MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Synechococcus sp. PCC 7502 plasmid pSYN7502.01

Total Repeats: 127

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019691	TCAT	2	8	1634	1641	25 %	50 %	0 %	25 %	428223390
2	NC_019691	AGGT	2	8	1987	1994	25 %	25 %	50 %	0 %	428223391
3	NC_019691	TTAA	2	8	2022	2029	50 %	50 %	0 %	0 %	428223391
4	NC_019691	GCTA	2	8	2751	2758	25 %	25 %	25 %	25 %	428223393
5	NC_019691	GATC	2	8	2973	2980	25 %	25 %	25 %	25 %	428223393
6	NC_019691	AATC	2	8	3096	3103	50 %	25 %	0 %	25 %	428223393
7	NC_019691	TAGT	2	8	3110	3117	25 %	50 %	25 %	0 %	428223393
8	NC_019691	TAAA	2	8	3453	3460	75 %	25 %	0 %	0 %	428223393
9	NC_019691	GAAT	2	8	4197	4204	50 %	25 %	25 %	0 %	428223393
10	NC_019691	TTGG	2	8	4409	4416	0 %	50 %	50 %	0 %	428223393
11	NC_019691	AAAT	2	8	4448	4455	75 %	25 %	0 %	0 %	428223393
12	NC_019691	ACTT	2	8	4750	4757	25 %	50 %	0 %	25 %	428223393
13	NC_019691	TAGC	2	8	5018	5025	25 %	25 %	25 %	25 %	428223393
14	NC_019691	CCAC	2	8	5510	5517	25 %	0 %	0 %	75 %	428223393
15	NC_019691	TAAC	2	8	5741	5748	50 %	25 %	0 %	25 %	428223393
16	NC_019691	CTGA	2	8	6733	6740	25 %	25 %	25 %	25 %	428223394
17	NC_019691	ATTT	2	8	6811	6818	25 %	75 %	0 %	0 %	428223394
18	NC_019691	AACT	2	8	7060	7067	50 %	25 %	0 %	25 %	428223394
19	NC_019691	TGAG	2	8	7838	7845	25 %	25 %	50 %	0 %	428223394
20	NC_019691	AGGT	2	8	8238	8245	25 %	25 %	50 %	0 %	428223395
21	NC_019691	CTAG	2	8	8442	8449	25 %	25 %	25 %	25 %	428223395
22	NC_019691	TTGA	2	8	8684	8691	25 %	50 %	25 %	0 %	428223395
23	NC_019691	CGAT	2	8	9441	9448	25 %	25 %	25 %	25 %	428223395
24	NC_019691	GGTA	2	8	9699	9706	25 %	25 %	50 %	0 %	428223395
25	NC_019691	GGCG	2	8	10321	10328	0 %	0 %	75 %	25 %	428223395
26	NC_019691	GCTT	2	8	12694	12701	0 %	50 %	25 %	25 %	428223398
27	NC_019691	GTAA	2	8	12783	12790	50 %	25 %	25 %	0 %	428223398
28	NC_019691	CAGC	2	8	12916	12923	25 %	0 %	25 %	50 %	428223398
29	NC_019691	ATCG	2	8	13250	13257	25 %	25 %	25 %	25 %	428223398
30	NC_019691	CAAC	2	8	13277	13284	50 %	0 %	0 %	50 %	428223398
31	NC_019691	AATT	2	8	13327	13334	50 %	50 %	0 %	0 %	428223398
32	NC_019691	TCGA	2	8	13370	13377	25 %	25 %	25 %	25 %	428223398
33	NC_019691	ACGC	2	8	13408	13415	25 %	0 %	25 %	50 %	428223398
34	NC_019691	GATC	2	8	13456	13463	25 %	25 %	25 %	25 %	428223398
35	NC_019691	CTGA	2	8	13515	13522	25 %	25 %	25 %	25 %	428223398
36	NC_019691	CGAT	2	8	13608	13615	25 %	25 %	25 %	25 %	428223398
37	NC_019691	TTTC	2	8	14749	14756	0 %	75 %	0 %	25 %	428223400
38	NC_019691	GGTG	2	8	14782	14789	0 %	25 %	75 %	0 %	428223400
39	NC_019691	ACTG	2	8	15136	15143	25 %	25 %	25 %	25 %	428223400
40	NC_019691	CAAT	2	8	15403	15410	50 %	25 %	0 %	25 %	428223401
41	NC_019691	TATT	2	8	17553	17560	25 %	75 %	0 %	0 %	428223402
