MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus agalactiae SA20-06 chromosome

Total Repeats: 33304

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_019048	GAA	2	6	149154	149159	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410593843
2502	NC_019048	TTTGAT	2	12	149205	149216	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	410593843
2503	NC_019048	GATT	2	8	149249	149256	25 %	50 %	25 %	0 %	410593843
2504	NC_019048	ACCA	2	8	149329	149336	50 %	0 %	0 %	50 %	410593843
2505	NC_019048	ATG	3	9	149437	149445	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410593843
2506	NC_019048	ATTG	2	8	149514	149521	25 %	50 %	25 %	0 %	410593844
2507	NC_019048	TAT	2	6	149531	149536	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410593844
2508	NC_019048	TAT	2	6	149553	149558	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410593844
2509	NC_019048	GAA	2	6	149606	149611	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410593844
2510	NC_019048	CAA	2	6	149613	149618	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410593844
2511	NC_019048	AGT	2	6	149632	149637	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410593844
2512	NC_019048	GGT	2	6	149638	149643	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410593844
2513	NC_019048	TC	3	6	149655	149660	0 %	50 %	0 %	50 %	410593844
2514	NC_019048	TGT	2	6	149664	149669	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410593844
2515	NC_019048	AAC	2	6	149670	149675	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410593844
2516	NC_019048	ATT	2	6	149676	149681	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410593844
2517	NC_019048	GGC	2	6	149694	149699	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410593844
2518	NC_019048	ATT	2	6	149749	149754	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410593844
2519	NC_019048	GGT	2	6	149755	149760	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410593844
2520	NC_019048	ACA	3	9	149770	149778	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410593844
2521	NC_019048	ATT	3	9	149830	149838	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410593844
2522	NC_019048	GGT	2	6	149899	149904	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410593844
2523	NC_019048	CTTT	2	8	149933	149940	0 %	75 %	0 %	25 %	410593844
2524	NC_019048	ATT	2	6	149956	149961	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410593844
2525	NC_019048	TGAT	2	8	149984	149991	25 %	50 %	25 %	0 %	410593844
2526	NC_019048	TAGT	2	8	150005	150012	25 %	50 %	25 %	0 %	410593844
2527	NC_019048	ATC	2	6	150022	150027	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410593844
2528	NC_019048	T	7	7	150078	150084	0 %	100 %	0 %	0 %	410593844
2529	NC_019048	T	6	6	150126	150131	0 %	100 %	0 %	0 %	410593844
2530	NC_019048	ATC	2	6	150143	150148	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410593844
2531	NC_019048	TAT	2	6	150206	150211	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410593844
2532	NC_019048	A	6	6	150225	150230	100 %	0 %	0 %	0 %	410593844
2533	NC_019048	ATT	2	6	150262	150267	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410593844
2534	NC_019048	CTAT	2	8	150370	150377	25 %	50 %	0 %	25 %	410593844
2535	NC_019048	GTT	2	6	150406	150411	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410593844
2536	NC_019048	GCTTT	2	10	150442	150451	0 %	60 %	20 %	20 %	410593844
2537	NC_019048	TCT	2	6	150483	150488	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410593844
2538	NC_019048	CTA	2	6	150496	150501	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410593844
2539	NC_019048	TGC	2	6	150899	150904	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410593845
2540	NC_019048	CAG	2	6	150943	150948	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410593845
2541	NC_019048	TAT	2	6	150950	150955	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410593845
2542	NC_019048	CAG	2	6	150979	150984	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410593845
2543	NC_019048	AGC	2	6	151112	151117	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410593845
2544	NC_019048	TGA	3	9	151136	151144	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410593845
2545	NC_019048	ACT	2	6	151193	151198	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410593845
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2548	NC_019048	GAA	2	6	151256	151261	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410593845
2549	NC_019048	GTG	2	6	151381	151386	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410593845
2550	NC_019048	ATT	2	6	151404	151409	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410593845
2551	NC_019048	AC	3	6	151410	151415	50 %	0 %	0 %	50 %	410593845
2552	NC_019048	ATTAC	2	10	151432	151441	40 %	40 %	0 %	20 %	410593845
2553	NC_019048	ATG	2	6	151461	151466	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410593845
2554	NC_019048	GTA	2	6	151476	151481	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410593845
2555	NC_019048	AGG	2	6	151487	151492	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	410593845
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2557	NC_019048	AGA	2	6	151565	151570	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410593845
2558	NC_019048	AAG	2	6	151621	151626	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410593846
2559	NC_019048	T	6	6	151637	151642	0 %	100 %	0 %	0 %	410593846
2560	NC_019048	A	6	6	151696	151701	100 %	0 %	0 %	0 %	410593846
2561	NC_019048	AGA	2	6	151703	151708	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410593846
2562	NC_019048	GAA	2	6	151926	151931	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410593846
2563	NC_019048	GAA	2	6	151977	151982	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410593846
2564	NC_019048	TGC	2	6	151991	151996	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410593846
2565	NC_019048	CA	3	6	152001	152006	50 %	0 %	0 %	50 %	410593846
