MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Synechococcus sp. PCC 6312 chromosome

Total Repeats: 55484

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_019680	GCCC	2	8	293996	294003	0 %	0 %	25 %	75 %	427711442
4502	NC_019680	AGA	2	6	294055	294060	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427711442
4503	NC_019680	GTG	2	6	294062	294067	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427711442
4504	NC_019680	AGA	2	6	294187	294192	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427711442
4505	NC_019680	GAT	2	6	294298	294303	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427711443
4506	NC_019680	CAC	2	6	294444	294449	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427711443
4507	NC_019680	CCTGG	2	10	294570	294579	0 %	20 %	40 %	40 %	427711443
4508	NC_019680	CCAC	2	8	294650	294657	25 %	0 %	0 %	75 %	427711443
4509	NC_019680	T	6	6	294730	294735	0 %	100 %	0 %	0 %	427711443
4510	NC_019680	GGC	2	6	294811	294816	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	427711443
4511	NC_019680	CCA	2	6	295062	295067	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427711443
4512	NC_019680	AGA	2	6	295092	295097	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427711443
4513	NC_019680	GCC	2	6	295211	295216	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	427711443
4514	NC_019680	CAGT	2	8	295263	295270	25 %	25 %	25 %	25 %	427711443
4515	NC_019680	GAC	2	6	295328	295333	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427711443
4516	NC_019680	CT	3	6	295554	295559	0 %	50 %	0 %	50 %	427711444
4517	NC_019680	GCG	2	6	295586	295591	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	427711444
4518	NC_019680	TGG	2	6	295705	295710	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427711444
4519	NC_019680	GTG	2	6	295818	295823	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427711444
4520	NC_019680	AGA	2	6	295826	295831	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427711444
4521	NC_019680	GTG	2	6	295959	295964	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427711444
4522	NC_019680	CCTTGG	2	12	295984	295995	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427711444
4523	NC_019680	AGT	2	6	296021	296026	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427711444
4524	NC_019680	GACTGA	2	12	296039	296050	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	427711444
4525	NC_019680	TGG	2	6	296073	296078	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427711444
4526	NC_019680	ATG	2	6	296103	296108	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427711445
4527	NC_019680	TTAA	2	8	296115	296122	50 %	50 %	0 %	0 %	427711445
4528	NC_019680	TG	3	6	296148	296153	0 %	50 %	50 %	0 %	427711445
4529	NC_019680	CGG	2	6	296191	296196	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	427711445
4530	NC_019680	TTGT	2	8	296254	296261	0 %	75 %	25 %	0 %	427711445
4531	NC_019680	GCG	2	6	296277	296282	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	427711445
4532	NC_019680	TGC	2	6	296314	296319	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427711445
4533	NC_019680	GGT	2	6	296339	296344	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427711445
4534	NC_019680	GCA	2	6	296369	296374	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427711445
4535	NC_019680	CGGAT	2	10	296455	296464	20 %	20 %	40 %	20 %	427711445
4536	NC_019680	GAA	2	6	296469	296474	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427711445
4537	NC_019680	TAC	2	6	296499	296504	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427711445
4538	NC_019680	TTGG	2	8	296538	296545	0 %	50 %	50 %	0 %	427711445
4539	NC_019680	GGT	2	6	296649	296654	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427711445
4540	NC_019680	CAA	3	9	296696	296704	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427711445
4541	NC_019680	GAT	2	6	296754	296759	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427711445
4542	NC_019680	ATTG	2	8	296831	296838	25 %	50 %	25 %	0 %	427711445
4543	NC_019680	TGC	2	6	296858	296863	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427711445
4544	NC_019680	TCC	2	6	296926	296931	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	427711445
4545	NC_019680	GTT	2	6	296954	296959	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427711445
4546	NC_019680	GAA	2	6	297005	297010	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427711445
4547	NC_019680	A	6	6	297009	297014	100 %	0 %	0 %	0 %	427711445
4548	NC_019680	GCC	2	6	297033	297038	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	427711445
