MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Sinorhizobium meliloti Rm41 plasmid pSYMA

Total Repeats: 28648

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_018683	GCCAT	2	10	288579	288588	20 %	20 %	20 %	40 %	407690286
5502	NC_018683	TCG	2	6	288597	288602	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407690286
5503	NC_018683	CAA	2	6	288613	288618	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407690286
5504	NC_018683	ATA	2	6	288627	288632	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407690286
5505	NC_018683	T	6	6	288926	288931	0 %	100 %	0 %	0 %	407690287
5506	NC_018683	CTT	2	6	288942	288947	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407690287
5507	NC_018683	TC	3	6	288985	288990	0 %	50 %	0 %	50 %	407690287
5508	NC_018683	TCG	2	6	289043	289048	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407690287
5509	NC_018683	GCT	2	6	289186	289191	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407690288
5510	NC_018683	ATT	2	6	289197	289202	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407690288
5511	NC_018683	AGC	2	6	289236	289241	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407690288
5512	NC_018683	CCAT	2	8	289255	289262	25 %	25 %	0 %	50 %	407690288
5513	NC_018683	CGG	2	6	289397	289402	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407690288
5514	NC_018683	TTC	2	6	289408	289413	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407690288
5515	NC_018683	CTG	2	6	289615	289620	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407690289
5516	NC_018683	GCC	2	6	289742	289747	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407690289
5517	NC_018683	TCC	2	6	289775	289780	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407690289
5518	NC_018683	CCT	2	6	289962	289967	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407690289
5519	NC_018683	TTC	2	6	289991	289996	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407690289
5520	NC_018683	CGA	2	6	290023	290028	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407690289
5521	NC_018683	CTT	2	6	290038	290043	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407690289
5522	NC_018683	CGA	2	6	290067	290072	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407690289
5523	NC_018683	TGC	2	6	290086	290091	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407690289
5524	NC_018683	AGCG	2	8	290204	290211	25 %	0 %	50 %	25 %	407690289
5525	NC_018683	CGT	2	6	290229	290234	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407690289
5526	NC_018683	GAC	2	6	290251	290256	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407690289
5527	NC_018683	GC	3	6	290290	290295	0 %	0 %	50 %	50 %	407690289
5528	NC_018683	CAA	2	6	290313	290318	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407690289
5529	NC_018683	TGGT	2	8	290329	290336	0 %	50 %	50 %	0 %	407690289
5530	NC_018683	ATA	2	6	290448	290453	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407690290
5531	NC_018683	TCGC	2	8	290533	290540	0 %	25 %	25 %	50 %	407690290
5532	NC_018683	CAC	2	6	290605	290610	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407690290
5533	NC_018683	CGG	2	6	290651	290656	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407690290
5534	NC_018683	AG	3	6	290681	290686	50 %	0 %	50 %	0 %	407690290
5535	NC_018683	GGC	2	6	290698	290703	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407690290
5536	NC_018683	TCG	2	6	290781	290786	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407690290
5537	NC_018683	TCG	2	6	290844	290849	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407690290
5538	NC_018683	CCTG	2	8	290893	290900	0 %	25 %	25 %	50 %	407690290
5539	NC_018683	CGG	2	6	290936	290941	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407690290
5540	NC_018683	GTG	2	6	290942	290947	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407690290
5541	NC_018683	CCT	2	6	290958	290963	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407690290
5542	NC_018683	GGCC	2	8	290978	290985	0 %	0 %	50 %	50 %	407690290
5543	NC_018683	CAATG	2	10	291112	291121	40 %	20 %	20 %	20 %	407690290
5544	NC_018683	CTG	2	6	291135	291140	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407690290
5545	NC_018683	AAG	2	6	291142	291147	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407690290
5546	NC_018683	CCGC	2	8	291281	291288	0 %	0 %	25 %	75 %	407690290
5547	NC_018683	GC	3	6	291295	291300	0 %	0 %	50 %	50 %	407690290
5548	NC_018683	CCT	2	6	291310	291315	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407690290
5549	NC_018683	CGT	2	6	291413	291418	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407690291
5550	NC_018683	AGC	2	6	291484	291489	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407690291
5551	NC_018683	CTT	2	6	291567	291572	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407690292
5552	NC_018683	CGA	2	6	291573	291578	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407690292
5553	NC_018683	CGCTT	2	10	291633	291642	0 %	40 %	20 %	40 %	407690292
5554	NC_018683	CGC	2	6	291643	291648	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407690292
5555	NC_018683	TC	3	6	291722	291727	0 %	50 %	0 %	50 %	407690292
5556	NC_018683	GTC	2	6	291742	291747	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407690292
5557	NC_018683	CTG	2	6	291792	291797	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407690292
5558	NC_018683	CCAG	2	8	291825	291832	25 %	0 %	25 %	50 %	407690292
5559	NC_018683	GTA	2	6	291874	291879	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407690292
5560	NC_018683	GCC	2	6	291885	291890	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407690292
5561	NC_018683	GTT	2	6	291924	291929	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407690292
5562	NC_018683	GGC	2	6	291978	291983	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407690292
5563	NC_018683	GGAT	2	8	292001	292008	25 %	25 %	50 %	0 %	407690292
5564	NC_018683	GCG	2	6	292047	292052	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407690292
5565	NC_018683	TGA	2	6	292070	292075	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407690292
5566	NC_018683	GGA	2	6	292121	292126	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407690292
5567	NC_018683	GCC	2	6	292156	292161	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407690292
5568	NC_018683	GCC	2	6	292204	292209	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407690292
5569	NC_018683	CAT	2	6	292294	292299	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407690292
