MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Synechococcus sp. PCC 7502 chromosome

Total Repeats: 50837

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_019702	AGCC	2	8	328053	328060	25 %	0 %	25 %	50 %	428220447
5002	NC_019702	ACCAA	2	10	328175	328184	60 %	0 %	0 %	40 %	428220447
5003	NC_019702	GAA	2	6	328193	328198	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428220447
5004	NC_019702	ATT	2	6	328419	328424	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428220447
5005	NC_019702	GGT	2	6	328426	328431	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428220447
5006	NC_019702	CTC	2	6	328473	328478	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428220447
5007	NC_019702	ATTT	2	8	328506	328513	25 %	75 %	0 %	0 %	428220447
5008	NC_019702	TGG	3	9	328520	328528	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428220447
5009	NC_019702	GTC	2	6	328560	328565	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428220447
5010	NC_019702	ATT	2	6	328699	328704	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428220447
5011	NC_019702	CTG	2	6	328706	328711	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428220447
5012	NC_019702	GAA	2	6	328724	328729	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428220447
5013	NC_019702	TGC	2	6	328770	328775	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428220447
5014	NC_019702	ATTA	2	8	328777	328784	50 %	50 %	0 %	0 %	428220447
5015	NC_019702	CGG	2	6	328785	328790	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428220447
5016	NC_019702	CGG	2	6	328820	328825	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428220447
5017	NC_019702	TGG	2	6	328852	328857	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428220447
5018	NC_019702	ATCA	2	8	328882	328889	50 %	25 %	0 %	25 %	428220447
5019	NC_019702	TAC	2	6	328930	328935	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428220447
5020	NC_019702	TG	3	6	329036	329041	0 %	50 %	50 %	0 %	428220447
5021	NC_019702	TATG	2	8	329043	329050	25 %	50 %	25 %	0 %	428220447
5022	NC_019702	TTACTG	2	12	329156	329167	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	428220447
5023	NC_019702	GAG	2	6	329172	329177	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428220447
5024	NC_019702	GATA	2	8	329230	329237	50 %	25 %	25 %	0 %	428220447
5025	NC_019702	GGC	2	6	329447	329452	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428220447
5026	NC_019702	AAG	2	6	329484	329489	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428220447
5027	NC_019702	ATGG	2	8	329528	329535	25 %	25 %	50 %	0 %	428220447
5028	NC_019702	A	6	6	329634	329639	100 %	0 %	0 %	0 %	428220447
5029	NC_019702	AATCC	2	10	330050	330059	40 %	20 %	0 %	40 %	428220448
5030	NC_019702	GGT	2	6	330072	330077	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428220448
5031	NC_019702	ACT	2	6	330116	330121	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428220448
5032	NC_019702	T	6	6	330129	330134	0 %	100 %	0 %	0 %	428220448
5033	NC_019702	TTTA	2	8	330152	330159	25 %	75 %	0 %	0 %	428220448
5034	NC_019702	TA	3	6	330252	330257	50 %	50 %	0 %	0 %	428220448
5035	NC_019702	A	6	6	330264	330269	100 %	0 %	0 %	0 %	428220448
5036	NC_019702	AGA	2	6	330293	330298	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428220448
5037	NC_019702	T	7	7	330305	330311	0 %	100 %	0 %	0 %	428220448
5038	NC_019702	A	7	7	330360	330366	100 %	0 %	0 %	0 %	428220448
5039	NC_019702	T	7	7	330449	330455	0 %	100 %	0 %	0 %	428220448
5040	NC_019702	TGG	2	6	330470	330475	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428220448
5041	NC_019702	T	6	6	330512	330517	0 %	100 %	0 %	0 %	428220448
5042	NC_019702	CTA	2	6	330549	330554	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428220448
5043	NC_019702	ATT	2	6	330576	330581	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428220448
5044	NC_019702	A	6	6	330627	330632	100 %	0 %	0 %	0 %	428220448
5045	NC_019702	TGA	2	6	330768	330773	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428220449
5046	NC_019702	CAT	2	6	330895	330900	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428220449
5047	NC_019702	ATT	2	6	330914	330919	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428220449
5048	NC_019702	GTA	2	6	330932	330937	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428220449
5049	NC_019702	A	6	6	330945	330950	100 %	0 %	0 %	0 %	428220449
5050	NC_019702	GGA	2	6	331053	331058	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428220449
5051	NC_019702	GCTG	2	8	331176	331183	0 %	25 %	50 %	25 %	428220449
5052	NC_019702	TTTA	2	8	331208	331215	25 %	75 %	0 %	0 %	428220449
