MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Streptococcus suis S735 chromosome

Total Repeats: 1243

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018526	CTATC	2	10	928	937	20 %	40 %	0 %	40 %	403060704
2	NC_018526	AATAA	2	10	1297	1306	80 %	20 %	0 %	0 %	403060704
3	NC_018526	CATAT	2	10	2807	2816	40 %	40 %	0 %	20 %	403060706
4	NC_018526	AAACA	2	10	5721	5730	80 %	0 %	0 %	20 %	403060710
5	NC_018526	TGTCT	2	10	6112	6121	0 %	60 %	20 %	20 %	403060710
6	NC_018526	GAGAT	2	10	6830	6839	40 %	20 %	40 %	0 %	403060711
7	NC_018526	TGAAA	2	10	9967	9976	60 %	20 %	20 %	0 %	403060712
8	NC_018526	CTATT	2	10	11204	11213	20 %	60 %	0 %	20 %	403060715
9	NC_018526	CTTTG	2	10	13433	13442	0 %	60 %	20 %	20 %	403060717
10	NC_018526	AACAG	2	10	13877	13886	60 %	0 %	20 %	20 %	403060718
11	NC_018526	CTTGT	2	10	15033	15042	0 %	60 %	20 %	20 %	403060718
12	NC_018526	TTTAT	2	10	24433	24442	20 %	80 %	0 %	0 %	403060721
13	NC_018526	AATGC	2	10	25399	25408	40 %	20 %	20 %	20 %	403060722
14	NC_018526	CTACG	2	10	30753	30762	20 %	20 %	20 %	40 %	403060728
15	NC_018526	GAACG	2	10	33039	33048	40 %	0 %	40 %	20 %	403060729
16	NC_018526	AAACC	2	10	33175	33184	60 %	0 %	0 %	40 %	403060729
17	NC_018526	ATTCT	2	10	34522	34531	20 %	60 %	0 %	20 %	403060729
18	NC_018526	GCCAT	2	10	34997	35006	20 %	20 %	20 %	40 %	403060729
19	NC_018526	AAATG	2	10	36083	36092	60 %	20 %	20 %	0 %	403060730
20	NC_018526	AGCAG	2	10	38714	38723	40 %	0 %	40 %	20 %	403060733
21	NC_018526	CTATT	2	10	38939	38948	20 %	60 %	0 %	20 %	403060733
22	NC_018526	CTATT	2	10	41501	41510	20 %	60 %	0 %	20 %	403060735
23	NC_018526	GAAGC	2	10	42679	42688	40 %	0 %	40 %	20 %	403060736
24	NC_018526	AGCGG	2	10	45785	45794	20 %	0 %	60 %	20 %	403060739
25	NC_018526	TTAGT	2	10	47401	47410	20 %	60 %	20 %	0 %	403060741
26	NC_018526	GAAGT	2	10	48048	48057	40 %	20 %	40 %	0 %	403060742
27	NC_018526	TTATC	2	10	48179	48188	20 %	60 %	0 %	20 %	403060742
28	NC_018526	TAATC	2	10	48287	48296	40 %	40 %	0 %	20 %	403060742
29	NC_018526	TCAAT	2	10	48546	48555	40 %	40 %	0 %	20 %	403060743
30	NC_018526	TTATT	2	10	48799	48808	20 %	80 %	0 %	0 %	403060743
31	NC_018526	GAGAA	2	10	52305	52314	60 %	0 %	40 %	0 %	403060747
32	NC_018526	GCAGA	2	10	53786	53795	40 %	0 %	40 %	20 %	403060749
33	NC_018526	GGGCT	2	10	54257	54266	0 %	20 %	60 %	20 %	403060749
34	NC_018526	TGAAT	2	10	55880	55889	40 %	40 %	20 %	0 %	403060751
35	NC_018526	AGCAG	2	10	60020	60029	40 %	0 %	40 %	20 %	403060754
36	NC_018526	GCCCT	2	10	62842	62851	0 %	20 %	20 %	60 %	403060757
37	NC_018526	TTGCT	2	10	65941	65950	0 %	60 %	20 %	20 %	403060759
38	NC_018526	GTATC	2	10	69228	69237	20 %	40 %	20 %	20 %	403060762
39	NC_018526	TGGAT	2	10	71222	71231	20 %	40 %	40 %	0 %	403060766
40	NC_018526	TTATG	2	10	71432	71441	20 %	60 %	20 %	0 %	403060767
41	NC_018526	AAATT	2	10	72323	72332	60 %	40 %	0 %	0 %	403060768
