MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Sinorhizobium fredii HH103 plasmid pSfHH103d

Total Repeats: 4644

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_018299	GCC	2	6	156484	156489	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995478
3002	NC_018299	CGG	2	6	156537	156542	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995478
3003	NC_018299	GGC	2	6	156567	156572	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995478
3004	NC_018299	ATC	2	6	156651	156656	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	399995478
3005	NC_018299	CAT	2	6	157066	157071	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	399995479
3006	NC_018299	ACG	2	6	157094	157099	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995479
3007	NC_018299	GAA	2	6	157101	157106	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	399995479
3008	NC_018299	TGC	2	6	157145	157150	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995479
3009	NC_018299	TTCGGC	2	12	157243	157254	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995479
3010	NC_018299	AGA	2	6	157259	157264	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	399995479
3011	NC_018299	GGT	2	6	157292	157297	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	399995479
3012	NC_018299	AAG	2	6	157402	157407	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	399995479
3013	NC_018299	AGG	2	6	157418	157423	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	399995479
3014	NC_018299	AAC	2	6	157593	157598	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	399995479
3015	NC_018299	AGT	2	6	157608	157613	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	399995479
3016	NC_018299	GCG	2	6	157655	157660	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995479
3017	NC_018299	CAAA	2	8	157712	157719	75 %	0 %	0 %	25 %	399995479
3018	NC_018299	ATG	2	6	157753	157758	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	399995479
3019	NC_018299	CGGTA	2	10	157780	157789	20 %	20 %	40 %	20 %	399995479
3020	NC_018299	GAC	2	6	157832	157837	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995479
3021	NC_018299	GAGC	2	8	157874	157881	25 %	0 %	50 %	25 %	399995479
3022	NC_018299	ACG	2	6	157899	157904	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995479
3023	NC_018299	AGA	2	6	157908	157913	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	399995479
3024	NC_018299	CTC	2	6	158644	158649	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	399995481
3025	NC_018299	CGC	2	6	158675	158680	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995481
3026	NC_018299	GAC	2	6	158683	158688	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995481
3027	NC_018299	GCC	2	6	158747	158752	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995481
3028	NC_018299	CCGG	3	12	158775	158786	0 %	0 %	50 %	50 %	399995481
3029	NC_018299	TGC	2	6	158826	158831	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995481
3030	NC_018299	TGGA	2	8	158840	158847	25 %	25 %	50 %	0 %	399995481
3031	NC_018299	GAGC	2	8	158848	158855	25 %	0 %	50 %	25 %	399995481
3032	NC_018299	TCG	2	6	158865	158870	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995481
3033	NC_018299	CGC	2	6	159419	159424	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995482
3034	NC_018299	CCTA	2	8	159425	159432	25 %	25 %	0 %	50 %	399995482
3035	NC_018299	CTG	2	6	159441	159446	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995482
3036	NC_018299	CGA	2	6	159485	159490	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995482
3037	NC_018299	CGG	2	6	159505	159510	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995482
3038	NC_018299	TCC	2	6	159601	159606	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	399995482
3039	NC_018299	GCC	2	6	159695	159700	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995482
3040	NC_018299	CGAC	2	8	159715	159722	25 %	0 %	25 %	50 %	399995482
3041	NC_018299	CTCCG	2	10	159726	159735	0 %	20 %	20 %	60 %	399995482
3042	NC_018299	CGC	2	6	159752	159757	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995482
3043	NC_018299	CGT	2	6	159763	159768	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995482
3044	NC_018299	GGA	2	6	159834	159839	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	399995482
3045	NC_018299	GAT	2	6	159858	159863	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	399995482
3046	NC_018299	CGC	2	6	159890	159895	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995482
3047	NC_018299	CG	3	6	159964	159969	0 %	0 %	50 %	50 %	399995482
3048	NC_018299	GACGAG	2	12	160002	160013	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	399995482
3049	NC_018299	GAA	2	6	160020	160025	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	399995482
3050	NC_018299	GCG	2	6	160030	160035	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995482
3051	NC_018299	TGC	2	6	160036	160041	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995482
3052	NC_018299	CGG	2	6	160060	160065	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995482
3053	NC_018299	TGC	2	6	160066	160071	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995482
