MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Sinorhizobium meliloti Rm41 plasmid pRM41A

Total Repeats: 4278

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_018682	CGG	2	6	231521	231526	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407689986
4002	NC_018682	GATC	2	8	231531	231538	25 %	25 %	25 %	25 %	407689986
4003	NC_018682	GAT	2	6	231615	231620	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407689986
4004	NC_018682	CCG	2	6	232046	232051	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407689987
4005	NC_018682	CG	3	6	232061	232066	0 %	0 %	50 %	50 %	407689987
4006	NC_018682	TCG	2	6	232140	232145	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407689987
4007	NC_018682	TCAT	2	8	232219	232226	25 %	50 %	0 %	25 %	407689987
4008	NC_018682	CCG	2	6	232277	232282	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407689987
4009	NC_018682	CG	3	6	232314	232319	0 %	0 %	50 %	50 %	407689987
4010	NC_018682	CGA	2	6	232322	232327	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407689987
4011	NC_018682	ATCGAA	2	12	232354	232365	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	407689987
4012	NC_018682	GAACG	2	10	232383	232392	40 %	0 %	40 %	20 %	407689987
4013	NC_018682	ATC	2	6	232573	232578	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407689987
4014	NC_018682	CAT	2	6	232638	232643	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407689987
4015	NC_018682	CCTC	2	8	232649	232656	0 %	25 %	0 %	75 %	407689987
4016	NC_018682	ATC	2	6	232659	232664	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407689987
4017	NC_018682	GACC	2	8	232837	232844	25 %	0 %	25 %	50 %	407689988
4018	NC_018682	GGC	2	6	232865	232870	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407689988
4019	NC_018682	CCG	2	6	232900	232905	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407689988
4020	NC_018682	AGA	2	6	232912	232917	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407689988
4021	NC_018682	TGCA	2	8	232947	232954	25 %	25 %	25 %	25 %	407689988
4022	NC_018682	TGC	2	6	233011	233016	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407689988
4023	NC_018682	CGA	2	6	233023	233028	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407689988
4024	NC_018682	AT	3	6	233041	233046	50 %	50 %	0 %	0 %	407689988
4025	NC_018682	ACA	2	6	233107	233112	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407689988
4026	NC_018682	ACG	2	6	233139	233144	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407689988
4027	NC_018682	GAA	2	6	233152	233157	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407689988
4028	NC_018682	TCC	2	6	233178	233183	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407689988
4029	NC_018682	GT	3	6	233193	233198	0 %	50 %	50 %	0 %	407689988
4030	NC_018682	TGA	2	6	233343	233348	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407689988
4031	NC_018682	ACGC	2	8	233504	233511	25 %	0 %	25 %	50 %	407689988
4032	NC_018682	CG	3	6	233585	233590	0 %	0 %	50 %	50 %	407689988
4033	NC_018682	ATG	2	6	233651	233656	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407689988
4034	NC_018682	AAG	2	6	233657	233662	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407689988
4035	NC_018682	CG	3	6	233677	233682	0 %	0 %	50 %	50 %	407689988
4036	NC_018682	ACCC	2	8	233706	233713	25 %	0 %	0 %	75 %	407689988
4037	NC_018682	ATGTGG	2	12	233763	233774	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	407689988
4038	NC_018682	GAG	2	6	233842	233847	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407689989
4039	NC_018682	GCC	2	6	233910	233915	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407689989
4040	NC_018682	AT	3	6	233933	233938	50 %	50 %	0 %	0 %	407689989
4041	NC_018682	GCTG	2	8	233940	233947	0 %	25 %	50 %	25 %	407689989
4042	NC_018682	TCC	2	6	233969	233974	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407689989
4043	NC_018682	GGCG	2	8	234000	234007	0 %	0 %	75 %	25 %	407689989
4044	NC_018682	ACG	2	6	234248	234253	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407689990
4045	NC_018682	CCG	2	6	234354	234359	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407689990
4046	NC_018682	GAG	2	6	234388	234393	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407689990
4047	NC_018682	GC	3	6	234399	234404	0 %	0 %	50 %	50 %	407689990
4048	NC_018682	TGGCAA	2	12	234585	234596	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	407689991
4049	NC_018682	TGC	2	6	234650	234655	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407689991
4050	NC_018682	ATC	2	6	234785	234790	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407689991
4051	NC_018682	TCA	2	6	234810	234815	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407689991
4052	NC_018682	T	6	6	234829	234834	0 %	100 %	0 %	0 %	407689991
4053	NC_018682	CAT	2	6	234889	234894	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407689991
4054	NC_018682	CGC	2	6	234930	234935	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407689991
