019702	ATT	2	6	229243	229248	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428220363
3515	NC_019702	TAAT	2	8	229293	229300	50 %	50 %	0 %	0 %	428220363
3516	NC_019702	GAC	2	6	229336	229341	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428220363
3517	NC_019702	CAT	2	6	229427	229432	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428220363
3518	NC_019702	TGG	2	6	229560	229565	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428220363
3519	NC_019702	GGCG	2	8	229787	229794	0 %	0 %	75 %	25 %	428220364
3520	NC_019702	AGTTGT	2	12	229805	229816	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	428220364
3521	NC_019702	A	6	6	229871	229876	100 %	0 %	0 %	0 %	428220364
3522	NC_019702	GATC	2	8	229997	230004	25 %	25 %	25 %	25 %	428220364
3523	NC_019702	ACT	2	6	230009	230014	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428220364
3524	NC_019702	GCT	2	6	230088	230093	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428220364
3525	NC_019702	AAG	2	6	230146	230151	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428220364
3526	NC_019702	CCG	2	6	230152	230157	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428220364
3527	NC_019702	GCC	2	6	230346	230351	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428220364
3528	NC_019702	AGG	2	6	230354	230359	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428220364
3529	NC_019702	TTG	2	6	230374	230379	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428220364
3530	NC_019702	AAG	2	6	230449	230454	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428220364
3531	NC_019702	ATT	2	6	230489	230494	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428220364
3532	NC_019702	CAT	2	6	230538	230543	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428220364
3533	NC_019702	G	6	6	230571	230576	0 %	0 %	100 %	0 %	428220364
3534	NC_019702	AGA	2	6	230684	230689	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428220364
3535	NC_019702	TC	3	6	230704	230709	0 %	50 %	0 %	50 %	428220364
3536	NC_019702	CTA	2	6	230758	230763	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428220364
3537	NC_019702	TTA	2	6	230780	230785	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428220364
3538	NC_019702	AAC	2	6	230821	230826	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428220364
3539	NC_019702	GTC	2	6	230893	230898	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428220364
3540	NC_019702	CAA	3	9	230982	230990	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428220364
3541	NC_019702	AAC	2	6	231325	231330	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428220365
3542	NC_019702	ATC	2	6	231427	231432	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428220365
3543	NC_019702	CTT	2	6	231434	231439	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428220365
3544	NC_019702	CT	3	6	231461	231466	0 %	50 %	0 %	50 %	428220365
3545	NC_019702	TCC	2	6	231467	231472	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428220365
3546	NC_019702	TGC	2	6	231484	231489	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428220365
3547	NC_019702	TGA	2	6	231533	231538	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428220365
3548	NC_019702	A	7	7	231546	231552	100 %	0 %	0 %	0 %	428220365
3549	NC_019702	ATC	2	6	231582	231587	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428220365
3550	NC_019702	AATC	2	8	231668	231675	50 %	25 %	0 %	25 %	428220365
3551	NC_019702	GAA	2	6	231693	231698	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428220365
3552	NC_019702	GCC	2	6	231738	231743	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428220365
3553	NC_019702	CGC	2	6	231753	231758	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428220365
3554	NC_019702	GCA	2	6	231785	231790	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428220365
3555	NC_019702	GAA	2	6	231822	231827	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428220365
3556	NC_019702	GCC	2	6	231895	231900	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428220365
3557	NC_019702	TAT	2	6	231902	231907	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428220365
3558	NC_019702	ATT	2	6	232070	232075	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428220365
3559	NC_019702	ACA	2	6	232157	232162	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428220365
3560	NC_019702	ATT	2	6	232176	232181	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428220365
3561	NC_019702	AT	3	6	232286	232291	50 %	50 %	0 %	0 %	428220365
3562	NC_019702	ACCCAA	2	12	232305	232316	50 %	0 %	0 %	50 %	428220365
3563	NC_019702	TGG	2	6	232390	232395	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428220365
3564	NC_019702	AGC	2	6	232436	232441	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428220365
3565	NC_019702	ATG	2	6	232480	232485	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428220365
3566	NC_019702	TAG	2	6	232646	232651	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428220365
3567	NC_019702	GCA	2	6	232663	232668	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428220365
3568	NC_019702	GTG	2	6	232731	232736	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428220365
3569	NC_019702	ATT	2	6	232739	232744	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428220365
3570	NC_019702	TTGATT	2	12	232819	232830	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	428220365
3571	NC_019702	GAA	2	6	232881	232886	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428220365
3572	NC_019702	AT	3	6	233027	233032	50 %	50 %	0 %	0 %	428220366
3573	NC_019702	AGGA	2	8	233113	233120	50 %	0 %	50 %	0 %	428220366
3574	NC_019702	GTA	2	6	233127	233132	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428220366
3575	NC_019702	ATTA	2	8	233133	233140	50 %	50 %	0 %	0 %	428220366
3576	NC_019702	CGG	3	9	233155	233163	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428220366
3577	NC_019702	TAA	2	6	233297	233302	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428220366
3578	NC_019702	TAT	2	6	233441	233446	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428220366
3579	NC_019702	TGC	2	6	233501	233506	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428220366
3580	NC_019702	CAC	2	6	233597	233602	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428220366
3581	NC_019702	CTCG	2	8	233652	233659	0 %	25 %	25 %	50 %	428220366
3582	NC_019702	GAA	2	6	233673	233678	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428220366
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3584	NC_019702	CTG	2	6	233713	233718	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428220366
