MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Synechococcus sp. PCC 6312 chromosome

Total Repeats: 55484

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6501	NC_019680	TGC	2	6	424122	424127	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427711567
6502	NC_019680	C	6	6	424190	424195	0 %	0 %	0 %	100 %	427711567
6503	NC_019680	AAC	2	6	424200	424205	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427711567
6504	NC_019680	TCC	2	6	424259	424264	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	427711567
6505	NC_019680	ATT	2	6	424295	424300	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427711567
6506	NC_019680	CCA	2	6	424313	424318	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427711567
6507	NC_019680	C	6	6	424326	424331	0 %	0 %	0 %	100 %	427711567
6508	NC_019680	TTC	2	6	424376	424381	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427711567
6509	NC_019680	AAT	2	6	424396	424401	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427711567
6510	NC_019680	CTA	2	6	424424	424429	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427711567
6511	NC_019680	GTTT	2	8	424506	424513	0 %	75 %	25 %	0 %	427711568
6512	NC_019680	T	7	7	424511	424517	0 %	100 %	0 %	0 %	427711568
6513	NC_019680	TGC	2	6	424609	424614	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427711568
6514	NC_019680	AAT	2	6	424636	424641	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427711568
6515	NC_019680	CCA	2	6	424646	424651	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427711568
6516	NC_019680	ATA	2	6	424665	424670	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427711568
6517	NC_019680	GCC	2	6	424702	424707	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	427711568
6518	NC_019680	ATC	2	6	424714	424719	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427711568
6519	NC_019680	TTCA	2	8	424758	424765	25 %	50 %	0 %	25 %	427711568
6520	NC_019680	TGGAC	2	10	424793	424802	20 %	20 %	40 %	20 %	427711568
6521	NC_019680	AG	3	6	424904	424909	50 %	0 %	50 %	0 %	427711568
6522	NC_019680	CTT	2	6	424920	424925	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427711568
6523	NC_019680	TAG	2	6	425148	425153	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427711569
6524	NC_019680	GCT	2	6	425202	425207	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427711569
6525	NC_019680	T	6	6	425213	425218	0 %	100 %	0 %	0 %	427711569
6526	NC_019680	CAGG	2	8	425467	425474	25 %	0 %	50 %	25 %	427711569
6527	NC_019680	TAG	2	6	425596	425601	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427711569
6528	NC_019680	C	7	7	426061	426067	0 %	0 %	0 %	100 %	427711570
6529	NC_019680	GTT	2	6	426126	426131	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427711570
6530	NC_019680	TGC	2	6	426152	426157	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427711570
6531	NC_019680	GAA	2	6	426183	426188	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427711570
6532	NC_019680	GCG	2	6	426228	426233	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	427711570
6533	NC_019680	T	8	8	426237	426244	0 %	100 %	0 %	0 %	427711570
6534	NC_019680	GAA	2	6	426250	426255	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427711570
6535	NC_019680	CAG	2	6	426338	426343	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427711570
6536	NC_019680	AAC	2	6	426482	426487	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427711570
6537	NC_019680	CAT	2	6	426664	426669	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427711570
6538	NC_019680	CTT	2	6	426679	426684	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427711570
6539	NC_019680	AAT	2	6	426736	426741	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427711570
6540	NC_019680	ATG	2	6	426821	426826	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427711570
6541	NC_019680	T	6	6	426882	426887	0 %	100 %	0 %	0 %	427711570
6542	NC_019680	TTA	2	6	426931	426936	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427711570
6543	NC_019680	CTG	2	6	427040	427045	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427711570
6544	NC_019680	TAC	2	6	427051	427056	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427711570
6545	NC_019680	GC	3	6	427091	427096	0 %	0 %	50 %	50 %	427711570
6546	NC_019680	GGCCT	2	10	427210	427219	0 %	20 %	40 %	40 %	427711570
6547	NC_019680	G	6	6	427229	427234	0 %	0 %	100 %	0 %	427711570
6548	NC_019680	CAGG	2	8	427237	427244	25 %	0 %	50 %	25 %	427711570
6549	NC_019680	ACC	2	6	427364	427369	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427711570
