MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Sinorhizobium meliloti Rm41 plasmid pSYMA

Total Repeats: 28648

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_018683	CAG	2	6	235360	235365	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407690234
4502	NC_018683	CTGG	2	8	235405	235412	0 %	25 %	50 %	25 %	407690234
4503	NC_018683	GAG	2	6	235429	235434	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407690234
4504	NC_018683	TC	3	6	235498	235503	0 %	50 %	0 %	50 %	407690234
4505	NC_018683	CG	3	6	235570	235575	0 %	0 %	50 %	50 %	407690234
4506	NC_018683	CAA	2	6	235579	235584	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407690234
4507	NC_018683	CAG	2	6	235606	235611	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407690234
4508	NC_018683	GAGC	2	8	235614	235621	25 %	0 %	50 %	25 %	407690234
4509	NC_018683	AGC	2	6	235627	235632	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407690234
4510	NC_018683	GCG	2	6	235660	235665	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407690234
4511	NC_018683	CTG	2	6	235675	235680	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407690234
4512	NC_018683	CAG	3	9	235693	235701	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407690234
4513	NC_018683	CGG	2	6	235713	235718	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407690234
4514	NC_018683	TGG	2	6	235731	235736	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407690234
4515	NC_018683	CGC	2	6	235744	235749	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407690234
4516	NC_018683	GC	3	6	235806	235811	0 %	0 %	50 %	50 %	407690234
4517	NC_018683	CGT	2	6	235825	235830	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407690234
4518	NC_018683	CCA	2	6	235833	235838	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407690234
4519	NC_018683	CAG	2	6	235908	235913	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407690234
4520	NC_018683	ATC	2	6	235945	235950	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407690234
4521	NC_018683	CGG	2	6	236106	236111	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407690235
4522	NC_018683	GCC	2	6	236478	236483	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407690236
4523	NC_018683	TCC	2	6	236557	236562	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407690236
4524	NC_018683	GTTG	2	8	236640	236647	0 %	50 %	50 %	0 %	407690236
4525	NC_018683	GAGC	2	8	236851	236858	25 %	0 %	50 %	25 %	407690236
4526	NC_018683	CCA	2	6	236900	236905	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407690236
4527	NC_018683	GCC	2	6	236952	236957	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407690236
4528	NC_018683	ACCG	2	8	236980	236987	25 %	0 %	25 %	50 %	407690236
4529	NC_018683	GCG	2	6	237082	237087	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407690236
4530	NC_018683	GCGATC	2	12	237130	237141	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	407690236
4531	NC_018683	GCG	2	6	237329	237334	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407690237
4532	NC_018683	GTC	2	6	237344	237349	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407690237
4533	NC_018683	GCGCA	2	10	237413	237422	20 %	0 %	40 %	40 %	407690237
4534	NC_018683	ACC	2	6	237479	237484	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407690237
4535	NC_018683	C	6	6	237499	237504	0 %	0 %	0 %	100 %	407690237
4536	NC_018683	GCTG	2	8	237528	237535	0 %	25 %	50 %	25 %	407690237
4537	NC_018683	CCA	2	6	237567	237572	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407690237
4538	NC_018683	GAC	2	6	237626	237631	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407690237
4539	NC_018683	GGC	2	6	237665	237670	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407690237
4540	NC_018683	CGG	2	6	237835	237840	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407690237
4541	NC_018683	CGC	2	6	237902	237907	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407690237
4542	NC_018683	CGG	2	6	237925	237930	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407690237
4543	NC_018683	GCG	2	6	237943	237948	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407690237
4544	NC_018683	AAG	2	6	237990	237995	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407690237
4545	NC_018683	CCGA	2	8	238011	238018	25 %	0 %	25 %	50 %	407690237
4546	NC_018683	GCT	2	6	238059	238064	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407690237
4547	NC_018683	CCG	2	6	238078	238083	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407690237
4548	NC_018683	ATC	2	6	238113	238118	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407690237
4549	NC_018683	GC	4	8	238177	238184	0 %	0 %	50 %	50 %	407690237
4550	NC_018683	GAT	2	6	238196	238201	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407690237
4551	NC_018683	GCC	2	6	238217	238222	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407690237
4552	NC_018683	TGAA	2	8	238236	238243	50 %	25 %	25 %	0 %	407690237
4553	NC_018683	GCC	2	6	238357	238362	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407690238
4554	NC_018683	GCTG	2	8	238377	238384	0 %	25 %	50 %	25 %	407690238
4555	NC_018683	GC	3	6	238395	238400	0 %	0 %	50 %	50 %	407690238
4556	NC_018683	GATC	2	8	238404	238411	25 %	25 %	25 %	25 %	407690238
4557	NC_018683	GAA	2	6	238414	238419	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407690238
