MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Sinorhizobium meliloti Rm41 plasmid pSYMA

Total Repeats: 28648

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_018683	GAT	2	6	49951	49956	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407690049
1002	NC_018683	CCGC	2	8	49976	49983	0 %	0 %	25 %	75 %	407690049
1003	NC_018683	GCA	2	6	50031	50036	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407690049
1004	NC_018683	GA	3	6	50050	50055	50 %	0 %	50 %	0 %	407690049
1005	NC_018683	AGGAG	2	10	50094	50103	40 %	0 %	60 %	0 %	407690049
1006	NC_018683	TCG	2	6	50117	50122	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407690049
1007	NC_018683	TCGG	2	8	50159	50166	0 %	25 %	50 %	25 %	407690049
1008	NC_018683	GGT	2	6	50218	50223	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407690049
1009	NC_018683	GCC	2	6	50227	50232	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407690049
1010	NC_018683	GCC	3	9	50245	50253	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407690049
1011	NC_018683	TTC	2	6	50351	50356	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407690049
1012	NC_018683	CGA	2	6	50364	50369	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407690049
1013	NC_018683	GCGG	2	8	50431	50438	0 %	0 %	75 %	25 %	407690049
1014	NC_018683	CGG	2	6	50511	50516	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407690049
1015	NC_018683	GTC	2	6	50581	50586	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407690049
1016	NC_018683	CGA	2	6	50607	50612	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407690049
1017	NC_018683	GC	4	8	50614	50621	0 %	0 %	50 %	50 %	407690049
1018	NC_018683	TCC	2	6	50630	50635	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407690049
1019	NC_018683	CGA	2	6	50673	50678	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407690049
1020	NC_018683	GC	3	6	50700	50705	0 %	0 %	50 %	50 %	407690049
1021	NC_018683	GAA	2	6	50710	50715	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407690049
1022	NC_018683	GTTC	2	8	50766	50773	0 %	50 %	25 %	25 %	407690049
1023	NC_018683	CAC	2	6	51167	51172	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407690050
1024	NC_018683	CCG	2	6	51185	51190	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407690050
1025	NC_018683	GCC	3	9	51243	51251	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407690050
1026	NC_018683	GTG	2	6	51282	51287	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407690050
1027	NC_018683	AGGA	2	8	51301	51308	50 %	0 %	50 %	0 %	407690050
1028	NC_018683	GCGG	2	8	51378	51385	0 %	0 %	75 %	25 %	407690050
1029	NC_018683	GGCA	2	8	51410	51417	25 %	0 %	50 %	25 %	407690050
1030	NC_018683	GTA	2	6	51429	51434	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407690050
1031	NC_018683	GAC	2	6	51446	51451	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407690050
1032	NC_018683	CGCT	2	8	51454	51461	0 %	25 %	25 %	50 %	407690050
1033	NC_018683	GCTGCC	2	12	51470	51481	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	407690050
1034	NC_018683	CGC	2	6	51515	51520	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407690050
1035	NC_018683	GCG	2	6	51522	51527	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407690050
1036	NC_018683	CCGG	2	8	51551	51558	0 %	0 %	50 %	50 %	407690050
1037	NC_018683	GCGG	2	8	51611	51618	0 %	0 %	75 %	25 %	407690050
1038	NC_018683	GAC	2	6	51708	51713	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407690050
1039	NC_018683	CAG	2	6	51735	51740	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407690050
1040	NC_018683	GGGGTA	2	12	51789	51800	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	407690050
1041	NC_018683	CGGC	2	8	51850	51857	0 %	0 %	50 %	50 %	407690050
1042	NC_018683	GGC	2	6	51885	51890	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407690050
1043	NC_018683	GACG	3	12	51986	51997	25 %	0 %	50 %	25 %	407690050
1044	NC_018683	CGC	2	6	52010	52015	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407690050
1045	NC_018683	CGC	2	6	52019	52024	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407690050
1046	NC_018683	TGA	2	6	52093	52098	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407690050
