MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Synechococcus sp. PCC 7502 chromosome

Total Repeats: 50837

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_019702	TAT	2	6	196989	196994	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428220336
3002	NC_019702	TGG	2	6	197042	197047	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428220336
3003	NC_019702	TGC	2	6	197051	197056	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428220336
3004	NC_019702	GAA	2	6	197104	197109	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428220336
3005	NC_019702	ACT	2	6	197117	197122	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428220336
3006	NC_019702	A	6	6	197226	197231	100 %	0 %	0 %	0 %	428220336
3007	NC_019702	T	6	6	197251	197256	0 %	100 %	0 %	0 %	428220336
3008	NC_019702	GAT	2	6	197257	197262	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428220336
3009	NC_019702	TGAT	2	8	197291	197298	25 %	50 %	25 %	0 %	428220336
3010	NC_019702	AGT	2	6	197313	197318	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428220336
3011	NC_019702	A	7	7	197334	197340	100 %	0 %	0 %	0 %	428220336
3012	NC_019702	TGA	2	6	197357	197362	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428220336
3013	NC_019702	GAA	2	6	197377	197382	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428220336
3014	NC_019702	GTA	2	6	197398	197403	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428220336
3015	NC_019702	GAT	3	9	197410	197418	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428220336
3016	NC_019702	ACT	2	6	197642	197647	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428220336
3017	NC_019702	TAA	2	6	197682	197687	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428220336
3018	NC_019702	TG	3	6	197743	197748	0 %	50 %	50 %	0 %	428220336
3019	NC_019702	TA	3	6	197780	197785	50 %	50 %	0 %	0 %	428220336
3020	NC_019702	GACC	2	8	197828	197835	25 %	0 %	25 %	50 %	428220336
3021	NC_019702	AT	3	6	197855	197860	50 %	50 %	0 %	0 %	428220336
3022	NC_019702	TG	3	6	197953	197958	0 %	50 %	50 %	0 %	428220336
3023	NC_019702	GATT	2	8	197976	197983	25 %	50 %	25 %	0 %	428220336
3024	NC_019702	GCT	2	6	197989	197994	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428220336
3025	NC_019702	AAT	2	6	198031	198036	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428220336
3026	NC_019702	GTA	2	6	198146	198151	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428220337
3027	NC_019702	AATA	2	8	198185	198192	75 %	25 %	0 %	0 %	428220337
3028	NC_019702	AAAG	2	8	198227	198234	75 %	0 %	25 %	0 %	428220337
3029	NC_019702	CCAC	2	8	198237	198244	25 %	0 %	0 %	75 %	428220337
3030	NC_019702	TAT	2	6	198323	198328	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428220337
3031	NC_019702	AGA	2	6	198427	198432	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428220338
3032	NC_019702	CCA	2	6	198456	198461	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428220338
3033	NC_019702	GCA	2	6	198473	198478	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428220338
3034	NC_019702	GCG	2	6	198689	198694	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428220338
3035	NC_019702	TTA	2	6	198719	198724	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428220338
3036	NC_019702	AGTAGA	2	12	198739	198750	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	428220338
3037	NC_019702	GCT	2	6	198842	198847	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428220338
3038	NC_019702	AGA	2	6	198907	198912	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428220338
3039	NC_019702	GGA	2	6	198994	198999	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428220338
3040	NC_019702	GAT	2	6	199013	199018	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428220338
3041	NC_019702	CAT	2	6	199056	199061	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428220338
3042	NC_019702	TTA	2	6	199083	199088	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428220338
3043	NC_019702	GAT	2	6	199105	199110	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428220338
3044	NC_019702	AAT	2	6	199205	199210	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428220339
3045	NC_019702	CTG	2	6	199241	199246	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428220339
3046	NC_019702	AACC	2	8	199286	199293	50 %	0 %	0 %	50 %	428220339
3047	NC_019702	AGC	2	6	199373	199378	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428220339
3048	NC_019702	TGG	2	6	199408	199413	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428220339
3049	NC_019702	TTA	2	6	199464	199469	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428220339
3050	NC_019702	ATA	3	9	199482	199490	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428220339
3051	NC_019702	CTC	2	6	199506	199511	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428220339
3052	NC_019702	CTT	2	6	199549	199554	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428220339
