MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus agalactiae SA20-06 chromosome

Total Repeats: 33304

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_019048	GTT	2	6	180172	180177	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410593864
3002	NC_019048	GTT	2	6	180199	180204	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410593864
3003	NC_019048	TTG	2	6	180209	180214	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410593864
3004	NC_019048	CTT	2	6	180282	180287	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410593864
3005	NC_019048	GAT	2	6	180316	180321	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410593864
3006	NC_019048	CGT	2	6	180340	180345	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410593864
3007	NC_019048	CAA	2	6	180457	180462	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410593864
3008	NC_019048	GCC	2	6	180487	180492	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410593864
3009	NC_019048	TCA	2	6	180511	180516	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410593864
3010	NC_019048	TC	3	6	180576	180581	0 %	50 %	0 %	50 %	410593864
3011	NC_019048	TGG	2	6	180594	180599	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410593864
3012	NC_019048	TAA	2	6	180705	180710	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410593864
3013	NC_019048	AATA	2	8	180733	180740	75 %	25 %	0 %	0 %	410593864
3014	NC_019048	AACG	2	8	180792	180799	50 %	0 %	25 %	25 %	410593864
3015	NC_019048	CTG	2	6	180815	180820	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410593864
3016	NC_019048	GAA	2	6	180823	180828	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410593864
3017	NC_019048	AGA	2	6	180885	180890	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410593864
3018	NC_019048	GTC	2	6	180902	180907	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410593864
3019	NC_019048	TAA	2	6	180915	180920	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410593864
3020	NC_019048	TTG	2	6	180941	180946	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410593864
3021	NC_019048	TTG	2	6	180950	180955	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410593864
3022	NC_019048	AGT	2	6	180972	180977	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410593864
3023	NC_019048	ATG	2	6	181013	181018	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410593864
3024	NC_019048	ATTG	2	8	181068	181075	25 %	50 %	25 %	0 %	410593864
3025	NC_019048	AGC	2	6	181116	181121	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410593864
3026	NC_019048	T	6	6	181169	181174	0 %	100 %	0 %	0 %	410593864
3027	NC_019048	CGT	2	6	181243	181248	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410593864
3028	NC_019048	GTT	2	6	181375	181380	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410593864
3029	NC_019048	TGAG	2	8	181427	181434	25 %	25 %	50 %	0 %	410593864
3030	NC_019048	AGA	2	6	181446	181451	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410593864
3031	NC_019048	GAA	2	6	181474	181479	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410593864
3032	NC_019048	GAA	2	6	181516	181521	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410593864
3033	NC_019048	AAG	2	6	181607	181612	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410593864
3034	NC_019048	TTG	2	6	181622	181627	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410593864
3035	NC_019048	CTG	2	6	181661	181666	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410593864
3036	NC_019048	AGT	2	6	181752	181757	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410593864
3037	NC_019048	TGA	2	6	181791	181796	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410593864
3038	NC_019048	GTC	2	6	181877	181882	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410593864
3039	NC_019048	GTC	2	6	181897	181902	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410593864
3040	NC_019048	GCT	2	6	182032	182037	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410593864
3041	NC_019048	CTT	2	6	182081	182086	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410593864
3042	NC_019048	AGA	2	6	182088	182093	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410593864
3043	NC_019048	AAG	2	6	182111	182116	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410593864
3044	NC_019048	ATG	2	6	182150	182155	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410593864
3045	NC_019048	GT	3	6	182183	182188	0 %	50 %	50 %	0 %	410593864
3046	NC_019048	CAC	2	6	182218	182223	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	410593864
3047	NC_019048	TGA	2	6	182229	182234	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410593864
3048	NC_019048	CAA	2	6	182278	182283	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410593864
3049	NC_019048	TGG	2	6	182307	182312	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410593864
3050	NC_019048	TTC	2	6	182369	182374	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410593864
3051	NC_019048	TGA	2	6	182397	182402	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410593864
3052	NC_019048	TGA	2	6	182532	182537	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410593864
3053	NC_019048	TGA	2	6	182568	182573	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410593864
3054	NC_019048	GAT	3	9	182581	182589	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410593864
3055	NC_019048	TGA	2	6	182601	182606	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410593864
3056	NC_019048	AAG	2	6	182630	182635	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410593864
3057	NC_019048	GAA	2	6	182638	182643	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410593864
3058	NC_019048	AAG	2	6	182675	182680	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410593864
3059	NC_019048	A	6	6	182886	182891	100 %	0 %	0 %	0 %	410593865
3060	NC_019048	TGA	2	6	182942	182947	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410593865
