MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus pneumoniae SPNA45

Total Repeats: 32614

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_018594	AACAA	2	10	194344	194353	80 %	0 %	0 %	20 %	405760099
3002	NC_018594	ATT	2	6	194374	194379	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	405760099
3003	NC_018594	GAT	2	6	194441	194446	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	405760099
3004	NC_018594	GGA	2	6	194471	194476	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	405760099
3005	NC_018594	A	7	7	194502	194508	100 %	0 %	0 %	0 %	405760099
3006	NC_018594	A	6	6	194513	194518	100 %	0 %	0 %	0 %	405760099
3007	NC_018594	TGA	2	6	194533	194538	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	405760099
3008	NC_018594	ACA	2	6	194615	194620	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	405760099
3009	NC_018594	TAC	2	6	194668	194673	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	405760099
3010	NC_018594	ATG	2	6	194676	194681	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	405760099
3011	NC_018594	ATCCT	2	10	194715	194724	20 %	40 %	0 %	40 %	405760099
3012	NC_018594	AGA	2	6	194731	194736	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	405760099
3013	NC_018594	AT	3	6	194769	194774	50 %	50 %	0 %	0 %	405760099
3014	NC_018594	AAG	2	6	194862	194867	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	405760099
3015	NC_018594	TAG	2	6	194895	194900	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	405760099
3016	NC_018594	T	6	6	194908	194913	0 %	100 %	0 %	0 %	405760099
3017	NC_018594	AG	3	6	195062	195067	50 %	0 %	50 %	0 %	405760100
3018	NC_018594	GAA	2	6	195113	195118	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	405760100
3019	NC_018594	GAA	3	9	195122	195130	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	405760100
3020	NC_018594	TGG	2	6	195158	195163	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	405760100
3021	NC_018594	A	6	6	195248	195253	100 %	0 %	0 %	0 %	405760100
3022	NC_018594	GCA	2	6	195422	195427	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	405760100
3023	NC_018594	CAA	2	6	195433	195438	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	405760100
3024	NC_018594	ATC	2	6	195521	195526	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	405760100
3025	NC_018594	GTT	2	6	195527	195532	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	405760100
3026	NC_018594	CTTG	2	8	195597	195604	0 %	50 %	25 %	25 %	405760100
3027	NC_018594	TGA	2	6	195628	195633	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	405760100
3028	NC_018594	TGGCT	2	10	195652	195661	0 %	40 %	40 %	20 %	405760100
3029	NC_018594	GAA	2	6	195671	195676	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	405760100
3030	NC_018594	GGTA	2	8	195823	195830	25 %	25 %	50 %	0 %	405760100
3031	NC_018594	TCT	2	6	195856	195861	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	405760100
3032	NC_018594	CTA	2	6	195936	195941	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	405760100
3033	NC_018594	TCCA	2	8	195993	196000	25 %	25 %	0 %	50 %	405760100
3034	NC_018594	TAG	2	6	196050	196055	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	405760100
3035	NC_018594	CAT	2	6	196061	196066	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	405760100
3036	NC_018594	TGA	2	6	196078	196083	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	405760100
3037	NC_018594	TATAA	2	10	196125	196134	60 %	40 %	0 %	0 %	405760100
3038	NC_018594	ATCT	2	8	196250	196257	25 %	50 %	0 %	25 %	405760101
3039	NC_018594	TAA	2	6	196293	196298	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	405760101
3040	NC_018594	AAC	2	6	196364	196369	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	405760101
3041	NC_018594	CAG	2	6	196424	196429	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	405760101
3042	NC_018594	CTT	2	6	196456	196461	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	405760101
3043	NC_018594	ATGA	2	8	196489	196496	50 %	25 %	25 %	0 %	405760101
3044	NC_018594	GGAGAC	2	12	196699	196710	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	405760101
3045	NC_018594	GTTG	2	8	196770	196777	0 %	50 %	50 %	0 %	405760101
3046	NC_018594	CCAT	2	8	196907	196914	25 %	25 %	0 %	50 %	405760101
3047	NC_018594	GCT	2	6	196915	196920	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	405760101
3048	NC_018594	TGAAG	2	10	196959	196968	40 %	20 %	40 %	0 %	405760101
3049	NC_018594	CAAA	2	8	196991	196998	75 %	0 %	0 %	25 %	405760101
3050	NC_018594	AAG	2	6	197186	197191	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	405760101
3051	NC_018594	CAT	2	6	197223	197228	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	405760101
