MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Sinorhizobium meliloti Rm41 plasmid pRM41A

Total Repeats: 4278

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_018682	CGTC	2	8	32208	32215	0 %	25 %	25 %	50 %	407689798
502	NC_018682	CGA	2	6	32265	32270	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407689798
503	NC_018682	GA	3	6	32281	32286	50 %	0 %	50 %	0 %	407689798
504	NC_018682	ATT	2	6	32360	32365	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407689798
505	NC_018682	GAC	2	6	32383	32388	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407689798
506	NC_018682	TCGT	2	8	32425	32432	0 %	50 %	25 %	25 %	407689798
507	NC_018682	GCA	3	9	32458	32466	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407689798
508	NC_018682	CA	3	6	32522	32527	50 %	0 %	0 %	50 %	407689798
509	NC_018682	CAC	2	6	32653	32658	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407689798
510	NC_018682	AGC	2	6	32680	32685	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407689798
511	NC_018682	TCA	2	6	32692	32697	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407689798
512	NC_018682	TCG	2	6	32704	32709	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407689798
513	NC_018682	CGGC	2	8	32731	32738	0 %	0 %	50 %	50 %	407689798
514	NC_018682	TCGT	2	8	32739	32746	0 %	50 %	25 %	25 %	407689798
515	NC_018682	GAG	2	6	32786	32791	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407689798
516	NC_018682	TCA	3	9	32820	32828	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407689798
517	NC_018682	GAT	2	6	32840	32845	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407689799
518	NC_018682	TTG	2	6	32917	32922	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407689799
519	NC_018682	GTC	2	6	32967	32972	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407689799
520	NC_018682	AG	3	6	33119	33124	50 %	0 %	50 %	0 %	407689799
521	NC_018682	TC	3	6	33207	33212	0 %	50 %	0 %	50 %	407689800
522	NC_018682	AAG	2	6	33228	33233	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407689800
523	NC_018682	TCT	2	6	33252	33257	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407689800
524	NC_018682	ACC	2	6	33277	33282	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407689800
525	NC_018682	GTC	2	6	33293	33298	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407689800
526	NC_018682	GTG	2	6	33372	33377	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407689800
527	NC_018682	GCA	2	6	33475	33480	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407689800
528	NC_018682	TCT	2	6	33520	33525	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407689800
529	NC_018682	TGC	2	6	33537	33542	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407689800
530	NC_018682	GTC	2	6	33587	33592	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407689800
531	NC_018682	GGC	2	6	33674	33679	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407689800
532	NC_018682	TCG	2	6	33697	33702	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407689800
533	NC_018682	GACA	2	8	33787	33794	50 %	0 %	25 %	25 %	407689801
534	NC_018682	CTC	3	9	33975	33983	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407689801
535	NC_018682	AGC	2	6	33997	34002	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407689801
536	NC_018682	GCG	2	6	34003	34008	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407689801
537	NC_018682	TGCA	2	8	34089	34096	25 %	25 %	25 %	25 %	407689801
538	NC_018682	AAG	2	6	34106	34111	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407689801
539	NC_018682	TTC	2	6	34143	34148	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407689801
540	NC_018682	GT	3	6	34216	34221	0 %	50 %	50 %	0 %	407689801
541	NC_018682	CAC	2	6	34233	34238	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407689801
542	NC_018682	CAG	2	6	34272	34277	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407689801
543	NC_018682	AGGC	2	8	34298	34305	25 %	0 %	50 %	25 %	407689801
544	NC_018682	GCA	2	6	34334	34339	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407689801
545	NC_018682	GCA	2	6	34376	34381	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407689801
546	NC_018682	GCGTC	2	10	34394	34403	0 %	20 %	40 %	40 %	407689801
547	NC_018682	CCTG	2	8	34468	34475	0 %	25 %	25 %	50 %	407689802
548	NC_018682	AAGCG	2	10	34516	34525	40 %	0 %	40 %	20 %	407689802
549	NC_018682	CGCC	2	8	34544	34551	0 %	0 %	25 %	75 %	407689802
550	NC_018682	GCC	2	6	34647	34652	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407689802
551	NC_018682	GGAAT	2	10	34707	34716	40 %	20 %	40 %	0 %	407689802
552	NC_018682	GTA	2	6	34737	34742	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407689802
553	NC_018682	CGC	2	6	34751	34756	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407689802
554	NC_018682	TC	3	6	34817	34822	0 %	50 %	0 %	50 %	407689802
555	NC_018682	GGAA	3	12	34854	34865	50 %	0 %	50 %	0 %	407689802
556	NC_018682	GAA	2	6	34880	34885	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407689802
557	NC_018682	GTC	2	6	34905	34910	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407689802
558	NC_018682	CGT	2	6	34935	34940	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407689802
559	NC_018682	CGC	2	6	35018	35023	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407689802
560	NC_018682	GCCG	2	8	35110	35117	0 %	0 %	50 %	50 %	407689802
561	NC_018682	GTC	2	6	35134	35139	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407689802
562	NC_018682	GAC	2	6	35149	35154	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407689802
563	NC_018682	CGA	2	6	35288	35293	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407689802
564	NC_018682	CGA	2	6	35339	35344	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407689802
565	NC_018682	CTGT	2	8	35348	35355	0 %	50 %	25 %	25 %	407689802
566	NC_018682	GGC	2	6	35381	35386	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407689802
567	NC_018682	GAA	2	6	35477	35482	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407689803
568	NC_018682	TGC	2	6	35546	35551	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407689803
569	NC_018682	AGGT	2	8	35589	35596	25 %	25 %	50 %	0 %	407689803
570	NC_018682	ACC	2	6	35625	35630	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407689803
