MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Synechococcus sp. PCC 7502 chromosome

Total Repeats: 50837

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
32501	NC_019702	GCA	2	6	2213661	2213666	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428222189
32502	NC_019702	TTC	2	6	2213678	2213683	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428222189
32503	NC_019702	GAC	2	6	2213719	2213724	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428222189
32504	NC_019702	ATC	2	6	2213795	2213800	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428222189
32505	NC_019702	AAT	2	6	2213804	2213809	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428222189
32506	NC_019702	GCT	2	6	2214075	2214080	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428222190
32507	NC_019702	GGT	2	6	2214087	2214092	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428222190
32508	NC_019702	ACCGCC	2	12	2214324	2214335	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	428222190
32509	NC_019702	AGC	2	6	2214353	2214358	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428222190
32510	NC_019702	ACCT	2	8	2214397	2214404	25 %	25 %	0 %	50 %	428222190
32511	NC_019702	ACGCT	2	10	2214440	2214449	20 %	20 %	20 %	40 %	428222190
32512	NC_019702	GAT	3	9	2214524	2214532	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428222190
32513	NC_019702	TGTGC	2	10	2214732	2214741	0 %	40 %	40 %	20 %	428222190
32514	NC_019702	TTA	2	6	2214879	2214884	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428222190
32515	NC_019702	CAG	2	6	2214978	2214983	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428222190
32516	NC_019702	A	6	6	2215009	2215014	100 %	0 %	0 %	0 %	428222190
32517	NC_019702	TAG	2	6	2215042	2215047	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428222190
32518	NC_019702	ATC	2	6	2215063	2215068	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428222190
32519	NC_019702	GCC	2	6	2215080	2215085	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428222190
32520	NC_019702	CT	3	6	2215174	2215179	0 %	50 %	0 %	50 %	428222190
32521	NC_019702	CCTA	2	8	2215273	2215280	25 %	25 %	0 %	50 %	428222190
32522	NC_019702	ATG	2	6	2215336	2215341	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428222190
32523	NC_019702	AGCA	2	8	2215616	2215623	50 %	0 %	25 %	25 %	428222190
32524	NC_019702	CTG	2	6	2215648	2215653	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428222190
32525	NC_019702	GAA	2	6	2215676	2215681	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428222190
32526	NC_019702	AACGG	2	10	2215691	2215700	40 %	0 %	40 %	20 %	428222190
32527	NC_019702	CTA	2	6	2215835	2215840	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428222190
32528	NC_019702	ATA	2	6	2215897	2215902	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428222190
32529	NC_019702	TATC	2	8	2215907	2215914	25 %	50 %	0 %	25 %	428222190
32530	NC_019702	TATC	2	8	2216103	2216110	25 %	50 %	0 %	25 %	428222190
32531	NC_019702	GCA	2	6	2216183	2216188	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428222190
32532	NC_019702	TTC	2	6	2216221	2216226	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428222190
32533	NC_019702	GGGA	2	8	2216267	2216274	25 %	0 %	75 %	0 %	428222190
32534	NC_019702	ATC	2	6	2216283	2216288	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428222190
32535	NC_019702	TGA	2	6	2216291	2216296	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428222190
32536	NC_019702	AGT	2	6	2216318	2216323	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428222190
32537	NC_019702	TGA	2	6	2216329	2216334	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428222190
32538	NC_019702	CTAG	2	8	2216415	2216422	25 %	25 %	25 %	25 %	428222190
32539	NC_019702	TAG	2	6	2216425	2216430	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428222190
32540	NC_019702	TAAA	2	8	2216548	2216555	75 %	25 %	0 %	0 %	428222190
32541	NC_019702	TCA	2	6	2216579	2216584	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428222190
32542	NC_019702	CTA	2	6	2216588	2216593	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428222190
32543	NC_019702	TGA	2	6	2216627	2216632	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428222190
32544	NC_019702	AGG	2	6	2216644	2216649	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428222190
32545	NC_019702	TGA	2	6	2216693	2216698	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428222190
32546	NC_019702	TAA	2	6	2216714	2216719	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428222190
32547	NC_019702	TCT	2	6	2216746	2216751	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428222190
32548	NC_019702	GCGG	2	8	2216889	2216896	0 %	0 %	75 %	25 %	428222190
32549	NC_019702	TGA	2	6	2217034	2217039	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428222191
32550	NC_019702	TAC	2	6	2217111	2217116	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428222191
32551	NC_019702	TAA	2	6	2217148	2217153	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428222191
32552	NC_019702	TAT	2	6	2217238	2217243	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428222191
32553	NC_019702	GAA	2	6	2217251	2217256	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428222191
32554	NC_019702	GCT	2	6	2217275	2217280	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428222191
