MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Synechococcus sp. PCC 6312 chromosome

Total Repeats: 55484

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_019680	GTCA	2	8	156358	156365	25 %	25 %	25 %	25 %	427711318
2502	NC_019680	GC	3	6	156382	156387	0 %	0 %	50 %	50 %	427711318
2503	NC_019680	AGA	2	6	156406	156411	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427711318
2504	NC_019680	GAA	2	6	156469	156474	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427711318
2505	NC_019680	ATC	2	6	156593	156598	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427711319
2506	NC_019680	GCCA	2	8	156644	156651	25 %	0 %	25 %	50 %	427711319
2507	NC_019680	CT	3	6	156671	156676	0 %	50 %	0 %	50 %	427711319
2508	NC_019680	CCAA	2	8	156684	156691	50 %	0 %	0 %	50 %	427711319
2509	NC_019680	C	6	6	156705	156710	0 %	0 %	0 %	100 %	427711319
2510	NC_019680	A	6	6	156773	156778	100 %	0 %	0 %	0 %	427711319
2511	NC_019680	TCGCC	2	10	156817	156826	0 %	20 %	20 %	60 %	427711319
2512	NC_019680	CCG	2	6	156918	156923	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	427711319
2513	NC_019680	A	6	6	156983	156988	100 %	0 %	0 %	0 %	427711319
2514	NC_019680	AAT	2	6	157040	157045	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427711319
2515	NC_019680	CCA	2	6	157074	157079	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427711319
2516	NC_019680	A	6	6	157140	157145	100 %	0 %	0 %	0 %	427711319
2517	NC_019680	GTT	2	6	157216	157221	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427711319
2518	NC_019680	ATCCA	2	10	157229	157238	40 %	20 %	0 %	40 %	427711319
2519	NC_019680	CAA	2	6	157343	157348	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427711319
2520	NC_019680	ACC	2	6	157353	157358	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427711319
2521	NC_019680	AGCC	2	8	157402	157409	25 %	0 %	25 %	50 %	427711319
2522	NC_019680	ACG	2	6	157488	157493	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427711319
2523	NC_019680	CT	3	6	157520	157525	0 %	50 %	0 %	50 %	427711319
2524	NC_019680	TGA	2	6	157539	157544	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427711319
2525	NC_019680	A	6	6	157640	157645	100 %	0 %	0 %	0 %	427711319
2526	NC_019680	GGC	2	6	157648	157653	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	427711319
2527	NC_019680	GGC	2	6	157669	157674	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	427711319
2528	NC_019680	GCT	2	6	157691	157696	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427711319
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2530	NC_019680	GAA	2	6	157772	157777	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427711319
2531	NC_019680	AAG	2	6	157796	157801	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427711319
2532	NC_019680	GC	3	6	157830	157835	0 %	0 %	50 %	50 %	427711319
2533	NC_019680	C	6	6	157835	157840	0 %	0 %	0 %	100 %	427711319
2534	NC_019680	TGG	2	6	157921	157926	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427711320
2535	NC_019680	CCT	2	6	157949	157954	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	427711320
2536	NC_019680	AGC	2	6	158032	158037	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427711320
2537	NC_019680	ATGA	2	8	158169	158176	50 %	25 %	25 %	0 %	427711321
2538	NC_019680	TTA	2	6	158177	158182	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427711321
2539	NC_019680	GCC	2	6	158229	158234	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	427711321
2540	NC_019680	C	7	7	158273	158279	0 %	0 %	0 %	100 %	427711321
2541	NC_019680	A	6	6	158289	158294	100 %	0 %	0 %	0 %	427711321
2542	NC_019680	AGTT	2	8	158302	158309	25 %	50 %	25 %	0 %	427711321
2543	NC_019680	A	7	7	158322	158328	100 %	0 %	0 %	0 %	427711321
2544	NC_019680	AAG	2	6	158359	158364	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427711321
2545	NC_019680	CAC	2	6	158365	158370	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427711321
2546	NC_019680	CTA	2	6	158438	158443	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427711321
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2548	NC_019680	CGC	2	6	158529	158534	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	427711321
2549	NC_019680	GCC	2	6	158560	158565	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	427711321
2550	NC_019680	TTAG	2	8	158658	158665	25 %	50 %	25 %	0 %	427711321
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2553	NC_019680	TGG	2	6	158767	158772	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427711321
2554	NC_019680	ATCA	2	8	158856	158863	50 %	25 %	0 %	25 %	427711321
2555	NC_019680	AAC	2	6	158914	158919	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427711321
2556	NC_019680	CAA	3	9	158925	158933	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427711321
