MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Synechococcus sp. PCC 7502 chromosome

Total Repeats: 50837

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_019702	AATT	2	8	394672	394679	50 %	50 %	0 %	0 %	428220514
6002	NC_019702	CAC	2	6	394680	394685	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428220514
6003	NC_019702	GCA	2	6	394727	394732	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428220514
6004	NC_019702	AGT	2	6	394742	394747	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428220514
6005	NC_019702	GACC	2	8	394836	394843	25 %	0 %	25 %	50 %	428220514
6006	NC_019702	AGA	2	6	394855	394860	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428220514
6007	NC_019702	ATA	2	6	395042	395047	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428220514
6008	NC_019702	CAC	2	6	395064	395069	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428220514
6009	NC_019702	TGA	2	6	395184	395189	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428220514
6010	NC_019702	ATCG	2	8	395459	395466	25 %	25 %	25 %	25 %	428220515
6011	NC_019702	AAC	2	6	395560	395565	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428220515
6012	NC_019702	CTC	2	6	395582	395587	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428220515
6013	NC_019702	AGC	2	6	395775	395780	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428220515
6014	NC_019702	T	7	7	395782	395788	0 %	100 %	0 %	0 %	428220515
6015	NC_019702	AGT	2	6	395833	395838	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428220515
6016	NC_019702	CATT	2	8	395929	395936	25 %	50 %	0 %	25 %	428220515
6017	NC_019702	TTA	2	6	395978	395983	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428220515
6018	NC_019702	TGAT	2	8	395994	396001	25 %	50 %	25 %	0 %	428220515
6019	NC_019702	TGT	2	6	396054	396059	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428220515
6020	NC_019702	AACCC	2	10	396233	396242	40 %	0 %	0 %	60 %	428220515
6021	NC_019702	TGG	2	6	396370	396375	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428220515
6022	NC_019702	TGAT	2	8	396393	396400	25 %	50 %	25 %	0 %	428220515
6023	NC_019702	TGGCAG	2	12	396414	396425	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	428220515
6024	NC_019702	GCA	2	6	396461	396466	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428220515
6025	NC_019702	AAAG	2	8	396479	396486	75 %	0 %	25 %	0 %	428220515
6026	NC_019702	TTACCG	2	12	396495	396506	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	428220515
6027	NC_019702	TGA	2	6	396607	396612	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428220515
6028	NC_019702	CGC	2	6	396640	396645	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428220515
6029	NC_019702	TGG	2	6	396789	396794	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428220516
6030	NC_019702	TAC	2	6	396819	396824	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428220516
6031	NC_019702	GCA	2	6	396863	396868	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428220516
6032	NC_019702	T	7	7	396911	396917	0 %	100 %	0 %	0 %	428220516
6033	NC_019702	CCA	2	6	396923	396928	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428220516
6034	NC_019702	GGC	2	6	396958	396963	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428220516
6035	NC_019702	GGC	2	6	397029	397034	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428220516
6036	NC_019702	TG	3	6	397149	397154	0 %	50 %	50 %	0 %	428220516
6037	NC_019702	AAGCC	2	10	397165	397174	40 %	0 %	20 %	40 %	428220516
6038	NC_019702	AGC	2	6	397185	397190	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428220516
6039	NC_019702	CCA	2	6	397198	397203	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428220516
6040	NC_019702	AGGT	2	8	397207	397214	25 %	25 %	50 %	0 %	428220516
6041	NC_019702	TTA	2	6	397216	397221	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428220516
6042	NC_019702	A	6	6	397234	397239	100 %	0 %	0 %	0 %	428220516
6043	NC_019702	CTAG	2	8	397285	397292	25 %	25 %	25 %	25 %	428220516
6044	NC_019702	AGA	2	6	397318	397323	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428220516
6045	NC_019702	GCA	2	6	397373	397378	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428220516
6046	NC_019702	CTT	2	6	397457	397462	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428220516
6047	NC_019702	GGT	2	6	397464	397469	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428220516
6048	NC_019702	GTA	2	6	397707	397712	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428220517
6049	NC_019702	GAT	2	6	397808	397813	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428220517
6050	NC_019702	AGA	3	9	397854	397862	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428220517
6051	NC_019702	TGT	2	6	397956	397961	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428220517
6052	NC_019702	AT	3	6	397979	397984	50 %	50 %	0 %	0 %	428220517
6053	NC_019702	CAT	2	6	398003	398008	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428220517
6054	NC_019702	TTA	2	6	398011	398016	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428220517
6055	NC_019702	AT	3	6	398143	398148	50 %	50 %	0 %	0 %	428220517
6056	NC_019702	T	6	6	398463	398468	0 %	100 %	0 %	0 %	428220518
6057	NC_019702	TAA	2	6	398488	398493	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428220518
6058	NC_019702	AAG	2	6	398510	398515	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428220518
6059	NC_019702	ACCA	2	8	398548	398555	50 %	0 %	0 %	50 %	428220518
6060	NC_019702	ACTTC	2	10	398673	398682	20 %	40 %	0 %	40 %	428220519