32555	NC_019702	TAA	2	6	2217283	2217288	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428222191
32556	NC_019702	AAT	2	6	2217311	2217316	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428222191
32557	NC_019702	GAA	2	6	2217338	2217343	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428222191
32558	NC_019702	TTGG	2	8	2217392	2217399	0 %	50 %	50 %	0 %	428222191
32559	NC_019702	TTA	2	6	2217528	2217533	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428222192
32560	NC_019702	CA	3	6	2217534	2217539	50 %	0 %	0 %	50 %	428222192
32561	NC_019702	TGG	2	6	2217589	2217594	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428222192
32562	NC_019702	ATT	2	6	2217691	2217696	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428222192
32563	NC_019702	AT	3	6	2217767	2217772	50 %	50 %	0 %	0 %	428222192
32564	NC_019702	GAA	2	6	2217787	2217792	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428222192
32565	NC_019702	ATA	2	6	2217856	2217861	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428222192
32566	NC_019702	TTG	2	6	2217872	2217877	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428222192
32567	NC_019702	T	7	7	2217890	2217896	0 %	100 %	0 %	0 %	428222192
32568	NC_019702	AAAT	2	8	2217924	2217931	75 %	25 %	0 %	0 %	428222192
32569	NC_019702	TAAT	2	8	2218091	2218098	50 %	50 %	0 %	0 %	428222192
32570	NC_019702	CAG	2	6	2218151	2218156	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428222192
32571	NC_019702	A	6	6	2218297	2218302	100 %	0 %	0 %	0 %	428222192
32572	NC_019702	A	6	6	2218369	2218374	100 %	0 %	0 %	0 %	428222192
32573	NC_019702	GAA	2	6	2218402	2218407	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428222192
32574	NC_019702	ATT	2	6	2218418	2218423	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428222192
32575	NC_019702	GA	3	6	2218455	2218460	50 %	0 %	50 %	0 %	428222192
32576	NC_019702	TA	3	6	2218493	2218498	50 %	50 %	0 %	0 %	428222192
32577	NC_019702	TTC	2	6	2218523	2218528	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428222192
32578	NC_019702	AT	3	6	2218690	2218695	50 %	50 %	0 %	0 %	428222192
32579	NC_019702	CGG	2	6	2218802	2218807	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428222192
32580	NC_019702	AGA	2	6	2218830	2218835	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428222192
32581	NC_019702	TTA	2	6	2218837	2218842	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428222192
32582	NC_019702	CGG	2	6	2218910	2218915	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428222192
32583	NC_019702	A	6	6	2219001	2219006	100 %	0 %	0 %	0 %	428222192
32584	NC_019702	CAT	2	6	2219149	2219154	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428222192
32585	NC_019702	CCA	2	6	2219208	2219213	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428222192
32586	NC_019702	ACC	2	6	2219281	2219286	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428222192
32587	NC_019702	GAA	2	6	2219287	2219292	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428222192
32588	NC_019702	AAC	2	6	2219363	2219368	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428222192
32589	NC_019702	CTGA	2	8	2219416	2219423	25 %	25 %	25 %	25 %	428222192
32590	NC_019702	TGC	2	6	2219460	2219465	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428222192
32591	NC_019702	TAA	2	6	2219550	2219555	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428222192
32592	NC_019702	GCGA	2	8	2219653	2219660	25 %	0 %	50 %	25 %	428222192
32593	NC_019702	ATTT	2	8	2219750	2219757	25 %	75 %	0 %	0 %	428222192
32594	NC_019702	ATT	2	6	2219898	2219903	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428222192
32595	NC_019702	TGA	2	6	2219937	2219942	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428222192
32596	NC_019702	TTG	2	6	2219954	2219959	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428222192
32597	NC_019702	TAA	2	6	2220018	2220023	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428222192
32598	NC_019702	TGA	3	9	2220141	2220149	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428222192
32599	NC_019702	ACA	2	6	2220387	2220392	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428222193
32600	NC_019702	GCT	2	6	2220467	2220472	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428222193
32601	NC_019702	GA	3	6	2220510	2220515	50 %	0 %	50 %	0 %	428222193
32602	NC_019702	TAA	2	6	2220562	2220567	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428222193
32603	NC_019702	TGGC	2	8	2220596	2220603	0 %	25 %	50 %	25 %	428222193
32604	NC_019702	TTGG	2	8	2220690	2220697	0 %	50 %	50 %	0 %	428222193
32605	NC_019702	A	6	6	2220698	2220703	100 %	0 %	0 %	0 %	428222193
32606	NC_019702	TGC	2	6	2220805	2220810	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428222193
32607	NC_019702	CACC	2	8	2220908	2220915	25 %	0 %	0 %	75 %	428222194
32608	NC_019702	GAT	2	6	2220954	2220959	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428222194
32609	NC_019702	CTA	2	6	2221044	2221049	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428222194
32610	NC_019702	CAC	2	6	2221050	2221055	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428222194
32611	NC_019702	TGC	2	6	2221056	2221061	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428222194
32612	NC_019702	TAT	2	6	2221089	2221094	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428222194
32613	NC_019702	GGT	2	6	2221102	2221107	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428222194
