MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Sinorhizobium meliloti Rm41 plasmid pRM41A

Total Repeats: 4278

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_018682	AGG	2	6	59042	59047	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407689823
1002	NC_018682	TGA	2	6	59090	59095	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407689823
1003	NC_018682	ATC	3	9	59120	59128	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407689823
1004	NC_018682	TG	3	6	59172	59177	0 %	50 %	50 %	0 %	407689823
1005	NC_018682	ATC	2	6	59224	59229	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407689823
1006	NC_018682	GAC	2	6	59250	59255	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407689823
1007	NC_018682	CAGG	2	8	59305	59312	25 %	0 %	50 %	25 %	407689823
1008	NC_018682	GCA	2	6	59374	59379	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407689823
1009	NC_018682	GAT	2	6	59596	59601	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407689824
1010	NC_018682	GTG	2	6	59873	59878	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407689824
1011	NC_018682	GCC	2	6	59906	59911	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407689824
1012	NC_018682	GAG	2	6	59912	59917	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407689824
1013	NC_018682	TGA	2	6	59931	59936	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407689824
1014	NC_018682	CGA	2	6	59953	59958	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407689824
1015	NC_018682	GCT	2	6	59959	59964	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407689824
1016	NC_018682	CGC	2	6	59971	59976	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407689824
1017	NC_018682	GAA	2	6	59977	59982	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407689824
1018	NC_018682	CCG	2	6	60042	60047	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407689824
1019	NC_018682	TGG	2	6	60048	60053	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407689824
1020	NC_018682	AGC	2	6	60054	60059	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407689824
1021	NC_018682	ATC	2	6	60104	60109	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407689824
1022	NC_018682	AGG	2	6	60144	60149	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407689824
1023	NC_018682	CGCC	2	8	60175	60182	0 %	0 %	25 %	75 %	407689824
1024	NC_018682	CGG	2	6	60198	60203	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407689824
1025	NC_018682	GCTC	2	8	60277	60284	0 %	25 %	25 %	50 %	407689824
1026	NC_018682	CGT	2	6	60286	60291	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407689824
1027	NC_018682	GGC	2	6	60302	60307	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407689824
1028	NC_018682	CG	3	6	60314	60319	0 %	0 %	50 %	50 %	407689824
1029	NC_018682	GGA	2	6	60382	60387	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407689824
1030	NC_018682	CGA	2	6	60442	60447	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407689824
1031	NC_018682	CG	3	6	60593	60598	0 %	0 %	50 %	50 %	407689825
1032	NC_018682	G	6	6	60656	60661	0 %	0 %	100 %	0 %	407689825
1033	NC_018682	CGG	2	6	60676	60681	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407689825
1034	NC_018682	CGA	2	6	60722	60727	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407689825
1035	NC_018682	CCG	2	6	60776	60781	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407689825
1036	NC_018682	GCA	2	6	60871	60876	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407689825
1037	NC_018682	TCG	2	6	60922	60927	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407689825
1038	NC_018682	TGC	2	6	60943	60948	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407689825
1039	NC_018682	GCC	2	6	60981	60986	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407689825
1040	NC_018682	CT	3	6	61042	61047	0 %	50 %	0 %	50 %	407689825
1041	NC_018682	CGG	2	6	61048	61053	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407689825
1042	NC_018682	CAT	2	6	61073	61078	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407689825
1043	NC_018682	CGT	2	6	61079	61084	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407689825
1044	NC_018682	CGC	2	6	61313	61318	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407689825
1045	NC_018682	GCG	2	6	61335	61340	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407689825
1046	NC_018682	GGC	2	6	61358	61363	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407689825
1047	NC_018682	CGC	2	6	61370	61375	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407689825
1048	NC_018682	ATCA	2	8	61763	61770	50 %	25 %	0 %	25 %	407689826
1049	NC_018682	GCC	2	6	61790	61795	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407689826
1050	NC_018682	CGC	2	6	61815	61820	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407689826
1051	NC_018682	CTT	2	6	61843	61848	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407689826
1052	NC_018682	TGCC	2	8	61905	61912	0 %	25 %	25 %	50 %	407689826
1053	NC_018682	CTC	2	6	61984	61989	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407689826
1054	NC_018682	CGAAA	2	10	62008	62017	60 %	0 %	20 %	20 %	407689826
1055	NC_018682	CG	3	6	62047	62052	0 %	0 %	50 %	50 %	407689826
1056	NC_018682	GCC	2	6	62118	62123	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407689827
1057	NC_018682	CGG	2	6	62198	62203	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407689827
1058	NC_018682	GAT	2	6	62322	62327	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407689827
1059	NC_018682	CGAG	2	8	62362	62369	25 %	0 %	50 %	25 %	407689827
