MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Synechococcus sp. PCC 7502 chromosome

Total Repeats: 50837

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_019702	AAGT	2	8	99382	99389	50 %	25 %	25 %	0 %	428220231
1502	NC_019702	TCTG	2	8	99465	99472	0 %	50 %	25 %	25 %	428220232
1503	NC_019702	ACC	2	6	99498	99503	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428220232
1504	NC_019702	TAA	2	6	99512	99517	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428220232
1505	NC_019702	TGT	2	6	99571	99576	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428220232
1506	NC_019702	TACC	2	8	99601	99608	25 %	25 %	0 %	50 %	428220232
1507	NC_019702	CTG	2	6	99625	99630	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428220232
1508	NC_019702	GCC	2	6	99690	99695	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428220232
1509	NC_019702	GA	3	6	99730	99735	50 %	0 %	50 %	0 %	428220232
1510	NC_019702	TTG	2	6	99776	99781	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428220232
1511	NC_019702	TAA	2	6	99823	99828	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428220232
1512	NC_019702	G	6	6	99938	99943	0 %	0 %	100 %	0 %	428220232
1513	NC_019702	TACC	2	8	100054	100061	25 %	25 %	0 %	50 %	428220232
1514	NC_019702	GCC	2	6	100084	100089	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428220232
1515	NC_019702	A	6	6	100118	100123	100 %	0 %	0 %	0 %	428220232
1516	NC_019702	GAC	2	6	100154	100159	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428220232
1517	NC_019702	TGG	2	6	100166	100171	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428220232
1518	NC_019702	CA	3	6	100195	100200	50 %	0 %	0 %	50 %	428220232
1519	NC_019702	AGA	2	6	100295	100300	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428220232
1520	NC_019702	T	6	6	100301	100306	0 %	100 %	0 %	0 %	428220232
1521	NC_019702	CTT	2	6	100478	100483	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428220233
1522	NC_019702	AAG	2	6	100542	100547	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428220233
1523	NC_019702	GCG	2	6	100581	100586	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428220233
1524	NC_019702	AGC	3	9	100604	100612	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428220233
1525	NC_019702	TCCT	2	8	100816	100823	0 %	50 %	0 %	50 %	428220233
1526	NC_019702	CAG	3	9	100831	100839	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428220233
1527	NC_019702	GAT	2	6	100865	100870	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428220233
1528	NC_019702	TGC	2	6	100946	100951	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428220233
1529	NC_019702	TTA	2	6	100962	100967	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428220233
1530	NC_019702	GC	3	6	100977	100982	0 %	0 %	50 %	50 %	428220233
1531	NC_019702	TTC	2	6	101007	101012	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428220233
1532	NC_019702	ACGAG	2	10	101058	101067	40 %	0 %	40 %	20 %	428220233
1533	NC_019702	GGT	2	6	101133	101138	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428220233
1534	NC_019702	TGG	2	6	101149	101154	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428220233
1535	NC_019702	CCGC	2	8	101178	101185	0 %	0 %	25 %	75 %	428220233
1536	NC_019702	CCA	2	6	101256	101261	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428220233
1537	NC_019702	TTTGCC	2	12	101265	101276	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	428220233
1538	NC_019702	GA	3	6	101439	101444	50 %	0 %	50 %	0 %	428220233
1539	NC_019702	ACC	2	6	101462	101467	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428220233
1540	NC_019702	AAT	2	6	101576	101581	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428220233
1541	NC_019702	TAG	2	6	101626	101631	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428220233
1542	NC_019702	TGC	2	6	101660	101665	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428220233
1543	NC_019702	GCT	2	6	101670	101675	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428220233
1544	NC_019702	CAG	2	6	101698	101703	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428220233
1545	NC_019702	CGA	2	6	101718	101723	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428220233
1546	NC_019702	TCAA	2	8	101864	101871	50 %	25 %	0 %	25 %	428220234
1547	NC_019702	CAC	2	6	101881	101886	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428220234
1548	NC_019702	T	6	6	101910	101915	0 %	100 %	0 %	0 %	428220234
1549	NC_019702	C	6	6	101957	101962	0 %	0 %	0 %	100 %	428220234
1550	NC_019702	CGGGG	2	10	102084	102093	0 %	0 %	80 %	20 %	428220234
1551	NC_019702	AAT	2	6	102151	102156	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428220234
1552	NC_019702	AAT	3	9	102286	102294	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428220234
1553	NC_019702	AGA	2	6	102491	102496	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428220234
1554	NC_019702	TCA	2	6	102548	102553	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428220234
1555	NC_019702	CA	3	6	102627	102632	50 %	0 %	0 %	50 %	428220234
