MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Secondary endosymbiont of Heteropsylla cubana chromosome

Total Repeats: 12892

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_018420	T	8	8	49169	49176	0 %	100 %	0 %	0 %	400406029
502	NC_018420	CTA	2	6	49177	49182	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	400406029
503	NC_018420	ATT	2	6	49191	49196	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	400406029
504	NC_018420	TTA	2	6	49197	49202	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	400406029
505	NC_018420	GCTGA	2	10	49261	49270	20 %	20 %	40 %	20 %	400406029
506	NC_018420	ACG	2	6	49430	49435	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	400406029
507	NC_018420	CAC	2	6	49436	49441	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	400406029
508	NC_018420	ATA	2	6	49458	49463	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400406029
509	NC_018420	GATT	2	8	49471	49478	25 %	50 %	25 %	0 %	400406029
510	NC_018420	GAC	2	6	49540	49545	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	400406029
511	NC_018420	TTA	2	6	49555	49560	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	400406029
512	NC_018420	TTC	2	6	49567	49572	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	400406029
513	NC_018420	TC	3	6	49660	49665	0 %	50 %	0 %	50 %	400406029
514	NC_018420	T	6	6	49672	49677	0 %	100 %	0 %	0 %	400406029
515	NC_018420	TAC	2	6	49703	49708	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	400406029
516	NC_018420	TCT	2	6	49750	49755	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	400406029
517	NC_018420	CTA	2	6	49803	49808	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	400406029
518	NC_018420	C	6	6	49816	49821	0 %	0 %	0 %	100 %	400406029
519	NC_018420	CTC	2	6	49867	49872	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	400406029
520	NC_018420	A	7	7	49897	49903	100 %	0 %	0 %	0 %	400406029
521	NC_018420	CAG	2	6	49954	49959	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	400406029
522	NC_018420	A	6	6	49978	49983	100 %	0 %	0 %	0 %	400406029
523	NC_018420	TTG	2	6	49997	50002	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	400406029
524	NC_018420	A	6	6	50022	50027	100 %	0 %	0 %	0 %	400406029
525	NC_018420	TAA	2	6	50063	50068	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400406029
526	NC_018420	ATCT	2	8	50219	50226	25 %	50 %	0 %	25 %	400406029
527	NC_018420	CAA	2	6	50235	50240	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	400406029
528	NC_018420	TCG	2	6	50253	50258	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	400406029
529	NC_018420	A	6	6	50295	50300	100 %	0 %	0 %	0 %	400406029
530	NC_018420	TCC	2	6	50378	50383	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	400406029
531	NC_018420	CGTTG	2	10	50388	50397	0 %	40 %	40 %	20 %	400406029
532	NC_018420	AGT	2	6	50405	50410	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	400406029
533	NC_018420	A	6	6	50436	50441	100 %	0 %	0 %	0 %	400406029
534	NC_018420	ATA	2	6	50501	50506	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400406029
535	NC_018420	TCC	2	6	50511	50516	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	400406029
536	NC_018420	TGT	2	6	50550	50555	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	400406029
537	NC_018420	T	7	7	50560	50566	0 %	100 %	0 %	0 %	400406029
538	NC_018420	GAT	2	6	52363	52368	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	400406030
539	NC_018420	CAT	2	6	52382	52387	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	400406030
540	NC_018420	GAG	2	6	52413	52418	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	400406030
541	NC_018420	TG	3	6	52423	52428	0 %	50 %	50 %	0 %	400406030
542	NC_018420	AAG	2	6	52458	52463	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	400406030
543	NC_018420	TCA	2	6	52541	52546	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	400406030
544	NC_018420	GACTAT	2	12	52588	52599	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	400406030
545	NC_018420	TACGT	2	10	52636	52645	20 %	40 %	20 %	20 %	400406030
546	NC_018420	ATA	2	6	52718	52723	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400406030
547	NC_018420	GAA	2	6	52763	52768	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	400406030
548	NC_018420	TAT	2	6	52855	52860	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	400406030
549	NC_018420	T	8	8	52892	52899	0 %	100 %	0 %	0 %	400406030
550	NC_018420	AAGC	2	8	52918	52925	50 %	0 %	25 %	25 %	400406030
551	NC_018420	TAA	2	6	52943	52948	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400406030
552	NC_018420	AT	3	6	53150	53155	50 %	50 %	0 %	0 %	400406031
553	NC_018420	TTA	2	6	53167	53172	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	400406031
554	NC_018420	AT	3	6	53185	53190	50 %	50 %	0 %	0 %	400406031
555	NC_018420	ATC	2	6	53241	53246	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	400406031
556	NC_018420	TTA	2	6	53248	53253	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	400406031
557	NC_018420	TC	4	8	53254	53261	0 %	50 %	0 %	50 %	400406031
558	NC_018420	ACTT	2	8	53275	53282	25 %	50 %	0 %	25 %	400406031
559	NC_018420	A	6	6	53294	53299	100 %	0 %	0 %	0 %	400406031
560	NC_018420	TGC	2	6	53364	53369	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	400406031
561	NC_018420	CTA	2	6	53407	53412	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	400406031
562	NC_018420	TGT	2	6	53475	53480	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	400406031
563	NC_018420	TCTT	2	8	53504	53511	0 %	75 %	0 %	25 %	400406031
564	NC_018420	CAT	2	6	53516	53521	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	400406031