1047	NC_018683	CGG	2	6	52127	52132	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407690050
1048	NC_018683	GCGA	2	8	52172	52179	25 %	0 %	50 %	25 %	407690050
1049	NC_018683	GGA	2	6	52229	52234	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407690050
1050	NC_018683	CGG	2	6	52297	52302	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407690050
1051	NC_018683	CG	3	6	52658	52663	0 %	0 %	50 %	50 %	407690051
1052	NC_018683	GAT	2	6	52666	52671	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407690051
1053	NC_018683	TGC	2	6	52719	52724	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407690051
1054	NC_018683	CCG	2	6	52751	52756	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407690051
1055	NC_018683	GCCT	2	8	52757	52764	0 %	25 %	25 %	50 %	407690051
1056	NC_018683	CCCG	2	8	52768	52775	0 %	0 %	25 %	75 %	407690051
1057	NC_018683	CG	3	6	52809	52814	0 %	0 %	50 %	50 %	407690051
1058	NC_018683	TTGC	2	8	52838	52845	0 %	50 %	25 %	25 %	407690051
1059	NC_018683	TCC	2	6	52860	52865	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407690051
1060	NC_018683	GCGG	2	8	52892	52899	0 %	0 %	75 %	25 %	407690051
1061	NC_018683	CAT	2	6	52924	52929	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407690051
1062	NC_018683	TCG	2	6	52935	52940	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407690051
1063	NC_018683	CAT	3	9	52951	52959	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407690051
1064	NC_018683	CGT	2	6	53104	53109	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407690051
1065	NC_018683	AGA	2	6	53139	53144	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407690051
1066	NC_018683	CCTT	2	8	53145	53152	0 %	50 %	0 %	50 %	407690051
1067	NC_018683	GCG	2	6	53170	53175	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407690051
1068	NC_018683	GAT	2	6	53260	53265	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407690051
1069	NC_018683	GCG	2	6	53302	53307	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407690051
1070	NC_018683	AGC	2	6	53420	53425	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407690051
1071	NC_018683	CGG	2	6	53458	53463	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407690051
1072	NC_018683	GAA	2	6	53498	53503	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407690051
1073	NC_018683	GCC	2	6	53546	53551	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407690051
1074	NC_018683	TCCC	2	8	53552	53559	0 %	25 %	0 %	75 %	407690051
1075	NC_018683	GCG	2	6	53609	53614	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407690051
1076	NC_018683	GTG	2	6	53708	53713	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407690051
1077	NC_018683	GCG	2	6	53743	53748	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407690051
1078	NC_018683	CG	3	6	54408	54413	0 %	0 %	50 %	50 %	407690052
1079	NC_018683	CCCG	2	8	54516	54523	0 %	0 %	25 %	75 %	407690052
1080	NC_018683	CGA	2	6	54539	54544	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407690052
1081	NC_018683	GCG	2	6	54545	54550	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407690052
1082	NC_018683	CCA	2	6	54647	54652	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407690052
1083	NC_018683	GCTG	2	8	54811	54818	0 %	25 %	50 %	25 %	407690053
1084	NC_018683	CAA	2	6	54843	54848	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407690053
1085	NC_018683	CA	3	6	54887	54892	50 %	0 %	0 %	50 %	407690053
1086	NC_018683	CCGC	2	8	54893	54900	0 %	0 %	25 %	75 %	407690053
1087	NC_018683	GC	3	6	54915	54920	0 %	0 %	50 %	50 %	407690053
1088	NC_018683	CAC	2	6	55097	55102	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407690054
1089	NC_018683	CGC	3	9	55118	55126	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407690054
1090	NC_018683	GC	3	6	55247	55252	0 %	0 %	50 %	50 %	407690054
1091	NC_018683	GCTCC	2	10	55326	55335	0 %	20 %	20 %	60 %	407690054
1092	NC_018683	GCCG	2	8	55363	55370	0 %	0 %	50 %	50 %	407690054
1093	NC_018683	GCGGTC	2	12	55458	55469	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	407690054
1094	NC_018683	ACG	2	6	55528	55533	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407690054
1095	NC_018683	GCG	2	6	55575	55580	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407690054
