MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Synechococcus sp. PCC 6312 chromosome

Total Repeats: 55484

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_019680	CAC	2	6	194868	194873	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427711347
3002	NC_019680	CAA	2	6	194893	194898	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427711347
3003	NC_019680	T	6	6	194920	194925	0 %	100 %	0 %	0 %	427711347
3004	NC_019680	TGTGGA	2	12	194967	194978	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	427711347
3005	NC_019680	GCC	2	6	195050	195055	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	427711347
3006	NC_019680	TCAATG	2	12	195152	195163	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	427711347
3007	NC_019680	GCC	2	6	195199	195204	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	427711347
3008	NC_019680	AAC	2	6	195227	195232	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427711347
3009	NC_019680	GGC	2	6	195342	195347	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	427711347
3010	NC_019680	G	6	6	195356	195361	0 %	0 %	100 %	0 %	427711347
3011	NC_019680	ACT	2	6	195396	195401	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427711347
3012	NC_019680	GCG	2	6	195425	195430	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	427711348
3013	NC_019680	TCACTG	2	12	195508	195519	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	427711348
3014	NC_019680	CAA	2	6	195759	195764	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427711348
3015	NC_019680	AAC	2	6	195836	195841	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427711348
3016	NC_019680	CTGG	2	8	195877	195884	0 %	25 %	50 %	25 %	427711348
3017	NC_019680	GCTT	2	8	195937	195944	0 %	50 %	25 %	25 %	427711348
3018	NC_019680	A	6	6	195978	195983	100 %	0 %	0 %	0 %	427711348
3019	NC_019680	GAA	2	6	196044	196049	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427711348
3020	NC_019680	CAA	2	6	196056	196061	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427711348
3021	NC_019680	GGTT	2	8	196260	196267	0 %	50 %	50 %	0 %	427711348
3022	NC_019680	TCC	2	6	196372	196377	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	427711348
3023	NC_019680	TGT	2	6	196471	196476	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427711348
3024	NC_019680	TGG	2	6	196756	196761	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427711349
3025	NC_019680	GCT	2	6	196769	196774	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427711349
3026	NC_019680	GTT	2	6	196780	196785	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427711349
3027	NC_019680	TTG	2	6	196787	196792	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427711349
3028	NC_019680	GCG	2	6	197004	197009	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	427711349
3029	NC_019680	CAAT	2	8	197179	197186	50 %	25 %	0 %	25 %	427711349
3030	NC_019680	GCCTG	2	10	197188	197197	0 %	20 %	40 %	40 %	427711349
3031	NC_019680	GAT	2	6	197240	197245	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427711349
3032	NC_019680	ACC	2	6	197276	197281	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427711349
3033	NC_019680	GCC	2	6	197376	197381	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	427711349
3034	NC_019680	CTT	2	6	197482	197487	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427711349
3035	NC_019680	TGG	2	6	197499	197504	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427711349
3036	NC_019680	GTA	2	6	197722	197727	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427711350
3037	NC_019680	TGG	2	6	197747	197752	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427711350
3038	NC_019680	ATG	2	6	197822	197827	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427711350
3039	NC_019680	GTT	2	6	197899	197904	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427711350
3040	NC_019680	TGA	2	6	197982	197987	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427711350
3041	NC_019680	TAT	2	6	198007	198012	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427711350
3042	NC_019680	ATC	2	6	198079	198084	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427711350
3043	NC_019680	TATG	2	8	198105	198112	25 %	50 %	25 %	0 %	427711350
3044	NC_019680	GGT	2	6	198113	198118	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427711350
3045	NC_019680	AGTT	2	8	198185	198192	25 %	50 %	25 %	0 %	427711350
3046	NC_019680	AAG	2	6	198248	198253	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427711350
3047	NC_019680	TGGC	2	8	198340	198347	0 %	25 %	50 %	25 %	427711350
3048	NC_019680	CCTTT	2	10	198380	198389	0 %	60 %	0 %	40 %	427711350
3049	NC_019680	TGA	2	6	198431	198436	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427711350
3050	NC_019680	TTTG	2	8	198610	198617	0 %	75 %	25 %	0 %	427711350
3051	NC_019680	TGA	2	6	198621	198626	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427711350
3052	NC_019680	ATT	2	6	198649	198654	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427711350
3053	NC_019680	CCT	2	6	198657	198662	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	427711350
