MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus agalactiae GD201008-001 chromosome

Total Repeats: 39118

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_018646	AGT	2	6	35293	35298	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406708544
502	NC_018646	ATT	2	6	35378	35383	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406708545
503	NC_018646	GCA	2	6	35387	35392	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406708545
504	NC_018646	ATG	2	6	35437	35442	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406708545
505	NC_018646	TAT	2	6	35477	35482	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406708545
506	NC_018646	CAA	2	6	35547	35552	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406708545
507	NC_018646	TAA	3	9	35580	35588	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406708545
508	NC_018646	TTAT	2	8	35719	35726	25 %	75 %	0 %	0 %	406708546
509	NC_018646	CTA	2	6	35797	35802	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406708546
510	NC_018646	AAT	2	6	35850	35855	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406708546
511	NC_018646	TGGTG	2	10	35894	35903	0 %	40 %	60 %	0 %	406708546
512	NC_018646	A	6	6	35927	35932	100 %	0 %	0 %	0 %	406708546
513	NC_018646	A	6	6	35946	35951	100 %	0 %	0 %	0 %	406708546
514	NC_018646	ATT	2	6	35958	35963	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406708546
515	NC_018646	GGT	2	6	35972	35977	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	406708546
516	NC_018646	CAG	2	6	35992	35997	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406708546
517	NC_018646	GAA	2	6	36024	36029	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406708546
518	NC_018646	TAC	2	6	36063	36068	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406708546
519	NC_018646	ATG	2	6	36073	36078	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406708546
520	NC_018646	ATG	2	6	36100	36105	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406708546
521	NC_018646	ATG	2	6	36133	36138	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406708546
522	NC_018646	GA	3	6	36160	36165	50 %	0 %	50 %	0 %	406708546
523	NC_018646	ATG	2	6	36253	36258	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406708546
524	NC_018646	ATC	2	6	36264	36269	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406708546
525	NC_018646	TGA	2	6	36275	36280	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406708546
526	NC_018646	ATG	2	6	36564	36569	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406708547
527	NC_018646	TTG	2	6	36583	36588	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406708547
528	NC_018646	CTT	2	6	36658	36663	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406708547
529	NC_018646	ATG	2	6	36691	36696	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406708547
530	NC_018646	CTT	2	6	36812	36817	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406708547
531	NC_018646	AAG	2	6	36868	36873	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406708547
532	NC_018646	AGGTCA	2	12	36901	36912	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	406708547
533	NC_018646	GCAGAA	2	12	36948	36959	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	406708547
534	NC_018646	TTC	2	6	37077	37082	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406708547
535	NC_018646	ATT	2	6	37168	37173	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406708547
536	NC_018646	AATC	2	8	37177	37184	50 %	25 %	0 %	25 %	406708547
537	NC_018646	ACTGAG	2	12	37197	37208	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	406708547
538	NC_018646	CA	3	6	37248	37253	50 %	0 %	0 %	50 %	406708547
539	NC_018646	GAA	2	6	37271	37276	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406708547
540	NC_018646	AT	3	6	37331	37336	50 %	50 %	0 %	0 %	406708547
541	NC_018646	TGA	2	6	37346	37351	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406708547
542	NC_018646	GTC	2	6	37426	37431	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406708547
543	NC_018646	CTC	2	6	37515	37520	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	406708547
544	NC_018646	TGG	2	6	37568	37573	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	406708547
545	NC_018646	GCA	2	6	37575	37580	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406708547
546	NC_018646	GGT	2	6	37590	37595	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	406708547
547	NC_018646	CAGGCG	2	12	37651	37662	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	406708547
548	NC_018646	GCG	2	6	37728	37733	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406708547
549	NC_018646	TTC	2	6	37742	37747	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406708547
550	NC_018646	TGGT	2	8	37837	37844	0 %	50 %	50 %	0 %	406708547
551	NC_018646	GGT	2	6	37908	37913	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	406708547
552	NC_018646	GGT	2	6	37935	37940	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	406708547
553	NC_018646	GGT	2	6	38097	38102	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	406708547
554	NC_018646	GTT	2	6	38229	38234	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406708547
555	NC_018646	ATC	2	6	38349	38354	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406708547