3052	NC_018594	GACG	2	8	197230	197237	25 %	0 %	50 %	25 %	405760101
3053	NC_018594	CAG	2	6	197258	197263	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	405760101
3054	NC_018594	TCAAG	2	10	197308	197317	40 %	20 %	20 %	20 %	405760101
3055	NC_018594	TGT	2	6	197328	197333	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	405760101
3056	NC_018594	CTCA	2	8	197378	197385	25 %	25 %	0 %	50 %	405760101
3057	NC_018594	TGG	2	6	197505	197510	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	405760101
3058	NC_018594	TCT	2	6	197540	197545	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	405760101
3059	NC_018594	CAG	2	6	197711	197716	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	405760101
3060	NC_018594	AGC	2	6	197733	197738	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	405760101
3061	NC_018594	TGT	2	6	197850	197855	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	405760101
3062	NC_018594	GCT	2	6	197926	197931	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	405760101
3063	NC_018594	A	6	6	197954	197959	100 %	0 %	0 %	0 %	405760101
3064	NC_018594	TTC	2	6	198026	198031	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	405760101
3065	NC_018594	CCG	2	6	198042	198047	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	405760101
3066	NC_018594	AAT	2	6	198215	198220	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	405760101
3067	NC_018594	T	6	6	198353	198358	0 %	100 %	0 %	0 %	405760102
3068	NC_018594	ATG	2	6	198375	198380	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	405760102
3069	NC_018594	TAAA	2	8	198442	198449	75 %	25 %	0 %	0 %	405760102
3070	NC_018594	GCT	2	6	198570	198575	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	405760102
3071	NC_018594	GAAA	2	8	198596	198603	75 %	0 %	25 %	0 %	405760102
3072	NC_018594	A	6	6	198685	198690	100 %	0 %	0 %	0 %	405760103
3073	NC_018594	TGTC	2	8	198699	198706	0 %	50 %	25 %	25 %	405760103
3074	NC_018594	ATTAT	2	10	198914	198923	40 %	60 %	0 %	0 %	405760103
3075	NC_018594	AAGAT	2	10	198980	198989	60 %	20 %	20 %	0 %	405760103
3076	NC_018594	GAA	2	6	199042	199047	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	405760103
3077	NC_018594	AATG	2	8	199300	199307	50 %	25 %	25 %	0 %	405760104
3078	NC_018594	CAA	2	6	199357	199362	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	405760104
3079	NC_018594	AAG	2	6	199398	199403	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	405760104
3080	NC_018594	AAC	2	6	199459	199464	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	405760104
3081	NC_018594	AAG	2	6	199470	199475	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	405760104
3082	NC_018594	CAA	2	6	199511	199516	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	405760104
3083	NC_018594	A	7	7	199831	199837	100 %	0 %	0 %	0 %	405760105
3084	NC_018594	GAA	2	6	199915	199920	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	405760105
3085	NC_018594	AGC	2	6	199974	199979	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	405760105
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3087	NC_018594	GTG	2	6	200030	200035	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	405760105
3088	NC_018594	GTA	2	6	200080	200085	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	405760105
3089	NC_018594	AAC	2	6	200086	200091	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	405760105
3090	NC_018594	GAA	2	6	200122	200127	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	405760105
3091	NC_018594	GTT	2	6	200170	200175	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	405760105
3092	NC_018594	CAA	3	9	200189	200197	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	405760105
3093	NC_018594	TCCA	2	8	200267	200274	25 %	25 %	0 %	50 %	405760105
3094	NC_018594	ATC	2	6	200286	200291	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	405760105
3095	NC_018594	CAA	2	6	200384	200389	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	405760105
3096	NC_018594	GGT	2	6	200434	200439	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	405760105
3097	NC_018594	GGC	2	6	200454	200459	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	405760105
3098	NC_018594	AGC	2	6	200541	200546	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	405760105
3099	NC_018594	ACTT	2	8	200665	200672	25 %	50 %	0 %	25 %	405760105
3100	NC_018594	A	6	6	200680	200685	100 %	0 %	0 %	0 %	405760105
3101	NC_018594	CTT	2	6	200695	200700	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	405760105
3102	NC_018594	AACA	2	8	200826	200833	75 %	0 %	0 %	25 %	405760105
3103	NC_018594	TGC	2	6	200838	200843	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	405760105
3104	NC_018594	AAG	2	6	200852	200857	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	405760105