6061	NC_019702	CTT	2	6	398710	398715	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428220519
6062	NC_019702	CTC	2	6	398799	398804	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428220519
6063	NC_019702	CGG	2	6	398883	398888	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428220519
6064	NC_019702	GATC	2	8	398895	398902	25 %	25 %	25 %	25 %	428220519
6065	NC_019702	AGGA	2	8	398913	398920	50 %	0 %	50 %	0 %	428220519
6066	NC_019702	CGG	2	6	398940	398945	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428220519
6067	NC_019702	AT	3	6	399047	399052	50 %	50 %	0 %	0 %	428220519
6068	NC_019702	AATTTT	2	12	399119	399130	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428220520
6069	NC_019702	AAT	2	6	399285	399290	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428220520
6070	NC_019702	CTA	2	6	399298	399303	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428220520
6071	NC_019702	CAA	2	6	399410	399415	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428220520
6072	NC_019702	TGG	2	6	399563	399568	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428220520
6073	NC_019702	CGC	2	6	399662	399667	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428220520
6074	NC_019702	AAC	2	6	399714	399719	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428220520
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6078	NC_019702	CAA	2	6	400120	400125	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428220520
6079	NC_019702	TA	3	6	400169	400174	50 %	50 %	0 %	0 %	428220520
6080	NC_019702	GAT	2	6	400268	400273	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428220520
6081	NC_019702	TGC	3	9	400496	400504	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428220521
6082	NC_019702	AAT	2	6	400518	400523	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428220521
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6089	NC_019702	CCGC	2	8	401091	401098	0 %	0 %	25 %	75 %	428220521
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6092	NC_019702	ATTA	2	8	401616	401623	50 %	50 %	0 %	0 %	428220522
6093	NC_019702	CAT	3	9	401634	401642	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428220522
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6097	NC_019702	TG	3	6	401696	401701	0 %	50 %	50 %	0 %	428220522
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6101	NC_019702	A	6	6	401764	401769	100 %	0 %	0 %	0 %	428220522
6102	NC_019702	GCT	2	6	401784	401789	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428220522
6103	NC_019702	GAG	2	6	401796	401801	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428220522
6104	NC_019702	ACA	2	6	401828	401833	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428220522
6105	NC_019702	CAAG	2	8	401850	401857	50 %	0 %	25 %	25 %	428220522
6106	NC_019702	GGA	2	6	401859	401864	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428220522
6107	NC_019702	CTAT	2	8	401899	401906	25 %	50 %	0 %	25 %	428220522
6108	NC_019702	CAAG	2	8	401973	401980	50 %	0 %	25 %	25 %	428220522
6109	NC_019702	CTT	2	6	402007	402012	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428220522
6110	NC_019702	TTC	2	6	402040	402045	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428220522
6111	NC_019702	TCT	2	6	402159	402164	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428220522
6112	NC_019702	TGC	2	6	402233	402238	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428220523
6113	NC_019702	ATTG	2	8	402331	402338	25 %	50 %	25 %	0 %	428220523
6114	NC_019702	TGG	2	6	402356	402361	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428220523
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6118	NC_019702	TGTT	2	8	402641	402648	0 %	75 %	25 %	0 %	428220523
6119	NC_019702	ATA	2	6	402687	402692	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428220523
6120	NC_019702	TAA	2	6	402715	402720	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428220523
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6122	NC_019702	GCAGT	2	10	402774	402783	20 %	20 %	40 %	20 %	428220523
6123	NC_019702	GCA	2	6	402828	402833	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428220523
6124	NC_019702	CCTG	2	8	402870	402877	0 %	25 %	25 %	50 %	428220523
6125	NC_019702	CATCGG	2	12	402961	402972	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	428220523
6126	NC_019702	AGT	2	6	403012	403017	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428220523
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6132	NC_019702	CTTG	2	8	403578	403585	0 %	50 %	25 %	25 %	428220524
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6153	NC_019702	AAGT	2	8	405446	405453	50 %	25 %	25 %	0 %	428220527
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6241	NC_019702	ATT	2	6	411617	411622	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428220530
6242	NC_019702	ATCT	2	8	411623	411630	25 %	50 %	0 %	25 %	428220530
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6490	NC_019702	TGGG	2	8	431915	431922	0 %	25 %	75 %	0 %	428220550
6491	NC_019702	CTG	2	6	432001	432006	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428220550
6492	NC_019702	CCT	2	6	432113	432118	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428220550
6493	NC_019702	GAG	2	6	432130	432135	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428220550
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6495	NC_019702	AGC	2	6	432272	432277	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428220550
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