32614	NC_019702	GT	3	6	2221183	2221188	0 %	50 %	50 %	0 %	428222194
32615	NC_019702	GCA	2	6	2221209	2221214	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428222194
32616	NC_019702	GGT	2	6	2221219	2221224	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428222194
32617	NC_019702	AAT	2	6	2221317	2221322	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428222194
32618	NC_019702	AGT	2	6	2221455	2221460	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428222194
32619	NC_019702	CATT	2	8	2221462	2221469	25 %	50 %	0 %	25 %	428222194
32620	NC_019702	TGG	2	6	2221611	2221616	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428222194
32621	NC_019702	AT	3	6	2221764	2221769	50 %	50 %	0 %	0 %	428222194
32622	NC_019702	ATT	2	6	2221834	2221839	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428222194
32623	NC_019702	GTGG	2	8	2222005	2222012	0 %	25 %	75 %	0 %	428222194
32624	NC_019702	TGA	2	6	2222019	2222024	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428222194
32625	NC_019702	ATC	2	6	2222158	2222163	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428222194
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32629	NC_019702	GGT	2	6	2222334	2222339	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428222194
32630	NC_019702	C	6	6	2222479	2222484	0 %	0 %	0 %	100 %	428222194
32631	NC_019702	CGA	2	6	2222524	2222529	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428222195
32632	NC_019702	AATT	2	8	2222654	2222661	50 %	50 %	0 %	0 %	428222195
32633	NC_019702	TGT	2	6	2222794	2222799	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428222195
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32635	NC_019702	ATCT	2	8	2222887	2222894	25 %	50 %	0 %	25 %	428222195
32636	NC_019702	T	7	7	2222928	2222934	0 %	100 %	0 %	0 %	428222195
32637	NC_019702	TCT	2	6	2222985	2222990	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428222195
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32643	NC_019702	TTTG	2	8	2223304	2223311	0 %	75 %	25 %	0 %	428222195
32644	NC_019702	TAAAGG	2	12	2223347	2223358	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	428222195
32645	NC_019702	TTA	2	6	2223360	2223365	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428222195
32646	NC_019702	ATT	2	6	2223383	2223388	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428222195
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32667	NC_019702	A	6	6	2224397	2224402	100 %	0 %	0 %	0 %	428222197
32668	NC_019702	AAGA	2	8	2224424	2224431	75 %	0 %	25 %	0 %	428222197
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32730	NC_019702	CAA	2	6	2228682	2228687	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428222202
32731	NC_019702	A	6	6	2228686	2228691	100 %	0 %	0 %	0 %	428222202
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32734	NC_019702	ATT	2	6	2228951	2228956	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428222202
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32847	NC_019702	GGCG	2	8	2235802	2235809	0 %	0 %	75 %	25 %	428222209
32848	NC_019702	GTA	2	6	2235830	2235835	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428222209
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32851	NC_019702	T	6	6	2235939	2235944	0 %	100 %	0 %	0 %	428222209
32852	NC_019702	GTA	2	6	2235949	2235954	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428222209
32853	NC_019702	CTGA	2	8	2236033	2236040	25 %	25 %	25 %	25 %	428222209
32854	NC_019702	ATT	2	6	2236064	2236069	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428222209
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32872	NC_019702	GTA	2	6	2237660	2237665	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428222213
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32874	NC_019702	TGC	2	6	2237834	2237839	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428222213
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32882	NC_019702	TTA	2	6	2238797	2238802	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428222214
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32951	NC_019702	GCT	2	6	2243960	2243965	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428222220
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32954	NC_019702	TCCA	2	8	2244277	2244284	25 %	25 %	0 %	50 %	428222220
32955	NC_019702	AAG	2	6	2244426	2244431	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428222220
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32957	NC_019702	GTT	2	6	2244477	2244482	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428222221
32958	NC_019702	GTT	2	6	2244524	2244529	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428222221
32959	NC_019702	AGAA	2	8	2244554	2244561	75 %	0 %	25 %	0 %	428222221
32960	NC_019702	GCA	2	6	2244813	2244818	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428222221
32961	NC_019702	ATTA	2	8	2244968	2244975	50 %	50 %	0 %	0 %	428222221
32962	NC_019702	ATA	2	6	2245050	2245055	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428222221
32963	NC_019702	CCA	2	6	2245116	2245121	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428222221
32964	NC_019702	GACC	2	8	2245136	2245143	25 %	0 %	25 %	50 %	428222221
32965	NC_019702	ACC	2	6	2245193	2245198	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428222221
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