6550	NC_019680	CCAGG	2	10	427395	427404	20 %	0 %	40 %	40 %	427711570
6551	NC_019680	ATTT	2	8	427425	427432	25 %	75 %	0 %	0 %	427711570
6552	NC_019680	GCACC	2	10	427436	427445	20 %	0 %	20 %	60 %	427711570
6553	NC_019680	TCAA	2	8	427469	427476	50 %	25 %	0 %	25 %	427711570
6554	NC_019680	AAC	2	6	427684	427689	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427711571
6555	NC_019680	CCA	2	6	427691	427696	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427711571
6556	NC_019680	ATT	2	6	427774	427779	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427711571
6557	NC_019680	CAT	3	9	427788	427796	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427711571
6558	NC_019680	GGT	2	6	427798	427803	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427711571
6559	NC_019680	G	6	6	428063	428068	0 %	0 %	100 %	0 %	427711572
6560	NC_019680	ACCAG	2	10	428086	428095	40 %	0 %	20 %	40 %	427711572
6561	NC_019680	G	6	6	428099	428104	0 %	0 %	100 %	0 %	427711572
6562	NC_019680	CTG	2	6	428159	428164	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427711572
6563	NC_019680	CCCAT	2	10	428186	428195	20 %	20 %	0 %	60 %	427711572
6564	NC_019680	CTA	2	6	428214	428219	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427711572
6565	NC_019680	CTT	2	6	428347	428352	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427711572
6566	NC_019680	TAGCTG	2	12	428354	428365	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	427711572
6567	NC_019680	GAC	2	6	428387	428392	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427711572
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6570	NC_019680	TG	3	6	428554	428559	0 %	50 %	50 %	0 %	427711573
6571	NC_019680	CCA	2	6	428609	428614	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427711573
6572	NC_019680	TTG	2	6	428676	428681	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427711573
6573	NC_019680	CAT	2	6	428685	428690	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427711573
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6581	NC_019680	CTGA	2	8	429317	429324	25 %	25 %	25 %	25 %	427711575
6582	NC_019680	CCG	3	9	429433	429441	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	427711575
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6586	NC_019680	TGT	2	6	429559	429564	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427711575
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6588	NC_019680	CCCGC	2	10	429619	429628	0 %	0 %	20 %	80 %	427711575
6589	NC_019680	T	8	8	429660	429667	0 %	100 %	0 %	0 %	427711575
6590	NC_019680	TTC	2	6	429725	429730	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427711575
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6592	NC_019680	TCAC	2	8	429822	429829	25 %	25 %	0 %	50 %	427711575
6593	NC_019680	TGT	2	6	429902	429907	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427711575
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6596	NC_019680	GGGCT	2	10	430028	430037	0 %	20 %	60 %	20 %	427711575
6597	NC_019680	CAA	2	6	430094	430099	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427711575
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6600	NC_019680	T	6	6	430208	430213	0 %	100 %	0 %	0 %	427711575
6601	NC_019680	GTT	2	6	430504	430509	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427711575
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6604	NC_019680	A	7	7	430797	430803	100 %	0 %	0 %	0 %	427711576
6605	NC_019680	CTCA	2	8	430846	430853	25 %	25 %	0 %	50 %	427711576
6606	NC_019680	GGT	2	6	430877	430882	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427711576
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6609	NC_019680	TGA	2	6	430913	430918	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427711576
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6615	NC_019680	TGG	2	6	431217	431222	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427711577
6616	NC_019680	ACT	2	6	431301	431306	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427711578
6617	NC_019680	G	6	6	431515	431520	0 %	0 %	100 %	0 %	427711578
6618	NC_019680	AGAA	2	8	431532	431539	75 %	0 %	25 %	0 %	427711578
6619	NC_019680	CACAGC	2	12	431573	431584	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	427711578
6620	NC_019680	GAG	2	6	431645	431650	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	427711578
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6622	NC_019680	A	7	7	431723	431729	100 %	0 %	0 %	0 %	427711578
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