4558	NC_018683	ATG	2	6	238433	238438	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407690238
4559	NC_018683	GCG	2	6	238439	238444	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407690238
4560	NC_018683	GCC	2	6	238495	238500	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407690238
4561	NC_018683	GGT	2	6	238539	238544	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407690238
4562	NC_018683	GAC	2	6	238555	238560	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407690238
4563	NC_018683	GC	4	8	238561	238568	0 %	0 %	50 %	50 %	407690238
4564	NC_018683	GCC	2	6	238606	238611	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407690238
4565	NC_018683	CCG	2	6	238617	238622	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407690238
4566	NC_018683	GCG	2	6	238632	238637	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407690238
4567	NC_018683	GTT	2	6	238648	238653	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407690238
4568	NC_018683	GTC	2	6	238672	238677	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407690238
4569	NC_018683	GC	3	6	238695	238700	0 %	0 %	50 %	50 %	407690238
4570	NC_018683	CGT	2	6	238801	238806	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407690238
4571	NC_018683	TTA	2	6	239105	239110	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407690239
4572	NC_018683	CGTT	2	8	239135	239142	0 %	50 %	25 %	25 %	407690239
4573	NC_018683	AGC	2	6	239158	239163	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407690239
4574	NC_018683	GCT	2	6	239173	239178	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407690239
4575	NC_018683	TC	3	6	239184	239189	0 %	50 %	0 %	50 %	407690239
4576	NC_018683	GGAAC	2	10	239229	239238	40 %	0 %	40 %	20 %	407690239
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4579	NC_018683	TTC	2	6	239429	239434	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407690239
4580	NC_018683	CGC	2	6	239529	239534	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407690239
4581	NC_018683	CGG	2	6	239538	239543	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407690239
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4584	NC_018683	CCG	2	6	239651	239656	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407690239
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4586	NC_018683	GC	4	8	239748	239755	0 %	0 %	50 %	50 %	407690239
4587	NC_018683	AACGA	2	10	239761	239770	60 %	0 %	20 %	20 %	407690239
4588	NC_018683	TGA	2	6	239774	239779	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407690239
4589	NC_018683	CGC	2	6	239784	239789	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407690239
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4592	NC_018683	TGC	2	6	239849	239854	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407690239
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4594	NC_018683	ATGCCG	2	12	239900	239911	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	407690239
4595	NC_018683	ATCT	2	8	239913	239920	25 %	50 %	0 %	25 %	407690239
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4597	NC_018683	GCAG	2	8	240022	240029	25 %	0 %	50 %	25 %	407690239
4598	NC_018683	TGC	2	6	240263	240268	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407690240
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4600	NC_018683	CGA	2	6	240396	240401	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407690240
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4604	NC_018683	CGG	2	6	240533	240538	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407690240
4605	NC_018683	GGT	2	6	240567	240572	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407690240
4606	NC_018683	GGA	2	6	240720	240725	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407690240
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4608	NC_018683	CGC	2	6	240800	240805	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407690240
4609	NC_018683	CCT	2	6	240815	240820	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407690240
4610	NC_018683	TCG	2	6	240830	240835	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407690240
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4613	NC_018683	GC	3	6	240942	240947	0 %	0 %	50 %	50 %	407690240
4614	NC_018683	GC	3	6	240959	240964	0 %	0 %	50 %	50 %	407690240
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4619	NC_018683	TCG	2	6	241228	241233	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407690241
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4621	NC_018683	ACC	2	6	241247	241252	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407690241
4622	NC_018683	GGC	2	6	241364	241369	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407690241
4623	NC_018683	CGC	2	6	241424	241429	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407690241
4624	NC_018683	CCG	2	6	241536	241541	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407690241
4625	NC_018683	GGCG	2	8	241660	241667	0 %	0 %	75 %	25 %	407690242
4626	NC_018683	CCA	2	6	241704	241709	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407690242
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4629	NC_018683	GGC	2	6	241802	241807	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407690242
4630	NC_018683	CG	3	6	241869	241874	0 %	0 %	50 %	50 %	407690242
