MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Saccharothrix espanaensis DSM 44229 complete genome

Total Repeats: 254494

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_019673	GCC	2	6	178858	178863	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433602015
5002	NC_019673	CCG	2	6	178901	178906	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433602015
5003	NC_019673	GCCG	2	8	178913	178920	0 %	0 %	50 %	50 %	433602015
5004	NC_019673	CTGGCC	2	12	178932	178943	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	433602015
5005	NC_019673	CCG	2	6	179026	179031	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433602015
5006	NC_019673	CGC	2	6	179139	179144	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433602016
5007	NC_019673	CCCTCG	2	12	179153	179164	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	433602016
5008	NC_019673	CCG	2	6	179165	179170	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433602016
5009	NC_019673	CGC	2	6	179184	179189	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433602016
5010	NC_019673	CCG	2	6	179192	179197	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433602016
5011	NC_019673	AAG	2	6	179221	179226	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	433602016
5012	NC_019673	CGG	2	6	179298	179303	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433602016
5013	NC_019673	CG	3	6	179308	179313	0 %	0 %	50 %	50 %	433602016
5014	NC_019673	CAC	2	6	179319	179324	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433602016
5015	NC_019673	ACG	2	6	179330	179335	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433602016
5016	NC_019673	GCGCG	2	10	179364	179373	0 %	0 %	60 %	40 %	433602016
5017	NC_019673	CAC	2	6	179385	179390	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433602016
5018	NC_019673	CAC	2	6	179445	179450	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433602016
5019	NC_019673	CGC	2	6	179480	179485	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433602016
5020	NC_019673	GCG	2	6	179498	179503	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433602016
5021	NC_019673	GACGC	2	10	179533	179542	20 %	0 %	40 %	40 %	433602016
5022	NC_019673	CGAC	2	8	179555	179562	25 %	0 %	25 %	50 %	433602016
5023	NC_019673	CGGCG	2	10	179602	179611	0 %	0 %	60 %	40 %	433602016
5024	NC_019673	CGG	3	9	179642	179650	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433602016
5025	NC_019673	AAC	2	6	179677	179682	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	433602016
5026	NC_019673	GC	3	6	179714	179719	0 %	0 %	50 %	50 %	433602016
5027	NC_019673	CGT	2	6	179724	179729	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433602016
5028	NC_019673	CGG	2	6	179736	179741	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433602016
5029	NC_019673	GGA	2	6	179817	179822	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	433602016
5030	NC_019673	CGT	2	6	179874	179879	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433602016
5031	NC_019673	GC	3	6	179888	179893	0 %	0 %	50 %	50 %	433602016
5032	NC_019673	CTG	2	6	179953	179958	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433602016
5033	NC_019673	GGC	2	6	179977	179982	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433602016
5034	NC_019673	AAC	2	6	179995	180000	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	433602016
5035	NC_019673	TGG	2	6	180016	180021	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433602016
5036	NC_019673	GAG	2	6	180028	180033	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	433602016
5037	NC_019673	GCT	2	6	180039	180044	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433602016
5038	NC_019673	AGC	3	9	180080	180088	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433602016
5039	NC_019673	ACG	2	6	180152	180157	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433602016
5040	NC_019673	GGCGCG	2	12	180178	180189	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433602016
5041	NC_019673	TCGT	2	8	180220	180227	0 %	50 %	25 %	25 %	433602016
5042	NC_019673	GAA	2	6	180246	180251	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	433602016
5043	NC_019673	CCGG	2	8	180278	180285	0 %	0 %	50 %	50 %	433602016
5044	NC_019673	TCA	2	6	180302	180307	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433602016
5045	NC_019673	CGGC	2	8	180320	180327	0 %	0 %	50 %	50 %	433602016
5046	NC_019673	GGCG	2	8	180390	180397	0 %	0 %	75 %	25 %	433602016
5047	NC_019673	ACC	2	6	180416	180421	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433602016
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5050	NC_019673	CG	3	6	180560	180565	0 %	0 %	50 %	50 %	433602016
5051	NC_019673	GCG	2	6	180568	180573	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433602016
5052	NC_019673	CACGAC	2	12	180598	180609	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	433602016
5053	NC_019673	ACG	2	6	180617	180622	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433602016
5054	NC_019673	GTA	2	6	180630	180635	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433602016
5055	NC_019673	GC	3	6	180781	180786	0 %	0 %	50 %	50 %	433602017
5056	NC_019673	GCC	3	9	180871	180879	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433602017
5057	NC_019673	GTC	2	6	180898	180903	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433602017
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5059	NC_019673	GCC	2	6	180929	180934	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433602017
5060	NC_019673	GTC	2	6	180940	180945	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433602017
5061	NC_019673	CGA	2	6	180976	180981	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433602017
5062	NC_019673	CGTGG	2	10	180994	181003	0 %	20 %	60 %	20 %	433602017
5063	NC_019673	CAG	2	6	181099	181104	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433602017
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5065	NC_019673	GCC	2	6	181159	181164	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433602017
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5070	NC_019673	CGC	2	6	181284	181289	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433602017
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5078	NC_019673	GCC	4	12	181504	181515	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433602017
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5093	NC_019673	GAC	2	6	182798	182803	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433602018
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5108	NC_019673	CAG	2	6	183476	183481	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433602018
5109	NC_019673	CCAG	2	8	183499	183506	25 %	0 %	25 %	50 %	433602018
5110	NC_019673	GGC	2	6	183530	183535	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433602018
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5119	NC_019673	GCCG	2	8	183821	183828	0 %	0 %	50 %	50 %	433602018
5120	NC_019673	TCG	2	6	183873	183878	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433602018
5121	NC_019673	CGA	2	6	183928	183933	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433602018
5122	NC_019673	GCCGC	2	10	183987	183996	0 %	0 %	40 %	60 %	433602018
5123	NC_019673	GTC	2	6	184118	184123	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433602018
5124	NC_019673	CGA	2	6	184375	184380	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433602019
