MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Coding Repeats of Sinorhizobium fredii HH103 plasmid pSfHH103d

Total Repeats: 768

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_018303	ATC	2	6	31428	31433	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	399995606
502	NC_018303	CCAAGC	2	12	31515	31526	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	399995606
503	NC_018303	ACAT	2	8	31551	31558	50 %	25 %	0 %	25 %	399995606
504	NC_018303	TGC	2	6	31583	31588	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995606
505	NC_018303	TGC	2	6	31677	31682	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995606
506	NC_018303	GC	4	8	31779	31786	0 %	0 %	50 %	50 %	399995606
507	NC_018303	A	6	6	31817	31822	100 %	0 %	0 %	0 %	399995606
508	NC_018303	CGA	2	6	31825	31830	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995606
509	NC_018303	CCG	2	6	31838	31843	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995606
510	NC_018303	GCC	2	6	31875	31880	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995606
511	NC_018303	TGG	2	6	31918	31923	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	399995606
512	NC_018303	CGC	2	6	31946	31951	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995606
513	NC_018303	TGG	2	6	31960	31965	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	399995606
514	NC_018303	TCCT	2	8	32021	32028	0 %	50 %	0 %	50 %	399995606
515	NC_018303	AAGCC	2	10	32059	32068	40 %	0 %	20 %	40 %	399995606
516	NC_018303	AACG	2	8	32079	32086	50 %	0 %	25 %	25 %	399995606
517	NC_018303	CGG	2	6	32137	32142	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995607
518	NC_018303	GAA	2	6	32161	32166	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	399995607
519	NC_018303	CTC	2	6	32188	32193	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	399995607
520	NC_018303	GAA	2	6	32349	32354	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	399995608
521	NC_018303	CCG	2	6	32361	32366	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995608
522	NC_018303	CAT	2	6	32415	32420	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	399995608
523	NC_018303	CTG	2	6	32427	32432	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995608
524	NC_018303	CGC	2	6	32592	32597	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995608
525	NC_018303	GAG	2	6	32653	32658	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	399995608
526	NC_018303	GCT	2	6	32711	32716	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995608
527	NC_018303	CGT	2	6	32723	32728	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995608
528	NC_018303	CGA	2	6	32768	32773	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995608
529	NC_018303	TGC	2	6	32774	32779	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995608
530	NC_018303	TGT	2	6	32881	32886	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	399995608
531	NC_018303	GCTG	2	8	32891	32898	0 %	25 %	50 %	25 %	399995608
532	NC_018303	CCA	2	6	32939	32944	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	399995608
533	NC_018303	TTG	2	6	32962	32967	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	399995608
534	NC_018303	GCG	2	6	32989	32994	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995608
535	NC_018303	ACCG	2	8	33012	33019	25 %	0 %	25 %	50 %	399995608
536	NC_018303	CGA	2	6	33044	33049	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995608
537	NC_018303	CTC	2	6	33105	33110	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	399995609
538	NC_018303	GCC	2	6	33240	33245	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995609
539	NC_018303	GAC	2	6	33259	33264	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995609
540	NC_018303	CGATCT	2	12	33297	33308	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	399995609
541	NC_018303	CG	3	6	33342	33347	0 %	0 %	50 %	50 %	399995609
542	NC_018303	TCG	2	6	33387	33392	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995609
543	NC_018303	TCG	2	6	33548	33553	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995609
544	NC_018303	GCT	2	6	33651	33656	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995609
545	NC_018303	ATG	2	6	33742	33747	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	399995609
546	NC_018303	CGC	2	6	33777	33782	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995609
547	NC_018303	GAT	2	6	33852	33857	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	399995609
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549	NC_018303	CAGC	2	8	34017	34024	25 %	0 %	25 %	50 %	399995609
550	NC_018303	GC	3	6	34038	34043	0 %	0 %	50 %	50 %	399995609
551	NC_018303	CAG	2	6	34108	34113	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995609
552	NC_018303	GT	3	6	34149	34154	0 %	50 %	50 %	0 %	399995609
