MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Sinorhizobium meliloti Rm41 plasmid pRM41A

Total Repeats: 4278

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_018682	GAAG	2	8	142927	142934	50 %	0 %	50 %	0 %	407689902
2502	NC_018682	CGT	2	6	143029	143034	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407689902
2503	NC_018682	ACG	2	6	143055	143060	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407689902
2504	NC_018682	TCA	2	6	143073	143078	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407689902
2505	NC_018682	CTG	2	6	143199	143204	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407689902
2506	NC_018682	ACA	2	6	143239	143244	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407689903
2507	NC_018682	TGA	2	6	143375	143380	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407689903
2508	NC_018682	T	6	6	143393	143398	0 %	100 %	0 %	0 %	407689903
2509	NC_018682	TTG	2	6	143406	143411	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407689903
2510	NC_018682	AAG	2	6	143554	143559	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407689903
2511	NC_018682	ACG	2	6	143581	143586	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407689903
2512	NC_018682	GGC	2	6	144647	144652	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407689904
2513	NC_018682	GGGT	2	8	144680	144687	0 %	25 %	75 %	0 %	407689904
2514	NC_018682	TGC	2	6	144695	144700	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407689904
2515	NC_018682	TGC	2	6	144728	144733	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407689904
2516	NC_018682	GTG	2	6	144736	144741	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407689904
2517	NC_018682	GTC	2	6	144753	144758	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407689904
2518	NC_018682	CCT	2	6	144776	144781	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407689904
2519	NC_018682	CTT	2	6	144797	144802	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407689904
2520	NC_018682	CT	3	6	144803	144808	0 %	50 %	0 %	50 %	407689904
2521	NC_018682	CGTG	2	8	144845	144852	0 %	25 %	50 %	25 %	407689904
2522	NC_018682	CCGA	2	8	144885	144892	25 %	0 %	25 %	50 %	407689904
2523	NC_018682	GGC	2	6	144983	144988	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407689904
2524	NC_018682	GC	4	8	144997	145004	0 %	0 %	50 %	50 %	407689904
2525	NC_018682	AGTC	2	8	145073	145080	25 %	25 %	25 %	25 %	407689904
2526	NC_018682	GAT	2	6	145104	145109	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407689904
2527	NC_018682	TGC	2	6	145162	145167	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407689904
2528	NC_018682	GGT	2	6	145175	145180	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407689904
2529	NC_018682	ACG	2	6	145189	145194	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407689904
2530	NC_018682	TCGC	2	8	145232	145239	0 %	25 %	25 %	50 %	407689904
2531	NC_018682	TCG	2	6	145252	145257	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407689904
2532	NC_018682	GCC	2	6	145305	145310	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407689904
2533	NC_018682	AGG	2	6	145318	145323	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407689904
2534	NC_018682	CT	3	6	145399	145404	0 %	50 %	0 %	50 %	407689904
2535	NC_018682	GGC	2	6	145446	145451	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407689904
2536	NC_018682	TGGG	2	8	145534	145541	0 %	25 %	75 %	0 %	407689904
2537	NC_018682	GGC	2	6	145568	145573	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407689904
2538	NC_018682	AGG	2	6	145648	145653	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407689904
2539	NC_018682	CGC	2	6	145791	145796	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407689904
2540	NC_018682	TGAA	2	8	145813	145820	50 %	25 %	25 %	0 %	407689904
2541	NC_018682	TCC	2	6	145825	145830	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407689904
2542	NC_018682	CGT	2	6	145910	145915	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407689904
2543	NC_018682	AG	3	6	145920	145925	50 %	0 %	50 %	0 %	407689904
2544	NC_018682	CGG	2	6	146068	146073	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407689905
2545	NC_018682	CG	3	6	146117	146122	0 %	0 %	50 %	50 %	407689905
2546	NC_018682	TCCGA	2	10	146144	146153	20 %	20 %	20 %	40 %	407689905
2547	NC_018682	GGC	2	6	146182	146187	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407689905
2548	NC_018682	CCA	2	6	146259	146264	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407689905
2549	NC_018682	AC	3	6	146265	146270	50 %	0 %	0 %	50 %	407689905
2550	NC_018682	AAAG	2	8	146278	146285	75 %	0 %	25 %	0 %	407689905
2551	NC_018682	TG	3	6	146359	146364	0 %	50 %	50 %	0 %	407689905
2552	NC_018682	ATC	2	6	146367	146372	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407689905
2553	NC_018682	GGC	2	6	146373	146378	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407689905
2554	NC_018682	GCA	2	6	146486	146491	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407689905
2555	NC_018682	TCG	2	6	146621	146626	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407689905
2556	NC_018682	GTC	2	6	146672	146677	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407689905
2557	NC_018682	GTC	2	6	146699	146704	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407689905
2558	NC_018682	GCCTG	2	10	146718	146727	0 %	20 %	40 %	40 %	407689905
2559	NC_018682	TGA	2	6	146763	146768	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407689905
2560	NC_018682	TCGA	2	8	146792	146799	25 %	25 %	25 %	25 %	407689905
2561	NC_018682	TC	3	6	146830	146835	0 %	50 %	0 %	50 %	407689905
2562	NC_018682	GCA	2	6	146944	146949	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407689905
2563	NC_018682	GACC	2	8	146965	146972	25 %	0 %	25 %	50 %	407689905
2564	NC_018682	ACC	2	6	146991	146996	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407689905
2565	NC_018682	GCGG	2	8	147032	147039	0 %	0 %	75 %	25 %	407689905
2566	NC_018682	GCGA	2	8	147135	147142	25 %	0 %	50 %	25 %	407689905
2567	NC_018682	GCGG	2	8	147197	147204	0 %	0 %	75 %	25 %	407689905
2568	NC_018682	CAT	2	6	147298	147303	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407689905
2569	NC_018682	TCG	2	6	147309	147314	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407689905
2570	NC_018682	TCC	2	6	147324	147329	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407689905
2571	NC_018682	GCC	2	6	147389	147394	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407689905
