MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Synechococcus sp. PCC 6312 chromosome

Total Repeats: 55484

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_019680	GTC	2	6	326039	326044	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427711471
5002	NC_019680	CCA	2	6	326085	326090	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427711471
5003	NC_019680	AAT	2	6	326191	326196	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427711471
5004	NC_019680	GCC	2	6	326224	326229	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	427711471
5005	NC_019680	AAT	2	6	326370	326375	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427711471
5006	NC_019680	GC	3	6	326430	326435	0 %	0 %	50 %	50 %	427711471
5007	NC_019680	TCC	2	6	326636	326641	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	427711471
5008	NC_019680	AAT	2	6	326659	326664	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427711471
5009	NC_019680	TAAATC	2	12	326710	326721	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	427711471
5010	NC_019680	CA	3	6	326736	326741	50 %	0 %	0 %	50 %	427711471
5011	NC_019680	CAC	2	6	326743	326748	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427711471
5012	NC_019680	ATC	2	6	326755	326760	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427711471
5013	NC_019680	A	6	6	326761	326766	100 %	0 %	0 %	0 %	427711471
5014	NC_019680	CCA	2	6	326820	326825	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427711471
5015	NC_019680	TTC	2	6	326899	326904	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427711471
5016	NC_019680	CCA	2	6	326970	326975	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427711471
5017	NC_019680	AGG	2	6	327216	327221	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	427711472
5018	NC_019680	AAC	2	6	327256	327261	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427711472
5019	NC_019680	T	6	6	327357	327362	0 %	100 %	0 %	0 %	427711472
5020	NC_019680	TCA	2	6	327371	327376	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427711472
5021	NC_019680	CCG	2	6	327501	327506	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	427711472
5022	NC_019680	TCT	2	6	327515	327520	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427711472
5023	NC_019680	ATC	2	6	327547	327552	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427711472
5024	NC_019680	TCC	2	6	327566	327571	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	427711472
5025	NC_019680	ATC	3	9	327592	327600	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427711472
5026	NC_019680	ATC	2	6	327640	327645	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427711472
5027	NC_019680	TCC	3	9	327650	327658	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	427711472
5028	NC_019680	GGGT	2	8	327840	327847	0 %	25 %	75 %	0 %	427711472
5029	NC_019680	GCG	2	6	327961	327966	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	427711472
5030	NC_019680	TCAC	2	8	327977	327984	25 %	25 %	0 %	50 %	427711472
5031	NC_019680	CCA	2	6	328032	328037	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427711472
5032	NC_019680	TGC	2	6	328042	328047	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427711472
5033	NC_019680	TCG	2	6	328052	328057	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427711472
5034	NC_019680	T	7	7	328634	328640	0 %	100 %	0 %	0 %	427711473
5035	NC_019680	C	7	7	328746	328752	0 %	0 %	0 %	100 %	427711473
5036	NC_019680	G	6	6	328876	328881	0 %	0 %	100 %	0 %	427711473
5037	NC_019680	CAA	2	6	328898	328903	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427711473
5038	NC_019680	ATT	2	6	328983	328988	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427711473
5039	NC_019680	GCC	2	6	328989	328994	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	427711473
5040	NC_019680	ATT	2	6	329058	329063	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427711473
5041	NC_019680	CAA	2	6	329124	329129	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427711473
5042	NC_019680	TGGC	2	8	329157	329164	0 %	25 %	50 %	25 %	427711473
5043	NC_019680	AGC	2	6	329168	329173	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427711473
5044	NC_019680	AAG	2	6	329206	329211	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427711473
5045	NC_019680	CCCG	2	8	329260	329267	0 %	0 %	25 %	75 %	427711473
5046	NC_019680	GTT	2	6	329338	329343	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427711473
5047	NC_019680	AGGCC	2	10	329465	329474	20 %	0 %	40 %	40 %	427711473
5048	NC_019680	ATC	2	6	329485	329490	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427711473
5049	NC_019680	A	6	6	329544	329549	100 %	0 %	0 %	0 %	427711473
5050	NC_019680	GCG	2	6	329728	329733	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	427711473
5051	NC_019680	GGGGC	2	10	329734	329743	0 %	0 %	80 %	20 %	427711473
5052	NC_019680	GGC	2	6	329758	329763	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	427711473
5053	NC_019680	GCG	2	6	329826	329831	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	427711473
5054	NC_019680	T	6	6	329835	329840	0 %	100 %	0 %	0 %	427711473
5055	NC_019680	GCC	2	6	329853	329858	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	427711473
5056	NC_019680	CTG	2	6	329997	330002	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427711473
5057	NC_019680	T	6	6	330024	330029	0 %	100 %	0 %	0 %	427711473
5058	NC_019680	TCCCG	2	10	330039	330048	0 %	20 %	20 %	60 %	427711473
5059	NC_019680	TTC	2	6	330061	330066	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427711473
5060	NC_019680	GCC	2	6	330093	330098	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	427711473
5061	NC_019680	AGC	2	6	330236	330241	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427711473
5062	NC_019680	TC	3	6	330258	330263	0 %	50 %	0 %	50 %	427711473
5063	NC_019680	G	7	7	330428	330434	0 %	0 %	100 %	0 %	427711473
5064	NC_019680	TGC	2	6	330447	330452	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427711473
5065	NC_019680	GCA	2	6	330523	330528	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427711473