1096	NC_018683	CGT	2	6	55628	55633	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407690054
1097	NC_018683	CCG	2	6	55712	55717	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407690054
1098	NC_018683	CG	3	6	55737	55742	0 %	0 %	50 %	50 %	407690054
1099	NC_018683	GCC	2	6	55774	55779	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407690054
1100	NC_018683	AGCA	2	8	55794	55801	50 %	0 %	25 %	25 %	407690054
1101	NC_018683	T	6	6	55907	55912	0 %	100 %	0 %	0 %	407690055
1102	NC_018683	TCG	2	6	55927	55932	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407690055
1103	NC_018683	CTG	2	6	55939	55944	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407690055
1104	NC_018683	GGC	2	6	55954	55959	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407690055
1105	NC_018683	C	7	7	56032	56038	0 %	0 %	0 %	100 %	407690055
1106	NC_018683	GAC	2	6	56058	56063	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407690055
1107	NC_018683	GC	3	6	56114	56119	0 %	0 %	50 %	50 %	407690055
1108	NC_018683	GGGC	2	8	56180	56187	0 %	0 %	75 %	25 %	407690055
1109	NC_018683	ATC	2	6	56215	56220	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407690055
1110	NC_018683	ATC	2	6	56268	56273	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407690056
1111	NC_018683	ACGG	2	8	56275	56282	25 %	0 %	50 %	25 %	407690056
1112	NC_018683	GAG	2	6	56340	56345	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407690056
1113	NC_018683	GATGC	2	10	56355	56364	20 %	20 %	40 %	20 %	407690056
1114	NC_018683	GCC	2	6	56373	56378	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407690056
1115	NC_018683	CGGCA	2	10	56382	56391	20 %	0 %	40 %	40 %	407690056
1116	NC_018683	AGG	2	6	56446	56451	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407690056
1117	NC_018683	AGC	2	6	56455	56460	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407690056
1118	NC_018683	CCG	2	6	56477	56482	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407690056
1119	NC_018683	AGG	2	6	56498	56503	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407690056
1120	NC_018683	ACC	2	6	56536	56541	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407690056
1121	NC_018683	GCC	2	6	56562	56567	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407690056
1122	NC_018683	CGG	2	6	56609	56614	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407690056
1123	NC_018683	AGG	2	6	56626	56631	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407690056
1124	NC_018683	CCG	2	6	56731	56736	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407690056
1125	NC_018683	GCG	2	6	56746	56751	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407690056
1126	NC_018683	GCG	2	6	56848	56853	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407690056
1127	NC_018683	GCCATT	2	12	56932	56943	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	407690056
1128	NC_018683	GAG	2	6	56962	56967	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407690056
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1142	NC_018683	CTTC	2	8	57827	57834	0 %	50 %	0 %	50 %	407690056
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1253	NC_018683	TG	3	6	63949	63954	0 %	50 %	50 %	0 %	407690061
1254	NC_018683	TGGC	2	8	63962	63969	0 %	25 %	50 %	25 %	407690061
1255	NC_018683	CGGG	2	8	63971	63978	0 %	0 %	75 %	25 %	407690061
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1261	NC_018683	TGC	2	6	64200	64205	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407690061
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1303	NC_018683	CGA	2	6	67628	67633	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407690064
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1372	NC_018683	ACC	2	6	71809	71814	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407690071
1373	NC_018683	GAA	2	6	71886	71891	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407690071
1374	NC_018683	GGT	2	6	71973	71978	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407690071
1375	NC_018683	GTT	2	6	72030	72035	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407690071
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