MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Synechococcus sp. PCC 7502 chromosome

Total Repeats: 50837

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
33001	NC_019702	TCAGAA	2	12	2247260	2247271	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	428222222
33002	NC_019702	TAG	2	6	2247486	2247491	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428222222
33003	NC_019702	CGC	2	6	2247515	2247520	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428222222
33004	NC_019702	TAT	2	6	2247612	2247617	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428222223
33005	NC_019702	ACT	2	6	2247670	2247675	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428222223
33006	NC_019702	CCG	2	6	2247816	2247821	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428222223
33007	NC_019702	AATT	2	8	2247824	2247831	50 %	50 %	0 %	0 %	428222223
33008	NC_019702	GAA	2	6	2247840	2247845	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428222223
33009	NC_019702	GAA	2	6	2247855	2247860	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428222223
33010	NC_019702	ATT	2	6	2247881	2247886	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428222223
33011	NC_019702	AGC	2	6	2248044	2248049	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428222224
33012	NC_019702	AAAGCC	2	12	2248142	2248153	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	428222224
33013	NC_019702	CATGA	2	10	2248199	2248208	40 %	20 %	20 %	20 %	428222224
33014	NC_019702	TAG	2	6	2248318	2248323	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428222224
33015	NC_019702	AATTT	2	10	2248328	2248337	40 %	60 %	0 %	0 %	428222224
33016	NC_019702	TGGC	2	8	2248466	2248473	0 %	25 %	50 %	25 %	428222224
33017	NC_019702	ACT	2	6	2248678	2248683	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428222224
33018	NC_019702	ATC	2	6	2248687	2248692	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428222224
33019	NC_019702	GAA	2	6	2248751	2248756	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428222224
33020	NC_019702	T	6	6	2248757	2248762	0 %	100 %	0 %	0 %	428222224
33021	NC_019702	CTC	2	6	2248780	2248785	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428222224
33022	NC_019702	TTCG	2	8	2248812	2248819	0 %	50 %	25 %	25 %	428222224
33023	NC_019702	TAT	2	6	2248948	2248953	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428222224
33024	NC_019702	ATA	2	6	2249013	2249018	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428222224
33025	NC_019702	GGC	2	6	2249042	2249047	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428222224
33026	NC_019702	GTA	2	6	2249048	2249053	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428222224
33027	NC_019702	AGCT	2	8	2249104	2249111	25 %	25 %	25 %	25 %	428222224
33028	NC_019702	ACTT	2	8	2249202	2249209	25 %	50 %	0 %	25 %	428222224
33029	NC_019702	AGA	2	6	2249792	2249797	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428222225
33030	NC_019702	GA	3	6	2249862	2249867	50 %	0 %	50 %	0 %	428222225
33031	NC_019702	AAG	2	6	2249870	2249875	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428222225
33032	NC_019702	GCC	2	6	2249906	2249911	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428222225
33033	NC_019702	AT	4	8	2249914	2249921	50 %	50 %	0 %	0 %	428222225
33034	NC_019702	TTG	2	6	2250151	2250156	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428222225
33035	NC_019702	ATTA	2	8	2250204	2250211	50 %	50 %	0 %	0 %	428222225
33036	NC_019702	A	6	6	2250293	2250298	100 %	0 %	0 %	0 %	428222226
33037	NC_019702	CAACT	2	10	2250427	2250436	40 %	20 %	0 %	40 %	428222226
33038	NC_019702	ACAG	2	8	2250485	2250492	50 %	0 %	25 %	25 %	428222226
33039	NC_019702	GTA	2	6	2250506	2250511	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428222226
33040	NC_019702	TAAT	2	8	2250519	2250526	50 %	50 %	0 %	0 %	428222226
33041	NC_019702	C	6	6	2250614	2250619	0 %	0 %	0 %	100 %	428222226
33042	NC_019702	GCT	2	6	2250626	2250631	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428222226
33043	NC_019702	TAG	2	6	2250777	2250782	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428222226
33044	NC_019702	AAG	2	6	2250807	2250812	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428222226
33045	NC_019702	CGG	2	6	2251011	2251016	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428222226
33046	NC_019702	TTG	2	6	2251044	2251049	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428222226