1556	NC_019702	CAC	2	6	102637	102642	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428220234
1557	NC_019702	GAA	2	6	102700	102705	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428220234
1558	NC_019702	GTT	2	6	102874	102879	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428220234
1559	NC_019702	ATCA	2	8	102919	102926	50 %	25 %	0 %	25 %	428220234
1560	NC_019702	ATTC	2	8	102927	102934	25 %	50 %	0 %	25 %	428220234
1561	NC_019702	CTG	2	6	103114	103119	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428220234
1562	NC_019702	ACT	2	6	103121	103126	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428220234
1563	NC_019702	GCA	2	6	103182	103187	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428220234
1564	NC_019702	ATC	2	6	103249	103254	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428220234
1565	NC_019702	CTT	2	6	103263	103268	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428220234
1566	NC_019702	CCAA	2	8	103270	103277	50 %	0 %	0 %	50 %	428220234
1567	NC_019702	GAAA	2	8	103648	103655	75 %	0 %	25 %	0 %	428220235
1568	NC_019702	TGG	2	6	103737	103742	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428220235
1569	NC_019702	CTA	2	6	103777	103782	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428220235
1570	NC_019702	AAAG	2	8	103802	103809	75 %	0 %	25 %	0 %	428220235
1571	NC_019702	AAAC	2	8	103847	103854	75 %	0 %	0 %	25 %	428220235
1572	NC_019702	CAT	2	6	103921	103926	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428220236
1573	NC_019702	TGG	2	6	103942	103947	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428220236
1574	NC_019702	GAA	2	6	104018	104023	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428220236
1575	NC_019702	TGA	2	6	104044	104049	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428220236
1576	NC_019702	TGTA	2	8	104104	104111	25 %	50 %	25 %	0 %	428220236
1577	NC_019702	ATT	2	6	104126	104131	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428220236
1578	NC_019702	GCG	2	6	104141	104146	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428220236
1579	NC_019702	CTC	2	6	104151	104156	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428220236
1580	NC_019702	ATT	2	6	104174	104179	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428220236
1581	NC_019702	CGG	2	6	104245	104250	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428220236
1582	NC_019702	GTC	2	6	104313	104318	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428220236
1583	NC_019702	ACC	2	6	104342	104347	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428220236
1584	NC_019702	AAG	2	6	104352	104357	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428220236
1585	NC_019702	CAGT	2	8	104384	104391	25 %	25 %	25 %	25 %	428220236
1586	NC_019702	TCGG	2	8	104431	104438	0 %	25 %	50 %	25 %	428220236
1587	NC_019702	G	6	6	104572	104577	0 %	0 %	100 %	0 %	428220236
1588	NC_019702	TTA	2	6	104627	104632	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428220236
1589	NC_019702	CCA	2	6	104674	104679	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428220236
1590	NC_019702	A	6	6	104689	104694	100 %	0 %	0 %	0 %	428220236
1591	NC_019702	GCA	2	6	104728	104733	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428220236
1592	NC_019702	ATTTAT	2	12	104742	104753	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428220236
1593	NC_019702	ATT	2	6	104789	104794	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428220237
1594	NC_019702	AAG	2	6	104940	104945	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428220237
1595	NC_019702	TGGGAT	2	12	105034	105045	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	428220238
1596	NC_019702	CGC	2	6	105056	105061	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428220238
1597	NC_019702	CTA	2	6	105072	105077	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428220238
1598	NC_019702	TTTA	2	8	105103	105110	25 %	75 %	0 %	0 %	428220238
1599	NC_019702	TA	3	6	105126	105131	50 %	50 %	0 %	0 %	428220238
1600	NC_019702	CAAT	2	8	105207	105214	50 %	25 %	0 %	25 %	428220238
1601	NC_019702	AGC	3	9	105293	105301	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428220238
1602	NC_019702	ATT	2	6	105303	105308	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428220238
1603	NC_019702	GTACA	2	10	105388	105397	40 %	20 %	20 %	20 %	428220238
1604	NC_019702	TCC	2	6	105527	105532	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428220238
1605	NC_019702	AT	3	6	105548	105553	50 %	50 %	0 %	0 %	428220238
1606	NC_019702	TC	3	6	105559	105564	0 %	50 %	0 %	50 %	428220238
1607	NC_019702	TGT	2	6	105579	105584	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428220238
1608	NC_019702	GAC	2	6	105703	105708	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428220238
1609	NC_019702	TACT	2	8	105991	105998	25 %	50 %	0 %	25 %	428220239
1610	NC_019702	GAT	3	9	106040	106048	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428220239
1611	NC_019702	ATT	2	6	106067	106072	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428220239
