MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Streptococcus agalactiae SA20-06 chromosome

Total Repeats: 620

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019048	ATTTAC	2	12	351	362	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	410593713
2	NC_019048	TGCTTA	2	12	8968	8979	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	410593718
3	NC_019048	AGAAAA	2	12	10726	10737	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	410593722
4	NC_019048	GTATTG	2	12	12189	12200	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	410593724
5	NC_019048	GAAAGA	2	12	15205	15216	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410593726
6	NC_019048	CTACAG	2	12	29682	29693	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	410593727
7	NC_019048	ACTGAG	2	12	37115	37126	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	410593734
8	NC_019048	CAGGCG	2	12	37569	37580	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	410593734
9	NC_019048	TGATGC	2	12	45214	45225	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	410593739
10	NC_019048	AATGAA	2	12	47244	47255	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	410593741
11	NC_019048	CAAATA	2	12	48440	48451	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	410593741
12	NC_019048	ATTTAG	2	12	52727	52738	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	410593745
13	NC_019048	AGGTAG	2	12	52937	52948	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	410593745
14	NC_019048	ACCAAA	2	12	55885	55896	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410593749
15	NC_019048	ATATGC	2	12	61043	61054	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	410593754
16	NC_019048	CGTACC	2	12	66156	66167	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	410593758
17	NC_019048	GGTAAA	2	12	66991	67002	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	410593760
18	NC_019048	CAGTAT	2	12	74372	74383	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	410593764
19	NC_019048	AAAGGT	2	12	77034	77045	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	410593767
20	NC_019048	CGCAAT	2	12	79615	79626	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	410593772
21	NC_019048	ATTGAA	2	12	80027	80038	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	410593773
22	NC_019048	ACATCA	2	12	80163	80174	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	410593773
23	NC_019048	ATCGTT	2	12	82704	82715	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	410593779
24	NC_019048	TAAAGG	2	12	84120	84131	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	410593781
25	NC_019048	ATAAAA	2	12	84303	84314	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	410593782
26	NC_019048	TTTCTG	2	12	85134	85145	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	410593783
27	NC_019048	AAATTA	2	12	85178	85189	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410593784
28	NC_019048	ATTGAA	2	12	88107	88118	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	410593788
29	NC_019048	GTAAAG	2	12	88792	88803	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	410593790
30	NC_019048	TTGATA	2	12	98170	98181	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	410593794
31	NC_019048	TTTTCT	2	12	102768	102779	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	410593801
32	NC_019048	TTTTGA	2	12	103718	103729	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	410593802
33	NC_019048	ACTGAA	2	12	104564	104575	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	410593803
34	NC_019048	AACTCA	2	12	105967	105978	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	410593804
35	NC_019048	TTGTCA	2	12	106124	106135	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	410593804
36	NC_019048	TAACGA	2	12	113199	113210	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	410593811
37	NC_019048	TGACCT	2	12	115990	116001	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	410593814
38	NC_019048	CACCGT	2	12	117164	117175	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	410593814
39	NC_019048	GAGGAA	2	12	121968	121979	50 %	0 %	50 %	0 %	410593819
40	NC_019048	CAATGG	2	12	122599	122610	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	410593819
41	NC_019048	GCTTTT	2	12	124892	124903	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	410593821
42	NC_019048	CACCAG	2	12	128448	128459	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	410593825
43	NC_019048	TCAGGT	2	12	131549	131560	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	410593828
44	NC_019048	CAAAGA	2	12	131651	131662	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	410593828
45	NC_019048	TAGTAT	2	12	132937	132948	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	410593830
46	NC_019048	GTTAAC	2	12	137385	137396	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	410593833
47	NC_019048	GTTCAT	2	12	140369	140380	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	410593836
48	NC_019048	GTTGAA	2	12	140486	140497	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410593836
49	NC_019048	ACAAAA	2	12	141539	141550	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	410593837
50	NC_019048	CAGAAG	2	12	141927	141938	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	410593837
51	NC_019048	TTGATA	2	12	144375	144386	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	410593840
52	NC_019048	TTTGAT	2	12	149205	149216	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	410593843
53	NC_019048	TTTAGA	2	12	153327	153338	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	410593847
54	NC_019048	TTTCTA	2	12	154023	154034	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	410593847
55	NC_019048	CTGAAG	2	12	155931	155942	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	410593849
56	NC_019048	TTTGGT	2	12	156286	156297	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410593850
57	NC_019048	TCTGTT	2	12	157010	157021	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	410593850
58	NC_019048	AAATCA	2	12	164102	164113	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	410593856
59	NC_019048	GACAAC	2	12	164202	164213	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	410593856
60	NC_019048	TATGAT	2	12	170292	170303	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	410593857
61	NC_019048	ATAATG	2	12	170393	170404	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	410593857
62	NC_019048	TATTGC	2	12	172840	172851	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	410593860
63	NC_019048	TAAACC	2	12	174342	174353	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	410593861
64	NC_019048	TACGGT	2	12	183285	183296	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	410593865
65	NC_019048	GTGAAG	2	12	184330	184341	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	410593865
