MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Sinorhizobium meliloti Rm41 plasmid pSYMA

Total Repeats: 902

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018683	TCCCG	2	10	534	543	0 %	20 %	20 %	60 %	407690005
2	NC_018683	GATCT	2	10	2004	2013	20 %	40 %	20 %	20 %	407690006
3	NC_018683	GATCG	2	10	2810	2819	20 %	20 %	40 %	20 %	407690007
4	NC_018683	GGCCA	2	10	3158	3167	20 %	0 %	40 %	40 %	407690007
5	NC_018683	CGGTG	2	10	3253	3262	0 %	20 %	60 %	20 %	407690007
6	NC_018683	AGGGC	2	10	3398	3407	20 %	0 %	60 %	20 %	407690007
7	NC_018683	GCTTG	2	10	8340	8349	0 %	40 %	40 %	20 %	407690014
8	NC_018683	GTGCG	2	10	8794	8803	0 %	20 %	60 %	20 %	407690015
9	NC_018683	GAAGA	2	10	8867	8876	60 %	0 %	40 %	0 %	407690015
10	NC_018683	CGACG	2	10	10869	10878	20 %	0 %	40 %	40 %	407690017
11	NC_018683	GACCA	2	10	14406	14415	40 %	0 %	20 %	40 %	407690019
12	NC_018683	CGTGG	2	10	15340	15349	0 %	20 %	60 %	20 %	407690020
13	NC_018683	CGGCC	2	10	17131	17140	0 %	0 %	40 %	60 %	407690022
14	NC_018683	GCCCC	2	10	17178	17187	0 %	0 %	20 %	80 %	407690022
15	NC_018683	CATTC	2	10	18941	18950	20 %	40 %	0 %	40 %	407690024
16	NC_018683	CGCGC	2	10	19514	19523	0 %	0 %	40 %	60 %	407690024
17	NC_018683	GAAAG	2	10	20681	20690	60 %	0 %	40 %	0 %	407690025
18	NC_018683	CTTCG	2	10	29953	29962	0 %	40 %	20 %	40 %	407690033
19	NC_018683	CTCGC	2	10	30265	30274	0 %	20 %	20 %	60 %	407690033
20	NC_018683	GGCGA	2	10	33520	33529	20 %	0 %	60 %	20 %	407690037
21	NC_018683	CGCTT	2	10	37259	37268	0 %	40 %	20 %	40 %	407690040
22	NC_018683	TGCCG	2	10	37270	37279	0 %	20 %	40 %	40 %	407690040
23	NC_018683	CCGTC	2	10	39405	39414	0 %	20 %	20 %	60 %	407690041
24	NC_018683	CCTTG	2	10	40076	40085	0 %	40 %	20 %	40 %	407690042
25	NC_018683	TGCGA	2	10	41018	41027	20 %	20 %	40 %	20 %	407690043
26	NC_018683	CGGCG	2	10	43252	43261	0 %	0 %	60 %	40 %	407690044
27	NC_018683	CGGAT	2	10	48227	48236	20 %	20 %	40 %	20 %	407690048
28	NC_018683	AGGAG	2	10	50094	50103	40 %	0 %	60 %	0 %	407690049
29	NC_018683	GCTCC	2	10	55326	55335	0 %	20 %	20 %	60 %	407690054
30	NC_018683	GATGC	2	10	56355	56364	20 %	20 %	40 %	20 %	407690056
31	NC_018683	CGGCA	2	10	56382	56391	20 %	0 %	40 %	40 %	407690056
32	NC_018683	GGGTC	2	10	59534	59543	0 %	20 %	60 %	20 %	407690057
33	NC_018683	CGTTG	2	10	59726	59735	0 %	40 %	40 %	20 %	407690057
34	NC_018683	GGCAG	2	10	59815	59824	20 %	0 %	60 %	20 %	407690057
35	NC_018683	CATGG	2	10	61193	61202	20 %	20 %	40 %	20 %	407690058
36	NC_018683	CCGAT	2	10	61317	61326	20 %	20 %	20 %	40 %	407690058