3585	NC_019702	GGT	2	6	233754	233759	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428220366
3586	NC_019702	TTG	2	6	233948	233953	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428220367
3587	NC_019702	CTT	2	6	233968	233973	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428220367
3588	NC_019702	CTT	2	6	234019	234024	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428220367
3589	NC_019702	CA	3	6	234097	234102	50 %	0 %	0 %	50 %	428220367
3590	NC_019702	ATCGC	2	10	234261	234270	20 %	20 %	20 %	40 %	428220367
3591	NC_019702	CTT	2	6	234322	234327	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428220367
3592	NC_019702	TCA	2	6	234342	234347	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428220367
3593	NC_019702	CGC	3	9	234413	234421	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428220367
3594	NC_019702	T	6	6	234449	234454	0 %	100 %	0 %	0 %	428220367
3595	NC_019702	CAAT	2	8	234471	234478	50 %	25 %	0 %	25 %	428220367
3596	NC_019702	GCC	2	6	234495	234500	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428220367
3597	NC_019702	T	7	7	234722	234728	0 %	100 %	0 %	0 %	428220367
3598	NC_019702	T	6	6	234896	234901	0 %	100 %	0 %	0 %	428220367
3599	NC_019702	AAC	2	6	234926	234931	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428220367
3600	NC_019702	ACATC	2	10	234994	235003	40 %	20 %	0 %	40 %	428220367
3601	NC_019702	TCC	2	6	235047	235052	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428220367
3602	NC_019702	AAT	2	6	235085	235090	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428220367
3603	NC_019702	ATC	2	6	235244	235249	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428220367
3604	NC_019702	AATT	2	8	235529	235536	50 %	50 %	0 %	0 %	428220368
3605	NC_019702	GTT	2	6	235636	235641	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428220368
3606	NC_019702	GAG	2	6	235643	235648	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428220368
3607	NC_019702	GAG	2	6	235655	235660	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428220368
3608	NC_019702	CAA	2	6	235804	235809	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428220369
3609	NC_019702	A	6	6	235843	235848	100 %	0 %	0 %	0 %	428220369
3610	NC_019702	TAATT	2	10	235905	235914	40 %	60 %	0 %	0 %	428220369
3611	NC_019702	CAGC	2	8	235921	235928	25 %	0 %	25 %	50 %	428220369
3612	NC_019702	TCAA	2	8	235935	235942	50 %	25 %	0 %	25 %	428220369
3613	NC_019702	ATT	2	6	235996	236001	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428220369
3614	NC_019702	A	6	6	236023	236028	100 %	0 %	0 %	0 %	428220369
3615	NC_019702	TGG	2	6	236064	236069	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428220369
3616	NC_019702	TAAC	2	8	236117	236124	50 %	25 %	0 %	25 %	428220369
3617	NC_019702	AGGC	2	8	236174	236181	25 %	0 %	50 %	25 %	428220369
3618	NC_019702	A	6	6	236186	236191	100 %	0 %	0 %	0 %	428220369
3619	NC_019702	CTA	2	6	236237	236242	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428220369
3620	NC_019702	TTA	2	6	236303	236308	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428220369
3621	NC_019702	TGG	2	6	236379	236384	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428220369
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3623	NC_019702	TATT	2	8	236471	236478	25 %	75 %	0 %	0 %	428220369
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3860	NC_019702	TAG	2	6	250660	250665	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428220380
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3862	NC_019702	TTTA	2	8	250961	250968	25 %	75 %	0 %	0 %	428220381
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3868	NC_019702	CCGC	2	8	251461	251468	0 %	0 %	25 %	75 %	428220382
3869	NC_019702	GAC	2	6	251483	251488	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428220382
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3871	NC_019702	AGC	2	6	251574	251579	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428220382
3872	NC_019702	CAC	2	6	251619	251624	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428220382
3873	NC_019702	TTC	2	6	251847	251852	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428220382
3874	NC_019702	ACC	2	6	252024	252029	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428220382
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3876	NC_019702	GATG	2	8	252151	252158	25 %	25 %	50 %	0 %	428220382
3877	NC_019702	CAA	2	6	252293	252298	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428220382
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3880	NC_019702	CAT	2	6	252458	252463	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428220382
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3892	NC_019702	AGTTTT	2	12	253215	253226	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	428220382
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3971	NC_019702	ATAC	2	8	256773	256780	50 %	25 %	0 %	25 %	428220384
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3978	NC_019702	GGAT	2	8	257074	257081	25 %	25 %	50 %	0 %	428220384
3979	NC_019702	TAC	2	6	257176	257181	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428220385
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3985	NC_019702	ATT	2	6	257523	257528	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428220385
3986	NC_019702	ATTT	2	8	257682	257689	25 %	75 %	0 %	0 %	428220386
3987	NC_019702	GCTT	2	8	257856	257863	0 %	50 %	25 %	25 %	428220386
3988	NC_019702	TTG	2	6	257864	257869	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428220386
3989	NC_019702	ATC	2	6	257900	257905	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428220386
3990	NC_019702	TTC	2	6	257997	258002	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428220386
3991	NC_019702	CAC	2	6	258227	258232	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428220387
3992	NC_019702	CTG	2	6	258338	258343	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428220387
3993	NC_019702	ATT	2	6	258349	258354	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428220387
3994	NC_019702	TGAT	2	8	258506	258513	25 %	50 %	25 %	0 %	428220387
3995	NC_019702	TGC	2	6	258731	258736	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428220387
3996	NC_019702	ATT	3	9	258766	258774	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428220387
3997	NC_019702	ATT	2	6	258843	258848	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428220387
3998	NC_019702	CTAT	2	8	258853	258860	25 %	50 %	0 %	25 %	428220387
3999	NC_019702	T	6	6	258862	258867	0 %	100 %	0 %	0 %	428220387
4000	NC_019702	TGGG	2	8	258904	258911	0 %	25 %	75 %	0 %	428220387

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