MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Sinorhizobium meliloti Rm41 plasmid pRM41A

Total Repeats: 4278

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2001	NC_018682	GCA	2	6	113320	113325	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407689877
2002	NC_018682	TCCG	2	8	113344	113351	0 %	25 %	25 %	50 %	407689877
2003	NC_018682	CTGG	2	8	113408	113415	0 %	25 %	50 %	25 %	407689877
2004	NC_018682	CGG	2	6	113437	113442	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407689877
2005	NC_018682	CGC	2	6	113446	113451	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407689877
2006	NC_018682	GATG	2	8	113616	113623	25 %	25 %	50 %	0 %	407689878
2007	NC_018682	GCA	2	6	113691	113696	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407689878
2008	NC_018682	CGA	2	6	113775	113780	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407689878
2009	NC_018682	GCG	2	6	113796	113801	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407689878
2010	NC_018682	CGC	2	6	113871	113876	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407689878
2011	NC_018682	GCCGC	2	10	113915	113924	0 %	0 %	40 %	60 %	407689878
2012	NC_018682	TGT	2	6	113940	113945	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407689878
2013	NC_018682	TCGCG	2	10	113982	113991	0 %	20 %	40 %	40 %	407689878
2014	NC_018682	ATG	3	9	114029	114037	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407689878
2015	NC_018682	TCG	2	6	114080	114085	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407689878
2016	NC_018682	CGC	2	6	114093	114098	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407689878
2017	NC_018682	CCA	2	6	114200	114205	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407689879
2018	NC_018682	CATC	2	8	114269	114276	25 %	25 %	0 %	50 %	407689879
2019	NC_018682	GCG	2	6	114299	114304	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407689879
2020	NC_018682	GTT	2	6	114311	114316	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407689879
2021	NC_018682	CGC	2	6	114321	114326	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407689879
2022	NC_018682	ATC	2	6	114364	114369	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407689879
2023	NC_018682	GGGCG	2	10	114443	114452	0 %	0 %	80 %	20 %	407689879
2024	NC_018682	TCG	2	6	114523	114528	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407689879
2025	NC_018682	CG	3	6	114534	114539	0 %	0 %	50 %	50 %	407689879
2026	NC_018682	CCG	2	6	114547	114552	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407689879
2027	NC_018682	CGC	2	6	114567	114572	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407689879
2028	NC_018682	CTT	2	6	114585	114590	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407689879
2029	NC_018682	CCG	2	6	114604	114609	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407689879
2030	NC_018682	GAC	2	6	114681	114686	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407689879
2031	NC_018682	CCGG	2	8	114713	114720	0 %	0 %	50 %	50 %	407689879
2032	NC_018682	ATC	2	6	114757	114762	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407689879
2033	NC_018682	GCG	2	6	114827	114832	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407689879
2034	NC_018682	CG	3	6	114892	114897	0 %	0 %	50 %	50 %	407689879
2035	NC_018682	TCC	2	6	114951	114956	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407689880
2036	NC_018682	CATC	2	8	114973	114980	25 %	25 %	0 %	50 %	407689880
2037	NC_018682	TCA	2	6	114981	114986	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407689880
2038	NC_018682	CGGC	2	8	115021	115028	0 %	0 %	50 %	50 %	407689880
2039	NC_018682	GCAA	2	8	115143	115150	50 %	0 %	25 %	25 %	407689880
2040	NC_018682	GGC	2	6	115214	115219	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407689880
2041	NC_018682	TGA	2	6	115225	115230	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407689880
2042	NC_018682	GCT	2	6	115231	115236	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407689880
2043	NC_018682	GTC	2	6	115257	115262	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407689880
2044	NC_018682	GCG	2	6	115304	115309	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407689880
2045	NC_018682	TC	3	6	115331	115336	0 %	50 %	0 %	50 %	407689880
2046	NC_018682	GGGC	2	8	115504	115511	0 %	0 %	75 %	25 %	407689881
2047	NC_018682	CGCC	2	8	115531	115538	0 %	0 %	25 %	75 %	407689881
2048	NC_018682	GCCT	2	8	115565	115572	0 %	25 %	25 %	50 %	407689881
2049	NC_018682	GGC	2	6	115598	115603	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407689881
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2051	NC_018682	CGG	2	6	115741	115746	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407689881
2052	NC_018682	GC	3	6	115760	115765	0 %	0 %	50 %	50 %	407689881
2053	NC_018682	CGG	2	6	115777	115782	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407689881
2054	NC_018682	GC	3	6	115816	115821	0 %	0 %	50 %	50 %	407689881
2055	NC_018682	GCC	2	6	115865	115870	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407689881
2056	NC_018682	GAT	2	6	115909	115914	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407689881
2057	NC_018682	CTC	2	6	116030	116035	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407689881
2058	NC_018682	TGA	2	6	116077	116082	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407689881
2059	NC_018682	ATG	2	6	116160	116165	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407689881
2060	NC_018682	CCT	2	6	117421	117426	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407689882
2061	NC_018682	GCC	2	6	117444	117449	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407689882
2062	NC_018682	TCGA	2	8	117537	117544	25 %	25 %	25 %	25 %	407689882
2063	NC_018682	CGAT	2	8	117588	117595	25 %	25 %	25 %	25 %	407689882
2064	NC_018682	CTCA	2	8	117662	117669	25 %	25 %	0 %	50 %	407689882
2065	NC_018682	GA	4	8	117731	117738	50 %	0 %	50 %	0 %	407689882
2066	NC_018682	CGC	2	6	117750	117755	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407689882
2067	NC_018682	TCG	2	6	117789	117794	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407689882
2068	NC_018682	TCT	2	6	117823	117828	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407689882
2069	NC_018682	GAGGC	2	10	117876	117885	20 %	0 %	60 %	20 %	407689882
2070	NC_018682	CAT	2	6	117934	117939	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407689882
2071	NC_018682	GGT	2	6	117983	117988	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407689882
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2073	NC_018682	TC	3	6	118040	118045	0 %	50 %	0 %	50 %	407689882