37	NC_018683	CGGCG	2	10	62532	62541	0 %	0 %	60 %	40 %	407690059
38	NC_018683	CAGGC	2	10	62569	62578	20 %	0 %	40 %	40 %	407690059
39	NC_018683	TAGAG	2	10	64280	64289	40 %	20 %	40 %	0 %	407690061
40	NC_018683	CTGGG	2	10	65589	65598	0 %	20 %	60 %	20 %	407690062
41	NC_018683	GGCGA	2	10	66510	66519	20 %	0 %	60 %	20 %	407690063
42	NC_018683	AGGGG	2	10	67159	67168	20 %	0 %	80 %	0 %	407690064
43	NC_018683	AGGGG	2	10	67664	67673	20 %	0 %	80 %	0 %	407690064
44	NC_018683	CGGCG	2	10	67862	67871	0 %	0 %	60 %	40 %	407690064
45	NC_018683	GCATC	2	10	70021	70030	20 %	20 %	20 %	40 %	407690070
46	NC_018683	GCAAG	2	10	74620	74629	40 %	0 %	40 %	20 %	407690072
47	NC_018683	ATCGA	2	10	74820	74829	40 %	20 %	20 %	20 %	407690072
48	NC_018683	CTTGG	2	10	76786	76795	0 %	40 %	40 %	20 %	407690074
49	NC_018683	CGAAG	2	10	76951	76960	40 %	0 %	40 %	20 %	407690074
50	NC_018683	GCTTC	2	10	79958	79967	0 %	40 %	20 %	40 %	407690076
51	NC_018683	TGATC	2	10	83614	83623	20 %	40 %	20 %	20 %	407690080
52	NC_018683	GCGGG	2	10	84421	84430	0 %	0 %	80 %	20 %	407690080
53	NC_018683	TGTGG	2	10	84743	84752	0 %	40 %	60 %	0 %	407690080
54	NC_018683	ACAGC	2	10	86794	86803	40 %	0 %	20 %	40 %	407690082
55	NC_018683	CGAGA	2	10	87416	87425	40 %	0 %	40 %	20 %	407690082
56	NC_018683	CGTTG	2	10	88377	88386	0 %	40 %	40 %	20 %	407690084
57	NC_018683	CATTC	2	10	88455	88464	20 %	40 %	0 %	40 %	407690084
58	NC_018683	CGTCG	2	10	89470	89479	0 %	20 %	40 %	40 %	407690084
59	NC_018683	TGGGT	2	10	91239	91248	0 %	40 %	60 %	0 %	407690086
60	NC_018683	GTGCG	2	10	91522	91531	0 %	20 %	60 %	20 %	407690086
61	NC_018683	GGCGT	2	10	92361	92370	0 %	20 %	60 %	20 %	407690086
62	NC_018683	ACTGG	2	10	92400	92409	20 %	20 %	40 %	20 %	407690086
63	NC_018683	GCCGT	2	10	93383	93392	0 %	20 %	40 %	40 %	407690087
64	NC_018683	CCGGA	3	15	93516	93530	20 %	0 %	40 %	40 %	407690087
65	NC_018683	CGCTG	2	10	93652	93661	0 %	20 %	40 %	40 %	407690087
66	NC_018683	CCGTC	2	10	93852	93861	0 %	20 %	20 %	60 %	407690088
67	NC_018683	TCACC	2	10	95514	95523	20 %	20 %	0 %	60 %	407690089
68	NC_018683	CTGAA	2	10	98846	98855	40 %	20 %	20 %	20 %	407690094
69	NC_018683	AGCCG	2	10	99495	99504	20 %	0 %	40 %	40 %	407690094
70	NC_018683	ATTTC	2	10	99546	99555	20 %	60 %	0 %	20 %	407690094
71	NC_018683	ATCAC	2	10	100490	100499	40 %	20 %	0 %	40 %	407690095
72	NC_018683	GCCGC	2	10	108875	108884	0 %	0 %	40 %	60 %	407690108
73	NC_018683	ACGGC	2	10	109235	109244	20 %	0 %	40 %	40 %	407690108
74	NC_018683	GTGCC	2	10	114308	114317	0 %	20 %	40 %	40 %	407690113