2557	NC_019680	TGC	2	6	159587	159592	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427711322
2558	NC_019680	GAG	2	6	159613	159618	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	427711322
2559	NC_019680	CGG	2	6	159656	159661	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	427711322
2560	NC_019680	TCC	2	6	159721	159726	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	427711322
2561	NC_019680	CTT	3	9	159870	159878	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427711323
2562	NC_019680	AGA	2	6	159996	160001	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427711323
2563	NC_019680	ACT	2	6	160034	160039	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427711323
2564	NC_019680	CGG	2	6	160291	160296	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	427711324
2565	NC_019680	CCCCA	2	10	160338	160347	20 %	0 %	0 %	80 %	427711324
2566	NC_019680	TCCAA	2	10	160487	160496	40 %	20 %	0 %	40 %	427711324
2567	NC_019680	T	6	6	160558	160563	0 %	100 %	0 %	0 %	427711324
2568	NC_019680	T	7	7	160596	160602	0 %	100 %	0 %	0 %	427711324
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2571	NC_019680	TTA	2	6	160654	160659	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427711324
2572	NC_019680	AACTT	2	10	160733	160742	40 %	40 %	0 %	20 %	427711324
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2574	NC_019680	CAA	3	9	160816	160824	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427711324
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2578	NC_019680	TGGC	2	8	161245	161252	0 %	25 %	50 %	25 %	427711325
2579	NC_019680	CGGT	2	8	161260	161267	0 %	25 %	50 %	25 %	427711325
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2585	NC_019680	G	6	6	161606	161611	0 %	0 %	100 %	0 %	427711325
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2593	NC_019680	CTTCAG	2	12	162151	162162	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	427711325
2594	NC_019680	T	6	6	162164	162169	0 %	100 %	0 %	0 %	427711325
2595	NC_019680	TAG	2	6	162177	162182	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427711325
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2598	NC_019680	TGGT	3	12	162342	162353	0 %	50 %	50 %	0 %	427711325
2599	NC_019680	CATC	2	8	162355	162362	25 %	25 %	0 %	50 %	427711325
2600	NC_019680	GCC	2	6	162390	162395	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	427711325
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2602	NC_019680	GA	3	6	162426	162431	50 %	0 %	50 %	0 %	427711325
2603	NC_019680	AAT	2	6	162476	162481	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427711325
2604	NC_019680	CTTGG	2	10	162482	162491	0 %	40 %	40 %	20 %	427711325
2605	NC_019680	TGC	2	6	162687	162692	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427711325
2606	NC_019680	GTAA	2	8	162694	162701	50 %	25 %	25 %	0 %	427711325
2607	NC_019680	AAT	2	6	162761	162766	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427711325
2608	NC_019680	TAA	2	6	162896	162901	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427711325
2609	NC_019680	GA	3	6	163067	163072	50 %	0 %	50 %	0 %	427711326
2610	NC_019680	GGC	2	6	163207	163212	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	427711327
2611	NC_019680	GAC	2	6	163243	163248	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427711327
2612	NC_019680	GAC	2	6	163273	163278	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427711327
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2616	NC_019680	GGTGT	2	10	163391	163400	0 %	40 %	60 %	0 %	427711327
2617	NC_019680	TGG	2	6	163467	163472	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427711327
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2619	NC_019680	CGC	2	6	163505	163510	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	427711327
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2622	NC_019680	G	6	6	163743	163748	0 %	0 %	100 %	0 %	427711327
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2624	NC_019680	CT	3	6	163838	163843	0 %	50 %	0 %	50 %	427711327
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2992	NC_019680	G	6	6	194535	194540	0 %	0 %	100 %	0 %	427711347
2993	NC_019680	CAG	2	6	194576	194581	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427711347
2994	NC_019680	CTG	2	6	194608	194613	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427711347
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2996	NC_019680	TGG	2	6	194729	194734	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427711347
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2999	NC_019680	TCAA	2	8	194834	194841	50 %	25 %	0 %	25 %	427711347
3000	NC_019680	CAA	2	6	194859	194864	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427711347

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