42	NC_018526	TGGCG	2	10	73330	73339	0 %	20 %	60 %	20 %	403060770
43	NC_018526	AAAAC	2	10	73890	73899	80 %	0 %	0 %	20 %	403060771
44	NC_018526	TACAC	2	10	74304	74313	40 %	20 %	0 %	40 %	403060772
45	NC_018526	GAAAA	2	10	75183	75192	80 %	0 %	20 %	0 %	403060773
46	NC_018526	GTCTT	2	10	75471	75480	0 %	60 %	20 %	20 %	403060774
47	NC_018526	TTTGG	2	10	75602	75611	0 %	60 %	40 %	0 %	403060774
48	NC_018526	TAAGA	2	10	78935	78944	60 %	20 %	20 %	0 %	403060782
49	NC_018526	AGAAT	2	10	83723	83732	60 %	20 %	20 %	0 %	403060789
50	NC_018526	GAAAA	2	10	86049	86058	80 %	0 %	20 %	0 %	403060795
51	NC_018526	TGACT	2	10	86444	86453	20 %	40 %	20 %	20 %	403060795
52	NC_018526	TTTTC	2	10	94502	94511	0 %	80 %	0 %	20 %	403060797
53	NC_018526	TTTGG	2	10	96798	96807	0 %	60 %	40 %	0 %	403060801
54	NC_018526	ATTGC	2	10	97263	97272	20 %	40 %	20 %	20 %	403060801
55	NC_018526	GCTTT	2	10	97494	97503	0 %	60 %	20 %	20 %	403060802
56	NC_018526	AGAAA	2	10	97952	97961	80 %	0 %	20 %	0 %	403060802
57	NC_018526	GACTT	2	10	99531	99540	20 %	40 %	20 %	20 %	403060803
58	NC_018526	CTGGG	2	10	103751	103760	0 %	20 %	60 %	20 %	403060807
59	NC_018526	CCGTT	2	10	109635	109644	0 %	40 %	20 %	40 %	403060810
60	NC_018526	GGCCT	2	10	113175	113184	0 %	20 %	40 %	40 %	403060813
61	NC_018526	GTCAA	2	10	113272	113281	40 %	20 %	20 %	20 %	403060813
62	NC_018526	GCTTG	2	10	115123	115132	0 %	40 %	40 %	20 %	403060815
63	NC_018526	TGGTT	2	10	115251	115260	0 %	60 %	40 %	0 %	403060815
64	NC_018526	GGTCA	2	10	115550	115559	20 %	20 %	40 %	20 %	403060815
65	NC_018526	AAGGA	2	10	116640	116649	60 %	0 %	40 %	0 %	403060818
66	NC_018526	GGCAA	2	10	117198	117207	40 %	0 %	40 %	20 %	403060820
67	NC_018526	TTGGT	2	10	119586	119595	0 %	60 %	40 %	0 %	403060822
68	NC_018526	CTGGA	2	10	120988	120997	20 %	20 %	40 %	20 %	403060824
69	NC_018526	AGCAG	2	10	121344	121353	40 %	0 %	40 %	20 %	403060824
70	NC_018526	GGCCG	2	10	121525	121534	0 %	0 %	60 %	40 %	403060824
71	NC_018526	AATCA	2	10	121964	121973	60 %	20 %	0 %	20 %	403060825
72	NC_018526	AGGTG	2	10	122652	122661	20 %	20 %	60 %	0 %	403060825
73	NC_018526	ACTTT	2	10	126233	126242	20 %	60 %	0 %	20 %	403060830
74	NC_018526	TAGCG	2	10	129331	129340	20 %	20 %	40 %	20 %	403060834
75	NC_018526	ATCAA	2	10	130492	130501	60 %	20 %	0 %	20 %	403060836
76	NC_018526	CGTAT	2	10	131764	131773	20 %	40 %	20 %	20 %	403060837
77	NC_018526	ATCCA	2	10	131855	131864	40 %	20 %	0 %	40 %	403060837
78	NC_018526	CAAGA	2	10	132631	132640	60 %	0 %	20 %	20 %	403060837
79	NC_018526	AAGCT	2	10	133061	133070	40 %	20 %	20 %	20 %	403060837
80	NC_018526	AAGAA	2	10	135321	135330	80 %	0 %	20 %	0 %	403060838
81	NC_018526	GCAGT	2	10	135611	135620	20 %	20 %	40 %	20 %	403060838
82	NC_018526	ATCCA	2	10	135722	135731	40 %	20 %	0 %	40 %	403060838
83	NC_018526	TACGA	2	10	136223	136232	40 %	20 %	20 %	20 %	403060838
