MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Sinorhizobium meliloti Rm41 plasmid pRM41A

Total Repeats: 4278

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_018682	CAT	2	6	171556	171561	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407689928
3002	NC_018682	TCA	2	6	171563	171568	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407689928
3003	NC_018682	TGA	2	6	171581	171586	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407689928
3004	NC_018682	TGG	2	6	171806	171811	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407689928
3005	NC_018682	ATC	2	6	171822	171827	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407689928
3006	NC_018682	CGT	2	6	171980	171985	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407689929
3007	NC_018682	GCC	2	6	172069	172074	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407689929
3008	NC_018682	AGC	2	6	172124	172129	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407689929
3009	NC_018682	CAT	2	6	172170	172175	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407689929
3010	NC_018682	CGT	2	6	172182	172187	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407689929
3011	NC_018682	GGC	2	6	172221	172226	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407689929
3012	NC_018682	CAA	2	6	172254	172259	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407689929
3013	NC_018682	GAAG	2	8	172362	172369	50 %	0 %	50 %	0 %	407689929
3014	NC_018682	ACG	2	6	172454	172459	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407689929
3015	NC_018682	ATC	2	6	172492	172497	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407689929
3016	NC_018682	TGA	2	6	172541	172546	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407689929
3017	NC_018682	CAA	2	6	172590	172595	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407689929
3018	NC_018682	GAC	2	6	172597	172602	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407689929
3019	NC_018682	GGC	2	6	172632	172637	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407689929
3020	NC_018682	TCG	2	6	172661	172666	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407689929
3021	NC_018682	ACCT	2	8	172855	172862	25 %	25 %	0 %	50 %	407689929
3022	NC_018682	CAA	2	6	172863	172868	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407689929
3023	NC_018682	A	6	6	172993	172998	100 %	0 %	0 %	0 %	407689930
3024	NC_018682	AAAG	2	8	173010	173017	75 %	0 %	25 %	0 %	407689930
3025	NC_018682	TGT	2	6	173041	173046	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407689930
3026	NC_018682	TCG	2	6	173049	173054	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407689930
3027	NC_018682	CAG	2	6	173117	173122	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407689930
3028	NC_018682	ATC	2	6	173132	173137	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407689930
3029	NC_018682	TTC	2	6	173139	173144	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407689930
3030	NC_018682	TCA	3	9	173187	173195	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407689930
3031	NC_018682	TGG	2	6	173244	173249	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407689930
3032	NC_018682	GC	3	6	173281	173286	0 %	0 %	50 %	50 %	407689930
3033	NC_018682	TTGG	2	8	173342	173349	0 %	50 %	50 %	0 %	407689930
3034	NC_018682	ATG	2	6	173423	173428	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407689930
3035	NC_018682	ATC	2	6	173573	173578	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407689930
3036	NC_018682	CG	3	6	173647	173652	0 %	0 %	50 %	50 %	407689930
3037	NC_018682	TCA	2	6	173682	173687	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407689930
3038	NC_018682	AGT	2	6	173728	173733	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407689930
3039	NC_018682	CCA	2	6	173763	173768	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407689930
3040	NC_018682	GGC	2	6	173813	173818	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407689930
3041	NC_018682	CGG	2	6	173830	173835	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407689930
3042	NC_018682	GTCG	2	8	173837	173844	0 %	25 %	50 %	25 %	407689930
3043	NC_018682	TCA	2	6	173883	173888	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407689930
3044	NC_018682	ATC	2	6	173933	173938	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407689930
3045	NC_018682	GAT	2	6	173944	173949	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407689930
3046	NC_018682	TCG	2	6	173952	173957	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407689930
3047	NC_018682	CCG	2	6	173958	173963	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407689930
3048	NC_018682	TCA	2	6	173964	173969	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407689930
3049	NC_018682	TCA	2	6	174134	174139	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407689931
3050	NC_018682	CCG	2	6	174165	174170	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407689931
3051	NC_018682	GAG	2	6	174175	174180	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407689931
3052	NC_018682	AAGC	2	8	174245	174252	50 %	0 %	25 %	25 %	407689931
3053	NC_018682	GTCT	2	8	174262	174269	0 %	50 %	25 %	25 %	407689931
3054	NC_018682	CGA	3	9	174279	174287	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407689931
3055	NC_018682	CGGTCA	2	12	174309	174320	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	407689931
3056	NC_018682	ATG	2	6	174352	174357	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407689931
3057	NC_018682	GCG	2	6	174389	174394	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407689931
3058	NC_018682	GGC	2	6	174459	174464	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407689931
3059	NC_018682	GCG	2	6	174482	174487	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407689931
3060	NC_018682	GCT	2	6	174504	174509	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407689931
3061	NC_018682	ATGA	2	8	174553	174560	50 %	25 %	25 %	0 %	407689931
3062	NC_018682	TGC	2	6	174602	174607	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407689931
3063	NC_018682	ATC	2	6	174610	174615	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407689931
3064	NC_018682	GGCGA	2	10	174640	174649	20 %	0 %	60 %	20 %	407689931
3065	NC_018682	CGGC	2	8	174668	174675	0 %	0 %	50 %	50 %	407689931
3066	NC_018682	CCG	2	6	174684	174689	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407689931
3067	NC_018682	GCG	3	9	174751	174759	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407689931
3068	NC_018682	GC	3	6	174774	174779	0 %	0 %	50 %	50 %	407689931
3069	NC_018682	CGGG	2	8	174781	174788	0 %	0 %	75 %	25 %	407689931
3070	NC_018682	CGG	2	6	174789	174794	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407689931
3071	NC_018682	TGC	2	6	174803	174808	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407689931
3072	NC_018682	TACC	2	8	174855	174862	25 %	25 %	0 %	50 %	407689931
3073	NC_018682	GGC	2	6	174879	174884	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407689931