33047	NC_019702	TACCA	2	10	2251195	2251204	40 %	20 %	0 %	40 %	428222226
33048	NC_019702	GGT	2	6	2251253	2251258	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428222226
33049	NC_019702	TTTG	2	8	2251305	2251312	0 %	75 %	25 %	0 %	428222226
33050	NC_019702	ATCA	2	8	2251342	2251349	50 %	25 %	0 %	25 %	428222226
33051	NC_019702	GTT	2	6	2251377	2251382	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428222226
33052	NC_019702	AAT	2	6	2251425	2251430	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428222226
33053	NC_019702	GAT	2	6	2251452	2251457	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428222226
33054	NC_019702	GTAA	2	8	2251579	2251586	50 %	25 %	25 %	0 %	428222226
33055	NC_019702	ACC	2	6	2251594	2251599	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428222226
33056	NC_019702	CAA	2	6	2251768	2251773	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428222227
33057	NC_019702	CATCC	2	10	2251894	2251903	20 %	20 %	0 %	60 %	428222227
33058	NC_019702	TTA	2	6	2251920	2251925	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428222227
33059	NC_019702	TAC	2	6	2251951	2251956	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428222227
33060	NC_019702	CATC	2	8	2251958	2251965	25 %	25 %	0 %	50 %	428222227
33061	NC_019702	CTT	2	6	2252212	2252217	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428222227
33062	NC_019702	G	6	6	2252237	2252242	0 %	0 %	100 %	0 %	428222227
33063	NC_019702	TCA	2	6	2252287	2252292	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428222227
33064	NC_019702	G	6	6	2252302	2252307	0 %	0 %	100 %	0 %	428222227
33065	NC_019702	CTTGT	2	10	2252333	2252342	0 %	60 %	20 %	20 %	428222227
33066	NC_019702	T	6	6	2252402	2252407	0 %	100 %	0 %	0 %	428222227
33067	NC_019702	AAT	2	6	2252459	2252464	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428222227
33068	NC_019702	GAAT	2	8	2252466	2252473	50 %	25 %	25 %	0 %	428222227
33069	NC_019702	CCTT	2	8	2252555	2252562	0 %	50 %	0 %	50 %	428222227
33070	NC_019702	TCT	2	6	2252586	2252591	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428222227
33071	NC_019702	A	7	7	2252696	2252702	100 %	0 %	0 %	0 %	428222227
33072	NC_019702	AAC	2	6	2252711	2252716	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428222227
33073	NC_019702	AGC	2	6	2252726	2252731	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428222227
33074	NC_019702	TGC	2	6	2252753	2252758	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428222227
33075	NC_019702	GTG	2	6	2252763	2252768	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428222227
33076	NC_019702	GGCACA	2	12	2252819	2252830	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428222227
33077	NC_019702	TCT	2	6	2252847	2252852	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428222227
33078	NC_019702	CAA	2	6	2252999	2253004	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428222227
33079	NC_019702	TAG	2	6	2253059	2253064	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428222227
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33082	NC_019702	A	6	6	2253857	2253862	100 %	0 %	0 %	0 %	428222228
33083	NC_019702	GAA	2	6	2253932	2253937	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428222228
33084	NC_019702	T	6	6	2253954	2253959	0 %	100 %	0 %	0 %	428222228
33085	NC_019702	GTAT	2	8	2254005	2254012	25 %	50 %	25 %	0 %	428222228
33086	NC_019702	CTAA	2	8	2254049	2254056	50 %	25 %	0 %	25 %	428222228
33087	NC_019702	AGT	2	6	2254084	2254089	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428222228
33088	NC_019702	TTG	2	6	2254098	2254103	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428222228
33089	NC_019702	TGG	3	9	2254129	2254137	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428222228
33090	NC_019702	TGGC	2	8	2254242	2254249	0 %	25 %	50 %	25 %	428222228
33091	NC_019702	T	6	6	2254256	2254261	0 %	100 %	0 %	0 %	428222228
33092	NC_019702	TGGT	2	8	2254264	2254271	0 %	50 %	50 %	0 %	428222228
33093	NC_019702	GCT	2	6	2254286	2254291	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428222228
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33095	NC_019702	TATC	2	8	2254395	2254402	25 %	50 %	0 %	25 %	428222228
33096	NC_019702	ACT	3	9	2254410	2254418	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428222228