2572	NC_018682	CGGCT	2	10	147426	147435	0 %	20 %	40 %	40 %	407689905
2573	NC_018682	TACG	2	8	147521	147528	25 %	25 %	25 %	25 %	407689905
2574	NC_018682	CTC	2	6	147718	147723	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407689905
2575	NC_018682	GAG	2	6	147755	147760	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407689905
2576	NC_018682	ACG	2	6	147954	147959	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407689905
2577	NC_018682	CTT	2	6	147965	147970	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407689905
2578	NC_018682	CAG	2	6	147980	147985	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407689905
2579	NC_018682	CAT	2	6	148000	148005	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407689905
2580	NC_018682	GAA	2	6	148007	148012	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407689905
2581	NC_018682	TTA	2	6	148026	148031	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407689905
2582	NC_018682	GCAG	2	8	148400	148407	25 %	0 %	50 %	25 %	407689906
2583	NC_018682	ATTC	2	8	148419	148426	25 %	50 %	0 %	25 %	407689906
2584	NC_018682	CCGT	2	8	148444	148451	0 %	25 %	25 %	50 %	407689906
2585	NC_018682	GCCG	2	8	148470	148477	0 %	0 %	50 %	50 %	407689906
2586	NC_018682	ATC	2	6	148531	148536	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407689906
2587	NC_018682	GCA	2	6	148594	148599	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407689906
2588	NC_018682	CCA	2	6	148607	148612	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407689906
2589	NC_018682	GGT	2	6	148623	148628	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407689906
2590	NC_018682	GAC	2	6	148725	148730	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407689906
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2592	NC_018682	ATC	2	6	148836	148841	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407689906
2593	NC_018682	GCA	2	6	148844	148849	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407689906
2594	NC_018682	GCG	2	6	148901	148906	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407689906
2595	NC_018682	ATC	2	6	149013	149018	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407689906
2596	NC_018682	CGC	2	6	149056	149061	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407689906
2597	NC_018682	GCC	2	6	149216	149221	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407689906
2598	NC_018682	CGATGA	2	12	149227	149238	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	407689906
2599	NC_018682	AAG	2	6	149355	149360	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407689906
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2601	NC_018682	TGGCA	2	10	149391	149400	20 %	20 %	40 %	20 %	407689906
2602	NC_018682	GGT	2	6	149406	149411	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407689906
2603	NC_018682	CGG	2	6	149465	149470	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407689906
2604	NC_018682	ATCCG	2	10	149509	149518	20 %	20 %	20 %	40 %	407689906
2605	NC_018682	CGG	2	6	149549	149554	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407689906
2606	NC_018682	CGG	2	6	149609	149614	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407689906
2607	NC_018682	CTG	2	6	149622	149627	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407689906
2608	NC_018682	GAG	2	6	149629	149634	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407689906
2609	NC_018682	TGCC	2	8	149732	149739	0 %	25 %	25 %	50 %	407689906
2610	NC_018682	GAG	2	6	149754	149759	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407689906
2611	NC_018682	CGG	3	9	149795	149803	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407689906
2612	NC_018682	CGT	2	6	149861	149866	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407689906
2613	NC_018682	AGC	2	6	149876	149881	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407689906
2614	NC_018682	GC	3	6	150102	150107	0 %	0 %	50 %	50 %	407689907
2615	NC_018682	TTC	2	6	150116	150121	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407689907
2616	NC_018682	ACG	2	6	150131	150136	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407689907
2617	NC_018682	CA	3	6	150207	150212	50 %	0 %	0 %	50 %	407689907
2618	NC_018682	GGC	2	6	150304	150309	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407689907
2619	NC_018682	GGCC	2	8	150312	150319	0 %	0 %	50 %	50 %	407689907
2620	NC_018682	GAC	2	6	150343	150348	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407689907
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2622	NC_018682	ACCG	2	8	150403	150410	25 %	0 %	25 %	50 %	407689907
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2982	NC_018682	GA	3	6	170928	170933	50 %	0 %	50 %	0 %	407689927
2983	NC_018682	CTG	2	6	170961	170966	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407689927
2984	NC_018682	GAG	2	6	170970	170975	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407689927
2985	NC_018682	GCAA	2	8	171019	171026	50 %	0 %	25 %	25 %	407689928
2986	NC_018682	GAA	2	6	171055	171060	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407689928
2987	NC_018682	A	7	7	171076	171082	100 %	0 %	0 %	0 %	407689928
2988	NC_018682	ACG	2	6	171089	171094	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407689928
2989	NC_018682	CCG	2	6	171130	171135	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407689928
2990	NC_018682	GAGCTG	2	12	171187	171198	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	407689928
2991	NC_018682	TGC	2	6	171206	171211	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407689928
2992	NC_018682	GGC	2	6	171220	171225	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407689928
2993	NC_018682	CAA	2	6	171234	171239	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407689928
2994	NC_018682	TCGCC	2	10	171242	171251	0 %	20 %	20 %	60 %	407689928
2995	NC_018682	GGA	2	6	171258	171263	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407689928
2996	NC_018682	CCG	2	6	171308	171313	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407689928
2997	NC_018682	G	7	7	171317	171323	0 %	0 %	100 %	0 %	407689928
2998	NC_018682	CTGC	2	8	171336	171343	0 %	25 %	25 %	50 %	407689928
2999	NC_018682	ACA	2	6	171494	171499	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407689928
3000	NC_018682	ATG	2	6	171508	171513	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407689928

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