553	NC_018303	CGT	2	6	34161	34166	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995609
554	NC_018303	GGA	2	6	34232	34237	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	399995609
555	NC_018303	CGG	2	6	34427	34432	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995609
556	NC_018303	GT	3	6	34491	34496	0 %	50 %	50 %	0 %	399995609
557	NC_018303	CCA	2	6	34554	34559	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	399995609
558	NC_018303	CGAC	2	8	34578	34585	25 %	0 %	25 %	50 %	399995609
559	NC_018303	GAA	2	6	34612	34617	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	399995609
560	NC_018303	CTG	2	6	34630	34635	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995609
561	NC_018303	CTT	2	6	34639	34644	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	399995609
562	NC_018303	GCGT	2	8	34647	34654	0 %	25 %	50 %	25 %	399995609
563	NC_018303	CGA	2	6	34699	34704	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995609
564	NC_018303	CGG	2	6	34761	34766	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995609
565	NC_018303	CGG	2	6	34836	34841	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995609
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572	NC_018303	CG	3	6	34974	34979	0 %	0 %	50 %	50 %	399995609
573	NC_018303	CTC	2	6	35086	35091	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	399995609
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575	NC_018303	CTCG	2	8	35181	35188	0 %	25 %	25 %	50 %	399995609
576	NC_018303	CG	4	8	35187	35194	0 %	0 %	50 %	50 %	399995609
577	NC_018303	GC	3	6	35222	35227	0 %	0 %	50 %	50 %	399995609
578	NC_018303	TTGGA	2	10	35396	35405	20 %	40 %	40 %	0 %	399995610
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582	NC_018303	CGA	2	6	35687	35692	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995610
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584	NC_018303	GCT	2	6	35757	35762	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995610
585	NC_018303	GCA	2	6	35862	35867	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995610
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587	NC_018303	CCT	2	6	35894	35899	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	399995610
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589	NC_018303	CGG	2	6	36053	36058	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995610
590	NC_018303	CGC	2	6	36060	36065	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995610
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592	NC_018303	GCC	2	6	36109	36114	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995610
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598	NC_018303	CG	3	6	36336	36341	0 %	0 %	50 %	50 %	399995610
599	NC_018303	ACC	2	6	36606	36611	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	399995611
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609	NC_018303	CCCCT	2	10	37150	37159	0 %	20 %	0 %	80 %	399995613
610	NC_018303	GAG	2	6	37252	37257	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	399995613
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613	NC_018303	GCC	2	6	37287	37292	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995613
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616	NC_018303	GCC	2	6	37429	37434	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995613
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621	NC_018303	GCTT	2	8	37688	37695	0 %	50 %	25 %	25 %	399995614
622	NC_018303	GCT	2	6	37705	37710	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995614
623	NC_018303	TTG	2	6	37750	37755	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	399995614
624	NC_018303	CGC	2	6	37759	37764	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995614
625	NC_018303	GCA	2	6	37803	37808	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995614
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755	NC_018303	GGC	2	6	47121	47126	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995623
756	NC_018303	TCCGC	2	10	47144	47153	0 %	20 %	20 %	60 %	399995623
757	NC_018303	GCG	2	6	47213	47218	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995623
758	NC_018303	ATCG	2	8	47226	47233	25 %	25 %	25 %	25 %	399995623
759	NC_018303	AGCG	2	8	47242	47249	25 %	0 %	50 %	25 %	399995623
760	NC_018303	CGC	2	6	47258	47263	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995623
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763	NC_018303	CG	4	8	47386	47393	0 %	0 %	50 %	50 %	399995623
764	NC_018303	TGG	2	6	47416	47421	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	399995623
765	NC_018303	GCC	2	6	47437	47442	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995623
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