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33099	NC_019702	TAT	2	6	2254651	2254656	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428222228
33100	NC_019702	CTT	2	6	2254776	2254781	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428222228
33101	NC_019702	GCACA	2	10	2254838	2254847	40 %	0 %	20 %	40 %	428222228
33102	NC_019702	TCA	2	6	2254912	2254917	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428222228
33103	NC_019702	TGG	2	6	2254927	2254932	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428222228
33104	NC_019702	TGC	2	6	2254948	2254953	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428222228
33105	NC_019702	T	6	6	2254970	2254975	0 %	100 %	0 %	0 %	428222228
33106	NC_019702	TGAT	2	8	2255013	2255020	25 %	50 %	25 %	0 %	428222228
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33108	NC_019702	GTAT	2	8	2255066	2255073	25 %	50 %	25 %	0 %	428222228
33109	NC_019702	GCG	3	9	2255213	2255221	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428222228
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33111	NC_019702	TGG	2	6	2255266	2255271	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428222228
33112	NC_019702	TGG	2	6	2255287	2255292	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428222228
33113	NC_019702	TGC	2	6	2255299	2255304	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428222228
33114	NC_019702	CTT	2	6	2255332	2255337	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428222228
33115	NC_019702	GTG	2	6	2255475	2255480	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428222228
33116	NC_019702	GTA	2	6	2255549	2255554	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428222228
33117	NC_019702	GGT	2	6	2255633	2255638	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428222228
33118	NC_019702	CTATTA	2	12	2255655	2255666	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	428222228
33119	NC_019702	GGTT	2	8	2255669	2255676	0 %	50 %	50 %	0 %	428222228
33120	NC_019702	ATTG	2	8	2255824	2255831	25 %	50 %	25 %	0 %	428222228
33121	NC_019702	CA	3	6	2255847	2255852	50 %	0 %	0 %	50 %	428222228
33122	NC_019702	TAAAT	2	10	2255854	2255863	60 %	40 %	0 %	0 %	428222228
33123	NC_019702	TCT	2	6	2255932	2255937	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428222228
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33129	NC_019702	GGCAA	2	10	2256225	2256234	40 %	0 %	40 %	20 %	428222229
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33132	NC_019702	GCTG	2	8	2256470	2256477	0 %	25 %	50 %	25 %	428222229
33133	NC_019702	CAC	2	6	2256545	2256550	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428222229
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33137	NC_019702	CCTT	2	8	2256783	2256790	0 %	50 %	0 %	50 %	428222229
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33145	NC_019702	GCT	2	6	2257136	2257141	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428222229
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33152	NC_019702	TCA	2	6	2257597	2257602	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428222229
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33159	NC_019702	TCACT	2	10	2258173	2258182	20 %	40 %	0 %	40 %	428222229
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33202	NC_019702	TTA	2	6	2261871	2261876	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428222231
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33219	NC_019702	ATTTA	2	10	2262563	2262572	40 %	60 %	0 %	0 %	428222232
33220	NC_019702	CTA	2	6	2262588	2262593	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428222232
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33224	NC_019702	TAG	2	6	2263088	2263093	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428222233
33225	NC_019702	AGA	2	6	2263134	2263139	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428222233
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33228	NC_019702	TTA	2	6	2263257	2263262	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428222233
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33230	NC_019702	T	6	6	2263383	2263388	0 %	100 %	0 %	0 %	428222234
33231	NC_019702	GAT	2	6	2263419	2263424	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428222234
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33233	NC_019702	TTC	2	6	2263577	2263582	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428222234
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