1060	NC_018682	ACA	2	6	62398	62403	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407689827
1061	NC_018682	GGC	2	6	62415	62420	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407689827
1062	NC_018682	GCG	2	6	62505	62510	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407689827
1063	NC_018682	GCA	2	6	62523	62528	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407689827
1064	NC_018682	TGA	2	6	62606	62611	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407689827
1065	NC_018682	CCT	2	6	62672	62677	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407689827
1066	NC_018682	GCG	2	6	62779	62784	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407689827
1067	NC_018682	TCG	2	6	62803	62808	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407689827
1068	NC_018682	GAT	2	6	62988	62993	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407689828
1069	NC_018682	CCGC	2	8	63037	63044	0 %	0 %	25 %	75 %	407689828
1070	NC_018682	CGGT	2	8	63058	63065	0 %	25 %	50 %	25 %	407689828
1071	NC_018682	TCC	2	6	63076	63081	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407689828
1072	NC_018682	CGCC	2	8	63170	63177	0 %	0 %	25 %	75 %	407689828
1073	NC_018682	GCA	2	6	63182	63187	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407689828
1074	NC_018682	GAG	2	6	63228	63233	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407689828
1075	NC_018682	CGA	2	6	63260	63265	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407689828
1076	NC_018682	CG	3	6	63341	63346	0 %	0 %	50 %	50 %	407689828
1077	NC_018682	AGG	2	6	63347	63352	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407689828
1078	NC_018682	GAG	3	9	63366	63374	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407689828
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1080	NC_018682	GCC	2	6	63453	63458	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407689828
1081	NC_018682	CTTGGC	2	12	63477	63488	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407689828
1082	NC_018682	TGT	2	6	63506	63511	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407689828
1083	NC_018682	CTG	2	6	63564	63569	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407689828
1084	NC_018682	CGG	3	9	63714	63722	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407689828
1085	NC_018682	GAA	2	6	63929	63934	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407689829
1086	NC_018682	GAT	2	6	64126	64131	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407689829
1087	NC_018682	GGC	2	6	64203	64208	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407689829
1088	NC_018682	GCG	2	6	64212	64217	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407689829
1089	NC_018682	CGA	2	6	64371	64376	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407689829
1090	NC_018682	CCG	2	6	64397	64402	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407689829
1091	NC_018682	GCG	2	6	64415	64420	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407689829
1092	NC_018682	GCG	3	9	64478	64486	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407689829
1093	NC_018682	GGTT	2	8	64516	64523	0 %	50 %	50 %	0 %	407689829
1094	NC_018682	TCG	2	6	64545	64550	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407689829
1095	NC_018682	GTC	2	6	64589	64594	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407689829
1096	NC_018682	CGA	2	6	64600	64605	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407689829
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1099	NC_018682	CG	3	6	64742	64747	0 %	0 %	50 %	50 %	407689829
1100	NC_018682	GCTG	2	8	64839	64846	0 %	25 %	50 %	25 %	407689829
1101	NC_018682	GCG	2	6	64850	64855	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407689829
1102	NC_018682	GGC	2	6	64858	64863	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407689829
1103	NC_018682	GCAT	2	8	64867	64874	25 %	25 %	25 %	25 %	407689829
1104	NC_018682	CCGT	2	8	64883	64890	0 %	25 %	25 %	50 %	407689829
1105	NC_018682	CGG	2	6	64941	64946	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407689829
1106	NC_018682	CG	3	6	65024	65029	0 %	0 %	50 %	50 %	407689829
1107	NC_018682	CGC	2	6	65038	65043	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407689829
1108	NC_018682	GC	3	6	65064	65069	0 %	0 %	50 %	50 %	407689829
1109	NC_018682	GCG	2	6	65071	65076	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407689829
1110	NC_018682	CAC	2	6	65089	65094	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407689829
1111	NC_018682	GGC	2	6	65116	65121	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407689829
1112	NC_018682	GGCC	2	8	65184	65191	0 %	0 %	50 %	50 %	407689829
1113	NC_018682	GCG	2	6	65201	65206	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407689829
1114	NC_018682	CCAG	2	8	65254	65261	25 %	0 %	25 %	50 %	407689829
1115	NC_018682	AGGAG	2	10	65284	65293	40 %	0 %	60 %	0 %	407689829
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1125	NC_018682	TTC	2	6	65668	65673	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407689830
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1496	NC_018682	TGA	2	6	85240	85245	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407689848
1497	NC_018682	GCT	2	6	85276	85281	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407689848
1498	NC_018682	AGC	2	6	85359	85364	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407689848
1499	NC_018682	AATGA	2	10	85377	85386	60 %	20 %	20 %	0 %	407689848
1500	NC_018682	GTA	2	6	85462	85467	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407689849

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