5053	NC_019702	TTA	2	6	331340	331345	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428220450
5054	NC_019702	AAG	2	6	331404	331409	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428220450
5055	NC_019702	CTAGTT	2	12	331831	331842	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	428220451
5056	NC_019702	GCA	2	6	331916	331921	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428220451
5057	NC_019702	A	6	6	331970	331975	100 %	0 %	0 %	0 %	428220451
5058	NC_019702	GAT	2	6	331996	332001	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428220451
5059	NC_019702	TAA	2	6	332020	332025	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428220451
5060	NC_019702	TCTT	2	8	332030	332037	0 %	75 %	0 %	25 %	428220451
5061	NC_019702	TAA	2	6	332096	332101	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428220451
5062	NC_019702	GCA	2	6	332118	332123	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428220451
5063	NC_019702	CAC	2	6	332257	332262	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428220451
5064	NC_019702	CTT	2	6	332359	332364	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428220451
5065	NC_019702	AAT	2	6	332392	332397	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428220451
5066	NC_019702	GCA	2	6	332445	332450	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428220451
5067	NC_019702	TTC	2	6	332480	332485	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428220451
5068	NC_019702	AAT	2	6	332540	332545	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428220451
5069	NC_019702	ATC	2	6	332754	332759	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428220452
5070	NC_019702	AAT	2	6	332812	332817	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428220452
5071	NC_019702	TTA	2	6	332831	332836	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428220452
5072	NC_019702	GTG	2	6	333023	333028	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428220452
5073	NC_019702	GTC	2	6	333062	333067	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428220452
5074	NC_019702	TAA	2	6	333204	333209	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428220452
5075	NC_019702	TTA	2	6	333322	333327	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428220452
5076	NC_019702	AGT	2	6	333352	333357	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428220452
5077	NC_019702	ATG	2	6	333365	333370	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428220452
5078	NC_019702	G	6	6	333406	333411	0 %	0 %	100 %	0 %	428220452
5079	NC_019702	GTT	2	6	333468	333473	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428220452
5080	NC_019702	T	6	6	333540	333545	0 %	100 %	0 %	0 %	428220453
5081	NC_019702	CTC	2	6	333636	333641	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428220453
5082	NC_019702	ACT	2	6	333685	333690	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428220453
5083	NC_019702	GTAA	2	8	333718	333725	50 %	25 %	25 %	0 %	428220453
5084	NC_019702	ATC	2	6	333739	333744	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428220453
5085	NC_019702	AGA	2	6	333750	333755	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428220453
5086	NC_019702	CCG	2	6	333774	333779	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428220453
5087	NC_019702	TAAT	2	8	333831	333838	50 %	50 %	0 %	0 %	428220453
5088	NC_019702	CTG	2	6	333876	333881	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428220453
5089	NC_019702	CGC	2	6	334027	334032	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428220453
5090	NC_019702	AGC	3	9	334039	334047	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428220453
5091	NC_019702	A	6	6	334077	334082	100 %	0 %	0 %	0 %	428220453
5092	NC_019702	GCAGTC	2	12	334085	334096	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	428220453
5093	NC_019702	GTG	2	6	334196	334201	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428220453
5094	NC_019702	A	6	6	334217	334222	100 %	0 %	0 %	0 %	428220453
5095	NC_019702	GGT	2	6	334274	334279	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428220453
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5097	NC_019702	T	6	6	334362	334367	0 %	100 %	0 %	0 %	428220453
5098	NC_019702	CTT	2	6	334374	334379	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428220453
5099	NC_019702	GCTGG	2	10	334464	334473	0 %	20 %	60 %	20 %	428220453
5100	NC_019702	AGA	2	6	334484	334489	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428220453
5101	NC_019702	TG	3	6	334492	334497	0 %	50 %	50 %	0 %	428220453
5102	NC_019702	GCT	2	6	334499	334504	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428220453