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5067	NC_019680	ACC	2	6	330636	330641	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427711473
5068	NC_019680	CACT	2	8	330760	330767	25 %	25 %	0 %	50 %	427711473
5069	NC_019680	AAC	2	6	330834	330839	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427711473
5070	NC_019680	CAA	2	6	330936	330941	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427711473
5071	NC_019680	TAT	2	6	331274	331279	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427711474
5072	NC_019680	A	7	7	331381	331387	100 %	0 %	0 %	0 %	427711474
5073	NC_019680	ATAA	2	8	331430	331437	75 %	25 %	0 %	0 %	427711474
5074	NC_019680	TAA	2	6	331458	331463	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427711474
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5080	NC_019680	TGT	2	6	331911	331916	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427711475
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5082	NC_019680	CAT	2	6	331963	331968	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427711475
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5087	NC_019680	TGT	2	6	332288	332293	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427711475
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5091	NC_019680	CGG	2	6	332372	332377	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	427711475
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5102	NC_019680	CCTGA	2	10	333005	333014	20 %	20 %	20 %	40 %	427711475
5103	NC_019680	GGGGT	2	10	333067	333076	0 %	20 %	80 %	0 %	427711475
5104	NC_019680	CG	3	6	333089	333094	0 %	0 %	50 %	50 %	427711475
5105	NC_019680	G	6	6	333167	333172	0 %	0 %	100 %	0 %	427711475
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5110	NC_019680	CTC	2	6	333429	333434	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	427711476
5111	NC_019680	CAT	2	6	333443	333448	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427711476
5112	NC_019680	CGG	2	6	333458	333463	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	427711476
5113	NC_019680	AAT	2	6	333495	333500	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427711476
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5120	NC_019680	G	6	6	334086	334091	0 %	0 %	100 %	0 %	427711477
5121	NC_019680	GCT	2	6	334102	334107	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427711477
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5123	NC_019680	AAG	2	6	334175	334180	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427711477
5124	NC_019680	T	7	7	334218	334224	0 %	100 %	0 %	0 %	427711477
5125	NC_019680	GTA	2	6	334237	334242	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427711477
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5127	NC_019680	GC	3	6	334523	334528	0 %	0 %	50 %	50 %	427711477
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5235	NC_019680	TGA	2	6	341156	341161	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427711487
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5240	NC_019680	ATT	2	6	341277	341282	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427711487
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5243	NC_019680	GCC	2	6	341383	341388	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	427711487
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5245	NC_019680	AGCC	2	8	341536	341543	25 %	0 %	25 %	50 %	427711487
5246	NC_019680	A	6	6	341622	341627	100 %	0 %	0 %	0 %	427711487
5247	NC_019680	GTT	2	6	341660	341665	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427711487
5248	NC_019680	CTT	2	6	341673	341678	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427711487
5249	NC_019680	ATT	2	6	341709	341714	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427711487
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5251	NC_019680	TGA	2	6	341756	341761	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427711487
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5253	NC_019680	G	6	6	341825	341830	0 %	0 %	100 %	0 %	427711487
5254	NC_019680	AGT	2	6	341883	341888	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427711487
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5260	NC_019680	TTG	3	9	343541	343549	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427711488
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5350	NC_019680	TACCTT	2	12	348501	348512	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	427711493
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5353	NC_019680	TGG	2	6	348560	348565	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427711493
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5357	NC_019680	GCCCC	2	10	348772	348781	0 %	0 %	20 %	80 %	427711493
5358	NC_019680	C	6	6	348778	348783	0 %	0 %	0 %	100 %	427711493
5359	NC_019680	ACT	2	6	348867	348872	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427711493
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5367	NC_019680	TGACCG	2	12	349331	349342	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	427711493
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5369	NC_019680	A	6	6	349429	349434	100 %	0 %	0 %	0 %	427711493
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5490	NC_019680	CTC	2	6	356931	356936	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	427711502
5491	NC_019680	ATT	2	6	356950	356955	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427711502
5492	NC_019680	CATC	2	8	356978	356985	25 %	25 %	0 %	50 %	427711502
5493	NC_019680	GCC	2	6	357019	357024	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	427711502
5494	NC_019680	TC	3	6	357076	357081	0 %	50 %	0 %	50 %	427711502
5495	NC_019680	GGGT	2	8	357109	357116	0 %	25 %	75 %	0 %	427711502
5496	NC_019680	ATT	2	6	357195	357200	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427711502
5497	NC_019680	GTCGG	2	10	357211	357220	0 %	20 %	60 %	20 %	427711502
5498	NC_019680	GCGG	2	8	357221	357228	0 %	0 %	75 %	25 %	427711502
5499	NC_019680	CTC	2	6	357285	357290	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	427711502
5500	NC_019680	GGCC	2	8	357291	357298	0 %	0 %	50 %	50 %	427711502

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