66	NC_019048	TTATTT	2	12	188922	188933	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	410593868
67	NC_019048	GTGTAT	2	12	191342	191353	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	410593872
68	NC_019048	TATTAG	2	12	192600	192611	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	410593874
69	NC_019048	GCTTGT	2	12	194827	194838	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	410593877
70	NC_019048	CAGTTT	2	12	197836	197847	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	410593882
71	NC_019048	GCTTTG	2	12	199592	199603	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	410593884
72	NC_019048	TGGTAG	2	12	202695	202706	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	410593887
73	NC_019048	TCAAAA	2	12	203851	203862	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	410593889
74	NC_019048	AGCTAA	2	12	204814	204825	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	410593889
75	NC_019048	TATTAA	2	12	204979	204990	50 %	50 %	0 %	0 %	410593889
76	NC_019048	GTCATG	2	12	205344	205355	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	410593889
77	NC_019048	GTTGAA	2	12	214518	214529	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410593896
78	NC_019048	AAATCA	2	12	215322	215333	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	410593897
79	NC_019048	ATTGAT	2	12	221731	221742	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	410593902
80	NC_019048	AGCTAG	2	12	228238	228249	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	410593913
81	NC_019048	GCACAA	2	12	229029	229040	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	410593915
82	NC_019048	AGCTAA	2	12	231209	231220	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	410593919
83	NC_019048	ATGTGA	2	12	233536	233547	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410593925
84	NC_019048	AGGATT	2	12	235189	235200	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410593926
85	NC_019048	TTCCAA	2	12	237271	237282	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410593929
86	NC_019048	TTGATA	2	12	245790	245801	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	410593931
87	NC_019048	TTAAAT	2	12	252410	252421	50 %	50 %	0 %	0 %	410593938
88	NC_019048	CATAAG	2	12	254526	254537	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	410593941
89	NC_019048	TTAGAC	2	12	267815	267826	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	410593954
90	NC_019048	TTTTAT	2	12	272587	272598	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	410593958
91	NC_019048	CGGTAA	2	12	272599	272610	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	410593958
92	NC_019048	GTTCAG	2	12	279357	279368	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	410593964
93	NC_019048	ATTTTA	2	12	282263	282274	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410593966
94	NC_019048	AACGTA	2	12	283088	283099	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	410593966
95	NC_019048	TATTGA	2	12	283164	283175	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	410593966
96	NC_019048	GAAAAA	3	18	283452	283469	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	410593966
97	NC_019048	AATTGA	2	12	285611	285622	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	410593969
98	NC_019048	ACTTAT	2	12	288856	288867	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	410593972
99	NC_019048	TAGTAA	2	12	291344	291355	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	410593974
100	NC_019048	TTACCA	3	18	291420	291437	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410593975
101	NC_019048	AGTACC	2	12	291995	292006	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	410593975
102	NC_019048	TTTTCT	2	12	294161	294172	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	410593976
103	NC_019048	CAAGAA	2	12	297288	297299	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	410593981
104	NC_019048	AGTTCT	2	12	297525	297536	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	410593981
105	NC_019048	AATGGT	2	12	298251	298262	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410593981
106	NC_019048	AATGAA	2	12	299334	299345	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	410593983
107	NC_019048	AAAGAA	2	12	306139	306150	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	410593989
108	NC_019048	GAGCTA	2	12	307518	307529	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	410593990
109	NC_019048	AATTGG	2	12	310457	310468	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410593992
110	NC_019048	GTATCG	2	12	311322	311333	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	410593993
111	NC_019048	TTTTAT	2	12	313901	313912	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	410593996
112	NC_019048	ATATTA	2	12	314203	314214	50 %	50 %	0 %	0 %	410593996
113	NC_019048	TAGATG	2	12	317779	317790	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410594000
114	NC_019048	AAATCA	2	12	321493	321504	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	410594004
115	NC_019048	GAATAC	2	12	323220	323231	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	410594006
116	NC_019048	AATTTA	2	12	339710	339721	50 %	50 %	0 %	0 %	410594019
117	NC_019048	GACTGT	2	12	340925	340936	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	410594020
118	NC_019048	CGGTGG	2	12	342116	342127	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	410594022
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224	NC_019048	ATTTGA	2	12	674526	674537	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	410594332
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230	NC_019048	CCAATA	2	12	690339	690350	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	410594348
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232	NC_019048	TTAGCT	2	12	691280	691291	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	410594349
233	NC_019048	ATTAAA	2	12	693144	693155	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410594350
234	NC_019048	TTTTTG	2	12	694385	694396	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	410594351
235	NC_019048	AGATAA	2	12	695531	695542	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	410594352
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340	NC_019048	AGTATA	2	12	980063	980074	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	410594613
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345	NC_019048	TCACTG	2	12	990894	990905	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	410594623
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348	NC_019048	CAATAA	2	12	1005004	1005015	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	410594641
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460	NC_019048	ATTAAT	2	12	1328876	1328887	50 %	50 %	0 %	0 %	410594946
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