5103	NC_019702	GCT	2	6	334514	334519	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428220453
5104	NC_019702	CAA	2	6	334548	334553	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428220453
5105	NC_019702	CTG	2	6	334645	334650	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428220453
5106	NC_019702	GTA	2	6	334667	334672	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428220453
5107	NC_019702	CAT	2	6	334689	334694	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428220453
5108	NC_019702	AAC	2	6	334762	334767	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428220453
5109	NC_019702	TCA	2	6	334785	334790	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428220453
5110	NC_019702	T	6	6	334817	334822	0 %	100 %	0 %	0 %	428220453
5111	NC_019702	GGGT	2	8	335272	335279	0 %	25 %	75 %	0 %	428220454
5112	NC_019702	TCA	2	6	335361	335366	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428220454
5113	NC_019702	AT	3	6	335385	335390	50 %	50 %	0 %	0 %	428220454
5114	NC_019702	A	6	6	335438	335443	100 %	0 %	0 %	0 %	428220454
5115	NC_019702	CCG	2	6	335498	335503	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428220454
5116	NC_019702	TCT	2	6	335529	335534	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428220454
5117	NC_019702	TTAA	2	8	335556	335563	50 %	50 %	0 %	0 %	428220454
5118	NC_019702	CTGC	2	8	335599	335606	0 %	25 %	25 %	50 %	428220454
5119	NC_019702	ATA	2	6	335607	335612	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428220454
5120	NC_019702	CCA	2	6	335652	335657	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428220454
5121	NC_019702	AGTT	2	8	335933	335940	25 %	50 %	25 %	0 %	428220454
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5123	NC_019702	TTC	2	6	336257	336262	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428220455
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5246	NC_019702	CTGCC	2	10	345608	345617	0 %	20 %	20 %	60 %	428220465
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5350	NC_019702	GGGT	2	8	352933	352940	0 %	25 %	75 %	0 %	428220472
5351	NC_019702	TGG	2	6	352957	352962	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428220472
5352	NC_019702	CTG	2	6	352992	352997	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428220472
5353	NC_019702	CTA	2	6	353106	353111	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428220472
5354	NC_019702	A	6	6	353114	353119	100 %	0 %	0 %	0 %	428220472
5355	NC_019702	TGC	2	6	353161	353166	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428220472
5356	NC_019702	ATTT	2	8	353297	353304	25 %	75 %	0 %	0 %	428220472
5357	NC_019702	GTT	2	6	353626	353631	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428220473
5358	NC_019702	T	6	6	353644	353649	0 %	100 %	0 %	0 %	428220473
5359	NC_019702	GTG	2	6	353693	353698	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428220473
5360	NC_019702	AGC	2	6	353748	353753	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428220473
5361	NC_019702	CTAG	2	8	353774	353781	25 %	25 %	25 %	25 %	428220473
5362	NC_019702	CCG	2	6	353808	353813	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428220473
5363	NC_019702	AAC	2	6	353998	354003	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428220473
5364	NC_019702	GAA	2	6	354011	354016	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428220473
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5366	NC_019702	ACCCTA	3	18	354083	354100	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	428220473
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5489	NC_019702	TTA	2	6	360155	360160	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428220478
5490	NC_019702	ATCG	2	8	360480	360487	25 %	25 %	25 %	25 %	428220479
5491	NC_019702	TAC	2	6	360528	360533	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428220479
5492	NC_019702	ATT	2	6	360627	360632	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428220479
5493	NC_019702	GT	3	6	360642	360647	0 %	50 %	50 %	0 %	428220479
5494	NC_019702	ATC	2	6	360854	360859	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428220479
5495	NC_019702	TCA	2	6	360867	360872	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428220479
5496	NC_019702	AGT	2	6	360933	360938	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428220479
5497	NC_019702	GCA	2	6	360957	360962	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428220479
5498	NC_019702	ATGG	2	8	361077	361084	25 %	25 %	50 %	0 %	428220479
5499	NC_019702	TCA	2	6	361305	361310	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428220479
5500	NC_019702	TGAT	2	8	361334	361341	25 %	50 %	25 %	0 %	428220479

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