1612	NC_019702	GCCA	2	8	106126	106133	25 %	0 %	25 %	50 %	428220239
1613	NC_019702	TAA	2	6	106162	106167	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428220239
1614	NC_019702	TGATC	2	10	106179	106188	20 %	40 %	20 %	20 %	428220239
1615	NC_019702	ATCC	2	8	106199	106206	25 %	25 %	0 %	50 %	428220239
1616	NC_019702	TTTC	2	8	106208	106215	0 %	75 %	0 %	25 %	428220239
1617	NC_019702	ACT	2	6	106253	106258	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428220239
1618	NC_019702	TAA	2	6	106287	106292	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428220239
1619	NC_019702	AAT	2	6	106307	106312	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428220239
1620	NC_019702	TA	3	6	106339	106344	50 %	50 %	0 %	0 %	428220239
1621	NC_019702	AATAA	2	10	106353	106362	80 %	20 %	0 %	0 %	428220239
1622	NC_019702	AGCC	2	8	106365	106372	25 %	0 %	25 %	50 %	428220239
1623	NC_019702	ATTA	2	8	106396	106403	50 %	50 %	0 %	0 %	428220239
1624	NC_019702	TA	4	8	106441	106448	50 %	50 %	0 %	0 %	428220239
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1736	NC_019702	ATGCC	2	10	112325	112334	20 %	20 %	20 %	40 %	428220245
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1739	NC_019702	TAT	2	6	112445	112450	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428220245
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1741	NC_019702	AAG	2	6	112655	112660	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428220245
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1747	NC_019702	CCT	2	6	112913	112918	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428220246
1748	NC_019702	ATA	2	6	112956	112961	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428220246
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1750	NC_019702	CCT	2	6	113098	113103	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428220246
1751	NC_019702	T	6	6	113182	113187	0 %	100 %	0 %	0 %	428220246
1752	NC_019702	ACC	2	6	113193	113198	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428220246
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1761	NC_019702	CCT	2	6	114187	114192	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428220247
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1769	NC_019702	TGG	2	6	114538	114543	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428220247
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1788	NC_019702	T	6	6	115183	115188	0 %	100 %	0 %	0 %	428220248
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1857	NC_019702	CTA	2	6	119586	119591	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428220255
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1859	NC_019702	T	6	6	119878	119883	0 %	100 %	0 %	0 %	428220255
1860	NC_019702	CCCA	2	8	119910	119917	25 %	0 %	0 %	75 %	428220255
1861	NC_019702	ATC	2	6	119944	119949	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428220255
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1864	NC_019702	TCCA	2	8	120056	120063	25 %	25 %	0 %	50 %	428220255
1865	NC_019702	CCAA	2	8	120090	120097	50 %	0 %	0 %	50 %	428220255
1866	NC_019702	CAG	2	6	120192	120197	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428220255
1867	NC_019702	AGC	2	6	120511	120516	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428220256
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1869	NC_019702	TTA	2	6	120599	120604	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428220256
1870	NC_019702	TTAGG	2	10	120660	120669	20 %	40 %	40 %	0 %	428220256
1871	NC_019702	T	6	6	121622	121627	0 %	100 %	0 %	0 %	428220257
1872	NC_019702	CCTTG	2	10	121654	121663	0 %	40 %	20 %	40 %	428220257
1873	NC_019702	TTA	2	6	121704	121709	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428220257
1874	NC_019702	GCA	2	6	121751	121756	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428220257
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1877	NC_019702	TGA	2	6	121891	121896	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428220257
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1989	NC_019702	T	7	7	129670	129676	0 %	100 %	0 %	0 %	428220266
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1991	NC_019702	CTA	2	6	129703	129708	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428220266
1992	NC_019702	AACT	2	8	129743	129750	50 %	25 %	0 %	25 %	428220266
1993	NC_019702	CGTC	2	8	129892	129899	0 %	25 %	25 %	50 %	428220266
1994	NC_019702	T	7	7	129952	129958	0 %	100 %	0 %	0 %	428220266
1995	NC_019702	TA	3	6	129974	129979	50 %	50 %	0 %	0 %	428220266
1996	NC_019702	A	6	6	130119	130124	100 %	0 %	0 %	0 %	428220266
1997	NC_019702	TTA	2	6	130828	130833	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428220267
1998	NC_019702	T	6	6	130920	130925	0 %	100 %	0 %	0 %	428220267
1999	NC_019702	ACAAAA	2	12	130947	130958	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	428220267
2000	NC_019702	TGA	2	6	130989	130994	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428220267

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