MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus pneumoniae SPNA45

Total Repeats: 32614

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_018594	ATCA	2	8	327643	327650	50 %	25 %	0 %	25 %	405760236
5002	NC_018594	GCTA	2	8	327703	327710	25 %	25 %	25 %	25 %	405760236
5003	NC_018594	ACT	2	6	327757	327762	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	405760236
5004	NC_018594	ACT	2	6	327832	327837	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	405760236
5005	NC_018594	ACAA	2	8	327868	327875	75 %	0 %	0 %	25 %	405760236
5006	NC_018594	CAAA	2	8	327923	327930	75 %	0 %	0 %	25 %	405760236
5007	NC_018594	ACT	2	6	327988	327993	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	405760236
5008	NC_018594	AGGTTG	2	12	328106	328117	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	405760236
5009	NC_018594	GAAT	2	8	328176	328183	50 %	25 %	25 %	0 %	405760236
5010	NC_018594	CTCAA	2	10	328188	328197	40 %	20 %	0 %	40 %	405760236
5011	NC_018594	AAC	2	6	328351	328356	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	405760236
5012	NC_018594	ATG	2	6	328373	328378	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	405760236
5013	NC_018594	GTT	2	6	328435	328440	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	405760236
5014	NC_018594	AGC	2	6	328441	328446	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	405760236
5015	NC_018594	TCA	3	9	328540	328548	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	405760236
5016	NC_018594	AGA	2	6	328623	328628	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	405760236
5017	NC_018594	AAG	2	6	328648	328653	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	405760236
5018	NC_018594	CAAA	2	8	328666	328673	75 %	0 %	0 %	25 %	405760236
5019	NC_018594	CTA	2	6	328681	328686	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	405760236
5020	NC_018594	ATC	2	6	328729	328734	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	405760236
5021	NC_018594	AATC	2	8	328740	328747	50 %	25 %	0 %	25 %	405760236
5022	NC_018594	TTG	2	6	328772	328777	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	405760236
5023	NC_018594	GA	3	6	328799	328804	50 %	0 %	50 %	0 %	405760236
5024	NC_018594	TCA	2	6	328823	328828	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	405760236
5025	NC_018594	TGC	2	6	328935	328940	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	405760236
5026	NC_018594	TTA	2	6	328943	328948	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	405760236
5027	NC_018594	TCT	2	6	329000	329005	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	405760236
5028	NC_018594	CTA	2	6	329006	329011	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	405760236
5029	NC_018594	TGG	2	6	329067	329072	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	405760236
5030	NC_018594	AAT	2	6	329197	329202	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	405760236
5031	NC_018594	TAC	2	6	329328	329333	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	405760236
5032	NC_018594	GGAA	2	8	329416	329423	50 %	0 %	50 %	0 %	405760236
5033	NC_018594	GTT	2	6	329428	329433	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	405760236
5034	NC_018594	TGG	2	6	329434	329439	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	405760236
5035	NC_018594	TGGA	2	8	329470	329477	25 %	25 %	50 %	0 %	405760236
5036	NC_018594	CAGA	2	8	329486	329493	50 %	0 %	25 %	25 %	405760236
5037	NC_018594	GAG	2	6	329593	329598	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	405760236
5038	NC_018594	CTTA	2	8	329705	329712	25 %	50 %	0 %	25 %	405760236
5039	NC_018594	A	6	6	329738	329743	100 %	0 %	0 %	0 %	405760236
5040	NC_018594	A	6	6	329747	329752	100 %	0 %	0 %	0 %	405760236
5041	NC_018594	AAC	2	6	329775	329780	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	405760237
5042	NC_018594	CAA	2	6	329918	329923	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	405760238
5043	NC_018594	CAA	2	6	329927	329932	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	405760238
5044	NC_018594	GAT	2	6	329937	329942	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	405760238
5045	NC_018594	TGA	2	6	330033	330038	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	405760238
5046	NC_018594	CAG	2	6	330050	330055	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	405760238
5047	NC_018594	GAAA	2	8	330161	330168	75 %	0 %	25 %	0 %	405760239
5048	NC_018594	GGT	2	6	330303	330308	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	405760239
5049	NC_018594	CAA	2	6	330316	330321	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	405760239
5050	NC_018594	AGG	2	6	330421	330426	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	405760239
5051	NC_018594	GAA	2	6	330440	330445	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	405760240
5052	NC_018594	A	6	6	330450	330455	100 %	0 %	0 %	0 %	405760240
5053	NC_018594	T	8	8	330498	330505	0 %	100 %	0 %	0 %	405760240
5054	NC_018594	GA	3	6	330543	330548	50 %	0 %	50 %	0 %	405760240
5055	NC_018594	AGA	3	9	330546	330554	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	405760240
5056	NC_018594	TGA	2	6	330609	330614	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	405760240
5057	NC_018594	TCAC	2	8	330651	330658	25 %	25 %	0 %	50 %	405760240
5058	NC_018594	GAA	2	6	330707	330712	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	405760240
5059	NC_018594	CAA	2	6	330737	330742	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	405760241
5060	NC_018594	TAGCAG	2	12	330780	330791	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	405760241
5061	NC_018594	GA	3	6	330840	330845	50 %	0 %	50 %	0 %	405760241