2074	NC_018682	GCC	2	6	118085	118090	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407689882
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2077	NC_018682	CAT	2	6	118378	118383	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407689883
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2080	NC_018682	GAT	2	6	118450	118455	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407689883
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2087	NC_018682	TGCC	2	8	118818	118825	0 %	25 %	25 %	50 %	407689883
2088	NC_018682	TCA	2	6	118848	118853	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407689883
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2092	NC_018682	GCC	2	6	119064	119069	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407689884
2093	NC_018682	GCC	2	6	119072	119077	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407689884
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2104	NC_018682	CGC	2	6	119927	119932	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407689885
2105	NC_018682	TGA	2	6	119965	119970	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407689885
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2107	NC_018682	TACGA	2	10	120054	120063	40 %	20 %	20 %	20 %	407689885
2108	NC_018682	TGA	2	6	120091	120096	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407689885
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2110	NC_018682	TCG	2	6	120286	120291	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407689885
2111	NC_018682	CG	3	6	120312	120317	0 %	0 %	50 %	50 %	407689885
2112	NC_018682	GGT	2	6	120363	120368	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407689885
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2114	NC_018682	GGCC	2	8	120523	120530	0 %	0 %	50 %	50 %	407689885
2115	NC_018682	GAC	3	9	120651	120659	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407689885
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2118	NC_018682	GAA	2	6	121139	121144	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407689886
2119	NC_018682	GC	3	6	121171	121176	0 %	0 %	50 %	50 %	407689886
2120	NC_018682	TCG	2	6	121193	121198	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407689886
2121	NC_018682	CGGCTG	2	12	121217	121228	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	407689886
2122	NC_018682	GTG	2	6	121303	121308	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407689886
2123	NC_018682	TTC	2	6	121398	121403	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407689886
2124	NC_018682	CGGG	2	8	121438	121445	0 %	0 %	75 %	25 %	407689886
2125	NC_018682	ATG	2	6	121618	121623	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407689886
2126	NC_018682	GC	3	6	121642	121647	0 %	0 %	50 %	50 %	407689886
2127	NC_018682	GAG	2	6	121660	121665	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407689886
2128	NC_018682	TGC	2	6	121847	121852	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407689886
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2132	NC_018682	CG	3	6	122032	122037	0 %	0 %	50 %	50 %	407689886
2133	NC_018682	TGG	2	6	122227	122232	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407689887
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2141	NC_018682	TGG	2	6	122614	122619	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407689887
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2146	NC_018682	CTG	2	6	122808	122813	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407689887
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2154	NC_018682	GAC	2	6	123454	123459	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407689888
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2156	NC_018682	CGGC	2	8	123561	123568	0 %	0 %	50 %	50 %	407689888
2157	NC_018682	CGG	2	6	123572	123577	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407689888
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2239	NC_018682	CTT	2	6	126829	126834	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407689890
2240	NC_018682	A	7	7	126837	126843	100 %	0 %	0 %	0 %	407689890
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2242	NC_018682	CGG	2	6	126909	126914	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407689891
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2359	NC_018682	GTT	2	6	133517	133522	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407689896
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2364	NC_018682	GGA	2	6	133796	133801	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407689896
2365	NC_018682	CGA	2	6	134038	134043	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407689896
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2482	NC_018682	TGC	2	6	141871	141876	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407689902
2483	NC_018682	GAC	2	6	141935	141940	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407689902
2484	NC_018682	GGC	2	6	142013	142018	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407689902
2485	NC_018682	TGG	2	6	142121	142126	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407689902
2486	NC_018682	GCA	2	6	142131	142136	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407689902
2487	NC_018682	TGCG	2	8	142175	142182	0 %	25 %	50 %	25 %	407689902
2488	NC_018682	GTG	2	6	142185	142190	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407689902
2489	NC_018682	GCC	2	6	142325	142330	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407689902
2490	NC_018682	GCT	2	6	142423	142428	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407689902
2491	NC_018682	TCG	2	6	142439	142444	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407689902
2492	NC_018682	CTC	2	6	142471	142476	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407689902
2493	NC_018682	TGA	2	6	142497	142502	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407689902
2494	NC_018682	CGA	2	6	142534	142539	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407689902
2495	NC_018682	CTT	2	6	142540	142545	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407689902
2496	NC_018682	GGAA	2	8	142605	142612	50 %	0 %	50 %	0 %	407689902
2497	NC_018682	GCA	2	6	142692	142697	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407689902
2498	NC_018682	TG	3	6	142705	142710	0 %	50 %	50 %	0 %	407689902
2499	NC_018682	TC	3	6	142806	142811	0 %	50 %	0 %	50 %	407689902
2500	NC_018682	GC	4	8	142907	142914	0 %	0 %	50 %	50 %	407689902

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