MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus agalactiae SA20-06 chromosome

Total Repeats: 33304

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_019048	ACA	2	6	38891	38896	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410593734
502	NC_019048	TC	4	8	38914	38921	0 %	50 %	0 %	50 %	410593734
503	NC_019048	TAC	2	6	38951	38956	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410593734
504	NC_019048	AGA	2	6	38977	38982	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410593734
505	NC_019048	GCT	2	6	39053	39058	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410593734
506	NC_019048	GGT	2	6	39074	39079	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410593734
507	NC_019048	CAG	2	6	39151	39156	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410593734
508	NC_019048	CCT	2	6	39283	39288	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	410593734
509	NC_019048	GAA	2	6	39311	39316	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410593734
510	NC_019048	GAA	2	6	39353	39358	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410593734
511	NC_019048	CTG	2	6	39363	39368	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410593734
512	NC_019048	TCA	2	6	39384	39389	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410593734
513	NC_019048	GCT	2	6	39527	39532	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410593734
514	NC_019048	ATC	2	6	39581	39586	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410593734
515	NC_019048	GGA	2	6	39596	39601	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	410593734
516	NC_019048	CAG	2	6	39606	39611	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410593734
517	NC_019048	AAG	2	6	39662	39667	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410593734
518	NC_019048	ATC	2	6	39710	39715	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410593734
519	NC_019048	TCT	2	6	39754	39759	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410593734
520	NC_019048	CT	3	6	39801	39806	0 %	50 %	0 %	50 %	410593734
521	NC_019048	TTGG	2	8	39874	39881	0 %	50 %	50 %	0 %	410593734
522	NC_019048	TGT	2	6	39940	39945	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410593734
523	NC_019048	ATC	2	6	40094	40099	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410593734
524	NC_019048	GAA	2	6	40471	40476	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410593735
525	NC_019048	ACTT	2	8	40522	40529	25 %	50 %	0 %	25 %	410593735
526	NC_019048	AAG	2	6	40559	40564	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410593735
527	NC_019048	AATC	2	8	40642	40649	50 %	25 %	0 %	25 %	410593735
528	NC_019048	CCT	2	6	40847	40852	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	410593735
529	NC_019048	TCG	2	6	40881	40886	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410593735
530	NC_019048	AAG	2	6	40919	40924	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410593735
531	NC_019048	TGA	2	6	40961	40966	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410593735
532	NC_019048	AGA	2	6	40968	40973	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410593735
533	NC_019048	TGC	2	6	40983	40988	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410593735
534	NC_019048	GGT	2	6	41076	41081	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410593735
535	NC_019048	GTG	2	6	41138	41143	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410593735
536	NC_019048	TGA	2	6	41163	41168	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410593735
537	NC_019048	A	6	6	41256	41261	100 %	0 %	0 %	0 %	410593735
538	NC_019048	GCT	2	6	41338	41343	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410593735
539	NC_019048	GAA	2	6	41356	41361	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410593735
540	NC_019048	A	6	6	41391	41396	100 %	0 %	0 %	0 %	410593735
541	NC_019048	GTT	2	6	41500	41505	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410593735
542	NC_019048	TGA	2	6	41511	41516	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410593735
543	NC_019048	ATT	2	6	41556	41561	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410593735
544	NC_019048	AATT	2	8	41657	41664	50 %	50 %	0 %	0 %	410593735
545	NC_019048	GT	3	6	41689	41694	0 %	50 %	50 %	0 %	410593735
546	NC_019048	ATT	2	6	41698	41703	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410593735
547	NC_019048	TATC	2	8	41722	41729	25 %	50 %	0 %	25 %	410593735
548	NC_019048	TTGA	2	8	41740	41747	25 %	50 %	25 %	0 %	410593735
549	NC_019048	TGG	2	6	41778	41783	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410593735
550	NC_019048	GAA	3	9	41836	41844	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410593735
551	NC_019048	AGA	2	6	41859	41864	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410593735
552	NC_019048	A	6	6	41864	41869	100 %	0 %	0 %	0 %	410593735
553	NC_019048	A	7	7	41997	42003	100 %	0 %	0 %	0 %	410593736
554	NC_019048	TGG	2	6	42054	42059	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410593736
555	NC_019048	TGCT	2	8	42137	42144	0 %	50 %	25 %	25 %	410593736
556	NC_019048	TG	3	6	42191	42196	0 %	50 %	50 %	0 %	410593736
557	NC_019048	ATT	2	6	42205	42210	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410593736
558	NC_019048	GCA	2	6	42211	42216	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410593736
559	NC_019048	T	6	6	42234	42239	0 %	100 %	0 %	0 %	410593736
560	NC_019048	A	6	6	42258	42263	100 %	0 %	0 %	0 %	410593736
561	NC_019048	GAA	2	6	42280	42285	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410593736
562	NC_019048	GTT	2	6	42286	42291	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410593736
563	NC_019048	AGC	2	6	42324	42329	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410593736
