MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Synechococcus sp. PCC 6312 chromosome

Total Repeats: 55484

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_019680	T	6	6	228825	228830	0 %	100 %	0 %	0 %	427711378
3502	NC_019680	CCA	2	6	228841	228846	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427711378
3503	NC_019680	G	6	6	228944	228949	0 %	0 %	100 %	0 %	427711378
3504	NC_019680	GGCC	2	8	228962	228969	0 %	0 %	50 %	50 %	427711378
3505	NC_019680	GTG	2	6	229007	229012	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427711378
3506	NC_019680	ATT	2	6	229077	229082	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427711378
3507	NC_019680	ACC	2	6	229110	229115	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427711378
3508	NC_019680	CGAA	2	8	229124	229131	50 %	0 %	25 %	25 %	427711378
3509	NC_019680	CAA	2	6	229200	229205	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427711378
3510	NC_019680	TGAT	2	8	229288	229295	25 %	50 %	25 %	0 %	427711378
3511	NC_019680	TGC	2	6	229406	229411	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427711378
3512	NC_019680	CCCCG	2	10	229545	229554	0 %	0 %	20 %	80 %	427711378
3513	NC_019680	CAA	2	6	229599	229604	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427711378
3514	NC_019680	ATGG	2	8	229605	229612	25 %	25 %	50 %	0 %	427711378
3515	NC_019680	T	6	6	229614	229619	0 %	100 %	0 %	0 %	427711378
3516	NC_019680	CCG	2	6	229819	229824	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	427711379
3517	NC_019680	GAG	2	6	229861	229866	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	427711379
3518	NC_019680	ATC	2	6	229952	229957	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427711379
3519	NC_019680	TCC	2	6	230021	230026	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	427711379
3520	NC_019680	AGT	2	6	230051	230056	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427711379
3521	NC_019680	ACCCA	2	10	230105	230114	40 %	0 %	0 %	60 %	427711379
3522	NC_019680	CCCG	2	8	230181	230188	0 %	0 %	25 %	75 %	427711379
3523	NC_019680	AGG	2	6	230267	230272	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	427711379
3524	NC_019680	CAGAT	2	10	230330	230339	40 %	20 %	20 %	20 %	427711379
3525	NC_019680	CAA	2	6	230371	230376	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427711379
3526	NC_019680	CAC	2	6	230380	230385	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427711379
3527	NC_019680	GCC	2	6	230402	230407	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	427711379
3528	NC_019680	GGGCC	2	10	230431	230440	0 %	0 %	60 %	40 %	427711379
3529	NC_019680	CAT	2	6	230567	230572	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427711380
3530	NC_019680	CAG	2	6	230615	230620	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427711380
3531	NC_019680	CCA	2	6	230626	230631	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427711380
3532	NC_019680	GCA	2	6	230662	230667	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427711380
3533	NC_019680	T	6	6	230707	230712	0 %	100 %	0 %	0 %	427711380
3534	NC_019680	AAC	2	6	230859	230864	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427711381
3535	NC_019680	ATG	2	6	230915	230920	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427711381
3536	NC_019680	CAG	2	6	231038	231043	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427711381
3537	NC_019680	GAT	2	6	231057	231062	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427711381
3538	NC_019680	TGC	2	6	231105	231110	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427711381
3539	NC_019680	TGG	2	6	231138	231143	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427711381
3540	NC_019680	ATC	2	6	231221	231226	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427711381
3541	NC_019680	AGTA	2	8	231396	231403	50 %	25 %	25 %	0 %	427711382
3542	NC_019680	CCA	2	6	231421	231426	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427711382
3543	NC_019680	ACC	2	6	231482	231487	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427711382
3544	NC_019680	G	6	6	231491	231496	0 %	0 %	100 %	0 %	427711382
3545	NC_019680	TCGG	2	8	231528	231535	0 %	25 %	50 %	25 %	427711382
3546	NC_019680	CCAGGC	2	12	231634	231645	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	427711382
