MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus agalactiae SA20-06 chromosome

Total Repeats: 33304

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_019048	T	7	7	320511	320517	0 %	100 %	0 %	0 %	410594002
5502	NC_019048	AAC	2	6	320579	320584	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410594002
5503	NC_019048	AATAG	2	10	320599	320608	60 %	20 %	20 %	0 %	410594002
5504	NC_019048	A	6	6	320655	320660	100 %	0 %	0 %	0 %	410594002
5505	NC_019048	TA	3	6	320742	320747	50 %	50 %	0 %	0 %	410594002
5506	NC_019048	ATT	2	6	320988	320993	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410594003
5507	NC_019048	ACA	2	6	321026	321031	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410594003
5508	NC_019048	TATC	2	8	321032	321039	25 %	50 %	0 %	25 %	410594003
5509	NC_019048	AAG	2	6	321058	321063	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410594003
5510	NC_019048	AAG	2	6	321151	321156	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410594003
5511	NC_019048	AGG	2	6	321158	321163	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	410594003
5512	NC_019048	ATTC	2	8	321192	321199	25 %	50 %	0 %	25 %	410594003
5513	NC_019048	TGA	2	6	321211	321216	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410594003
5514	NC_019048	ATT	2	6	321249	321254	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410594003
5515	NC_019048	GCA	2	6	321328	321333	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410594004
5516	NC_019048	AAG	2	6	321383	321388	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410594004
5517	NC_019048	AAATCA	2	12	321493	321504	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	410594004
5518	NC_019048	TGA	2	6	321510	321515	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410594004
5519	NC_019048	AAT	2	6	321649	321654	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410594005
5520	NC_019048	ATT	2	6	321689	321694	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410594005
5521	NC_019048	GTT	2	6	321734	321739	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410594005
5522	NC_019048	TAT	2	6	322988	322993	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410594006
5523	NC_019048	CAA	2	6	323022	323027	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410594006
5524	NC_019048	CTT	2	6	323037	323042	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410594006
5525	NC_019048	TG	3	6	323089	323094	0 %	50 %	50 %	0 %	410594006
5526	NC_019048	GGT	2	6	323166	323171	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410594006
5527	NC_019048	GAATAC	2	12	323220	323231	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	410594006
5528	NC_019048	CTA	2	6	323250	323255	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410594006
5529	NC_019048	GCTAC	2	10	323279	323288	20 %	20 %	20 %	40 %	410594006
5530	NC_019048	C	6	6	323308	323313	0 %	0 %	0 %	100 %	410594006
5531	NC_019048	ACG	2	6	323348	323353	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410594006
5532	NC_019048	CAA	2	6	323355	323360	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410594006
5533	NC_019048	CTG	2	6	323406	323411	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410594006
5534	NC_019048	CAT	2	6	323427	323432	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410594006
5535	NC_019048	CTC	2	6	323536	323541	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	410594006
5536	NC_019048	AAAT	2	8	323568	323575	75 %	25 %	0 %	0 %	410594006
5537	NC_019048	T	6	6	323581	323586	0 %	100 %	0 %	0 %	410594006
5538	NC_019048	TCT	2	6	323591	323596	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410594006
5539	NC_019048	ATA	2	6	323685	323690	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410594007
5540	NC_019048	ATT	2	6	323697	323702	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410594007
5541	NC_019048	TAGG	2	8	323703	323710	25 %	25 %	50 %	0 %	410594007
5542	NC_019048	AAAG	2	8	323776	323783	75 %	0 %	25 %	0 %	410594007
5543	NC_019048	ATT	3	9	323850	323858	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410594007
5544	NC_019048	TAT	2	6	323906	323911	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410594007
5545	NC_019048	A	6	6	323919	323924	100 %	0 %	0 %	0 %	410594007
5546	NC_019048	AGA	2	6	323989	323994	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410594007
5547	NC_019048	GTT	2	6	323995	324000	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410594007
5548	NC_019048	TCT	2	6	324025	324030	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410594007
5549	NC_019048	GGA	2	6	324101	324106	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	410594007
5550	NC_019048	TGTT	2	8	324136	324143	0 %	75 %	25 %	0 %	410594007
5551	NC_019048	CTT	2	6	324210	324215	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410594007
5552	NC_019048	TTG	2	6	324288	324293	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410594007
5553	NC_019048	AGAA	2	8	324409	324416	75 %	0 %	25 %	0 %	410594007
5554	NC_019048	AAGAA	2	10	324424	324433	80 %	0 %	20 %	0 %	410594007
