MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Saccharothrix espanaensis DSM 44229 complete genome

Total Repeats: 254494

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_019673	CACCG	2	10	202620	202629	20 %	0 %	20 %	60 %	433602032
5502	NC_019673	GCG	2	6	202630	202635	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433602032
5503	NC_019673	CGG	2	6	202643	202648	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433602032
5504	NC_019673	CAC	2	6	202754	202759	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433602032
5505	NC_019673	GCG	2	6	202786	202791	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433602032
5506	NC_019673	ATCC	2	8	202794	202801	25 %	25 %	0 %	50 %	433602032
5507	NC_019673	CGG	2	6	203369	203374	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433602033
5508	NC_019673	TCC	2	6	203459	203464	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	433602033
5509	NC_019673	GCG	2	6	203479	203484	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433602033
5510	NC_019673	CGG	3	9	203593	203601	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433602034
5511	NC_019673	CGG	2	6	203618	203623	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433602034
5512	NC_019673	CG	3	6	203658	203663	0 %	0 %	50 %	50 %	433602034
5513	NC_019673	GCA	2	6	203690	203695	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433602034
5514	NC_019673	GGC	2	6	203727	203732	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433602034
5515	NC_019673	CGA	2	6	203816	203821	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433602034
5516	NC_019673	CGA	2	6	203861	203866	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433602034
5517	NC_019673	CCA	2	6	203996	204001	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433602034
5518	NC_019673	GCG	2	6	204075	204080	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433602034
5519	NC_019673	AGC	2	6	204091	204096	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433602034
5520	NC_019673	CAG	2	6	204105	204110	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433602034
5521	NC_019673	CGGC	2	8	204128	204135	0 %	0 %	50 %	50 %	433602034
5522	NC_019673	CGG	2	6	204173	204178	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433602034
5523	NC_019673	GCG	2	6	204274	204279	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433602034
5524	NC_019673	CGG	2	6	204287	204292	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433602034
5525	NC_019673	CTTGGC	2	12	204327	204338	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433602034
5526	NC_019673	CCA	2	6	204371	204376	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433602034
5527	NC_019673	CCG	2	6	204409	204414	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433602034
5528	NC_019673	GCA	2	6	204465	204470	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433602034
5529	NC_019673	AGCCGG	2	12	204481	204492	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	433602034
5530	NC_019673	TCG	3	9	204493	204501	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433602034
5531	NC_019673	GGGTG	2	10	204519	204528	0 %	20 %	80 %	0 %	433602034
5532	NC_019673	TCG	2	6	204529	204534	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433602034
5533	NC_019673	GCA	2	6	204536	204541	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433602034
5534	NC_019673	CCT	2	6	204548	204553	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	433602034
5535	NC_019673	GTC	2	6	204561	204566	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433602034
5536	NC_019673	GGT	3	9	204612	204620	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433602034
5537	NC_019673	CAGC	2	8	204621	204628	25 %	0 %	25 %	50 %	433602034
5538	NC_019673	CGGC	2	8	204653	204660	0 %	0 %	50 %	50 %	433602034
5539	NC_019673	CGG	2	6	204671	204676	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433602034
5540	NC_019673	CGG	3	9	204689	204697	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433602034
5541	NC_019673	CCT	2	6	204698	204703	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	433602034
5542	NC_019673	CCGC	2	8	204946	204953	0 %	0 %	25 %	75 %	433602035
5543	NC_019673	ACC	2	6	204969	204974	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433602035
5544	NC_019673	GCCC	2	8	204997	205004	0 %	0 %	25 %	75 %	433602035
5545	NC_019673	CGTT	2	8	205035	205042	0 %	50 %	25 %	25 %	433602035
5546	NC_019673	TGC	2	6	205072	205077	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433602035
5547	NC_019673	GTC	2	6	205091	205096	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433602035
5548	NC_019673	CCGG	3	12	205196	205207	0 %	0 %	50 %	50 %	433602036
5549	NC_019673	ATC	2	6	205217	205222	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433602036
5550	NC_019673	CG	3	6	205292	205297	0 %	0 %	50 %	50 %	433602036
5551	NC_019673	ACC	2	6	205310	205315	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433602036
5552	NC_019673	TCG	2	6	205337	205342	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433602036
5553	NC_019673	CAG	2	6	205357	205362	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433602036
5554	NC_019673	CGC	2	6	205401	205406	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433602036
5555	NC_019673	GTC	2	6	205444	205449	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433602036
5556	NC_019673	GGT	2	6	205459	205464	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433602036
5557	NC_019673	CCG	2	6	205603	205608	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433602036
5558	NC_019673	GTC	3	9	205663	205671	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433602036
5559	NC_019673	ACCC	2	8	205685	205692	25 %	0 %	0 %	75 %	433602036