3061	NC_019048	CAA	2	6	182962	182967	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410593865
3062	NC_019048	TCG	2	6	183062	183067	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410593865
3063	NC_019048	GAA	2	6	183177	183182	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410593865
3064	NC_019048	TTAT	2	8	183184	183191	25 %	75 %	0 %	0 %	410593865
3065	NC_019048	TGT	2	6	183203	183208	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410593865
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3067	NC_019048	TACGGT	2	12	183285	183296	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	410593865
3068	NC_019048	TTG	2	6	183301	183306	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410593865
3069	NC_019048	TCT	2	6	183335	183340	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410593865
3070	NC_019048	TCG	2	6	183425	183430	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410593865
3071	NC_019048	A	6	6	183453	183458	100 %	0 %	0 %	0 %	410593865
3072	NC_019048	ATGG	2	8	183476	183483	25 %	25 %	50 %	0 %	410593865
3073	NC_019048	TGG	2	6	183539	183544	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410593865
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3077	NC_019048	TTG	2	6	183615	183620	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410593865
3078	NC_019048	CAT	2	6	183638	183643	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410593865
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3080	NC_019048	GTC	2	6	183700	183705	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410593865
3081	NC_019048	GTC	2	6	183709	183714	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410593865
3082	NC_019048	GTC	2	6	183733	183738	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410593865
3083	NC_019048	CTTG	2	8	183794	183801	0 %	50 %	25 %	25 %	410593865
3084	NC_019048	AGC	2	6	183956	183961	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410593865
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3086	NC_019048	TTA	2	6	184015	184020	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410593865
3087	NC_019048	GAA	2	6	184191	184196	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410593865
3088	NC_019048	TGCT	2	8	184222	184229	0 %	50 %	25 %	25 %	410593865
3089	NC_019048	TAC	2	6	184302	184307	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410593865
3090	NC_019048	GTGAAG	2	12	184330	184341	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	410593865
3091	NC_019048	TACA	2	8	184402	184409	50 %	25 %	0 %	25 %	410593865
3092	NC_019048	AGA	2	6	184454	184459	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410593865
3093	NC_019048	ACA	2	6	184482	184487	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410593865
3094	NC_019048	TAA	2	6	184547	184552	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410593865
3095	NC_019048	A	6	6	184567	184572	100 %	0 %	0 %	0 %	410593865
3096	NC_019048	CTT	2	6	184586	184591	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410593865
3097	NC_019048	AAG	2	6	184650	184655	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410593865
3098	NC_019048	ACA	2	6	184701	184706	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410593865
3099	NC_019048	ATT	2	6	184818	184823	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410593865
3100	NC_019048	CAC	2	6	184833	184838	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	410593865
3101	NC_019048	TGA	2	6	184876	184881	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410593865
3102	NC_019048	GAA	2	6	184884	184889	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410593865
3103	NC_019048	ACA	3	9	184908	184916	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410593865
3104	NC_019048	AAG	2	6	184930	184935	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410593865
3105	NC_019048	ATG	3	9	184986	184994	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410593865
3106	NC_019048	GCT	2	6	185058	185063	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410593865
3107	NC_019048	TTC	2	6	185133	185138	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410593865
3108	NC_019048	TCG	2	6	185207	185212	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410593865
3109	NC_019048	TTA	2	6	185236	185241	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410593865
3110	NC_019048	AAG	2	6	185349	185354	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410593865
3111	NC_019048	TCAA	2	8	185355	185362	50 %	25 %	0 %	25 %	410593865
3112	NC_019048	TTG	2	6	185386	185391	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410593865
3113	NC_019048	GCT	2	6	185421	185426	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410593865
3114	NC_019048	GTT	2	6	185430	185435	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410593865
3115	NC_019048	GTC	2	6	185500	185505	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410593865
3116	NC_019048	GGT	2	6	185628	185633	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410593865
3117	NC_019048	TTA	2	6	185716	185721	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410593865
3118	NC_019048	GAA	2	6	185751	185756	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410593865
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3120	NC_019048	GTT	2	6	185817	185822	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410593865
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3488	NC_019048	ATT	2	6	205806	205811	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410593890
3489	NC_019048	GGT	2	6	205936	205941	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410593890
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3491	NC_019048	GGT	2	6	206017	206022	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410593890
3492	NC_019048	TTC	2	6	206036	206041	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410593890
3493	NC_019048	ATG	2	6	206163	206168	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410593890
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