84	NC_018526	GTTTA	2	10	140219	140228	20 %	60 %	20 %	0 %	403060841
85	NC_018526	GCATG	2	10	141741	141750	20 %	20 %	40 %	20 %	403060843
86	NC_018526	AAAAT	2	10	142154	142163	80 %	20 %	0 %	0 %	403060843
87	NC_018526	GGGTC	2	10	146778	146787	0 %	20 %	60 %	20 %	403060848
88	NC_018526	TTTCA	2	10	147748	147757	20 %	60 %	0 %	20 %	403060849
89	NC_018526	TGGTC	2	10	150934	150943	0 %	40 %	40 %	20 %	403060852
90	NC_018526	GTCTT	2	10	151889	151898	0 %	60 %	20 %	20 %	403060853
91	NC_018526	TTGGA	2	10	154405	154414	20 %	40 %	40 %	0 %	403060854
92	NC_018526	TCATC	2	10	155278	155287	20 %	40 %	0 %	40 %	403060856
93	NC_018526	CTTGG	2	10	155447	155456	0 %	40 %	40 %	20 %	403060856
94	NC_018526	TTTTC	2	10	156466	156475	0 %	80 %	0 %	20 %	403060857
95	NC_018526	CACCT	2	10	157029	157038	20 %	20 %	0 %	60 %	403060857
96	NC_018526	CCAGC	2	10	160595	160604	20 %	0 %	20 %	60 %	403060857
97	NC_018526	TCCAA	2	10	160729	160738	40 %	20 %	0 %	40 %	403060857
98	NC_018526	CCAGC	2	10	160823	160832	20 %	0 %	20 %	60 %	403060857
99	NC_018526	AGACT	2	10	163718	163727	40 %	20 %	20 %	20 %	403060859
100	NC_018526	ATACA	2	10	168837	168846	60 %	20 %	0 %	20 %	403060864
101	NC_018526	GGTTT	2	10	170995	171004	0 %	60 %	40 %	0 %	403060865
102	NC_018526	TTATC	2	10	171871	171880	20 %	60 %	0 %	20 %	403060866
103	NC_018526	TCTGG	2	10	175306	175315	0 %	40 %	40 %	20 %	403060869
104	NC_018526	TTCAA	2	10	175846	175855	40 %	40 %	0 %	20 %	403060869
105	NC_018526	TGATT	2	10	180691	180700	20 %	60 %	20 %	0 %	403060873
106	NC_018526	GAAGC	2	10	182808	182817	40 %	0 %	40 %	20 %	403060874
107	NC_018526	GGAAA	2	10	188177	188186	60 %	0 %	40 %	0 %	403060877
108	NC_018526	CTGGT	2	10	188673	188682	0 %	40 %	40 %	20 %	403060878
109	NC_018526	CCAGA	2	10	188726	188735	40 %	0 %	20 %	40 %	403060878
110	NC_018526	AGCAG	2	10	190774	190783	40 %	0 %	40 %	20 %	403060880
111	NC_018526	TTTTG	2	10	192306	192315	0 %	80 %	20 %	0 %	403060882
112	NC_018526	GAACA	2	10	192341	192350	60 %	0 %	20 %	20 %	403060882
113	NC_018526	TTTTA	2	10	193530	193539	20 %	80 %	0 %	0 %	403060883
114	NC_018526	AAGGA	2	10	195347	195356	60 %	0 %	40 %	0 %	403060884
115	NC_018526	AGTAA	2	10	195818	195827	60 %	20 %	20 %	0 %	403060884
116	NC_018526	CAAGT	2	10	197576	197585	40 %	20 %	20 %	20 %	403060885
117	NC_018526	ATGGA	2	10	198246	198255	40 %	20 %	40 %	0 %	403060885
118	NC_018526	TTTGG	2	10	201363	201372	0 %	60 %	40 %	0 %	403060887
119	NC_018526	TCTAC	2	10	202143	202152	20 %	40 %	0 %	40 %	403060888
120	NC_018526	AATGT	2	10	202290	202299	40 %	40 %	20 %	0 %	403060888
121	NC_018526	AGCAG	2	10	206430	206439	40 %	0 %	40 %	20 %	403060894
122	NC_018526	GACCA	2	10	209259	209268	40 %	0 %	20 %	40 %	403060895
123	NC_018526	GTTTT	2	10	210368	210377	0 %	80 %	20 %	0 %	403060896
124	NC_018526	CCATA	2	10	210470	210479	40 %	20 %	0 %	40 %	403060897