3053	NC_019702	ATT	2	6	199579	199584	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428220339
3054	NC_019702	CGC	2	6	199595	199600	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428220339
3055	NC_019702	AGCA	2	8	199707	199714	50 %	0 %	25 %	25 %	428220339
3056	NC_019702	TAG	2	6	199803	199808	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428220339
3057	NC_019702	CG	3	6	199841	199846	0 %	0 %	50 %	50 %	428220339
3058	NC_019702	TCT	2	6	199872	199877	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428220339
3059	NC_019702	TGTT	2	8	199905	199912	0 %	75 %	25 %	0 %	428220339
3060	NC_019702	TATT	2	8	199977	199984	25 %	75 %	0 %	0 %	428220339
3061	NC_019702	GTCG	2	8	200000	200007	0 %	25 %	50 %	25 %	428220339
3062	NC_019702	GGT	2	6	200027	200032	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428220339
3063	NC_019702	ATG	2	6	200037	200042	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428220339
3064	NC_019702	GATG	2	8	200077	200084	25 %	25 %	50 %	0 %	428220339
3065	NC_019702	ATT	4	12	200105	200116	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428220339
3066	NC_019702	CAAC	2	8	200121	200128	50 %	0 %	0 %	50 %	428220339
3067	NC_019702	GTA	2	6	200186	200191	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428220339
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3069	NC_019702	AAAG	2	8	200425	200432	75 %	0 %	25 %	0 %	428220339
3070	NC_019702	ATT	2	6	200540	200545	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428220339
3071	NC_019702	GAA	2	6	200588	200593	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428220339
3072	NC_019702	GGT	2	6	200642	200647	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428220339
3073	NC_019702	AGA	2	6	200656	200661	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428220339
3074	NC_019702	GAA	3	9	200675	200683	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428220339
3075	NC_019702	GCA	2	6	200710	200715	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428220339
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3077	NC_019702	AT	3	6	200880	200885	50 %	50 %	0 %	0 %	428220339
3078	NC_019702	AAT	2	6	201017	201022	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428220339
3079	NC_019702	TGC	2	6	201311	201316	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428220340
3080	NC_019702	TAA	2	6	201345	201350	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428220340
3081	NC_019702	GGAA	2	8	201510	201517	50 %	0 %	50 %	0 %	428220340
3082	NC_019702	ATGG	2	8	201586	201593	25 %	25 %	50 %	0 %	428220340
3083	NC_019702	GAAT	2	8	201653	201660	50 %	25 %	25 %	0 %	428220340
3084	NC_019702	TGA	2	6	201774	201779	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428220340
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3086	NC_019702	TCA	2	6	201859	201864	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428220340
3087	NC_019702	CGA	2	6	201902	201907	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428220340
3088	NC_019702	A	7	7	201926	201932	100 %	0 %	0 %	0 %	428220340
3089	NC_019702	CTA	2	6	202058	202063	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428220340
3090	NC_019702	CAG	2	6	202097	202102	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428220340
3091	NC_019702	GAT	2	6	202120	202125	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428220340
3092	NC_019702	AG	3	6	202142	202147	50 %	0 %	50 %	0 %	428220340
3093	NC_019702	TG	3	6	202157	202162	0 %	50 %	50 %	0 %	428220340
3094	NC_019702	GCGG	2	8	202207	202214	0 %	0 %	75 %	25 %	428220340
3095	NC_019702	TTA	2	6	202252	202257	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428220340
3096	NC_019702	AGA	2	6	202317	202322	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428220340
3097	NC_019702	AT	3	6	202366	202371	50 %	50 %	0 %	0 %	428220340
3098	NC_019702	A	6	6	202444	202449	100 %	0 %	0 %	0 %	428220340
3099	NC_019702	GAA	3	9	202486	202494	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428220340
3100	NC_019702	AGC	2	6	202500	202505	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428220340
3101	NC_019702	G	6	6	202566	202571	0 %	0 %	100 %	0 %	428220340
3102	NC_019702	GCA	2	6	202603	202608	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428220340
3103	NC_019702	ATT	2	6	202609	202614	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428220340
3104	NC_019702	GGGC	2	8	202616	202623	0 %	0 %	75 %	25 %	428220340
3105	NC_019702	GGT	2	6	202666	202671	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428220340
3106	NC_019702	TTTGG	2	10	202675	202684	0 %	60 %	40 %	0 %	428220340
3107	NC_019702	AAG	2	6	202739	202744	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428220340
3108	NC_019702	TAC	2	6	202778	202783	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428220340
3109	NC_019702	TGA	2	6	202797	202802	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428220340