42	NC_019691	ACTA	2	8	17862	17869	50 %	25 %	0 %	25 %	428223402
43	NC_019691	CTAC	2	8	18842	18849	25 %	25 %	0 %	50 %	428223403
44	NC_019691	GATA	2	8	22675	22682	50 %	25 %	25 %	0 %	428223405
45	NC_019691	AAAC	2	8	23101	23108	75 %	0 %	0 %	25 %	428223405
46	NC_019691	TCCC	2	8	23430	23437	0 %	25 %	0 %	75 %	428223406
47	NC_019691	TTCC	2	8	23539	23546	0 %	50 %	0 %	50 %	428223406
48	NC_019691	TTTC	2	8	23682	23689	0 %	75 %	0 %	25 %	428223406
49	NC_019691	CCAT	2	8	23831	23838	25 %	25 %	0 %	50 %	428223406
50	NC_019691	TCAA	2	8	23856	23863	50 %	25 %	0 %	25 %	428223406
51	NC_019691	ATTT	2	8	24052	24059	25 %	75 %	0 %	0 %	428223406
52	NC_019691	AGCT	2	8	25143	25150	25 %	25 %	25 %	25 %	428223409
53	NC_019691	TAGT	2	8	25608	25615	25 %	50 %	25 %	0 %	428223409
54	NC_019691	AGAA	2	8	26058	26065	75 %	0 %	25 %	0 %	428223409
55	NC_019691	CAAG	2	8	27678	27685	50 %	0 %	25 %	25 %	428223410
56	NC_019691	GGGT	2	8	28044	28051	0 %	25 %	75 %	0 %	428223410
57	NC_019691	TTAA	2	8	28477	28484	50 %	50 %	0 %	0 %	428223410
58	NC_019691	GTTT	2	8	28523	28530	0 %	75 %	25 %	0 %	428223410
59	NC_019691	CCTG	2	8	28546	28553	0 %	25 %	25 %	50 %	428223410
60	NC_019691	ATTA	2	8	30140	30147	50 %	50 %	0 %	0 %	428223411
61	NC_019691	AGCA	2	8	30252	30259	50 %	0 %	25 %	25 %	428223411
62	NC_019691	TTCA	2	8	30265	30272	25 %	50 %	0 %	25 %	428223411
63	NC_019691	ATTC	2	8	30300	30307	25 %	50 %	0 %	25 %	428223411
64	NC_019691	TAAA	2	8	30414	30421	75 %	25 %	0 %	0 %	428223412
65	NC_019691	TAAT	2	8	30767	30774	50 %	50 %	0 %	0 %	428223413
66	NC_019691	AAAT	2	8	30860	30867	75 %	25 %	0 %	0 %	428223413
67	NC_019691	ATGG	2	8	30925	30932	25 %	25 %	50 %	0 %	428223413
68	NC_019691	TCAA	2	8	31019	31026	50 %	25 %	0 %	25 %	428223413
69	NC_019691	CTTT	2	8	31029	31036	0 %	75 %	0 %	25 %	428223413
70	NC_019691	ACAA	2	8	33170	33177	75 %	0 %	0 %	25 %	428223415
71	NC_019691	AAAC	2	8	33623	33630	75 %	0 %	0 %	25 %	428223416
72	NC_019691	TGAT	2	8	34069	34076	25 %	50 %	25 %	0 %	428223418
73	NC_019691	TAAT	2	8	34936	34943	50 %	50 %	0 %	0 %	428223421
74	NC_019691	GTTG	2	8	35133	35140	0 %	50 %	50 %	0 %	428223421
75	NC_019691	ACTG	2	8	37250	37257	25 %	25 %	25 %	25 %	428223422
76	NC_019691	GAAG	2	8	37445	37452	50 %	0 %	50 %	0 %	428223422
77	NC_019691	GACT	2	8	37540	37547	25 %	25 %	25 %	25 %	428223422
78	NC_019691	ACCT	2	8	38078	38085	25 %	25 %	0 %	50 %	428223422
79	NC_019691	CCCG	2	8	38256	38263	0 %	0 %	25 %	75 %	428223422
80	NC_019691	CACC	2	8	38602	38609	25 %	0 %	0 %	75 %	428223423
81	NC_019691	AATT	2	8	38627	38634	50 %	50 %	0 %	0 %	428223423
82	NC_019691	ACAG	2	8	38863	38870	50 %	0 %	25 %	25 %	428223423
83	NC_019691	ATTG	2	8	39759	39766	25 %	50 %	25 %	0 %	428223424
84	NC_019691	CTGG	2	8	40059	40066	0 %	25 %	50 %	25 %	428223424
85	NC_019691	AGTT	2	8	40099	40106	25 %	50 %	25 %	0 %	428223424