4055	NC_018682	GATC	2	8	234948	234955	25 %	25 %	25 %	25 %	407689991
4056	NC_018682	TCG	2	6	234959	234964	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407689991
4057	NC_018682	GTC	2	6	235003	235008	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407689991
4058	NC_018682	A	7	7	235019	235025	100 %	0 %	0 %	0 %	407689991
4059	NC_018682	C	6	6	235029	235034	0 %	0 %	0 %	100 %	407689991
4060	NC_018682	AAT	2	6	235071	235076	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407689991
4061	NC_018682	CTT	2	6	235140	235145	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407689991
4062	NC_018682	ATC	2	6	235208	235213	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407689991
4063	NC_018682	GCT	2	6	235226	235231	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407689991
4064	NC_018682	GAGC	2	8	235246	235253	25 %	0 %	50 %	25 %	407689991
4065	NC_018682	GTC	2	6	235581	235586	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407689992
4066	NC_018682	GGAA	2	8	235603	235610	50 %	0 %	50 %	0 %	407689992
4067	NC_018682	CGA	2	6	235626	235631	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407689992
4068	NC_018682	TCG	2	6	235665	235670	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407689992
4069	NC_018682	TTC	2	6	235685	235690	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407689992
4070	NC_018682	CGCGA	2	10	235705	235714	20 %	0 %	40 %	40 %	407689992
4071	NC_018682	GGC	2	6	235741	235746	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407689992
4072	NC_018682	GCC	2	6	235829	235834	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407689992
4073	NC_018682	GCC	2	6	235879	235884	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407689992
4074	NC_018682	GCC	2	6	235912	235917	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407689992
4075	NC_018682	GAC	2	6	235960	235965	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407689992
4076	NC_018682	CAGG	2	8	236097	236104	25 %	0 %	50 %	25 %	407689992
4077	NC_018682	TCC	2	6	236231	236236	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407689992
4078	NC_018682	GCT	2	6	236291	236296	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407689992
4079	NC_018682	TGT	2	6	236313	236318	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407689992
4080	NC_018682	GCTGTC	2	12	236321	236332	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407689992
4081	NC_018682	CGT	2	6	236365	236370	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407689992
4082	NC_018682	GC	3	6	236431	236436	0 %	0 %	50 %	50 %	407689992
4083	NC_018682	CTC	2	6	236503	236508	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407689992
4084	NC_018682	CGT	2	6	236528	236533	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407689992
4085	NC_018682	CGCGG	2	10	236545	236554	0 %	0 %	60 %	40 %	407689992
4086	NC_018682	CGC	2	6	236655	236660	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407689992
4087	NC_018682	TGG	2	6	236682	236687	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407689992
4088	NC_018682	TGC	2	6	236718	236723	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407689992
4089	NC_018682	ACG	2	6	236759	236764	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407689992
4090	NC_018682	ATG	2	6	236789	236794	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407689992
4091	NC_018682	GAT	2	6	236800	236805	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407689992
4092	NC_018682	TCG	2	6	236840	236845	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407689992
4093	NC_018682	TGA	2	6	237075	237080	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407689993
4094	NC_018682	GTT	2	6	237155	237160	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407689993
4095	NC_018682	GCA	2	6	237221	237226	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407689993
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4098	NC_018682	CTG	2	6	237364	237369	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407689994
4099	NC_018682	CGA	2	6	237417	237422	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407689994
4100	NC_018682	TCA	2	6	237423	237428	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407689994
4101	NC_018682	TTC	2	6	237434	237439	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407689994
4102	NC_018682	CCG	2	6	237467	237472	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407689994
4103	NC_018682	GAC	2	6	237475	237480	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407689994
4104	NC_018682	GCA	2	6	237617	237622	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407689994
4105	NC_018682	GCC	2	6	237631	237636	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407689994
4106	NC_018682	TCG	2	6	237669	237674	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407689994
4107	NC_018682	CGT	2	6	237760	237765	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407689994