3054	NC_019680	TCC	2	6	198680	198685	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	427711350
3055	NC_019680	TGG	2	6	198686	198691	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427711350
3056	NC_019680	CTC	2	6	198719	198724	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	427711350
3057	NC_019680	G	8	8	198797	198804	0 %	0 %	100 %	0 %	427711350
3058	NC_019680	GGCCTG	2	12	198946	198957	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	427711350
3059	NC_019680	ACT	2	6	199010	199015	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427711350
3060	NC_019680	C	6	6	199124	199129	0 %	0 %	0 %	100 %	427711350
3061	NC_019680	GTTT	2	8	199137	199144	0 %	75 %	25 %	0 %	427711350
3062	NC_019680	CAAC	2	8	199164	199171	50 %	0 %	0 %	50 %	427711350
3063	NC_019680	T	7	7	199211	199217	0 %	100 %	0 %	0 %	427711350
3064	NC_019680	GAA	2	6	199252	199257	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427711350
3065	NC_019680	ACA	2	6	199501	199506	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427711351
3066	NC_019680	GTT	2	6	199521	199526	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427711351
3067	NC_019680	CGGC	2	8	199533	199540	0 %	0 %	50 %	50 %	427711351
3068	NC_019680	A	6	6	199546	199551	100 %	0 %	0 %	0 %	427711351
3069	NC_019680	CCA	2	6	199639	199644	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427711351
3070	NC_019680	TAT	2	6	199712	199717	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427711351
3071	NC_019680	GTT	2	6	199749	199754	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427711351
3072	NC_019680	TGAC	2	8	199810	199817	25 %	25 %	25 %	25 %	427711351
3073	NC_019680	AAC	2	6	199821	199826	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427711351
3074	NC_019680	GCC	2	6	199857	199862	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	427711351
3075	NC_019680	GTT	2	6	199893	199898	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427711351
3076	NC_019680	TGAT	2	8	199908	199915	25 %	50 %	25 %	0 %	427711351
3077	NC_019680	CATA	2	8	199925	199932	50 %	25 %	0 %	25 %	427711351
3078	NC_019680	CCAACT	2	12	200023	200034	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	427711351
3079	NC_019680	TGA	2	6	200052	200057	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427711351
3080	NC_019680	TGA	2	6	200099	200104	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427711351
3081	NC_019680	CTGGG	2	10	200835	200844	0 %	20 %	60 %	20 %	427711352
3082	NC_019680	TGA	2	6	200909	200914	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427711352
3083	NC_019680	GGC	2	6	201049	201054	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	427711352
3084	NC_019680	TGGG	2	8	201083	201090	0 %	25 %	75 %	0 %	427711352
3085	NC_019680	CTT	2	6	201252	201257	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427711352
3086	NC_019680	CCG	2	6	201360	201365	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	427711352
3087	NC_019680	AGTC	2	8	201381	201388	25 %	25 %	25 %	25 %	427711352
3088	NC_019680	CTC	2	6	201444	201449	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	427711352
3089	NC_019680	CTG	2	6	201456	201461	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427711352
3090	NC_019680	GAC	2	6	201466	201471	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427711352
3091	NC_019680	TGC	2	6	201472	201477	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427711352
3092	NC_019680	ATT	2	6	201734	201739	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427711353
3093	NC_019680	GAC	2	6	201773	201778	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427711353
3094	NC_019680	ATC	2	6	201879	201884	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427711353
3095	NC_019680	G	6	6	201980	201985	0 %	0 %	100 %	0 %	427711353
3096	NC_019680	GTC	2	6	202023	202028	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427711353
3097	NC_019680	GAC	2	6	202267	202272	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427711354
3098	NC_019680	TGA	2	6	202371	202376	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427711354
3099	NC_019680	TGC	2	6	202423	202428	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427711354
3100	NC_019680	TCC	2	6	202429	202434	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	427711354
3101	NC_019680	AAC	2	6	202487	202492	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427711354
3102	NC_019680	ATC	2	6	202493	202498	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427711354
3103	NC_019680	CTT	2	6	202515	202520	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427711354
3104	NC_019680	GCT	2	6	202559	202564	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427711354
3105	NC_019680	GGT	2	6	202589	202594	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427711354
3106	NC_019680	CTT	2	6	202618	202623	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427711354
3107	NC_019680	TCT	2	6	202632	202637	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427711354
3108	NC_019680	TCT	2	6	202734	202739	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427711354
3109	NC_019680	TTCT	2	8	202762	202769	0 %	75 %	0 %	25 %	427711354