4549	NC_019680	CAA	2	6	297261	297266	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427711446
4550	NC_019680	GAT	2	6	297311	297316	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427711446
4551	NC_019680	TGA	2	6	297351	297356	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427711446
4552	NC_019680	ATC	2	6	297465	297470	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427711446
4553	NC_019680	CAC	2	6	297554	297559	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427711447
4554	NC_019680	GACT	2	8	297592	297599	25 %	25 %	25 %	25 %	427711447
4555	NC_019680	GGC	2	6	297692	297697	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	427711447
4556	NC_019680	CCG	2	6	297730	297735	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	427711447
4557	NC_019680	CT	3	6	297809	297814	0 %	50 %	0 %	50 %	427711447
4558	NC_019680	GCA	2	6	297900	297905	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427711447
4559	NC_019680	GTT	2	6	298186	298191	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427711448
4560	NC_019680	TG	3	6	298219	298224	0 %	50 %	50 %	0 %	427711448
4561	NC_019680	CAC	2	6	298278	298283	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427711448
4562	NC_019680	TTG	2	6	298322	298327	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427711448
4563	NC_019680	GCG	2	6	298398	298403	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	427711448
4564	NC_019680	CA	3	6	298416	298421	50 %	0 %	0 %	50 %	427711448
4565	NC_019680	GAA	2	6	298510	298515	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427711448
4566	NC_019680	CCA	2	6	298631	298636	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427711448
4567	NC_019680	ATC	2	6	298675	298680	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427711448
4568	NC_019680	GGT	2	6	298756	298761	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427711448
4569	NC_019680	A	7	7	298858	298864	100 %	0 %	0 %	0 %	427711448
4570	NC_019680	GCG	2	6	298951	298956	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	427711448
4571	NC_019680	TTA	2	6	299012	299017	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427711448
4572	NC_019680	GAG	2	6	299074	299079	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	427711448
4573	NC_019680	TG	3	6	299081	299086	0 %	50 %	50 %	0 %	427711448
4574	NC_019680	AGA	2	6	299151	299156	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427711448
4575	NC_019680	TGA	2	6	299160	299165	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427711448
4576	NC_019680	TGG	2	6	299174	299179	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427711448
4577	NC_019680	G	6	6	299178	299183	0 %	0 %	100 %	0 %	427711448
4578	NC_019680	CGG	2	6	299198	299203	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	427711448
4579	NC_019680	A	7	7	299218	299224	100 %	0 %	0 %	0 %	427711448
4580	NC_019680	CCAA	2	8	299240	299247	50 %	0 %	0 %	50 %	427711448
4581	NC_019680	GGC	2	6	299280	299285	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	427711448
4582	NC_019680	CTG	2	6	299329	299334	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427711448
4583	NC_019680	TGA	2	6	299378	299383	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427711448
4584	NC_019680	ACC	2	6	299404	299409	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427711448
4585	NC_019680	A	7	7	299418	299424	100 %	0 %	0 %	0 %	427711448
4586	NC_019680	C	6	6	299552	299557	0 %	0 %	0 %	100 %	427711448
4587	NC_019680	ACA	2	6	299643	299648	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427711448
4588	NC_019680	CTG	2	6	299729	299734	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427711448
4589	NC_019680	AAC	2	6	299777	299782	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427711448
4590	NC_019680	GCA	2	6	299958	299963	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427711448
4591	NC_019680	CT	3	6	299966	299971	0 %	50 %	0 %	50 %	427711448
4592	NC_019680	GCG	2	6	300004	300009	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	427711448
4593	NC_019680	TGG	2	6	300051	300056	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427711448
4594	NC_019680	GAT	2	6	300058	300063	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427711448
4595	NC_019680	TGAT	2	8	300065	300072	25 %	50 %	25 %	0 %	427711448
4596	NC_019680	AG	3	6	300177	300182	50 %	0 %	50 %	0 %	427711449
4597	NC_019680	AAT	2	6	300256	300261	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427711449
4598	NC_019680	GTT	2	6	300360	300365	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427711449