4631	NC_018683	CGG	2	6	241891	241896	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407690242
4632	NC_018683	GTC	2	6	241988	241993	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407690242
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4634	NC_018683	TCCTG	2	10	242059	242068	0 %	40 %	20 %	40 %	407690242
4635	NC_018683	ATG	2	6	242127	242132	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407690243
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4646	NC_018683	GCG	2	6	242673	242678	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407690243
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4650	NC_018683	CGC	2	6	242840	242845	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407690243
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4652	NC_018683	CGT	2	6	242876	242881	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407690243
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4654	NC_018683	CGC	2	6	242967	242972	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407690243
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4731	NC_018683	TCG	3	9	247147	247155	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407690247
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4734	NC_018683	CGCC	2	8	247403	247410	0 %	0 %	25 %	75 %	407690247
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4737	NC_018683	CA	3	6	247505	247510	50 %	0 %	0 %	50 %	407690247
4738	NC_018683	GCG	2	6	247859	247864	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407690248
4739	NC_018683	GA	3	6	247917	247922	50 %	0 %	50 %	0 %	407690248
4740	NC_018683	GACGGC	2	12	247975	247986	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	407690248
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4742	NC_018683	CGA	2	6	248094	248099	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407690248
4743	NC_018683	GGA	2	6	248124	248129	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407690248
4744	NC_018683	TGCT	2	8	248132	248139	0 %	50 %	25 %	25 %	407690248
4745	NC_018683	GCC	2	6	248159	248164	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407690248
4746	NC_018683	CGAA	2	8	248165	248172	50 %	0 %	25 %	25 %	407690248
4747	NC_018683	TCG	3	9	248189	248197	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407690248
4748	NC_018683	CGA	2	6	248352	248357	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407690248
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4751	NC_018683	CAT	2	6	248497	248502	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407690249
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4756	NC_018683	GGA	2	6	248615	248620	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407690249
4757	NC_018683	CGCTC	2	10	248792	248801	0 %	20 %	20 %	60 %	407690249
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4759	NC_018683	TCA	2	6	248947	248952	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407690249
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4763	NC_018683	GGA	2	6	249065	249070	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407690249
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4830	NC_018683	CAAGA	2	10	253296	253305	60 %	0 %	20 %	20 %	407690254
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4852	NC_018683	GAACG	2	10	254981	254990	40 %	0 %	40 %	20 %	407690256
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4861	NC_018683	GC	3	6	255526	255531	0 %	0 %	50 %	50 %	407690257
4862	NC_018683	GTT	2	6	255533	255538	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407690257
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4983	NC_018683	TCT	2	6	262108	262113	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407690262
4984	NC_018683	CTG	2	6	262125	262130	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407690262
4985	NC_018683	GCTG	2	8	262156	262163	0 %	25 %	50 %	25 %	407690262
4986	NC_018683	GGCGCT	2	12	262205	262216	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	407690262
4987	NC_018683	ATC	2	6	262239	262244	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407690262
4988	NC_018683	TGCGC	2	10	262343	262352	0 %	20 %	40 %	40 %	407690262
4989	NC_018683	CGTC	2	8	262381	262388	0 %	25 %	25 %	50 %	407690262
4990	NC_018683	CGT	3	9	262415	262423	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407690262
4991	NC_018683	GTG	2	6	262533	262538	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407690262
4992	NC_018683	CG	3	6	262566	262571	0 %	0 %	50 %	50 %	407690262
4993	NC_018683	CCG	2	6	262667	262672	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407690263
4994	NC_018683	TGGG	2	8	262684	262691	0 %	25 %	75 %	0 %	407690263
4995	NC_018683	CTG	2	6	262717	262722	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407690263
4996	NC_018683	ATC	2	6	262817	262822	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407690263
4997	NC_018683	ATC	2	6	262835	262840	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407690263
4998	NC_018683	CAG	2	6	262857	262862	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407690263
4999	NC_018683	CGGT	2	8	262892	262899	0 %	25 %	50 %	25 %	407690263
5000	NC_018683	CGG	2	6	262919	262924	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407690263

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