MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Sinorhizobium meliloti Rm41 plasmid pSYMB

Total Repeats: 34063

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
34001	NC_018701	GAGC	2	8	1661506	1661513	25 %	0 %	50 %	25 %	407724226
34002	NC_018701	GC	3	6	1661512	1661517	0 %	0 %	50 %	50 %	407724226
34003	NC_018701	TCG	2	6	1661522	1661527	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407724226
34004	NC_018701	GC	3	6	1661529	1661534	0 %	0 %	50 %	50 %	407724226
34005	NC_018701	GGC	2	6	1661698	1661703	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407724226
34006	NC_018701	GCCG	2	8	1661734	1661741	0 %	0 %	50 %	50 %	407724226
34007	NC_018701	AGC	2	6	1661792	1661797	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407724226
34008	NC_018701	GCACC	2	10	1661886	1661895	20 %	0 %	20 %	60 %	407724226
34009	NC_018701	TCGCC	2	10	1661927	1661936	0 %	20 %	20 %	60 %	407724226
34010	NC_018701	TGCCC	2	10	1661972	1661981	0 %	20 %	20 %	60 %	407724226
34011	NC_018701	CTC	2	6	1662157	1662162	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407724226
34012	NC_018701	TCG	2	6	1662227	1662232	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407724226
34013	NC_018701	TCGC	2	8	1662236	1662243	0 %	25 %	25 %	50 %	407724226
34014	NC_018701	CGG	2	6	1662274	1662279	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407724226
34015	NC_018701	GTC	2	6	1662281	1662286	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407724226
34016	NC_018701	GGT	2	6	1662339	1662344	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407724226
34017	NC_018701	GCCG	2	8	1662399	1662406	0 %	0 %	50 %	50 %	407724226
34018	NC_018701	GCC	2	6	1662439	1662444	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407724226
34019	NC_018701	GAG	2	6	1662538	1662543	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407724226
34020	NC_018701	CGT	2	6	1662544	1662549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407724226
34021	NC_018701	TCG	2	6	1662551	1662556	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407724226
34022	NC_018701	GC	3	6	1662596	1662601	0 %	0 %	50 %	50 %	407724226
34023	NC_018701	TCA	2	6	1662624	1662629	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407724226
34024	NC_018701	TGGC	2	8	1662650	1662657	0 %	25 %	50 %	25 %	407724226
34025	NC_018701	GAG	2	6	1662664	1662669	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407724226
34026	NC_018701	TCGC	2	8	1662725	1662732	0 %	25 %	25 %	50 %	407724226
34027	NC_018701	TTC	2	6	1662754	1662759	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407724226
34028	NC_018701	CAG	2	6	1662760	1662765	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407724226
34029	NC_018701	TCG	2	6	1662770	1662775	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407724226
34030	NC_018701	CG	3	6	1662802	1662807	0 %	0 %	50 %	50 %	407724226
34031	NC_018701	GC	3	6	1662828	1662833	0 %	0 %	50 %	50 %	407724226
34032	NC_018701	GGA	2	6	1662853	1662858	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407724226
34033	NC_018701	GCTC	2	8	1662884	1662891	0 %	25 %	25 %	50 %	407724226
34034	NC_018701	GAT	2	6	1662913	1662918	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407724226
34035	NC_018701	GCGG	2	8	1662957	1662964	0 %	0 %	75 %	25 %	407724226
34036	NC_018701	GCG	2	6	1662983	1662988	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407724226
34037	NC_018701	TGA	2	6	1663029	1663034	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407724226
34038	NC_018701	GCG	2	6	1663082	1663087	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407724226
34039	NC_018701	TCGC	2	8	1663133	1663140	0 %	25 %	25 %	50 %	407724226
34040	NC_018701	TGC	2	6	1663151	1663156	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407724226
34041	NC_018701	GTT	2	6	1663174	1663179	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407724226
34042	NC_018701	GC	3	6	1663194	1663199	0 %	0 %	50 %	50 %	407724226
34043	NC_018701	CGC	2	6	1663209	1663214	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407724226
34044	NC_018701	CGAATT	2	12	1663215	1663226	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	407724226
34045	NC_018701	T	6	6	1663258	1663263	0 %	100 %	0 %	0 %	407724226
34046	NC_018701	AGC	2	6	1663338	1663343	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407724226
34047	NC_018701	GC	3	6	1663474	1663479	0 %	0 %	50 %	50 %	407724227
34048	NC_018701	CGA	2	6	1663495	1663500	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407724227
34049	NC_018701	AGC	2	6	1663527	1663532	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407724227
34050	NC_018701	CGC	3	9	1663549	1663557	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407724227
34051	NC_018701	ACCG	2	8	1663592	1663599	25 %	0 %	25 %	50 %	407724227
34052	NC_018701	AGC	2	6	1663683	1663688	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407724227
34053	NC_018701	GCG	2	6	1663701	1663706	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407724227
34054	NC_018701	CCG	2	6	1663738	1663743	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407724227
34055	NC_018701	CTC	2	6	1663760	1663765	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407724227
34056	NC_018701	GCC	2	6	1663781	1663786	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407724227
34057	NC_018701	GGC	2	6	1663795	1663800	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407724227
34058	NC_018701	CGA	2	6	1663820	1663825	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407724227
34059	NC_018701	CGCT	2	8	1663874	1663881	0 %	25 %	25 %	50 %	407724227
34060	NC_018701	CGT	2	6	1663933	1663938	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407724227
34061	NC_018701	GCC	2	6	1663996	1664001	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407724227
34062	NC_018701	AGA	2	6	1664347	1664352	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407724228
34063	NC_018701	CCG	2	6	1664514	1664519	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407724228

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.