MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Synechococcus sp. PCC 6312 chromosome

Total Repeats: 55484

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2001	NC_019680	TTG	2	6	124873	124878	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427711287
2002	NC_019680	CTTG	2	8	124905	124912	0 %	50 %	25 %	25 %	427711287
2003	NC_019680	TCA	2	6	124949	124954	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427711287
2004	NC_019680	T	6	6	125034	125039	0 %	100 %	0 %	0 %	427711287
2005	NC_019680	GCC	2	6	125051	125056	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	427711287
2006	NC_019680	GCC	2	6	125084	125089	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	427711287
2007	NC_019680	CCG	2	6	125097	125102	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	427711287
2008	NC_019680	CAG	2	6	125119	125124	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427711287
2009	NC_019680	GAAA	2	8	125125	125132	75 %	0 %	25 %	0 %	427711287
2010	NC_019680	TCG	2	6	125195	125200	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427711288
2011	NC_019680	GTT	2	6	125226	125231	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427711288
2012	NC_019680	GTT	3	9	125256	125264	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427711288
2013	NC_019680	GCT	2	6	125333	125338	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427711288
2014	NC_019680	CGA	2	6	125385	125390	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427711288
2015	NC_019680	G	6	6	125448	125453	0 %	0 %	100 %	0 %	427711288
2016	NC_019680	AAT	3	9	125724	125732	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427711289
2017	NC_019680	ATC	2	6	125806	125811	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427711289
2018	NC_019680	CAG	2	6	125841	125846	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427711289
2019	NC_019680	AGC	2	6	126014	126019	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427711290
2020	NC_019680	CAAT	2	8	126033	126040	50 %	25 %	0 %	25 %	427711290
2021	NC_019680	CGC	2	6	126089	126094	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	427711290
2022	NC_019680	CCG	2	6	126119	126124	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	427711290
2023	NC_019680	GTC	2	6	126251	126256	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427711290
2024	NC_019680	CAT	2	6	126292	126297	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427711290
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2026	NC_019680	AG	3	6	126511	126516	50 %	0 %	50 %	0 %	427711290
2027	NC_019680	T	6	6	126518	126523	0 %	100 %	0 %	0 %	427711290
2028	NC_019680	TTC	2	6	126548	126553	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427711290
2029	NC_019680	TTC	2	6	126575	126580	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427711290
2030	NC_019680	ACAA	2	8	126629	126636	75 %	0 %	0 %	25 %	427711290
2031	NC_019680	CTT	2	6	126638	126643	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427711290
2032	NC_019680	CCG	2	6	126738	126743	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	427711290
2033	NC_019680	GCC	2	6	126750	126755	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	427711290
2034	NC_019680	ATCCTG	2	12	126770	126781	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	427711290
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2038	NC_019680	CGC	2	6	126907	126912	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	427711290
2039	NC_019680	TGGCC	2	10	127016	127025	0 %	20 %	40 %	40 %	427711291
2040	NC_019680	CGA	2	6	127076	127081	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427711291
2041	NC_019680	GCTTTG	2	12	127120	127131	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	427711291
2042	NC_019680	CCG	2	6	127160	127165	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	427711291
2043	NC_019680	T	6	6	127380	127385	0 %	100 %	0 %	0 %	427711291
2044	NC_019680	GGCC	2	8	127391	127398	0 %	0 %	50 %	50 %	427711291
2045	NC_019680	GC	3	6	127404	127409	0 %	0 %	50 %	50 %	427711291
2046	NC_019680	CCG	2	6	127449	127454	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	427711291
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2051	NC_019680	CGGT	2	8	127903	127910	0 %	25 %	50 %	25 %	427711291
2052	NC_019680	AAT	2	6	127932	127937	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427711291
2053	NC_019680	AAC	3	9	127963	127971	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427711291
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2055	NC_019680	TAA	2	6	128412	128417	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427711292
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2057	NC_019680	GTT	2	6	128426	128431	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427711292
2058	NC_019680	CCAGT	2	10	128442	128451	20 %	20 %	20 %	40 %	427711292
2059	NC_019680	GTT	2	6	128522	128527	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427711292
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2061	NC_019680	TTC	2	6	128640	128645	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427711292
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2063	NC_019680	GTT	2	6	128702	128707	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427711292
2064	NC_019680	G	6	6	128717	128722	0 %	0 %	100 %	0 %	427711292
2065	NC_019680	GCT	2	6	128764	128769	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427711292
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2067	NC_019680	GTT	2	6	128794	128799	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427711292
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2071	NC_019680	TTA	2	6	129007	129012	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427711293
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2092	NC_019680	CTGT	2	8	130321	130328	0 %	50 %	25 %	25 %	427711294
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2116	NC_019680	CCAA	2	8	131926	131933	50 %	0 %	0 %	50 %	427711296
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2121	NC_019680	ACTGG	2	10	132606	132615	20 %	20 %	40 %	20 %	427711296
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2123	NC_019680	CTGGGC	2	12	132764	132775	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	427711296
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2128	NC_019680	T	6	6	133247	133252	0 %	100 %	0 %	0 %	427711297
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2246	NC_019680	TG	3	6	140221	140226	0 %	50 %	50 %	0 %	427711303
2247	NC_019680	CGG	2	6	140237	140242	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	427711303
2248	NC_019680	AGTC	2	8	140276	140283	25 %	25 %	25 %	25 %	427711303
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2350	NC_019680	TGAT	2	8	146804	146811	25 %	50 %	25 %	0 %	427711307
2351	NC_019680	CGG	2	6	146828	146833	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	427711307
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2354	NC_019680	GAT	2	6	147626	147631	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427711308
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2358	NC_019680	TTTGGC	2	12	147815	147826	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	427711308
2359	NC_019680	TTGTC	2	10	147841	147850	0 %	60 %	20 %	20 %	427711308
2360	NC_019680	TGA	2	6	147934	147939	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427711308
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2362	NC_019680	CCT	2	6	147974	147979	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	427711308
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2366	NC_019680	ATT	2	6	148322	148327	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427711308
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