2566	NC_019048	GTG	2	6	152020	152025	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410593846
2567	NC_019048	T	6	6	152077	152082	0 %	100 %	0 %	0 %	410593846
2568	NC_019048	TAA	2	6	152111	152116	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410593846
2569	NC_019048	CTT	2	6	152124	152129	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410593846
2570	NC_019048	TTG	2	6	152131	152136	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410593846
2571	NC_019048	A	6	6	152138	152143	100 %	0 %	0 %	0 %	410593846
2572	NC_019048	GTTA	2	8	152151	152158	25 %	50 %	25 %	0 %	410593846
2573	NC_019048	GAAC	2	8	152193	152200	50 %	0 %	25 %	25 %	410593846
2574	NC_019048	AAATT	2	10	152245	152254	60 %	40 %	0 %	0 %	410593846
2575	NC_019048	GTC	2	6	152299	152304	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410593846
2576	NC_019048	GTC	2	6	152308	152313	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410593846
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2578	NC_019048	TGA	2	6	152350	152355	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410593846
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2580	NC_019048	AGT	2	6	152423	152428	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410593846
2581	NC_019048	TGC	2	6	152429	152434	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410593846
2582	NC_019048	CAA	2	6	152595	152600	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410593846
2583	NC_019048	ATCCT	2	10	152647	152656	20 %	40 %	0 %	40 %	410593846
2584	NC_019048	TGAT	2	8	152659	152666	25 %	50 %	25 %	0 %	410593846
2585	NC_019048	ATG	2	6	152671	152676	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410593846
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2587	NC_019048	TGA	2	6	152734	152739	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410593846
2588	NC_019048	A	6	6	152755	152760	100 %	0 %	0 %	0 %	410593846
2589	NC_019048	CAG	2	6	152761	152766	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410593846
2590	NC_019048	AAG	2	6	152821	152826	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410593846
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2592	NC_019048	GCA	2	6	152968	152973	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410593847
2593	NC_019048	TAC	2	6	153016	153021	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410593847
2594	NC_019048	GTG	2	6	153047	153052	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410593847
2595	NC_019048	ACT	2	6	153076	153081	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410593847
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2597	NC_019048	CAC	2	6	153159	153164	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	410593847
2598	NC_019048	TGA	2	6	153216	153221	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410593847
2599	NC_019048	CAT	2	6	153244	153249	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410593847
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2601	NC_019048	GA	3	6	153280	153285	50 %	0 %	50 %	0 %	410593847
2602	NC_019048	TTTAGA	2	12	153327	153338	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	410593847
2603	NC_019048	TAA	2	6	153348	153353	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410593847
2604	NC_019048	GTT	2	6	153466	153471	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410593847
2605	NC_019048	TTC	2	6	153529	153534	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410593847
2606	NC_019048	GAAA	2	8	153588	153595	75 %	0 %	25 %	0 %	410593847
2607	NC_019048	TGG	2	6	153627	153632	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410593847
2608	NC_019048	TGAT	2	8	153638	153645	25 %	50 %	25 %	0 %	410593847
2609	NC_019048	GGAA	2	8	153671	153678	50 %	0 %	50 %	0 %	410593847
2610	NC_019048	ATT	2	6	153746	153751	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410593847
2611	NC_019048	TCA	2	6	153777	153782	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410593847
2612	NC_019048	AGTTT	2	10	153793	153802	20 %	60 %	20 %	0 %	410593847
2613	NC_019048	ATG	2	6	153914	153919	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410593847
2614	NC_019048	TCA	2	6	153963	153968	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410593847
2615	NC_019048	TTA	2	6	153983	153988	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410593847
2616	NC_019048	ATC	2	6	153989	153994	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410593847
2617	NC_019048	CGG	2	6	154007	154012	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410593847
2618	NC_019048	TTTCTA	2	12	154023	154034	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	410593847
2619	NC_019048	A	6	6	154076	154081	100 %	0 %	0 %	0 %	410593847
2620	NC_019048	CT	3	6	154103	154108	0 %	50 %	0 %	50 %	410593847
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2622	NC_019048	AAT	2	6	154202	154207	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410593848
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2989	NC_019048	TTGG	2	8	179613	179620	0 %	50 %	50 %	0 %	410593864
2990	NC_019048	ACA	2	6	179686	179691	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410593864
2991	NC_019048	TTG	2	6	179729	179734	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410593864
2992	NC_019048	ATT	2	6	179767	179772	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410593864
2993	NC_019048	CGT	2	6	179911	179916	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410593864
2994	NC_019048	GCT	2	6	179926	179931	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410593864
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2997	NC_019048	GA	3	6	180023	180028	50 %	0 %	50 %	0 %	410593864
2998	NC_019048	TTG	2	6	180032	180037	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410593864
2999	NC_019048	AC	3	6	180116	180121	50 %	0 %	0 %	50 %	410593864
3000	NC_019048	TTC	2	6	180155	180160	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410593864

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