5560	NC_019673	CGG	2	6	205712	205717	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433602036
5561	NC_019673	TCC	3	9	205718	205726	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	433602036
5562	NC_019673	GCC	2	6	205732	205737	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433602036
5563	NC_019673	GTC	2	6	205778	205783	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433602036
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5565	NC_019673	GCACC	2	10	206607	206616	20 %	0 %	20 %	60 %	433602037
5566	NC_019673	GAC	2	6	206635	206640	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433602037
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5571	NC_019673	TCG	2	6	206789	206794	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433602037
5572	NC_019673	GGT	2	6	206799	206804	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433602037
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5579	NC_019673	CG	3	6	207060	207065	0 %	0 %	50 %	50 %	433602037
5580	NC_019673	CTG	2	6	207121	207126	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433602037
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5587	NC_019673	GCT	2	6	207393	207398	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433602037
5588	NC_019673	GTC	2	6	207399	207404	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433602037
5589	NC_019673	CGCT	2	8	207406	207413	0 %	25 %	25 %	50 %	433602037
5590	NC_019673	CGGC	2	8	207440	207447	0 %	0 %	50 %	50 %	433602037
5591	NC_019673	TCGGGC	2	12	207458	207469	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	433602037
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5599	NC_019673	G	6	6	208019	208024	0 %	0 %	100 %	0 %	433602038
5600	NC_019673	CG	3	6	208089	208094	0 %	0 %	50 %	50 %	433602038
5601	NC_019673	GCC	2	6	208104	208109	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433602038
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5604	NC_019673	GTCG	2	8	208214	208221	0 %	25 %	50 %	25 %	433602038
5605	NC_019673	GGT	2	6	208226	208231	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433602038
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5609	NC_019673	GCCG	2	8	208309	208316	0 %	0 %	50 %	50 %	433602038
5610	NC_019673	ACG	2	6	208342	208347	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433602038
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5612	NC_019673	GGT	2	6	208407	208412	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433602038
5613	NC_019673	TCGA	2	8	208434	208441	25 %	25 %	25 %	25 %	433602038
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5615	NC_019673	GCACG	2	10	208466	208475	20 %	0 %	40 %	40 %	433602038
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5621	NC_019673	CGG	2	6	208646	208651	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433602038
5622	NC_019673	GCT	2	6	208664	208669	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433602038
5623	NC_019673	CGG	2	6	208675	208680	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433602038
5624	NC_019673	CGC	2	6	208694	208699	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433602038
5625	NC_019673	CGT	3	9	208709	208717	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433602038
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5739	NC_019673	GCT	2	6	213108	213113	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433602044
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5741	NC_019673	CGG	2	6	213241	213246	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433602044
5742	NC_019673	GCC	2	6	213258	213263	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433602044
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5744	NC_019673	TGG	3	9	213332	213340	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433602044
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5746	NC_019673	GT	3	6	213350	213355	0 %	50 %	50 %	0 %	433602044
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5855	NC_019673	CGGC	2	8	217085	217092	0 %	0 %	50 %	50 %	433602049
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5971	NC_019673	CTGG	2	8	221843	221850	0 %	25 %	50 %	25 %	433602054
5972	NC_019673	GTCGAC	2	12	221895	221906	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	433602054
5973	NC_019673	CGATCC	2	12	221932	221943	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	433602054
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5979	NC_019673	CAGC	2	8	222360	222367	25 %	0 %	25 %	50 %	433602055
5980	NC_019673	CAGC	2	8	222370	222377	25 %	0 %	25 %	50 %	433602055
5981	NC_019673	CAG	2	6	222380	222385	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433602055
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5983	NC_019673	CGCC	2	8	222430	222437	0 %	0 %	25 %	75 %	433602055
5984	NC_019673	CGC	2	6	222445	222450	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433602055
5985	NC_019673	GCC	2	6	222794	222799	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433602056
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5987	NC_019673	GC	3	6	222824	222829	0 %	0 %	50 %	50 %	433602056
5988	NC_019673	CGA	2	6	222846	222851	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433602056
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5990	NC_019673	GCA	2	6	222945	222950	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433602056
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5992	NC_019673	TCG	2	6	223076	223081	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433602056
5993	NC_019673	CGT	2	6	223173	223178	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433602056
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