565	NC_018420	AAAG	2	8	53524	53531	75 %	0 %	25 %	0 %	400406031
566	NC_018420	CGA	2	6	53539	53544	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	400406031
567	NC_018420	A	7	7	53561	53567	100 %	0 %	0 %	0 %	400406031
568	NC_018420	CAG	2	6	53654	53659	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	400406031
569	NC_018420	TAA	2	6	53730	53735	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400406031
570	NC_018420	AAC	2	6	53752	53757	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	400406031
571	NC_018420	GTA	2	6	53759	53764	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	400406031
572	NC_018420	AAT	2	6	53774	53779	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400406031
573	NC_018420	CTCTT	2	10	53894	53903	0 %	60 %	0 %	40 %	400406032
574	NC_018420	GAA	2	6	53905	53910	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	400406032
575	NC_018420	GAAA	2	8	53916	53923	75 %	0 %	25 %	0 %	400406032
576	NC_018420	AATCTG	2	12	54005	54016	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	400406032
577	NC_018420	CTT	2	6	54124	54129	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	400406032
578	NC_018420	TAT	2	6	54207	54212	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	400406032
579	NC_018420	TTCC	2	8	54265	54272	0 %	50 %	0 %	50 %	400406032
580	NC_018420	AAGGA	2	10	54320	54329	60 %	0 %	40 %	0 %	400406032
581	NC_018420	AGAAA	2	10	54359	54368	80 %	0 %	20 %	0 %	400406032
582	NC_018420	GTA	2	6	54376	54381	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	400406032
583	NC_018420	ACT	2	6	54429	54434	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	400406032
584	NC_018420	TGAC	2	8	54482	54489	25 %	25 %	25 %	25 %	400406032
585	NC_018420	GAGAT	2	10	54590	54599	40 %	20 %	40 %	0 %	400406032
586	NC_018420	CTGA	2	8	54736	54743	25 %	25 %	25 %	25 %	400406032
587	NC_018420	GAA	2	6	54766	54771	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	400406032
588	NC_018420	AGT	2	6	54837	54842	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	400406032
589	NC_018420	TGA	2	6	54882	54887	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	400406032
590	NC_018420	CGT	2	6	54892	54897	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	400406032
591	NC_018420	AACCC	2	10	54926	54935	40 %	0 %	0 %	60 %	400406032
592	NC_018420	ATCT	2	8	55052	55059	25 %	50 %	0 %	25 %	400406032
593	NC_018420	AT	3	6	55061	55066	50 %	50 %	0 %	0 %	400406032
594	NC_018420	GAA	2	6	55084	55089	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	400406032
595	NC_018420	A	6	6	55105	55110	100 %	0 %	0 %	0 %	400406032
596	NC_018420	TGA	2	6	55113	55118	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	400406032
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599	NC_018420	AAC	2	6	55178	55183	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	400406032
600	NC_018420	TAA	2	6	55200	55205	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400406032
601	NC_018420	TAAA	2	8	55217	55224	75 %	25 %	0 %	0 %	400406032
602	NC_018420	A	6	6	55222	55227	100 %	0 %	0 %	0 %	400406032
603	NC_018420	GTA	2	6	55229	55234	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	400406032
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607	NC_018420	AAG	2	6	55493	55498	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	400406032
608	NC_018420	GCA	2	6	55537	55542	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	400406032
609	NC_018420	AAT	3	9	55553	55561	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400406032
610	NC_018420	AATT	2	8	55702	55709	50 %	50 %	0 %	0 %	400406033
611	NC_018420	AT	3	6	55736	55741	50 %	50 %	0 %	0 %	400406033
612	NC_018420	ACT	2	6	55743	55748	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	400406033
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614	NC_018420	ATTA	2	8	55921	55928	50 %	50 %	0 %	0 %	400406033
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616	NC_018420	A	6	6	56830	56835	100 %	0 %	0 %	0 %	400406034
617	NC_018420	T	8	8	56872	56879	0 %	100 %	0 %	0 %	400406034
618	NC_018420	AT	3	6	56899	56904	50 %	50 %	0 %	0 %	400406034
619	NC_018420	CAAT	2	8	56967	56974	50 %	25 %	0 %	25 %	400406034
620	NC_018420	ATT	3	9	57065	57073	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	400406034
621	NC_018420	AAT	2	6	57077	57082	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400406034
622	NC_018420	ATC	2	6	57083	57088	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	400406034
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624	NC_018420	TCT	2	6	57123	57128	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	400406034
625	NC_018420	ATA	2	6	57150	57155	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400406034
626	NC_018420	TAA	2	6	57163	57168	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400406034
627	NC_018420	CCA	2	6	57204	57209	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	400406034
628	NC_018420	CAC	2	6	57340	57345	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	400406034
629	NC_018420	CAT	2	6	57386	57391	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	400406034
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633	NC_018420	TAA	2	6	58884	58889	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400406035
634	NC_018420	TCA	2	6	58909	58914	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	400406035
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752	NC_018420	A	6	6	78333	78338	100 %	0 %	0 %	0 %	400406041
753	NC_018420	A	8	8	78435	78442	100 %	0 %	0 %	0 %	400406041
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