125	NC_018526	AGCTC	2	10	213669	213678	20 %	20 %	20 %	40 %	403060899
126	NC_018526	CCAAG	2	10	216360	216369	40 %	0 %	20 %	40 %	403060902
127	NC_018526	AAGGT	2	10	216668	216677	40 %	20 %	40 %	0 %	403060903
128	NC_018526	TCCAA	2	10	217104	217113	40 %	20 %	0 %	40 %	403060904
129	NC_018526	AAAGA	2	10	220009	220018	80 %	0 %	20 %	0 %	403060906
130	NC_018526	AGGGC	2	10	223534	223543	20 %	0 %	60 %	20 %	403060909
131	NC_018526	AGCAG	2	10	223567	223576	40 %	0 %	40 %	20 %	403060909
132	NC_018526	ATCAA	2	10	224390	224399	60 %	20 %	0 %	20 %	403060910
133	NC_018526	CCTTG	2	10	225957	225966	0 %	40 %	20 %	40 %	403060911
134	NC_018526	ACCAA	2	10	226966	226975	60 %	0 %	0 %	40 %	403060912
135	NC_018526	TAATG	2	10	229452	229461	40 %	40 %	20 %	0 %	403060914
136	NC_018526	TTGGA	2	10	233955	233964	20 %	40 %	40 %	0 %	403060916
137	NC_018526	CTACT	2	10	235056	235065	20 %	40 %	0 %	40 %	403060917
138	NC_018526	TGGGC	2	10	235151	235160	0 %	20 %	60 %	20 %	403060917
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149	NC_018526	TGGCA	2	10	246041	246050	20 %	20 %	40 %	20 %	403060927
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157	NC_018526	TGACC	2	10	261703	261712	20 %	20 %	20 %	40 %	403060943
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159	NC_018526	AGCTG	2	10	267808	267817	20 %	20 %	40 %	20 %	403060946
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165	NC_018526	TCTTG	2	10	271441	271450	0 %	60 %	20 %	20 %	403060948
166	NC_018526	CTATT	2	10	272556	272565	20 %	60 %	0 %	20 %	403060950
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169	NC_018526	CCTAG	2	10	276824	276833	20 %	20 %	20 %	40 %	403060953
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172	NC_018526	TGGTC	2	10	281099	281108	0 %	40 %	40 %	20 %	403060957
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174	NC_018526	CAGGG	2	10	281310	281319	20 %	0 %	60 %	20 %	403060957
175	NC_018526	CCTCT	2	10	281403	281412	0 %	40 %	0 %	60 %	403060957
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249	NC_018526	CAGGT	2	10	408575	408584	20 %	20 %	40 %	20 %	403061069
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254	NC_018526	TGGAT	2	10	414010	414019	20 %	40 %	40 %	0 %	403061075
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256	NC_018526	TGTAT	2	10	417753	417762	20 %	60 %	20 %	0 %	403061079
257	NC_018526	TTAAT	2	10	425263	425272	40 %	60 %	0 %	0 %	403061081
258	NC_018526	CTTGA	2	10	425504	425513	20 %	40 %	20 %	20 %	403061081
259	NC_018526	ATAGT	2	10	425589	425598	40 %	40 %	20 %	0 %	403061081
260	NC_018526	GGAAA	2	10	426087	426096	60 %	0 %	40 %	0 %	403061082
261	NC_018526	ATTTT	2	10	427240	427249	20 %	80 %	0 %	0 %	403061083
262	NC_018526	AGAAT	2	10	428485	428494	60 %	20 %	20 %	0 %	403061085
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