3105	NC_018594	CAG	2	6	200984	200989	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	405760105
3106	NC_018594	CA	3	6	200995	201000	50 %	0 %	0 %	50 %	405760105
3107	NC_018594	GAA	2	6	201007	201012	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	405760105
3108	NC_018594	TGG	2	6	201078	201083	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	405760105
3109	NC_018594	CTT	2	6	201105	201110	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	405760105
3110	NC_018594	CAT	2	6	201113	201118	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	405760105
3111	NC_018594	A	6	6	201193	201198	100 %	0 %	0 %	0 %	405760105
3112	NC_018594	CTTC	2	8	201235	201242	0 %	50 %	0 %	50 %	405760105
3113	NC_018594	ATTCA	2	10	201263	201272	40 %	40 %	0 %	20 %	405760105
3114	NC_018594	CCATG	2	10	201321	201330	20 %	20 %	20 %	40 %	405760105
3115	NC_018594	ATC	2	6	201355	201360	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	405760105
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3117	NC_018594	TCG	2	6	201375	201380	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	405760105
3118	NC_018594	GTT	2	6	201388	201393	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	405760105
3119	NC_018594	CAT	2	6	201483	201488	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	405760105
3120	NC_018594	GGT	2	6	201496	201501	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	405760105
3121	NC_018594	TGC	2	6	201516	201521	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	405760105
3122	NC_018594	AAG	2	6	201628	201633	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	405760105
3123	NC_018594	AAC	2	6	201712	201717	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	405760105
3124	NC_018594	ACT	2	6	201737	201742	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	405760105
3125	NC_018594	TGC	2	6	201804	201809	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	405760105
3126	NC_018594	CAA	2	6	201980	201985	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	405760105
3127	NC_018594	CA	3	6	202060	202065	50 %	0 %	0 %	50 %	405760105
3128	NC_018594	ACT	2	6	202157	202162	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	405760105
3129	NC_018594	CGCA	2	8	202191	202198	25 %	0 %	25 %	50 %	405760105
3130	NC_018594	AGA	2	6	202224	202229	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	405760105
3131	NC_018594	ATC	2	6	202420	202425	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	405760105
3132	NC_018594	AAAG	2	8	202447	202454	75 %	0 %	25 %	0 %	405760105
3133	NC_018594	AAT	2	6	202469	202474	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	405760105
3134	NC_018594	TATT	2	8	203341	203348	25 %	75 %	0 %	0 %	405760106
3135	NC_018594	AAT	2	6	203385	203390	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	405760106
3136	NC_018594	TCT	2	6	203410	203415	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	405760106
3137	NC_018594	GCAT	2	8	203416	203423	25 %	25 %	25 %	25 %	405760106
3138	NC_018594	T	6	6	203444	203449	0 %	100 %	0 %	0 %	405760106
3139	NC_018594	CTT	2	6	203459	203464	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	405760106
3140	NC_018594	CTA	2	6	203498	203503	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	405760106
3141	NC_018594	CTT	2	6	203516	203521	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	405760106
3142	NC_018594	CTT	2	6	203537	203542	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	405760106
3143	NC_018594	GAT	2	6	203584	203589	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	405760106
3144	NC_018594	GCT	2	6	203593	203598	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	405760106
3145	NC_018594	AT	3	6	203626	203631	50 %	50 %	0 %	0 %	405760106
3146	NC_018594	TCT	2	6	203638	203643	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	405760106
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3148	NC_018594	TTTC	2	8	203752	203759	0 %	75 %	0 %	25 %	405760107
3149	NC_018594	T	7	7	203893	203899	0 %	100 %	0 %	0 %	405760107
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3151	NC_018594	CAA	2	6	203978	203983	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	405760108
3152	NC_018594	AGA	2	6	204016	204021	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	405760108
3153	NC_018594	GAT	2	6	204036	204041	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	405760108
3154	NC_018594	CTG	2	6	204071	204076	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	405760108
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3156	NC_018594	TAA	2	6	204339	204344	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	405760108