5555	NC_019048	A	7	7	324436	324442	100 %	0 %	0 %	0 %	410594007
5556	NC_019048	CTAG	2	8	324449	324456	25 %	25 %	25 %	25 %	410594007
5557	NC_019048	ATAA	2	8	324560	324567	75 %	25 %	0 %	0 %	410594007
5558	NC_019048	TTA	2	6	324593	324598	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410594007
5559	NC_019048	A	6	6	324663	324668	100 %	0 %	0 %	0 %	410594007
5560	NC_019048	ACT	2	6	324752	324757	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410594007
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5562	NC_019048	ATC	2	6	324813	324818	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410594007
5563	NC_019048	CTTC	2	8	324898	324905	0 %	50 %	0 %	50 %	410594007
5564	NC_019048	ATG	2	6	324906	324911	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410594007
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5566	NC_019048	GCAA	2	8	325127	325134	50 %	0 %	25 %	25 %	410594008
5567	NC_019048	TATT	2	8	325161	325168	25 %	75 %	0 %	0 %	410594008
5568	NC_019048	A	6	6	325174	325179	100 %	0 %	0 %	0 %	410594008
5569	NC_019048	A	6	6	325228	325233	100 %	0 %	0 %	0 %	410594008
5570	NC_019048	ATT	2	6	325262	325267	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410594008
5571	NC_019048	GCT	2	6	325300	325305	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410594008
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5573	NC_019048	A	6	6	325435	325440	100 %	0 %	0 %	0 %	410594008
5574	NC_019048	TAA	3	9	325461	325469	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410594008
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5577	NC_019048	TTG	2	6	325541	325546	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410594008
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5582	NC_019048	GTG	2	6	325740	325745	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410594009
5583	NC_019048	CT	3	6	325793	325798	0 %	50 %	0 %	50 %	410594009
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5589	NC_019048	CAAGT	2	10	326037	326046	40 %	20 %	20 %	20 %	410594009
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5591	NC_019048	GTA	2	6	326084	326089	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410594009
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5593	NC_019048	TTG	2	6	326150	326155	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410594009
5594	NC_019048	AGA	2	6	326200	326205	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410594009
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5597	NC_019048	T	6	6	331933	331938	0 %	100 %	0 %	0 %	410594010
5598	NC_019048	TAGA	2	8	332014	332021	50 %	25 %	25 %	0 %	410594010
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5603	NC_019048	TAA	2	6	332347	332352	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410594010
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5605	NC_019048	TAAG	2	8	332442	332449	50 %	25 %	25 %	0 %	410594010
5606	NC_019048	TGC	2	6	332489	332494	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410594010
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5608	NC_019048	TCT	2	6	332607	332612	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410594010
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5610	NC_019048	AAT	2	6	332690	332695	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410594010
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5612	NC_019048	A	6	6	332777	332782	100 %	0 %	0 %	0 %	410594010
5613	NC_019048	AACT	2	8	332789	332796	50 %	25 %	0 %	25 %	410594010
5614	NC_019048	GTT	2	6	332801	332806	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410594010
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5622	NC_019048	TCT	2	6	333036	333041	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410594010
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5624	NC_019048	ATA	2	6	333099	333104	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410594010
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5990	NC_019048	CAT	2	6	351407	351412	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410594030
5991	NC_019048	TGA	2	6	351457	351462	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410594030
5992	NC_019048	GCTT	2	8	351500	351507	0 %	50 %	25 %	25 %	410594030
5993	NC_019048	TCA	3	9	351552	351560	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410594030
5994	NC_019048	TTG	2	6	351582	351587	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410594030
5995	NC_019048	ATC	2	6	351602	351607	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410594030
5996	NC_019048	TGAT	2	8	351674	351681	25 %	50 %	25 %	0 %	410594030
5997	NC_019048	TGGC	2	8	351705	351712	0 %	25 %	50 %	25 %	410594030
5998	NC_019048	AAT	3	9	351713	351721	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410594030
5999	NC_019048	TAC	2	6	352034	352039	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410594031
6000	NC_019048	AAT	3	9	352040	352048	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410594031

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