564	NC_019048	GAT	2	6	42376	42381	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410593736
565	NC_019048	AAGG	2	8	42448	42455	50 %	0 %	50 %	0 %	410593736
566	NC_019048	CGT	2	6	42514	42519	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410593736
567	NC_019048	GCT	2	6	42546	42551	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410593736
568	NC_019048	AAC	2	6	42569	42574	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410593736
569	NC_019048	CTT	2	6	42586	42591	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410593736
570	NC_019048	AGC	2	6	42615	42620	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410593736
571	NC_019048	GTG	2	6	42671	42676	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410593736
572	NC_019048	GAT	2	6	42709	42714	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410593736
573	NC_019048	GAA	2	6	42796	42801	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410593736
574	NC_019048	ATC	2	6	42910	42915	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410593736
575	NC_019048	GTG	2	6	42934	42939	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410593736
576	NC_019048	AGCAG	2	10	43166	43175	40 %	0 %	40 %	20 %	410593737
577	NC_019048	AGTT	2	8	43181	43188	25 %	50 %	25 %	0 %	410593737
578	NC_019048	ATC	2	6	43201	43206	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410593737
579	NC_019048	GGC	2	6	43286	43291	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410593737
580	NC_019048	TTG	2	6	43314	43319	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410593737
581	NC_019048	GTCT	2	8	43341	43348	0 %	50 %	25 %	25 %	410593737
582	NC_019048	ATC	2	6	43404	43409	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410593737
583	NC_019048	CCTG	2	8	43427	43434	0 %	25 %	25 %	50 %	410593737
584	NC_019048	GGTCA	2	10	43530	43539	20 %	20 %	40 %	20 %	410593737
585	NC_019048	CAA	2	6	43542	43547	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410593737
586	NC_019048	TAT	2	6	43770	43775	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410593738
587	NC_019048	ACCA	2	8	43802	43809	50 %	0 %	0 %	50 %	410593738
588	NC_019048	TCT	2	6	43813	43818	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410593738
589	NC_019048	ATC	2	6	43839	43844	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410593738
590	NC_019048	CTA	2	6	43879	43884	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410593738
591	NC_019048	GGA	2	6	43899	43904	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	410593738
592	NC_019048	TAT	2	6	43905	43910	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410593738
593	NC_019048	TTGA	2	8	43942	43949	25 %	50 %	25 %	0 %	410593738
594	NC_019048	CGA	2	6	43991	43996	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410593738
595	NC_019048	A	6	6	43996	44001	100 %	0 %	0 %	0 %	410593738
596	NC_019048	TTTG	2	8	44007	44014	0 %	75 %	25 %	0 %	410593738
597	NC_019048	TGA	2	6	44076	44081	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410593738
598	NC_019048	TAG	2	6	44126	44131	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410593738
599	NC_019048	A	6	6	44158	44163	100 %	0 %	0 %	0 %	410593738
600	NC_019048	TGT	2	6	44178	44183	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410593738
601	NC_019048	TCG	2	6	44274	44279	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410593738
602	NC_019048	CAA	2	6	44291	44296	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410593738
603	NC_019048	ATT	2	6	44501	44506	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410593739
604	NC_019048	TTGGG	2	10	44531	44540	0 %	40 %	60 %	0 %	410593739
605	NC_019048	TGG	2	6	44554	44559	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410593739
606	NC_019048	CGA	2	6	44605	44610	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410593739
607	NC_019048	GAT	2	6	44629	44634	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410593739
608	NC_019048	TCG	2	6	44686	44691	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410593739
609	NC_019048	GCT	2	6	44714	44719	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410593739
610	NC_019048	ACA	2	6	44724	44729	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410593739
611	NC_019048	TTGA	2	8	44738	44745	25 %	50 %	25 %	0 %	410593739
612	NC_019048	CGG	2	6	44833	44838	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410593739
613	NC_019048	GAC	2	6	44944	44949	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410593739
614	NC_019048	CAG	2	6	44994	44999	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410593739
615	NC_019048	ACG	2	6	45003	45008	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410593739
616	NC_019048	GA	3	6	45102	45107	50 %	0 %	50 %	0 %	410593739
617	NC_019048	CAA	2	6	45113	45118	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410593739
618	NC_019048	ACT	2	6	45153	45158	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410593739
619	NC_019048	AAT	2	6	45203	45208	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410593739
620	NC_019048	TGATGC	2	12	45214	45225	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	410593739
621	NC_019048	TAT	2	6	45235	45240	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410593739
622	NC_019048	TGA	2	6	45310	45315	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410593739
623	NC_019048	TTG	2	6	45375	45380	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410593739
624	NC_019048	TCT	2	6	45429	45434	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410593739
625	NC_019048	ATC	3	9	45440	45448	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410593739
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