571	NC_018682	CCG	2	6	35646	35651	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407689803
572	NC_018682	TTGC	2	8	35745	35752	0 %	50 %	25 %	25 %	407689803
573	NC_018682	CGG	2	6	35774	35779	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407689803
574	NC_018682	CTG	2	6	35846	35851	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407689803
575	NC_018682	GC	3	6	35979	35984	0 %	0 %	50 %	50 %	407689803
576	NC_018682	CG	3	6	36047	36052	0 %	0 %	50 %	50 %	407689803
577	NC_018682	GC	3	6	36063	36068	0 %	0 %	50 %	50 %	407689803
578	NC_018682	GC	3	6	36088	36093	0 %	0 %	50 %	50 %	407689803
579	NC_018682	GCA	2	6	36135	36140	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407689803
580	NC_018682	TCG	2	6	36153	36158	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407689803
581	NC_018682	TCA	2	6	36286	36291	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407689803
582	NC_018682	CGC	2	6	36295	36300	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407689803
583	NC_018682	TCG	2	6	36352	36357	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407689803
584	NC_018682	AAG	2	6	36383	36388	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407689803
585	NC_018682	CTC	2	6	36398	36403	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407689803
586	NC_018682	GAC	2	6	36458	36463	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407689803
587	NC_018682	CG	3	6	36521	36526	0 %	0 %	50 %	50 %	407689804
588	NC_018682	GAGGAT	2	12	36552	36563	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	407689804
589	NC_018682	GCC	2	6	36621	36626	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407689804
590	NC_018682	TCGAGG	2	12	36665	36676	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	407689804
591	NC_018682	GAG	2	6	36681	36686	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407689804
592	NC_018682	CGG	2	6	36731	36736	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407689804
593	NC_018682	TGA	2	6	36737	36742	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407689804
594	NC_018682	GGCA	2	8	36748	36755	25 %	0 %	50 %	25 %	407689804
595	NC_018682	GC	3	6	36807	36812	0 %	0 %	50 %	50 %	407689804
596	NC_018682	GAT	2	6	36855	36860	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407689804
597	NC_018682	A	7	7	36946	36952	100 %	0 %	0 %	0 %	407689804
598	NC_018682	CAT	2	6	36978	36983	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407689804
599	NC_018682	TCC	2	6	37012	37017	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407689804
600	NC_018682	GCT	2	6	37051	37056	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407689804
601	NC_018682	GAT	2	6	37200	37205	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407689804
602	NC_018682	CGTG	2	8	37209	37216	0 %	25 %	50 %	25 %	407689804
603	NC_018682	ATAGG	2	10	37241	37250	40 %	20 %	40 %	0 %	407689804
604	NC_018682	CGA	2	6	37380	37385	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407689805
605	NC_018682	TGA	2	6	37392	37397	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407689805
606	NC_018682	CGC	2	6	37488	37493	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407689805
607	NC_018682	CGA	3	9	37566	37574	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407689805
608	NC_018682	CAT	2	6	37585	37590	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407689805
609	NC_018682	CGC	2	6	37642	37647	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407689805
610	NC_018682	CAA	2	6	37683	37688	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407689805
611	NC_018682	GAT	2	6	37690	37695	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407689805
612	NC_018682	GCCA	2	8	37748	37755	25 %	0 %	25 %	50 %	407689805
613	NC_018682	GAC	2	6	37760	37765	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407689805
614	NC_018682	CCGA	2	8	37793	37800	25 %	0 %	25 %	50 %	407689805
615	NC_018682	CAG	2	6	37804	37809	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407689805
616	NC_018682	CGT	2	6	37827	37832	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407689805
617	NC_018682	GCC	2	6	37981	37986	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407689805
618	NC_018682	GAT	2	6	37987	37992	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407689805
619	NC_018682	CAG	2	6	38137	38142	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407689805
620	NC_018682	GGCCG	2	10	38152	38161	0 %	0 %	60 %	40 %	407689805
621	NC_018682	CGAG	2	8	38197	38204	25 %	0 %	50 %	25 %	407689805
622	NC_018682	CGG	2	6	38209	38214	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407689805
623	NC_018682	GGC	2	6	38236	38241	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407689805
624	NC_018682	CCT	2	6	38250	38255	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407689805
625	NC_018682	CCGC	2	8	38360	38367	0 %	0 %	25 %	75 %	407689806
626	NC_018682	TTC	2	6	38375	38380	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407689806
627	NC_018682	ATG	2	6	38384	38389	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407689806
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629	NC_018682	GGCGC	2	10	38502	38511	0 %	0 %	60 %	40 %	407689806
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743	NC_018682	TCG	2	6	45893	45898	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407689812
744	NC_018682	ACC	2	6	45907	45912	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407689812
745	NC_018682	GC	3	6	45966	45971	0 %	0 %	50 %	50 %	407689812
746	NC_018682	ATC	2	6	45994	45999	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407689812
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748	NC_018682	CTG	2	6	46108	46113	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407689812
749	NC_018682	G	6	6	46156	46161	0 %	0 %	100 %	0 %	407689812
750	NC_018682	GC	5	10	46235	46244	0 %	0 %	50 %	50 %	407689812
751	NC_018682	CGA	2	6	46266	46271	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407689812
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753	NC_018682	CGA	2	6	46421	46426	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407689812
754	NC_018682	ATC	2	6	46451	46456	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407689812
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