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3160	NC_018594	ATT	2	6	204426	204431	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	405760108
3161	NC_018594	TGC	2	6	204432	204437	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	405760108
3162	NC_018594	TTAA	2	8	204457	204464	50 %	50 %	0 %	0 %	405760108
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3164	NC_018594	AAT	3	9	204640	204648	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	405760108
3165	NC_018594	AAC	2	6	204654	204659	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	405760108
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3202	NC_018594	TCA	2	6	206476	206481	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	405760109
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3211	NC_018594	ATTT	3	12	206851	206862	25 %	75 %	0 %	0 %	405760110
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3219	NC_018594	CTT	2	6	207391	207396	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	405760110
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3227	NC_018594	TAG	2	6	208218	208223	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	405760111
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3230	NC_018594	GA	3	6	208721	208726	50 %	0 %	50 %	0 %	405760113
3231	NC_018594	TGA	2	6	208733	208738	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	405760113
3232	NC_018594	TAG	2	6	208753	208758	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	405760113
3233	NC_018594	TGT	2	6	208781	208786	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	405760113
3234	NC_018594	TGA	2	6	208822	208827	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	405760113
3235	NC_018594	ATG	2	6	208833	208838	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	405760113
3236	NC_018594	CA	3	6	208901	208906	50 %	0 %	0 %	50 %	405760113
3237	NC_018594	TGT	2	6	208940	208945	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	405760113
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3239	NC_018594	CAA	2	6	209174	209179	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	405760113
3240	NC_018594	CCAAA	2	10	209189	209198	60 %	0 %	0 %	40 %	405760113
3241	NC_018594	TGC	2	6	209203	209208	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	405760113
3242	NC_018594	GGT	2	6	209222	209227	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	405760113
3243	NC_018594	GAG	2	6	209246	209251	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	405760113
3244	NC_018594	TGG	2	6	209252	209257	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	405760113
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3282	NC_018594	CAGC	2	8	212313	212320	25 %	0 %	25 %	50 %	405760115
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3343	NC_018594	A	6	6	215271	215276	100 %	0 %	0 %	0 %	405760118
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3352	NC_018594	TTCT	2	8	215627	215634	0 %	75 %	0 %	25 %	405760118
3353	NC_018594	TCT	2	6	215665	215670	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	405760118
3354	NC_018594	CTG	2	6	215683	215688	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	405760118
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3357	NC_018594	A	6	6	215805	215810	100 %	0 %	0 %	0 %	405760118
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3363	NC_018594	GCA	2	6	216042	216047	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	405760118
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3365	NC_018594	GCT	2	6	216078	216083	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	405760118
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3487	NC_018594	ATT	2	6	232100	232105	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	405760128
3488	NC_018594	TGA	2	6	232111	232116	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	405760128
3489	NC_018594	GAA	2	6	232232	232237	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	405760128
3490	NC_018594	GGC	2	6	232383	232388	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	405760129
3491	NC_018594	AC	3	6	232406	232411	50 %	0 %	0 %	50 %	405760129
3492	NC_018594	CATA	2	8	232496	232503	50 %	25 %	0 %	25 %	405760129
3493	NC_018594	CCTGT	2	10	232575	232584	0 %	40 %	20 %	40 %	405760130
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3495	NC_018594	ATCA	2	8	232855	232862	50 %	25 %	0 %	25 %	405760130
3496	NC_018594	GAT	2	6	232891	232896	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	405760130
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3499	NC_018594	GT	3	6	233263	233268	0 %	50 %	50 %	0 %	405760130
3500	NC_018594	CAC	2	6	233272	233277	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	405760130

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