MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus agalactiae SA20-06 chromosome

Total Repeats: 33304

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_019048	ATAA	2	8	90214	90221	75 %	25 %	0 %	0 %	410593792
1502	NC_019048	TCT	2	6	90304	90309	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410593793
1503	NC_019048	ACT	2	6	90329	90334	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410593793
1504	NC_019048	A	6	6	90369	90374	100 %	0 %	0 %	0 %	410593793
1505	NC_019048	GTG	2	6	90393	90398	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410593793
1506	NC_019048	TCG	2	6	90409	90414	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410593793
1507	NC_019048	GCT	3	9	90419	90427	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410593793
1508	NC_019048	ATG	2	6	90459	90464	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410593793
1509	NC_019048	CAA	2	6	90486	90491	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410593793
1510	NC_019048	GAC	2	6	90512	90517	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410593793
1511	NC_019048	GGA	2	6	90545	90550	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	410593793
1512	NC_019048	TGC	2	6	90589	90594	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410593793
1513	NC_019048	ATT	2	6	90605	90610	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410593793
1514	NC_019048	AG	3	6	97809	97814	50 %	0 %	50 %	0 %	410593794
1515	NC_019048	ATG	2	6	97816	97821	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410593794
1516	NC_019048	A	6	6	97822	97827	100 %	0 %	0 %	0 %	410593794
1517	NC_019048	TA	3	6	97828	97833	50 %	50 %	0 %	0 %	410593794
1518	NC_019048	AGCA	2	8	97926	97933	50 %	0 %	25 %	25 %	410593794
1519	NC_019048	GAA	2	6	97943	97948	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410593794
1520	NC_019048	A	7	7	97953	97959	100 %	0 %	0 %	0 %	410593794
1521	NC_019048	A	7	7	97964	97970	100 %	0 %	0 %	0 %	410593794
1522	NC_019048	AAT	2	6	98006	98011	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410593794
1523	NC_019048	ATTG	2	8	98055	98062	25 %	50 %	25 %	0 %	410593794
1524	NC_019048	ATG	2	6	98065	98070	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410593794
1525	NC_019048	AGG	3	9	98105	98113	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	410593794
1526	NC_019048	TAA	2	6	98141	98146	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410593794
1527	NC_019048	TTGATA	2	12	98170	98181	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	410593794
1528	NC_019048	A	6	6	98204	98209	100 %	0 %	0 %	0 %	410593794
1529	NC_019048	ATT	2	6	98246	98251	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410593794
1530	NC_019048	A	7	7	98424	98430	100 %	0 %	0 %	0 %	410593795
1531	NC_019048	ATG	2	6	98459	98464	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410593795
1532	NC_019048	TGA	2	6	98505	98510	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410593795
1533	NC_019048	TAA	2	6	99443	99448	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410593796
1534	NC_019048	TTG	2	6	99468	99473	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410593796
1535	NC_019048	TG	3	6	99476	99481	0 %	50 %	50 %	0 %	410593796
1536	NC_019048	TGT	2	6	99552	99557	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410593796
1537	NC_019048	T	6	6	99559	99564	0 %	100 %	0 %	0 %	410593796
1538	NC_019048	GAA	2	6	99583	99588	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410593796
1539	NC_019048	GGT	2	6	99591	99596	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410593796
1540	NC_019048	AAC	2	6	99602	99607	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410593796
1541	NC_019048	GAT	2	6	99757	99762	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410593796
1542	NC_019048	AAG	2	6	99886	99891	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410593796
1543	NC_019048	AAT	2	6	99898	99903	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410593796
1544	NC_019048	A	7	7	99927	99933	100 %	0 %	0 %	0 %	410593796
1545	NC_019048	AGT	2	6	100327	100332	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410593797
1546	NC_019048	A	6	6	100378	100383	100 %	0 %	0 %	0 %	410593797
1547	NC_019048	A	6	6	100469	100474	100 %	0 %	0 %	0 %	410593797
1548	NC_019048	ATTG	2	8	100479	100486	25 %	50 %	25 %	0 %	410593797
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1551	NC_019048	TAAAG	2	10	100709	100718	60 %	20 %	20 %	0 %	410593798
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1554	NC_019048	ATG	2	6	100768	100773	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410593798
1555	NC_019048	AAG	2	6	100783	100788	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410593798
1556	NC_019048	TATT	2	8	100827	100834	25 %	75 %	0 %	0 %	410593798
1557	NC_019048	ATT	2	6	100882	100887	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410593798
1558	NC_019048	TAA	2	6	100931	100936	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410593798
1559	NC_019048	GAA	2	6	100947	100952	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410593798
1560	NC_019048	GAA	2	6	101037	101042	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410593798
1561	NC_019048	GTG	2	6	101086	101091	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410593798
1562	NC_019048	GAA	2	6	101105	101110	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410593798
1563	NC_019048	T	6	6	101135	101140	0 %	100 %	0 %	0 %	410593798
1564	NC_019048	TA	3	6	101300	101305	50 %	50 %	0 %	0 %	410593799
1565	NC_019048	ACT	2	6	101374	101379	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410593799
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1568	NC_019048	GA	3	6	101529	101534	50 %	0 %	50 %	0 %	410593799