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4601	NC_019680	TGC	2	6	300692	300697	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427711449
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4603	NC_019680	TGT	2	6	300802	300807	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427711449
4604	NC_019680	TCAA	2	8	300872	300879	50 %	25 %	0 %	25 %	427711449
4605	NC_019680	TTC	2	6	300892	300897	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427711449
4606	NC_019680	ATCC	2	8	300923	300930	25 %	25 %	0 %	50 %	427711449
4607	NC_019680	GA	3	6	301072	301077	50 %	0 %	50 %	0 %	427711449
4608	NC_019680	CCAG	2	8	301085	301092	25 %	0 %	25 %	50 %	427711449
4609	NC_019680	TTG	2	6	301153	301158	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427711449
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4611	NC_019680	CATC	2	8	301284	301291	25 %	25 %	0 %	50 %	427711449
4612	NC_019680	AGT	2	6	301369	301374	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427711449
4613	NC_019680	GCA	2	6	301611	301616	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427711450
4614	NC_019680	GTT	2	6	301629	301634	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427711450
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4616	NC_019680	GGCTGG	2	12	301641	301652	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	427711450
4617	NC_019680	CAA	2	6	301746	301751	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427711450
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4620	NC_019680	TTAA	2	8	301885	301892	50 %	50 %	0 %	0 %	427711450
4621	NC_019680	TGA	2	6	302004	302009	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427711450
4622	NC_019680	ATT	2	6	302038	302043	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427711450
4623	NC_019680	GAT	2	6	302062	302067	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427711450
4624	NC_019680	CAA	2	6	302149	302154	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427711450
4625	NC_019680	CAA	2	6	302217	302222	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427711450
4626	NC_019680	TGA	2	6	302235	302240	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427711450
4627	NC_019680	CAA	2	6	302269	302274	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427711450
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4654	NC_019680	CGG	2	6	303505	303510	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	427711450
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4734	NC_019680	GGCCA	2	10	307673	307682	20 %	0 %	40 %	40 %	427711456
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4741	NC_019680	G	6	6	308269	308274	0 %	0 %	100 %	0 %	427711456
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4866	NC_019680	TGG	2	6	316273	316278	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427711460
4867	NC_019680	TTG	2	6	316292	316297	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427711460
4868	NC_019680	TAGG	2	8	316312	316319	25 %	25 %	50 %	0 %	427711460
4869	NC_019680	ATG	2	6	316338	316343	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427711460
4870	NC_019680	AAT	2	6	316493	316498	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427711460
4871	NC_019680	GGGC	2	8	316552	316559	0 %	0 %	75 %	25 %	427711460
4872	NC_019680	GGCTGA	2	12	316571	316582	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	427711460
4873	NC_019680	AG	3	6	316599	316604	50 %	0 %	50 %	0 %	427711460
4874	NC_019680	A	7	7	316611	316617	100 %	0 %	0 %	0 %	427711460
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4895	NC_019680	CAGA	2	8	317675	317682	50 %	0 %	25 %	25 %	427711462
4896	NC_019680	AGTT	2	8	317744	317751	25 %	50 %	25 %	0 %	427711462
4897	NC_019680	ATGA	2	8	318024	318031	50 %	25 %	25 %	0 %	427711463
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4987	NC_019680	GCCTG	2	10	324370	324379	0 %	20 %	40 %	40 %	427711470
4988	NC_019680	ACA	2	6	324466	324471	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427711470
4989	NC_019680	ACC	2	6	324525	324530	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427711470
4990	NC_019680	CATCA	2	10	324545	324554	40 %	20 %	0 %	40 %	427711470
4991	NC_019680	GGTA	2	8	324556	324563	25 %	25 %	50 %	0 %	427711470
4992	NC_019680	TTC	2	6	324621	324626	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427711470
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5000	NC_019680	GC	3	6	326024	326029	0 %	0 %	50 %	50 %	427711471

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