4108	NC_018682	GCC	2	6	237826	237831	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407689994
4109	NC_018682	GAC	2	6	237946	237951	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407689994
4110	NC_018682	ACTT	2	8	238029	238036	25 %	50 %	0 %	25 %	407689994
4111	NC_018682	GTC	2	6	238064	238069	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407689994
4112	NC_018682	GCAA	2	8	238094	238101	50 %	0 %	25 %	25 %	407689994
4113	NC_018682	CGG	2	6	238119	238124	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407689994
4114	NC_018682	GCTGT	2	10	238172	238181	0 %	40 %	40 %	20 %	407689995
4115	NC_018682	TCG	2	6	238226	238231	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407689995
4116	NC_018682	GCG	2	6	238241	238246	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407689995
4117	NC_018682	CCTTGC	2	12	238295	238306	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	407689995
4118	NC_018682	TGT	2	6	238364	238369	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407689995
4119	NC_018682	TCT	2	6	238439	238444	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407689995
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4121	NC_018682	TCGA	2	8	238482	238489	25 %	25 %	25 %	25 %	407689995
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4241	NC_018682	CGC	2	6	243918	243923	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407690001
4242	NC_018682	GCC	2	6	243937	243942	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407690001
4243	NC_018682	CCG	2	6	243954	243959	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407690001
4244	NC_018682	ACC	3	9	244033	244041	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407690001
4245	NC_018682	A	6	6	244075	244080	100 %	0 %	0 %	0 %	407690001
4246	NC_018682	TTC	2	6	244145	244150	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407690002
4247	NC_018682	GCT	2	6	244291	244296	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407690002
4248	NC_018682	CGG	2	6	244306	244311	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407690002
4249	NC_018682	CGC	2	6	244369	244374	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407690002
4250	NC_018682	AGC	2	6	244412	244417	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407690002
4251	NC_018682	ACG	2	6	244437	244442	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407690002
4252	NC_018682	AGC	2	6	244476	244481	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407690002
4253	NC_018682	GAA	2	6	244513	244518	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407690002
4254	NC_018682	CGG	2	6	244546	244551	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407690002
4255	NC_018682	TCC	2	6	244575	244580	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407690002
4256	NC_018682	GGA	2	6	244670	244675	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407690002
4257	NC_018682	CGC	2	6	244694	244699	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407690002
4258	NC_018682	TCA	2	6	244711	244716	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407690002
4259	NC_018682	GACGC	2	10	244750	244759	20 %	0 %	40 %	40 %	407690002
4260	NC_018682	ACG	2	6	244760	244765	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407690002
4261	NC_018682	ACC	2	6	244791	244796	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407690002
4262	NC_018682	GGC	2	6	244797	244802	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407690002
4263	NC_018682	GAT	2	6	244847	244852	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407690002
4264	NC_018682	CGGCCG	2	12	244912	244923	0 %	0 %	50 %	50 %	407690002
4265	NC_018682	AAC	2	6	244971	244976	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407690002
4266	NC_018682	CCT	2	6	245050	245055	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407690002
4267	NC_018682	CGG	2	6	245183	245188	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407690003
4268	NC_018682	TCT	2	6	245222	245227	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407690003
4269	NC_018682	CG	3	6	245263	245268	0 %	0 %	50 %	50 %	407690003
4270	NC_018682	GAT	2	6	245337	245342	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407690003
4271	NC_018682	ATC	2	6	245434	245439	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407690003
4272	NC_018682	GAA	2	6	245468	245473	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407690003
4273	NC_018682	GCA	2	6	245516	245521	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407690003
4274	NC_018682	CGC	2	6	245543	245548	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407690003
4275	NC_018682	TCGG	2	8	245637	245644	0 %	25 %	50 %	25 %	407690003
4276	NC_018682	GC	3	6	245656	245661	0 %	0 %	50 %	50 %	407690003
4277	NC_018682	TGA	2	6	245668	245673	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407690003
4278	NC_018682	GAA	2	6	245678	245683	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407690003

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