556	NC_018646	GTT	2	6	38400	38405	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406708547
557	NC_018646	GCAC	2	8	38445	38452	25 %	0 %	25 %	50 %	406708547
558	NC_018646	ACC	2	6	38569	38574	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	406708547
559	NC_018646	GGT	2	6	38580	38585	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	406708547
560	NC_018646	GAC	2	6	38645	38650	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406708547
561	NC_018646	TGC	2	6	38714	38719	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406708547
562	NC_018646	CTT	2	6	38853	38858	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406708547
563	NC_018646	GGT	2	6	38901	38906	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	406708547
564	NC_018646	ACC	2	6	38945	38950	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	406708547
565	NC_018646	GAC	2	6	38972	38977	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406708547
566	NC_018646	TC	4	8	38996	39003	0 %	50 %	0 %	50 %	406708547
567	NC_018646	CTA	2	6	39032	39037	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406708547
568	NC_018646	AGA	2	6	39059	39064	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406708547
569	NC_018646	CTG	2	6	39133	39138	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406708547
570	NC_018646	GGT	2	6	39156	39161	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	406708547
571	NC_018646	CAG	2	6	39233	39238	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406708547
572	NC_018646	AGC	2	6	39371	39376	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406708547
573	NC_018646	GAA	2	6	39435	39440	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406708547
574	NC_018646	CTG	2	6	39445	39450	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406708547
575	NC_018646	TCA	2	6	39466	39471	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406708547
576	NC_018646	GCT	2	6	39609	39614	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406708547
577	NC_018646	ATC	2	6	39663	39668	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406708547
578	NC_018646	CAG	2	6	39688	39693	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406708547
579	NC_018646	ATC	2	6	39792	39797	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406708547
580	NC_018646	TCT	2	6	39836	39841	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406708547
581	NC_018646	CT	3	6	39883	39888	0 %	50 %	0 %	50 %	406708547
582	NC_018646	TGT	2	6	40022	40027	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406708547
583	NC_018646	ATC	2	6	40176	40181	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406708547
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587	NC_018646	AATC	2	8	40724	40731	50 %	25 %	0 %	25 %	406708548
588	NC_018646	CCT	2	6	40929	40934	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	406708548
589	NC_018646	TCG	2	6	40963	40968	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406708548
590	NC_018646	AAG	2	6	41001	41006	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406708548
591	NC_018646	TGA	2	6	41043	41048	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406708548
592	NC_018646	AGA	2	6	41050	41055	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406708548
593	NC_018646	TGC	2	6	41065	41070	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406708548
594	NC_018646	GGT	2	6	41158	41163	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	406708548
595	NC_018646	TGA	2	6	41245	41250	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406708548
596	NC_018646	A	6	6	41338	41343	100 %	0 %	0 %	0 %	406708548
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598	NC_018646	GAA	2	6	41438	41443	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406708548
599	NC_018646	A	6	6	41473	41478	100 %	0 %	0 %	0 %	406708548
600	NC_018646	GTT	2	6	41582	41587	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406708548
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604	NC_018646	GT	3	6	41771	41776	0 %	50 %	50 %	0 %	406708548
605	NC_018646	ATT	2	6	41780	41785	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406708548
606	NC_018646	TC	3	6	41806	41811	0 %	50 %	0 %	50 %	406708548
607	NC_018646	TTGA	2	8	41822	41829	25 %	50 %	25 %	0 %	406708548
608	NC_018646	TGG	2	6	41860	41865	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	406708548
609	NC_018646	GAA	3	9	41918	41926	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406708548
610	NC_018646	AGA	2	6	41941	41946	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406708548
611	NC_018646	A	6	6	41946	41951	100 %	0 %	0 %	0 %	406708548
612	NC_018646	A	7	7	42015	42021	100 %	0 %	0 %	0 %	406708549
613	NC_018646	A	7	7	42079	42085	100 %	0 %	0 %	0 %	406708549
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616	NC_018646	TG	3	6	42273	42278	0 %	50 %	50 %	0 %	406708549
617	NC_018646	ATT	2	6	42287	42292	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406708549
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620	NC_018646	GTAT	2	8	42444	42451	25 %	50 %	25 %	0 %	406708549
621	NC_018646	GAT	2	6	42458	42463	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406708549
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