MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus pneumoniae gamPNI0373 chromosome

Total Repeats: 35282

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_018630	TTG	2	6	57618	57623	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410475532
1002	NC_018630	GCT	2	6	57665	57670	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410475532
1003	NC_018630	ATA	2	6	57741	57746	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410475532
1004	NC_018630	ACG	2	6	57804	57809	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410475532
1005	NC_018630	CTCA	2	8	57902	57909	25 %	25 %	0 %	50 %	410475533
1006	NC_018630	TGT	2	6	57990	57995	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410475533
1007	NC_018630	CAT	2	6	58008	58013	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410475533
1008	NC_018630	AAC	2	6	58030	58035	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410475533
1009	NC_018630	AACC	2	8	58243	58250	50 %	0 %	0 %	50 %	410475533
1010	NC_018630	AAC	2	6	58252	58257	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410475533
1011	NC_018630	GTAC	2	8	58386	58393	25 %	25 %	25 %	25 %	410475533
1012	NC_018630	TAT	2	6	58447	58452	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410475533
1013	NC_018630	GAA	2	6	58488	58493	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410475533
1014	NC_018630	CA	3	6	58495	58500	50 %	0 %	0 %	50 %	410475533
1015	NC_018630	TAC	2	6	58513	58518	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410475533
1016	NC_018630	GAA	2	6	58551	58556	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410475533
1017	NC_018630	TAC	2	6	58633	58638	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410475533
1018	NC_018630	AAG	2	6	58649	58654	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410475533
1019	NC_018630	CGGA	2	8	58688	58695	25 %	0 %	50 %	25 %	410475533
1020	NC_018630	TAC	2	6	58705	58710	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410475533
1021	NC_018630	TAAA	2	8	58779	58786	75 %	25 %	0 %	0 %	410475533
1022	NC_018630	CTG	2	6	59093	59098	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410475534
1023	NC_018630	AGT	2	6	59151	59156	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410475534
1024	NC_018630	TC	3	6	59227	59232	0 %	50 %	0 %	50 %	410475534
1025	NC_018630	TTTTG	2	10	59411	59420	0 %	80 %	20 %	0 %	410475535
1026	NC_018630	TCT	2	6	59512	59517	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410475535
1027	NC_018630	TCA	2	6	59528	59533	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410475535
1028	NC_018630	TAT	2	6	59810	59815	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410475536
1029	NC_018630	GAA	2	6	59822	59827	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410475536
1030	NC_018630	AAG	2	6	59829	59834	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410475536
1031	NC_018630	GAGG	2	8	59842	59849	25 %	0 %	75 %	0 %	410475536
1032	NC_018630	GA	3	6	59854	59859	50 %	0 %	50 %	0 %	410475536
1033	NC_018630	TG	3	6	59900	59905	0 %	50 %	50 %	0 %	410475536
1034	NC_018630	AGCG	2	8	59961	59968	25 %	0 %	50 %	25 %	410475536
1035	NC_018630	ATGC	2	8	59972	59979	25 %	25 %	25 %	25 %	410475536
1036	NC_018630	TGAG	2	8	60009	60016	25 %	25 %	50 %	0 %	410475536
1037	NC_018630	GCT	2	6	60143	60148	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410475536
1038	NC_018630	ATC	2	6	60186	60191	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410475536
1039	NC_018630	T	7	7	60247	60253	0 %	100 %	0 %	0 %	410475536
1040	NC_018630	A	6	6	60266	60271	100 %	0 %	0 %	0 %	410475536
1041	NC_018630	GTT	2	6	60572	60577	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410475537
1042	NC_018630	GA	3	6	60585	60590	50 %	0 %	50 %	0 %	410475537
1043	NC_018630	TTC	2	6	60658	60663	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410475537
1044	NC_018630	AAG	2	6	60674	60679	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410475537
1045	NC_018630	TTAA	2	8	60689	60696	50 %	50 %	0 %	0 %	410475537
1046	NC_018630	ATT	2	6	60720	60725	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410475537
1047	NC_018630	GAA	2	6	60766	60771	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410475537
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1050	NC_018630	TA	3	6	60966	60971	50 %	50 %	0 %	0 %	410475538
1051	NC_018630	GCA	2	6	61013	61018	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410475538
1052	NC_018630	AAT	2	6	61061	61066	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410475538
1053	NC_018630	TCT	2	6	61071	61076	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410475538
1054	NC_018630	TTA	2	6	61149	61154	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410475538
1055	NC_018630	AGA	2	6	61203	61208	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410475538