1569	NC_019048	GTG	2	6	101550	101555	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410593799
1570	NC_019048	TGGA	2	8	101567	101574	25 %	25 %	50 %	0 %	410593799
1571	NC_019048	ATG	2	6	101579	101584	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410593799
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1573	NC_019048	GAA	2	6	101647	101652	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410593799
1574	NC_019048	ATTTG	2	10	101660	101669	20 %	60 %	20 %	0 %	410593799
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1576	NC_019048	A	7	7	101749	101755	100 %	0 %	0 %	0 %	410593799
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1579	NC_019048	A	6	6	101960	101965	100 %	0 %	0 %	0 %	410593799
1580	NC_019048	A	8	8	101976	101983	100 %	0 %	0 %	0 %	410593799
1581	NC_019048	CAA	2	6	102066	102071	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410593800
1582	NC_019048	TCA	2	6	102072	102077	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410593800
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1584	NC_019048	A	6	6	102121	102126	100 %	0 %	0 %	0 %	410593800
1585	NC_019048	ATC	2	6	102155	102160	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410593800
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1588	NC_019048	AAGC	2	8	102264	102271	50 %	0 %	25 %	25 %	410593800
1589	NC_019048	GCT	2	6	102288	102293	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410593800
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1591	NC_019048	AGT	2	6	102527	102532	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410593800
1592	NC_019048	CAGT	2	8	102533	102540	25 %	25 %	25 %	25 %	410593800
1593	NC_019048	CAG	2	6	102595	102600	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410593800
1594	NC_019048	AT	3	6	102659	102664	50 %	50 %	0 %	0 %	410593800
1595	NC_019048	CAT	2	6	102672	102677	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410593800
1596	NC_019048	AGA	2	6	102686	102691	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410593800
1597	NC_019048	TTA	2	6	102702	102707	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410593800
1598	NC_019048	TTG	2	6	102753	102758	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410593801
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1601	NC_019048	A	6	6	102867	102872	100 %	0 %	0 %	0 %	410593801
1602	NC_019048	TAT	2	6	102925	102930	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410593801
1603	NC_019048	GGC	2	6	102937	102942	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410593801
1604	NC_019048	GA	3	6	102960	102965	50 %	0 %	50 %	0 %	410593801
1605	NC_019048	TAA	2	6	102976	102981	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410593801
1606	NC_019048	GTTTG	2	10	102994	103003	0 %	60 %	40 %	0 %	410593801
1607	NC_019048	TAG	2	6	103042	103047	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410593801
1608	NC_019048	A	7	7	103054	103060	100 %	0 %	0 %	0 %	410593801
1609	NC_019048	A	6	6	103145	103150	100 %	0 %	0 %	0 %	410593801
1610	NC_019048	A	7	7	103244	103250	100 %	0 %	0 %	0 %	410593801
1611	NC_019048	GATT	2	8	103535	103542	25 %	50 %	25 %	0 %	410593802
1612	NC_019048	TAG	2	6	103544	103549	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410593802
1613	NC_019048	CTA	2	6	103552	103557	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410593802
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1615	NC_019048	TGA	2	6	103685	103690	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410593802
1616	NC_019048	TTTTGA	2	12	103718	103729	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	410593802
1617	NC_019048	AGA	2	6	103742	103747	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410593802
1618	NC_019048	TGT	2	6	103847	103852	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410593802
1619	NC_019048	ATG	2	6	103867	103872	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410593802
1620	NC_019048	T	6	6	104098	104103	0 %	100 %	0 %	0 %	410593802
1621	NC_019048	AGC	2	6	104194	104199	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410593802
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1623	NC_019048	ATT	2	6	104431	104436	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410593802
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1625	NC_019048	A	6	6	104531	104536	100 %	0 %	0 %	0 %	410593803
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1988	NC_019048	GAG	2	6	122353	122358	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	410593819
1989	NC_019048	TCC	2	6	122384	122389	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	410593819
1990	NC_019048	CTT	2	6	122457	122462	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410593819
1991	NC_019048	TGCCA	2	10	122468	122477	20 %	20 %	20 %	40 %	410593819
1992	NC_019048	TAA	2	6	122489	122494	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410593819
1993	NC_019048	AATT	2	8	122581	122588	50 %	50 %	0 %	0 %	410593819
1994	NC_019048	ATC	2	6	122592	122597	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410593819
1995	NC_019048	CAATGG	2	12	122599	122610	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	410593819
1996	NC_019048	ATA	2	6	122611	122616	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410593819
1997	NC_019048	TCAC	2	8	122650	122657	25 %	25 %	0 %	50 %	410593819
1998	NC_019048	CAA	2	6	122659	122664	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410593819
1999	NC_019048	TAA	2	6	122946	122951	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410593820
2000	NC_019048	CAT	2	6	123040	123045	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410593820

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