MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Sinorhizobium fredii HH103 plasmid pSfHH103d

Total Repeats: 4644

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_018299	CCGC	2	8	210516	210523	0 %	0 %	25 %	75 %	399995522
4002	NC_018299	CGC	3	9	210521	210529	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995522
4003	NC_018299	CGGC	2	8	210552	210559	0 %	0 %	50 %	50 %	399995522
4004	NC_018299	CGG	3	9	210574	210582	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995522
4005	NC_018299	GGC	2	6	210665	210670	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995522
4006	NC_018299	CGC	2	6	210694	210699	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995522
4007	NC_018299	CTG	2	6	210700	210705	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995522
4008	NC_018299	GGC	2	6	210766	210771	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995522
4009	NC_018299	CCG	2	6	210778	210783	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995522
4010	NC_018299	ACG	2	6	210786	210791	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995522
4011	NC_018299	TCA	2	6	210819	210824	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	399995522
4012	NC_018299	GCA	2	6	211015	211020	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995523
4013	NC_018299	CGC	2	6	211034	211039	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995523
4014	NC_018299	TCCT	2	8	211073	211080	0 %	50 %	0 %	50 %	399995523
4015	NC_018299	CAT	2	6	211121	211126	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	399995523
4016	NC_018299	CCG	2	6	211148	211153	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995523
4017	NC_018299	CGT	2	6	211162	211167	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995523
4018	NC_018299	GGA	2	6	211231	211236	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	399995523
4019	NC_018299	GCT	3	9	211269	211277	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995524
4020	NC_018299	TTG	2	6	211291	211296	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	399995524
4021	NC_018299	TGG	2	6	211297	211302	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	399995524
4022	NC_018299	ACG	3	9	211307	211315	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995524
4023	NC_018299	ACG	2	6	211361	211366	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995524
4024	NC_018299	AGA	2	6	211437	211442	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	399995524
4025	NC_018299	TCA	2	6	211527	211532	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	399995524
4026	NC_018299	ATC	2	6	211547	211552	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	399995524
4027	NC_018299	GGAG	2	8	211575	211582	25 %	0 %	75 %	0 %	399995524
4028	NC_018299	GGC	2	6	211850	211855	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995525
4029	NC_018299	CAA	2	6	211884	211889	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	399995525
4030	NC_018299	CCA	2	6	212282	212287	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	399995526
4031	NC_018299	AGA	2	6	212306	212311	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	399995526
4032	NC_018299	CCA	2	6	212339	212344	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	399995526
4033	NC_018299	GCAA	2	8	212380	212387	50 %	0 %	25 %	25 %	399995526
4034	NC_018299	GAA	2	6	212395	212400	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	399995526
4035	NC_018299	CGCC	2	8	212466	212473	0 %	0 %	25 %	75 %	399995526
4036	NC_018299	GGCACC	2	12	212541	212552	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	399995526
4037	NC_018299	CGG	2	6	212553	212558	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995526
4038	NC_018299	AAG	2	6	212569	212574	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	399995526
4039	NC_018299	GAA	2	6	212963	212968	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	399995527
4040	NC_018299	GC	3	6	212971	212976	0 %	0 %	50 %	50 %	399995527
4041	NC_018299	CGC	2	6	213005	213010	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995527
4042	NC_018299	CTGG	2	8	213032	213039	0 %	25 %	50 %	25 %	399995527
4043	NC_018299	GGC	3	9	213049	213057	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995527
4044	NC_018299	AGG	2	6	213069	213074	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	399995527
4045	NC_018299	CGC	2	6	213085	213090	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995527
4046	NC_018299	CGC	2	6	213209	213214	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995528
4047	NC_018299	GT	3	6	213250	213255	0 %	50 %	50 %	0 %	399995528
4048	NC_018299	CG	3	6	213268	213273	0 %	0 %	50 %	50 %	399995528
4049	NC_018299	GCA	2	6	213286	213291	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995528
4050	NC_018299	CGC	2	6	213375	213380	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995528
4051	NC_018299	GC	3	6	213431	213436	0 %	0 %	50 %	50 %	399995528
4052	NC_018299	TCG	2	6	213445	213450	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995528
4053	NC_018299	TGAG	2	8	213483	213490	25 %	25 %	50 %	0 %	399995528
4054	NC_018299	CGA	2	6	213893	213898	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995529
4055	NC_018299	CG	3	6	213916	213921	0 %	0 %	50 %	50 %	399995529
4056	NC_018299	CGT	2	6	213963	213968	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995529
4057	NC_018299	GCG	2	6	213973	213978	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995529
4058	NC_018299	ATG	2	6	214042	214047	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	399995529
4059	NC_018299	TCG	2	6	214079	214084	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995529
4060	NC_018299	GCG	2	6	214102	214107	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995529
4061	NC_018299	CGC	2	6	214196	214201	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995529
4062	NC_018299	GGA	2	6	214209	214214	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	399995529
4063	NC_018299	CGAT	2	8	214239	214246	25 %	25 %	25 %	25 %	399995529