3547	NC_019680	CCT	3	9	231890	231898	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	427711383
3548	NC_019680	CTT	2	6	231953	231958	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427711383
3549	NC_019680	CTG	2	6	231978	231983	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427711383
3550	NC_019680	AAC	2	6	231993	231998	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427711383
3551	NC_019680	GCT	2	6	232003	232008	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427711383
3552	NC_019680	TTCC	2	8	232133	232140	0 %	50 %	0 %	50 %	427711383
3553	NC_019680	ATG	2	6	232168	232173	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427711383
3554	NC_019680	ATC	2	6	232182	232187	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427711383
3555	NC_019680	TGA	2	6	232189	232194	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427711383
3556	NC_019680	C	6	6	232230	232235	0 %	0 %	0 %	100 %	427711383
3557	NC_019680	C	8	8	232274	232281	0 %	0 %	0 %	100 %	427711383
3558	NC_019680	A	6	6	232378	232383	100 %	0 %	0 %	0 %	427711383
3559	NC_019680	GGGC	2	8	232467	232474	0 %	0 %	75 %	25 %	427711383
3560	NC_019680	CCA	2	6	232499	232504	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427711383
3561	NC_019680	CCG	2	6	232598	232603	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	427711383
3562	NC_019680	CCT	2	6	232622	232627	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	427711383
3563	NC_019680	G	6	6	232646	232651	0 %	0 %	100 %	0 %	427711383
3564	NC_019680	TGA	2	6	232748	232753	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427711383
3565	NC_019680	CCA	2	6	232763	232768	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427711383
3566	NC_019680	GCC	2	6	232776	232781	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	427711383
3567	NC_019680	CAT	2	6	232889	232894	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427711384
3568	NC_019680	CAAC	2	8	232923	232930	50 %	0 %	0 %	50 %	427711384
3569	NC_019680	GCC	2	6	232933	232938	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	427711384
3570	NC_019680	TTC	2	6	232959	232964	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427711384
3571	NC_019680	AGCA	2	8	233003	233010	50 %	0 %	25 %	25 %	427711384
3572	NC_019680	GTT	2	6	233042	233047	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427711384
3573	NC_019680	CA	3	6	233048	233053	50 %	0 %	0 %	50 %	427711384
3574	NC_019680	TGC	2	6	233330	233335	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427711385
3575	NC_019680	CTGG	2	8	233377	233384	0 %	25 %	50 %	25 %	427711385
3576	NC_019680	TGC	2	6	233396	233401	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427711385
3577	NC_019680	TAC	2	6	233402	233407	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427711385
3578	NC_019680	CGG	2	6	233578	233583	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	427711385
3579	NC_019680	TGA	2	6	233590	233595	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427711385
3580	NC_019680	CGG	2	6	233656	233661	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	427711385
3581	NC_019680	CCG	2	6	233723	233728	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	427711385
3582	NC_019680	ACA	2	6	233746	233751	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427711385
3583	NC_019680	CT	3	6	233775	233780	0 %	50 %	0 %	50 %	427711385
3584	NC_019680	ATC	2	6	233831	233836	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427711385
3585	NC_019680	GGC	2	6	234065	234070	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	427711385
3586	NC_019680	GCTG	2	8	234363	234370	0 %	25 %	50 %	25 %	427711385
3587	NC_019680	C	6	6	234450	234455	0 %	0 %	0 %	100 %	427711386
3588	NC_019680	GAT	2	6	234490	234495	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427711386
3589	NC_019680	TG	3	6	234496	234501	0 %	50 %	50 %	0 %	427711386
3590	NC_019680	GTG	3	9	234499	234507	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427711386
3591	NC_019680	GCG	2	6	234508	234513	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	427711386
3592	NC_019680	GGCTG	2	10	234522	234531	0 %	20 %	60 %	20 %	427711386
3593	NC_019680	TTGGCG	2	12	234568	234579	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	427711386
3594	NC_019680	GGCG	2	8	234585	234592	0 %	0 %	75 %	25 %	427711386
3595	NC_019680	TAT	2	6	234611	234616	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427711386