75	NC_018683	GTGTC	2	10	116839	116848	0 %	40 %	40 %	20 %	407690117
76	NC_018683	TGCGT	2	10	118948	118957	0 %	40 %	40 %	20 %	407690119
77	NC_018683	CGATC	2	10	121441	121450	20 %	20 %	20 %	40 %	407690120
78	NC_018683	GCGTG	2	10	124075	124084	0 %	20 %	60 %	20 %	407690124
79	NC_018683	GGAGC	2	10	127621	127630	20 %	0 %	60 %	20 %	407690128
80	NC_018683	GACGA	2	10	128770	128779	40 %	0 %	40 %	20 %	407690129
81	NC_018683	CCGGG	2	10	130857	130866	0 %	0 %	60 %	40 %	407690131
82	NC_018683	CCTCG	2	10	134943	134952	0 %	20 %	20 %	60 %	407690134
83	NC_018683	GTGCC	2	10	135511	135520	0 %	20 %	40 %	40 %	407690135
84	NC_018683	TCGGT	2	10	137903	137912	0 %	40 %	40 %	20 %	407690137
85	NC_018683	TACCG	2	10	140855	140864	20 %	20 %	20 %	40 %	407690140
86	NC_018683	GCGAG	2	10	141688	141697	20 %	0 %	60 %	20 %	407690140
87	NC_018683	ACGCC	2	10	142319	142328	20 %	0 %	20 %	60 %	407690141
88	NC_018683	GCCGA	2	10	143073	143082	20 %	0 %	40 %	40 %	407690142
89	NC_018683	TTGCA	2	10	145587	145596	20 %	40 %	20 %	20 %	407690144
90	NC_018683	CCGGG	2	10	146282	146291	0 %	0 %	60 %	40 %	407690145
91	NC_018683	CGGCG	2	10	147813	147822	0 %	0 %	60 %	40 %	407690146
92	NC_018683	TCCTT	2	10	147933	147942	0 %	60 %	0 %	40 %	407690146
93	NC_018683	CGTTT	2	10	151320	151329	0 %	60 %	20 %	20 %	407690150
94	NC_018683	CGCTG	2	10	154552	154561	0 %	20 %	40 %	40 %	407690152
95	NC_018683	TCGAT	2	10	158222	158231	20 %	40 %	20 %	20 %	407690156
96	NC_018683	GATGG	2	10	158604	158613	20 %	20 %	60 %	0 %	407690156
97	NC_018683	AGCAA	2	10	160818	160827	60 %	0 %	20 %	20 %	407690161
98	NC_018683	GTCGA	2	10	166015	166024	20 %	20 %	40 %	20 %	407690169
99	NC_018683	TGGAT	2	10	167374	167383	20 %	40 %	40 %	0 %	407690172
100	NC_018683	CGAGC	2	10	167703	167712	20 %	0 %	40 %	40 %	407690172
101	NC_018683	GCCGC	2	10	168479	168488	0 %	0 %	40 %	60 %	407690173
102	NC_018683	CACCG	2	10	168906	168915	20 %	0 %	20 %	60 %	407690173
103	NC_018683	GACGG	2	10	171498	171507	20 %	0 %	60 %	20 %	407690176
104	NC_018683	ATGTT	2	10	174384	174393	20 %	60 %	20 %	0 %	407690179
105	NC_018683	GCCTT	2	10	175781	175790	0 %	40 %	20 %	40 %	407690180
106	NC_018683	TGATC	2	10	177093	177102	20 %	40 %	20 %	20 %	407690182
107	NC_018683	CGAGG	2	10	178115	178124	20 %	0 %	60 %	20 %	407690183
108	NC_018683	GCGCC	2	10	178721	178730	0 %	0 %	40 %	60 %	407690184
109	NC_018683	GCCGA	2	10	178881	178890	20 %	0 %	40 %	40 %	407690184
110	NC_018683	GGAGG	2	10	179684	179693	20 %	0 %	80 %	0 %	407690184
111	NC_018683	AAGAC	2	10	181568	181577	60 %	0 %	20 %	20 %	407690186