3110	NC_019702	GCT	2	6	202810	202815	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428220340
3111	NC_019702	CGT	2	6	202816	202821	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428220340
3112	NC_019702	ACC	2	6	202833	202838	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428220340
3113	NC_019702	AGT	2	6	202894	202899	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428220340
3114	NC_019702	C	6	6	203021	203026	0 %	0 %	0 %	100 %	428220341
3115	NC_019702	GTG	2	6	203154	203159	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428220341
3116	NC_019702	TTG	2	6	203202	203207	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428220341
3117	NC_019702	CAT	2	6	203369	203374	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428220341
3118	NC_019702	TAA	2	6	203410	203415	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428220341
3119	NC_019702	GCA	2	6	203485	203490	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428220341
3120	NC_019702	CGC	2	6	203566	203571	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428220341
3121	NC_019702	A	7	7	203604	203610	100 %	0 %	0 %	0 %	428220341
3122	NC_019702	TGA	2	6	203635	203640	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428220341
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3135	NC_019702	AGT	2	6	204453	204458	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428220342
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3232	NC_019702	AT	3	6	210406	210411	50 %	50 %	0 %	0 %	428220349
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3240	NC_019702	ACA	2	6	210774	210779	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428220349
3241	NC_019702	AAT	2	6	210828	210833	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428220349
3242	NC_019702	CGG	2	6	210907	210912	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428220349
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3244	NC_019702	ATT	2	6	210966	210971	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428220349
3245	NC_019702	AAC	2	6	211019	211024	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428220349
3246	NC_019702	GAT	2	6	211074	211079	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428220349
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3248	NC_019702	ACT	2	6	211170	211175	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428220349
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3250	NC_019702	GGGT	2	8	211327	211334	0 %	25 %	75 %	0 %	428220349
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3350	NC_019702	TTAA	2	8	217444	217451	50 %	50 %	0 %	0 %	428220352
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3353	NC_019702	GAC	2	6	217895	217900	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428220353
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3359	NC_019702	AT	3	6	218419	218424	50 %	50 %	0 %	0 %	428220353
3360	NC_019702	CCGA	2	8	218673	218680	25 %	0 %	25 %	50 %	428220354
3361	NC_019702	GAAA	2	8	218787	218794	75 %	0 %	25 %	0 %	428220354
3362	NC_019702	CAAGTT	2	12	218847	218858	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	428220354
3363	NC_019702	CCG	2	6	219177	219182	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428220355
3364	NC_019702	TGGA	2	8	219242	219249	25 %	25 %	50 %	0 %	428220355
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3366	NC_019702	GGT	2	6	219561	219566	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428220355
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3368	NC_019702	CTA	2	6	219718	219723	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428220355
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3477	NC_019702	TAAA	2	8	226747	226754	75 %	25 %	0 %	0 %	428220361
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3489	NC_019702	ATT	2	6	227475	227480	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428220361
3490	NC_019702	AAT	2	6	227529	227534	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428220361
3491	NC_019702	TGA	2	6	227588	227593	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428220361
3492	NC_019702	ATGCT	2	10	227716	227725	20 %	40 %	20 %	20 %	428220361
3493	NC_019702	A	6	6	227736	227741	100 %	0 %	0 %	0 %	428220361
3494	NC_019702	TGA	2	6	227770	227775	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428220362
3495	NC_019702	CCG	2	6	227793	227798	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428220362
3496	NC_019702	GGT	2	6	227963	227968	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428220362
3497	NC_019702	AATCT	2	10	227997	228006	40 %	40 %	0 %	20 %	428220362
3498	NC_019702	AATGCC	2	12	228056	228067	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	428220362
3499	NC_019702	T	6	6	228079	228084	0 %	100 %	0 %	0 %	428220362
3500	NC_019702	TGAT	2	8	228096	228103	25 %	50 %	25 %	0 %	428220362

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