3596	NC_019680	GCT	2	6	234778	234783	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427711386
3597	NC_019680	TGGGGC	2	12	234816	234827	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	427711386
3598	NC_019680	TGG	2	6	234932	234937	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427711386
3599	NC_019680	GAT	2	6	234938	234943	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427711386
3600	NC_019680	T	6	6	234959	234964	0 %	100 %	0 %	0 %	427711387
3601	NC_019680	CCT	2	6	234986	234991	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	427711387
3602	NC_019680	AAG	2	6	235002	235007	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427711387
3603	NC_019680	CTG	2	6	235047	235052	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427711387
3604	NC_019680	GGCC	2	8	235058	235065	0 %	0 %	50 %	50 %	427711387
3605	NC_019680	TGG	2	6	235066	235071	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427711387
3606	NC_019680	TCGA	2	8	235087	235094	25 %	25 %	25 %	25 %	427711387
3607	NC_019680	A	6	6	235141	235146	100 %	0 %	0 %	0 %	427711387
3608	NC_019680	ATT	2	6	235209	235214	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427711387
3609	NC_019680	ACA	2	6	235233	235238	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427711387
3610	NC_019680	GCTGG	2	10	235297	235306	0 %	20 %	60 %	20 %	427711387
3611	NC_019680	TGT	2	6	235321	235326	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427711387
3612	NC_019680	TTC	2	6	235410	235415	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427711387
3613	NC_019680	G	6	6	235477	235482	0 %	0 %	100 %	0 %	427711387
3614	NC_019680	TGA	2	6	235534	235539	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427711387
3615	NC_019680	TGC	2	6	235543	235548	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427711387
3616	NC_019680	GATTGG	2	12	235601	235612	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	427711387
3617	NC_019680	AAC	2	6	235669	235674	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427711387
3618	NC_019680	GTT	2	6	235749	235754	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427711387
3619	NC_019680	AAT	2	6	235788	235793	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427711387
3620	NC_019680	TTA	2	6	235813	235818	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427711387
3621	NC_019680	GTA	2	6	235876	235881	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427711387
3622	NC_019680	TGC	2	6	235913	235918	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427711387
3623	NC_019680	TTG	2	6	236001	236006	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427711387
3624	NC_019680	T	6	6	236057	236062	0 %	100 %	0 %	0 %	427711387
3625	NC_019680	ATTT	2	8	236118	236125	25 %	75 %	0 %	0 %	427711387
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3655	NC_019680	ACGATT	2	12	238145	238156	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	427711388
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3987	NC_019680	GC	3	6	261451	261456	0 %	0 %	50 %	50 %	427711410
3988	NC_019680	GTT	2	6	261474	261479	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427711410
3989	NC_019680	GCGT	2	8	261480	261487	0 %	25 %	50 %	25 %	427711410
3990	NC_019680	TGCG	2	8	261540	261547	0 %	25 %	50 %	25 %	427711410
3991	NC_019680	AGGTT	2	10	261580	261589	20 %	40 %	40 %	0 %	427711410
3992	NC_019680	GCT	2	6	261657	261662	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427711410
3993	NC_019680	TGA	2	6	261684	261689	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427711410
3994	NC_019680	CGC	2	6	261694	261699	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	427711410
3995	NC_019680	G	6	6	261736	261741	0 %	0 %	100 %	0 %	427711410
3996	NC_019680	TGC	2	6	261751	261756	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427711410
3997	NC_019680	GAC	2	6	261762	261767	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427711410
3998	NC_019680	GAT	2	6	261949	261954	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427711411
3999	NC_019680	GAC	2	6	261987	261992	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427711411
4000	NC_019680	CCG	2	6	262099	262104	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	427711411

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