112	NC_018683	TGCAT	2	10	183388	183397	20 %	40 %	20 %	20 %	407690187
113	NC_018683	TCGTC	2	10	184664	184673	0 %	40 %	20 %	40 %	407690188
114	NC_018683	GTCGC	2	10	185405	185414	0 %	20 %	40 %	40 %	407690188
115	NC_018683	CTGGT	2	10	185760	185769	0 %	40 %	40 %	20 %	407690189
116	NC_018683	TTCGC	2	10	186432	186441	0 %	40 %	20 %	40 %	407690189
117	NC_018683	TTCCT	2	10	186494	186503	0 %	60 %	0 %	40 %	407690190
118	NC_018683	GCGCT	2	10	188991	189000	0 %	20 %	40 %	40 %	407690193
119	NC_018683	GCGCC	2	10	195799	195808	0 %	0 %	40 %	60 %	407690200
120	NC_018683	GCAAA	2	10	196658	196667	60 %	0 %	20 %	20 %	407690202
121	NC_018683	AGCGC	2	10	200252	200261	20 %	0 %	40 %	40 %	407690205
122	NC_018683	CGCTG	2	10	201036	201045	0 %	20 %	40 %	40 %	407690206
123	NC_018683	GTCCT	2	10	203109	203118	0 %	40 %	20 %	40 %	407690208
124	NC_018683	AACTT	2	10	204297	204306	40 %	40 %	0 %	20 %	407690209
125	NC_018683	ATTCC	2	10	206040	206049	20 %	40 %	0 %	40 %	407690211
126	NC_018683	GCGCG	2	10	206303	206312	0 %	0 %	60 %	40 %	407690211
127	NC_018683	AAGGC	2	10	206804	206813	40 %	0 %	40 %	20 %	407690211
128	NC_018683	GGCGC	2	10	209565	209574	0 %	0 %	60 %	40 %	407690213
129	NC_018683	AAGGC	2	10	209641	209650	40 %	0 %	40 %	20 %	407690213
130	NC_018683	GATTG	2	10	210978	210987	20 %	40 %	40 %	0 %	407690215
131	NC_018683	TCGCG	2	10	213642	213651	0 %	20 %	40 %	40 %	407690217
132	NC_018683	GCCGA	2	10	215083	215092	20 %	0 %	40 %	40 %	407690218
133	NC_018683	TGAGC	2	10	217991	218000	20 %	20 %	40 %	20 %	407690219
134	NC_018683	CGACC	2	10	218378	218387	20 %	0 %	20 %	60 %	407690219
135	NC_018683	GCACG	2	10	218819	218828	20 %	0 %	40 %	40 %	407690219
136	NC_018683	CAGAA	2	10	219016	219025	60 %	0 %	20 %	20 %	407690219
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253	NC_018683	TGCGC	2	10	409080	409089	0 %	20 %	40 %	40 %	407690425
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257	NC_018683	GTGCC	2	10	415848	415857	0 %	20 %	40 %	40 %	407690430
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259	NC_018683	GCGCA	2	10	418132	418141	20 %	0 %	40 %	40 %	407690432
260	NC_018683	GCACG	2	10	424172	424181	20 %	0 %	40 %	40 %	407690437
261	NC_018683	CTGCG	2	10	425575	425584	0 %	20 %	40 %	40 %	407690438
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295	NC_018683	GCCGA	2	10	485665	485674	20 %	0 %	40 %	40 %	407690503
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388	NC_018683	GGCGA	2	10	665437	665446	20 %	0 %	60 %	20 %	407690673
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