5570	NC_018683	GTC	2	6	292330	292335	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407690292
5571	NC_018683	CGC	2	6	292344	292349	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407690292
5572	NC_018683	CGAAG	2	10	292365	292374	40 %	0 %	40 %	20 %	407690292
5573	NC_018683	GGA	2	6	292411	292416	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407690292
5574	NC_018683	CCT	2	6	292425	292430	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407690292
5575	NC_018683	TACA	2	8	292435	292442	50 %	25 %	0 %	25 %	407690292
5576	NC_018683	GCA	2	6	292467	292472	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407690292
5577	NC_018683	GTC	2	6	292491	292496	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407690292
5578	NC_018683	GC	3	6	292502	292507	0 %	0 %	50 %	50 %	407690292
5579	NC_018683	CGG	2	6	292509	292514	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407690292
5580	NC_018683	GGA	2	6	292559	292564	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407690292
5581	NC_018683	CGC	2	6	292596	292601	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407690292
5582	NC_018683	GGC	2	6	292629	292634	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407690292
5583	NC_018683	TGA	2	6	293032	293037	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407690293
5584	NC_018683	GCT	2	6	293044	293049	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407690293
5585	NC_018683	CG	4	8	293117	293124	0 %	0 %	50 %	50 %	407690293
5586	NC_018683	GCCG	2	8	293161	293168	0 %	0 %	50 %	50 %	407690293
5587	NC_018683	GCT	2	6	293172	293177	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407690293
5588	NC_018683	TTC	2	6	293232	293237	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407690293
5589	NC_018683	AGC	2	6	293246	293251	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407690293
5590	NC_018683	T	6	6	293273	293278	0 %	100 %	0 %	0 %	407690293
5591	NC_018683	GGC	2	6	293349	293354	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407690293
5592	NC_018683	GAA	2	6	293358	293363	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407690293
5593	NC_018683	CGGT	2	8	293510	293517	0 %	25 %	50 %	25 %	407690293
5594	NC_018683	CGG	2	6	293579	293584	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407690293
5595	NC_018683	GAGC	2	8	293775	293782	25 %	0 %	50 %	25 %	407690293
5596	NC_018683	GTC	2	6	293835	293840	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407690293
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5599	NC_018683	CAC	2	6	293944	293949	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407690293
5600	NC_018683	GC	4	8	294104	294111	0 %	0 %	50 %	50 %	407690293
5601	NC_018683	TGA	2	6	294121	294126	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407690293
5602	NC_018683	CG	3	6	294172	294177	0 %	0 %	50 %	50 %	407690293
5603	NC_018683	GGCTC	2	10	294266	294275	0 %	20 %	40 %	40 %	407690293
5604	NC_018683	ACG	3	9	294284	294292	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407690293
5605	NC_018683	GAG	2	6	294330	294335	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407690293
5606	NC_018683	GC	3	6	294359	294364	0 %	0 %	50 %	50 %	407690293
5607	NC_018683	CAA	2	6	294425	294430	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407690293
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5609	NC_018683	CTC	2	6	294635	294640	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407690294
5610	NC_018683	GGA	2	6	294670	294675	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407690294
5611	NC_018683	ACT	2	6	294681	294686	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407690294
5612	NC_018683	GGC	2	6	294723	294728	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407690294
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5614	NC_018683	GAT	2	6	294814	294819	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407690294
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5616	NC_018683	CTTGC	2	10	294841	294850	0 %	40 %	20 %	40 %	407690294
5617	NC_018683	AGA	2	6	294870	294875	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407690294
5618	NC_018683	CG	3	6	294999	295004	0 %	0 %	50 %	50 %	407690294
5619	NC_018683	CTT	3	9	295057	295065	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407690294
5620	NC_018683	GAT	2	6	295199	295204	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407690294
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5622	NC_018683	GCC	2	6	295232	295237	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407690294
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5744	NC_018683	TCA	2	6	300334	300339	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407690299
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5747	NC_018683	CGGCTC	2	12	300444	300455	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	407690299
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5756	NC_018683	TCG	2	6	301223	301228	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407690300
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5763	NC_018683	AG	3	6	301605	301610	50 %	0 %	50 %	0 %	407690300
5764	NC_018683	CGA	2	6	301650	301655	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407690300
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5850	NC_018683	TCG	2	6	305674	305679	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407690304
5851	NC_018683	CTGC	2	8	305691	305698	0 %	25 %	25 %	50 %	407690304
5852	NC_018683	CG	3	6	305763	305768	0 %	0 %	50 %	50 %	407690304
5853	NC_018683	CGA	2	6	305798	305803	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407690304
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5855	NC_018683	GAA	2	6	305864	305869	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407690304
5856	NC_018683	TC	3	6	305879	305884	0 %	50 %	0 %	50 %	407690304
5857	NC_018683	TCA	2	6	305893	305898	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407690304
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5859	NC_018683	TCGG	2	8	305953	305960	0 %	25 %	50 %	25 %	407690304
5860	NC_018683	CCAT	2	8	306005	306012	25 %	25 %	0 %	50 %	407690304
5861	NC_018683	GCC	2	6	306030	306035	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407690304
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5864	NC_018683	AAC	2	6	306096	306101	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407690304
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5986	NC_018683	CCG	2	6	313839	313844	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407690312
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