86	NC_019691	AAAT	2	8	40149	40156	75 %	25 %	0 %	0 %	428223424
87	NC_019691	TTAA	2	8	41052	41059	50 %	50 %	0 %	0 %	428223426
88	NC_019691	ATCT	2	8	41263	41270	25 %	50 %	0 %	25 %	428223426
89	NC_019691	TCCT	2	8	41564	41571	0 %	50 %	0 %	50 %	428223426
90	NC_019691	AAGA	2	8	42839	42846	75 %	0 %	25 %	0 %	428223426
91	NC_019691	TTGC	2	8	42850	42857	0 %	50 %	25 %	25 %	428223426
92	NC_019691	TGGG	2	8	43245	43252	0 %	25 %	75 %	0 %	428223427
93	NC_019691	CTTG	2	8	43269	43276	0 %	50 %	25 %	25 %	428223427
94	NC_019691	TAAT	2	8	43620	43627	50 %	50 %	0 %	0 %	428223427
95	NC_019691	CCCA	2	8	44760	44767	25 %	0 %	0 %	75 %	428223428
96	NC_019691	CTAA	2	8	45754	45761	50 %	25 %	0 %	25 %	428223431
97	NC_019691	ATTA	2	8	46182	46189	50 %	50 %	0 %	0 %	428223431
98	NC_019691	CCCA	2	8	47124	47131	25 %	0 %	0 %	75 %	428223432
99	NC_019691	TCTT	2	8	47791	47798	0 %	75 %	0 %	25 %	428223433
100	NC_019691	AATT	2	8	48541	48548	50 %	50 %	0 %	0 %	428223433
101	NC_019691	ATTC	2	8	48706	48713	25 %	50 %	0 %	25 %	428223433
102	NC_019691	CCGA	2	8	48872	48879	25 %	0 %	25 %	50 %	428223433
103	NC_019691	CTGA	2	8	49524	49531	25 %	25 %	25 %	25 %	428223434
104	NC_019691	TGAT	2	8	49537	49544	25 %	50 %	25 %	0 %	428223434
105	NC_019691	AATT	2	8	50467	50474	50 %	50 %	0 %	0 %	428223436
106	NC_019691	ATTA	2	8	51311	51318	50 %	50 %	0 %	0 %	428223437
107	NC_019691	TAGC	2	8	51949	51956	25 %	25 %	25 %	25 %	428223437
108	NC_019691	AAAT	2	8	52012	52019	75 %	25 %	0 %	0 %	428223437
109	NC_019691	ACCA	2	8	52048	52055	50 %	0 %	0 %	50 %	428223437
110	NC_019691	ATTA	2	8	54037	54044	50 %	50 %	0 %	0 %	428223440
111	NC_019691	AAAT	2	8	54109	54116	75 %	25 %	0 %	0 %	428223440
112	NC_019691	CAAT	2	8	54347	54354	50 %	25 %	0 %	25 %	428223440
113	NC_019691	CCCG	2	8	54551	54558	0 %	0 %	25 %	75 %	428223440
114	NC_019691	CTTT	2	8	55754	55761	0 %	75 %	0 %	25 %	428223442
115	NC_019691	GGAC	2	8	55940	55947	25 %	0 %	50 %	25 %	428223442
116	NC_019691	TTTC	2	8	58067	58074	0 %	75 %	0 %	25 %	428223445
117	NC_019691	TAAC	2	8	59167	59174	50 %	25 %	0 %	25 %	428223446
118	NC_019691	GATG	2	8	59852	59859	25 %	25 %	50 %	0 %	428223446
119	NC_019691	TCAT	2	8	60187	60194	25 %	50 %	0 %	25 %	428223446
120	NC_019691	CAAA	2	8	60869	60876	75 %	0 %	0 %	25 %	428223446
121	NC_019691	AACC	2	8	61690	61697	50 %	0 %	0 %	50 %	428223446
122	NC_019691	ATGG	2	8	61908	61915	25 %	25 %	50 %	0 %	428223446
123	NC_019691	GGCA	2	8	62021	62028	25 %	0 %	50 %	25 %	428223446
124	NC_019691	CCTC	2	8	62226	62233	0 %	25 %	0 %	75 %	428223447
125	NC_019691	ATGG	2	8	62282	62289	25 %	25 %	50 %	0 %	428223447
126	NC_019691	ATCA	2	8	62694	62701	50 %	25 %	0 %	25 %	428223447
127	NC_019691	TATT	2	8	62832	62839	25 %	75 %	0 %	0 %	428223447

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.