4064	NC_018299	TCA	2	6	214276	214281	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	399995530
4065	NC_018299	CCG	2	6	214333	214338	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995530
4066	NC_018299	GAT	3	9	214384	214392	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	399995530
4067	NC_018299	CGGC	2	8	214441	214448	0 %	0 %	50 %	50 %	399995530
4068	NC_018299	TTC	2	6	214487	214492	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	399995530
4069	NC_018299	CGC	2	6	214542	214547	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995530
4070	NC_018299	GC	3	6	214564	214569	0 %	0 %	50 %	50 %	399995530
4071	NC_018299	AGG	2	6	214596	214601	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	399995530
4072	NC_018299	ACG	2	6	214623	214628	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995530
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4074	NC_018299	CAT	2	6	214684	214689	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	399995530
4075	NC_018299	CG	3	6	214716	214721	0 %	0 %	50 %	50 %	399995530
4076	NC_018299	CCT	2	6	214722	214727	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	399995530
4077	NC_018299	GAG	2	6	214747	214752	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	399995530
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4079	NC_018299	GAT	2	6	214831	214836	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	399995530
4080	NC_018299	TTG	2	6	214898	214903	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	399995530
4081	NC_018299	GCG	2	6	214949	214954	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995530
4082	NC_018299	CGAG	2	8	214962	214969	25 %	0 %	50 %	25 %	399995530
4083	NC_018299	TG	3	6	214976	214981	0 %	50 %	50 %	0 %	399995530
4084	NC_018299	ACGCGG	2	12	215061	215072	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	399995530
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4086	NC_018299	GCCG	2	8	215154	215161	0 %	0 %	50 %	50 %	399995530
4087	NC_018299	CGA	2	6	215289	215294	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995530
4088	NC_018299	TCG	2	6	215358	215363	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995530
4089	NC_018299	ACC	2	6	215411	215416	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	399995530
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4091	NC_018299	TCG	2	6	215493	215498	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995530
4092	NC_018299	ACCCG	2	10	215509	215518	20 %	0 %	20 %	60 %	399995530
4093	NC_018299	AGA	2	6	215523	215528	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	399995530
4094	NC_018299	GCC	2	6	215578	215583	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995530
4095	NC_018299	CGG	2	6	215680	215685	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995530
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4097	NC_018299	GC	3	6	215747	215752	0 %	0 %	50 %	50 %	399995530
4098	NC_018299	ACG	2	6	215768	215773	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995530
4099	NC_018299	CG	3	6	215783	215788	0 %	0 %	50 %	50 %	399995530
4100	NC_018299	CGA	2	6	215823	215828	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995530
4101	NC_018299	GC	3	6	215871	215876	0 %	0 %	50 %	50 %	399995530
4102	NC_018299	GCCG	2	8	215898	215905	0 %	0 %	50 %	50 %	399995530
4103	NC_018299	GCCAGC	2	12	216102	216113	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	399995530
4104	NC_018299	CGA	2	6	216114	216119	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995530
4105	NC_018299	GAT	2	6	216220	216225	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	399995531
4106	NC_018299	GCC	2	6	216275	216280	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995531
4107	NC_018299	GCC	2	6	216324	216329	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995531
4108	NC_018299	GAC	2	6	216369	216374	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995531
4109	NC_018299	GCC	2	6	216378	216383	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995531
4110	NC_018299	CCT	2	6	216404	216409	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	399995531
4111	NC_018299	CCG	2	6	216438	216443	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995532
4112	NC_018299	CAG	2	6	216492	216497	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995532
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4114	NC_018299	CG	3	6	216524	216529	0 %	0 %	50 %	50 %	399995532
4115	NC_018299	CTC	2	6	216556	216561	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	399995532
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4119	NC_018299	GT	3	6	216784	216789	0 %	50 %	50 %	0 %	399995533
4120	NC_018299	CAG	2	6	216962	216967	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995534
4121	NC_018299	GCC	3	9	216993	217001	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995534
4122	NC_018299	GAT	2	6	217019	217024	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	399995534
4123	NC_018299	GCTG	2	8	217114	217121	0 %	25 %	50 %	25 %	399995534
4124	NC_018299	GGC	2	6	217124	217129	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995534
4125	NC_018299	CGAC	2	8	217133	217140	25 %	0 %	25 %	50 %	399995534
4126	NC_018299	GCGA	2	8	217155	217162	25 %	0 %	50 %	25 %	399995534
4127	NC_018299	ATC	2	6	217227	217232	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	399995534
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4150	NC_018299	CG	4	8	218204	218211	0 %	0 %	50 %	50 %	399995534
4151	NC_018299	CGG	2	6	218232	218237	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995534
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4488	NC_018299	GCG	2	6	236880	236885	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995553
4489	NC_018299	CG	3	6	236940	236945	0 %	0 %	50 %	50 %	399995553
4490	NC_018299	GCCGTT	2	12	236992	237003	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995553
4491	NC_018299	GAC	2	6	237041	237046	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995553
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