3074	NC_018682	AGG	2	6	174932	174937	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407689931
3075	NC_018682	CGA	2	6	174972	174977	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407689931
3076	NC_018682	GATC	2	8	174993	175000	25 %	25 %	25 %	25 %	407689931
3077	NC_018682	GCG	2	6	175021	175026	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407689931
3078	NC_018682	CGC	2	6	175034	175039	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407689931
3079	NC_018682	CAC	2	6	175050	175055	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407689931
3080	NC_018682	CGA	2	6	175088	175093	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407689932
3081	NC_018682	ATG	2	6	175168	175173	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407689932
3082	NC_018682	CGG	2	6	175188	175193	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407689932
3083	NC_018682	GCT	2	6	175251	175256	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407689932
3084	NC_018682	GGC	2	6	175302	175307	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407689932
3085	NC_018682	TCG	2	6	175370	175375	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407689932
3086	NC_018682	GGC	2	6	175413	175418	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407689932
3087	NC_018682	CGG	2	6	175437	175442	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407689932
3088	NC_018682	GGT	2	6	175554	175559	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407689932
3089	NC_018682	CTG	3	9	175591	175599	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407689932
3090	NC_018682	CGA	3	9	175611	175619	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407689932
3091	NC_018682	TCG	2	6	175739	175744	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407689932
3092	NC_018682	GCC	2	6	175777	175782	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407689932
3093	NC_018682	GGC	2	6	175791	175796	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407689932
3094	NC_018682	CAT	2	6	175815	175820	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407689932
3095	NC_018682	CGC	2	6	175838	175843	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407689932
3096	NC_018682	CGA	2	6	175845	175850	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407689932
3097	NC_018682	GCT	2	6	175857	175862	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407689932
3098	NC_018682	GTC	2	6	175888	175893	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407689932
3099	NC_018682	TCG	2	6	175895	175900	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407689932
3100	NC_018682	GCC	2	6	175927	175932	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407689932
3101	NC_018682	GTC	2	6	176109	176114	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407689933
3102	NC_018682	CG	3	6	176204	176209	0 %	0 %	50 %	50 %	407689933
3103	NC_018682	GTC	2	6	176251	176256	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407689933
3104	NC_018682	GCC	3	9	176260	176268	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407689933
3105	NC_018682	GC	3	6	176321	176326	0 %	0 %	50 %	50 %	407689933
3106	NC_018682	CGA	2	6	176343	176348	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407689933
3107	NC_018682	CGA	2	6	176412	176417	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407689933
3108	NC_018682	GCC	2	6	176431	176436	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407689933
3109	NC_018682	GGC	2	6	176461	176466	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407689933
3110	NC_018682	GGT	2	6	176508	176513	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407689933
3111	NC_018682	GCT	2	6	176514	176519	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407689933
3112	NC_018682	GGC	2	6	176530	176535	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407689933
3113	NC_018682	GGT	2	6	176586	176591	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407689933
3114	NC_018682	CGT	2	6	176618	176623	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407689933
3115	NC_018682	GCG	2	6	176636	176641	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407689933
3116	NC_018682	GCG	2	6	176674	176679	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407689933
3117	NC_018682	CGG	2	6	176727	176732	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407689933
3118	NC_018682	CGC	2	6	176751	176756	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407689933
3119	NC_018682	CG	3	6	176768	176773	0 %	0 %	50 %	50 %	407689933
3120	NC_018682	CGCTGA	2	12	176780	176791	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	407689933
3121	NC_018682	TCG	2	6	176834	176839	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407689933
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3237	NC_018682	GGA	2	6	185352	185357	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407689944
3238	NC_018682	TAG	2	6	185377	185382	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407689944
3239	NC_018682	GAT	2	6	185418	185423	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407689944
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3241	NC_018682	GCC	2	6	185535	185540	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407689944
3242	NC_018682	ATGG	2	8	185574	185581	25 %	25 %	50 %	0 %	407689944
3243	NC_018682	GAT	2	6	185652	185657	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407689944
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3343	NC_018682	TGGCA	2	10	193242	193251	20 %	20 %	40 %	20 %	407689950
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3349	NC_018682	GTCG	2	8	193722	193729	0 %	25 %	50 %	25 %	407689950
3350	NC_018682	ACG	2	6	193808	193813	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407689950
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3353	NC_018682	TCG	2	6	193967	193972	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407689950
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3356	NC_018682	CT	3	6	194064	194069	0 %	50 %	0 %	50 %	407689951
3357	NC_018682	GAC	2	6	194081	194086	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407689951
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3359	NC_018682	CGC	2	6	194158	194163	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407689951
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3483	NC_018682	GC	3	6	200402	200407	0 %	0 %	50 %	50 %	407689955
3484	NC_018682	GA	3	6	200444	200449	50 %	0 %	50 %	0 %	407689955
3485	NC_018682	GCCC	2	8	200525	200532	0 %	0 %	25 %	75 %	407689955
3486	NC_018682	ACT	2	6	200542	200547	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407689955
3487	NC_018682	C	6	6	200583	200588	0 %	0 %	0 %	100 %	407689955
3488	NC_018682	CGG	2	6	200634	200639	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407689955
3489	NC_018682	CTA	2	6	200726	200731	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407689955
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3491	NC_018682	GCT	2	6	200772	200777	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407689955
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