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1057	NC_018630	GTT	2	6	61332	61337	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410475538
1058	NC_018630	GATT	2	8	61379	61386	25 %	50 %	25 %	0 %	410475538
1059	NC_018630	AGGTTG	2	12	61541	61552	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	410475539
1060	NC_018630	GT	3	6	61571	61576	0 %	50 %	50 %	0 %	410475539
1061	NC_018630	GGA	2	6	61656	61661	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	410475539
1062	NC_018630	GAG	2	6	61804	61809	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	410475539
1063	NC_018630	CAG	2	6	61816	61821	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410475539
1064	NC_018630	CCAG	2	8	61920	61927	25 %	0 %	25 %	50 %	410475539
1065	NC_018630	CTT	2	6	61929	61934	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410475539
1066	NC_018630	ATT	2	6	61936	61941	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410475539
1067	NC_018630	AAG	2	6	62081	62086	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410475539
1068	NC_018630	TGG	2	6	62120	62125	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410475539
1069	NC_018630	CAC	2	6	62155	62160	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	410475539
1070	NC_018630	GGC	2	6	62236	62241	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410475539
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1072	NC_018630	TCC	2	6	62305	62310	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	410475539
1073	NC_018630	TAC	2	6	62397	62402	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410475539
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1075	NC_018630	GTG	2	6	62504	62509	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410475539
1076	NC_018630	GA	3	6	62624	62629	50 %	0 %	50 %	0 %	410475539
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1078	NC_018630	AGG	2	6	62858	62863	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	410475540
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1081	NC_018630	CAA	2	6	63097	63102	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410475540
1082	NC_018630	AG	3	6	63112	63117	50 %	0 %	50 %	0 %	410475540
1083	NC_018630	AGA	2	6	63243	63248	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410475540
1084	NC_018630	AT	3	6	64316	64321	50 %	50 %	0 %	0 %	410475541
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1088	NC_018630	GAA	2	6	64473	64478	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410475541
1089	NC_018630	TGT	2	6	64598	64603	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410475541
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1095	NC_018630	TAT	2	6	64910	64915	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410475541
1096	NC_018630	CGT	2	6	64923	64928	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410475541
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1098	NC_018630	TTGA	2	8	64998	65005	25 %	50 %	25 %	0 %	410475541
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1100	NC_018630	TTCT	2	8	65101	65108	0 %	75 %	0 %	25 %	410475541
1101	NC_018630	GTT	2	6	65154	65159	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410475541
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1103	NC_018630	AGA	2	6	65180	65185	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410475541
1104	NC_018630	TGAT	2	8	65191	65198	25 %	50 %	25 %	0 %	410475541
1105	NC_018630	CGTA	2	8	65243	65250	25 %	25 %	25 %	25 %	410475541
1106	NC_018630	A	7	7	65292	65298	100 %	0 %	0 %	0 %	410475541
1107	NC_018630	ACA	2	6	65847	65852	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410475542
1108	NC_018630	GCTG	2	8	65886	65893	0 %	25 %	50 %	25 %	410475542
1109	NC_018630	AGA	2	6	65909	65914	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410475542
1110	NC_018630	CTTCC	2	10	65955	65964	0 %	40 %	0 %	60 %	410475542
1111	NC_018630	TTC	2	6	66049	66054	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410475542
1112	NC_018630	TCC	2	6	66086	66091	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	410475542
1113	NC_018630	CAG	2	6	66112	66117	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410475542
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1117	NC_018630	A	6	6	66487	66492	100 %	0 %	0 %	0 %	410475543
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1121	NC_018630	A	6	6	67017	67022	100 %	0 %	0 %	0 %	410475544
1122	NC_018630	TTA	2	6	67023	67028	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410475544
1123	NC_018630	TTGA	2	8	67029	67036	25 %	50 %	25 %	0 %	410475544
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1125	NC_018630	T	6	6	67062	67067	0 %	100 %	0 %	0 %	410475544
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1127	NC_018630	TTG	2	6	67155	67160	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410475544
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