5062	NC_018594	ATC	2	6	330854	330859	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	405760241
5063	NC_018594	GCT	2	6	330905	330910	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	405760241
5064	NC_018594	TGAC	2	8	330993	331000	25 %	25 %	25 %	25 %	405760241
5065	NC_018594	CAG	2	6	331026	331031	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	405760241
5066	NC_018594	ACG	2	6	331044	331049	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	405760241
5067	NC_018594	CTCA	2	8	331143	331150	25 %	25 %	0 %	50 %	405760242
5068	NC_018594	TGT	2	6	331231	331236	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	405760242
5069	NC_018594	AAC	2	6	331271	331276	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	405760242
5070	NC_018594	GAC	2	6	331442	331447	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	405760242
5071	NC_018594	AACC	4	16	331484	331499	50 %	0 %	0 %	50 %	405760242
5072	NC_018594	ATCCAT	2	12	331515	331526	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	405760242
5073	NC_018594	GTAC	2	8	331627	331634	25 %	25 %	25 %	25 %	405760242
5074	NC_018594	TAT	2	6	331688	331693	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	405760242
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5076	NC_018594	CA	3	6	331736	331741	50 %	0 %	0 %	50 %	405760242
5077	NC_018594	TAC	2	6	331754	331759	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	405760242
5078	NC_018594	GAA	2	6	331792	331797	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	405760242
5079	NC_018594	TAT	2	6	331874	331879	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	405760242
5080	NC_018594	AAG	2	6	331890	331895	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	405760242
5081	NC_018594	TAC	2	6	331946	331951	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	405760242
5082	NC_018594	AAAT	2	8	332021	332028	75 %	25 %	0 %	0 %	405760242
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5084	NC_018594	CAGA	2	8	332292	332299	50 %	0 %	25 %	25 %	405760243
5085	NC_018594	TTG	2	6	332370	332375	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	405760243
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5089	NC_018594	AGTA	2	8	333465	333472	50 %	25 %	25 %	0 %	405760245
5090	NC_018594	AAATT	2	10	333482	333491	60 %	40 %	0 %	0 %	405760245
5091	NC_018594	TCA	2	6	333493	333498	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	405760245
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5101	NC_018594	A	6	6	334091	334096	100 %	0 %	0 %	0 %	405760245
5102	NC_018594	TGG	2	6	334097	334102	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	405760245
5103	NC_018594	ATT	2	6	334210	334215	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	405760245
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5105	NC_018594	GTA	2	6	334282	334287	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	405760245
5106	NC_018594	AGA	2	6	334371	334376	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	405760245
5107	NC_018594	AGC	2	6	334422	334427	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	405760245
5108	NC_018594	GGT	2	6	334585	334590	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	405760245
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5110	NC_018594	AACTGA	2	12	334617	334628	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	405760245
5111	NC_018594	GAAA	2	8	334632	334639	75 %	0 %	25 %	0 %	405760245
5112	NC_018594	GAA	2	6	334687	334692	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	405760245
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5119	NC_018594	GCA	2	6	334981	334986	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	405760245
5120	NC_018594	TAGC	2	8	334991	334998	25 %	25 %	25 %	25 %	405760245
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5367	NC_018594	TAT	2	6	358749	358754	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	405760257
5368	NC_018594	TATC	2	8	358767	358774	25 %	50 %	0 %	25 %	405760257
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5379	NC_018594	T	6	6	359872	359877	0 %	100 %	0 %	0 %	405760258
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5395	NC_018594	TCA	2	6	360760	360765	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	405760258
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5453	NC_018594	CAGT	2	8	364298	364305	25 %	25 %	25 %	25 %	405760260
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5471	NC_018594	ATT	2	6	365016	365021	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	405760260
5472	NC_018594	GGT	2	6	365031	365036	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	405760260
5473	NC_018594	TTGA	2	8	365085	365092	25 %	50 %	25 %	0 %	405760260
5474	NC_018594	TAA	2	6	365108	365113	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	405760260
5475	NC_018594	GTCTT	2	10	365128	365137	0 %	60 %	20 %	20 %	405760260
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5480	NC_018594	GAA	2	6	365350	365355	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	405760261
5481	NC_018594	A	6	6	365354	365359	100 %	0 %	0 %	0 %	405760261
5482	NC_018594	CAT	2	6	365392	365397	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	405760261
5483	NC_018594	ATG	2	6	365442	365447	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	405760261
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5485	NC_018594	ATG	2	6	365660	365665	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	405760261
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5492	NC_018594	ATAG	2	8	366156	366163	50 %	25 %	25 %	0 %	405760261
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