3110	NC_019680	CCA	2	6	202855	202860	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427711354
3111	NC_019680	TGG	2	6	202882	202887	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427711354
3112	NC_019680	ACTGAA	2	12	202946	202957	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	427711354
3113	NC_019680	AAG	3	9	202986	202994	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427711354
3114	NC_019680	ACA	2	6	203001	203006	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427711354
3115	NC_019680	TGC	2	6	203011	203016	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427711354
3116	NC_019680	CAA	2	6	203059	203064	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427711354
3117	NC_019680	CTT	3	9	203080	203088	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427711354
3118	NC_019680	GCCTG	2	10	203093	203102	0 %	20 %	40 %	40 %	427711354
3119	NC_019680	CTTCAA	2	12	203161	203172	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427711354
3120	NC_019680	TGT	2	6	203179	203184	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427711354
3121	NC_019680	TCA	2	6	203202	203207	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427711354
3122	NC_019680	ATC	2	6	203222	203227	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427711354
3123	NC_019680	TCA	2	6	203571	203576	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427711355
3124	NC_019680	AAAT	2	8	203591	203598	75 %	25 %	0 %	0 %	427711355
3125	NC_019680	TAG	2	6	203630	203635	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427711355
3126	NC_019680	TCTGTA	2	12	203691	203702	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	427711355
3127	NC_019680	CAA	2	6	203710	203715	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427711355
3128	NC_019680	TGAACA	2	12	203718	203729	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	427711355
3129	NC_019680	TCA	2	6	203772	203777	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427711355
3130	NC_019680	CAATC	2	10	203783	203792	40 %	20 %	0 %	40 %	427711355
3131	NC_019680	TCT	3	9	203890	203898	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427711355
3132	NC_019680	GCA	2	6	203977	203982	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427711355
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3142	NC_019680	GGCC	2	8	204727	204734	0 %	0 %	50 %	50 %	427711356
3143	NC_019680	CAGGC	2	10	204781	204790	20 %	0 %	40 %	40 %	427711356
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3145	NC_019680	A	8	8	205011	205018	100 %	0 %	0 %	0 %	427711356
3146	NC_019680	TAAT	2	8	205058	205065	50 %	50 %	0 %	0 %	427711356
3147	NC_019680	GCG	2	6	205086	205091	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	427711356
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3154	NC_019680	GCT	2	6	205742	205747	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427711357
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3235	NC_019680	G	6	6	211215	211220	0 %	0 %	100 %	0 %	427711360
3236	NC_019680	C	6	6	211322	211327	0 %	0 %	0 %	100 %	427711360
3237	NC_019680	AAT	2	6	211357	211362	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427711360
3238	NC_019680	TGTCCC	2	12	211403	211414	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	427711360
3239	NC_019680	ATA	2	6	211531	211536	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427711360
3240	NC_019680	GGC	2	6	211549	211554	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	427711360
3241	NC_019680	ACC	2	6	211629	211634	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427711360
3242	NC_019680	AAAAT	2	10	211723	211732	80 %	20 %	0 %	0 %	427711360
3243	NC_019680	CGG	2	6	211734	211739	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	427711360
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3363	NC_019680	TAAA	2	8	219373	219380	75 %	25 %	0 %	0 %	427711368
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3488	NC_019680	GGA	2	6	227797	227802	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	427711376
3489	NC_019680	T	7	7	228024	228030	0 %	100 %	0 %	0 %	427711377
3490	NC_019680	GTTG	2	8	228125	228132	0 %	50 %	50 %	0 %	427711377
3491	NC_019680	ATT	2	6	228134	228139	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427711377
3492	NC_019680	CTG	2	6	228298	228303	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427711378
3493	NC_019680	CT	3	6	228419	228424	0 %	50 %	0 %	50 %	427711378
3494	NC_019680	TGAT	2	8	228490	228497	25 %	50 %	25 %	0 %	427711378
3495	NC_019680	CGC	2	6	228587	228592	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	427711378
3496	NC_019680	TGC	2	6	228593	228598	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427711378
3497	NC_019680	CTGGC	2	10	228640	228649	0 %	20 %	40 %	40 %	427711378
3498	NC_019680	CTC	2	6	228729	228734	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	427711378
3499	NC_019680	GATTG	2	10	228762	228771	20 %	40 %	40 %	0 %	427711378
3500	NC_019680	GGC	2	6	228782	228787	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	427711378

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