5125	NC_019673	GGA	2	6	184429	184434	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	433602019
5126	NC_019673	TGCGGA	2	12	184521	184532	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	433602019
5127	NC_019673	CGA	2	6	184546	184551	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433602019
5128	NC_019673	CCT	2	6	184557	184562	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	433602019
5129	NC_019673	CTG	2	6	184610	184615	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433602019
5130	NC_019673	CGC	3	9	184616	184624	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433602019
5131	NC_019673	CTG	2	6	184739	184744	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433602019
5132	NC_019673	GAG	2	6	184751	184756	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	433602019
5133	NC_019673	AGG	2	6	184758	184763	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	433602019
5134	NC_019673	TCA	2	6	184788	184793	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433602019
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5137	NC_019673	CGA	2	6	185330	185335	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433602020
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5140	NC_019673	CG	3	6	186228	186233	0 %	0 %	50 %	50 %	433602021
5141	NC_019673	CG	3	6	186238	186243	0 %	0 %	50 %	50 %	433602021
5142	NC_019673	ACC	2	6	186265	186270	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433602021
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5144	NC_019673	TGG	2	6	186281	186286	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433602021
5145	NC_019673	GAC	2	6	186322	186327	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433602021
5146	NC_019673	ACCGGC	2	12	186328	186339	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	433602021
5147	NC_019673	GCC	2	6	186372	186377	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433602021
5148	NC_019673	GCCG	2	8	186468	186475	0 %	0 %	50 %	50 %	433602021
5149	NC_019673	ACC	2	6	186486	186491	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433602021
5150	NC_019673	CGGA	2	8	186547	186554	25 %	0 %	50 %	25 %	433602021
5151	NC_019673	GC	3	6	186575	186580	0 %	0 %	50 %	50 %	433602021
5152	NC_019673	CCG	2	6	186608	186613	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433602021
5153	NC_019673	TGC	2	6	186647	186652	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433602021
5154	NC_019673	CGG	2	6	186678	186683	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433602021
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5156	NC_019673	CGG	2	6	186714	186719	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433602021
5157	NC_019673	GCG	2	6	186786	186791	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433602021
5158	NC_019673	TTC	3	9	186841	186849	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433602021
5159	NC_019673	CCCGA	2	10	186868	186877	20 %	0 %	20 %	60 %	433602021
5160	NC_019673	GCG	2	6	186921	186926	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433602021
5161	NC_019673	AGC	2	6	186989	186994	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433602021
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5163	NC_019673	CGG	3	9	187017	187025	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433602021
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5170	NC_019673	CG	3	6	187227	187232	0 %	0 %	50 %	50 %	433602021
5171	NC_019673	CGC	2	6	187419	187424	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433602021
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5179	NC_019673	CGT	2	6	187677	187682	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433602021
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5181	NC_019673	ACG	2	6	187745	187750	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433602021
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5200	NC_019673	GGT	2	6	188574	188579	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433602021
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5226	NC_019673	CGT	2	6	189642	189647	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433602022
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5230	NC_019673	GCT	2	6	189822	189827	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433602022
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5232	NC_019673	CTG	2	6	189850	189855	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433602022
5233	NC_019673	CGC	2	6	189879	189884	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433602022
5234	NC_019673	GATCGC	2	12	189900	189911	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	433602022
5235	NC_019673	CGG	2	6	189978	189983	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433602022
5236	NC_019673	CGG	2	6	190023	190028	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433602022
5237	NC_019673	TGA	2	6	190079	190084	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433602022
5238	NC_019673	GAA	2	6	190113	190118	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	433602022
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5240	NC_019673	TGC	3	9	190193	190201	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433602022
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5361	NC_019673	CGG	2	6	194356	194361	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433602026
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5480	NC_019673	GCT	2	6	200745	200750	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433602031
5481	NC_019673	CTG	2	6	200785	200790	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433602031
5482	NC_019673	CG	3	6	200842	200847	0 %	0 %	50 %	50 %	433602031
5483	NC_019673	GCGG	2	8	200866	200873	0 %	0 %	75 %	25 %	433602031
5484	NC_019673	GGT	2	6	200880	200885	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433602031
5485	NC_019673	GTA	2	6	200893	200898	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433602031
5486	NC_019673	ATT	2	6	200937	200942	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	433602031
5487	NC_019673	GC	3	6	200951	200956	0 %	0 %	50 %	50 %	433602031
5488	NC_019673	CCGA	2	8	201012	201019	25 %	0 %	25 %	50 %	433602031
5489	NC_019673	GCG	2	6	201033	201038	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433602031
5490	NC_019673	TG	3	6	201052	201057	0 %	50 %	50 %	0 %	433602031
5491	NC_019673	CACCT	2	10	201092	201101	20 %	20 %	0 %	60 %	433602031
5492	NC_019673	GAT	2	6	202363	202368	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433602032
5493	NC_019673	GCTG	2	8	202371	202378	0 %	25 %	50 %	25 %	433602032
5494	NC_019673	CAG	2	6	202381	202386	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433602032
5495	NC_019673	TGC	2	6	202403	202408	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433602032
5496	NC_019673	CTC	2	6	202467	202472	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	433602032
5497	NC_019673	AG	3	6	202489	202494	50 %	0 %	50 %	0 %	433602032
5498	NC_019673	CGC	5	15	202517	202531	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433602032
5499	NC_019673	GTA	2	6	202533	202538	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433602032
5500	NC_019673	GGGC	2	8	202592	202599	0 %	0 %	75 %	25 %	433602032

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