3054	NC_018299	TCGG	2	8	160132	160139	0 %	25 %	50 %	25 %	399995482
3055	NC_018299	CTG	2	6	160140	160145	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995482
3056	NC_018299	CAG	2	6	160180	160185	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995482
3057	NC_018299	ATCGCG	2	12	160243	160254	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	399995482
3058	NC_018299	GCT	2	6	160262	160267	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995482
3059	NC_018299	GCTGGC	2	12	160325	160336	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	399995482
3060	NC_018299	GAT	2	6	160343	160348	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	399995482
3061	NC_018299	TCG	2	6	160377	160382	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995482
3062	NC_018299	GTG	2	6	160437	160442	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	399995482
3063	NC_018299	CGC	2	6	160462	160467	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995482
3064	NC_018299	GGC	2	6	160469	160474	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995482
3065	NC_018299	GCG	2	6	160475	160480	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995482
3066	NC_018299	AGG	2	6	160515	160520	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	399995482
3067	NC_018299	AAG	2	6	160702	160707	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	399995483
3068	NC_018299	TCC	2	6	160716	160721	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	399995483
3069	NC_018299	CGC	2	6	160774	160779	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995483
3070	NC_018299	CGG	2	6	160810	160815	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995483
3071	NC_018299	GAA	2	6	160850	160855	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	399995483
3072	NC_018299	CG	3	6	160868	160873	0 %	0 %	50 %	50 %	399995483
3073	NC_018299	TGTGGA	2	12	161008	161019	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	399995483
3074	NC_018299	CGA	2	6	161087	161092	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995483
3075	NC_018299	TGC	2	6	161094	161099	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995483
3076	NC_018299	CG	3	6	161114	161119	0 %	0 %	50 %	50 %	399995483
3077	NC_018299	GCTC	2	8	161245	161252	0 %	25 %	25 %	50 %	399995483
3078	NC_018299	GCC	2	6	161278	161283	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995483
3079	NC_018299	GCG	2	6	161287	161292	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995483
3080	NC_018299	GC	4	8	161368	161375	0 %	0 %	50 %	50 %	399995483
3081	NC_018299	CGG	2	6	161431	161436	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995484
3082	NC_018299	AGA	2	6	161505	161510	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	399995484
3083	NC_018299	GCCA	2	8	161573	161580	25 %	0 %	25 %	50 %	399995484
3084	NC_018299	TCG	2	6	161597	161602	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995484
3085	NC_018299	AGG	2	6	161626	161631	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	399995484
3086	NC_018299	GCC	2	6	161686	161691	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995484
3087	NC_018299	GC	3	6	161713	161718	0 %	0 %	50 %	50 %	399995484
3088	NC_018299	GCG	2	6	161726	161731	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995484
3089	NC_018299	TCG	2	6	161777	161782	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995484
3090	NC_018299	CCAG	2	8	161787	161794	25 %	0 %	25 %	50 %	399995484
3091	NC_018299	CGC	2	6	161842	161847	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995484
3092	NC_018299	CAT	2	6	161893	161898	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	399995484
3093	NC_018299	CCG	2	6	161922	161927	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995484
3094	NC_018299	GCC	3	9	161932	161940	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995484
3095	NC_018299	GCG	2	6	161974	161979	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995484
3096	NC_018299	GC	3	6	162035	162040	0 %	0 %	50 %	50 %	399995484
3097	NC_018299	CAG	2	6	162154	162159	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995484
3098	NC_018299	CGA	2	6	162186	162191	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995484
3099	NC_018299	TCG	2	6	162194	162199	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995484
3100	NC_018299	GCC	2	6	162215	162220	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995484
3101	NC_018299	TCA	2	6	162251	162256	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	399995484
3102	NC_018299	GA	3	6	162272	162277	50 %	0 %	50 %	0 %	399995484
3103	NC_018299	CGCGT	2	10	162312	162321	0 %	20 %	40 %	40 %	399995484
3104	NC_018299	GTG	2	6	162329	162334	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	399995484
3105	NC_018299	CTT	2	6	162370	162375	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	399995484
3106	NC_018299	GTCCTC	2	12	162391	162402	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	399995484
3107	NC_018299	CG	3	6	162466	162471	0 %	0 %	50 %	50 %	399995484
3108	NC_018299	CGA	2	6	162522	162527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995484
3109	NC_018299	CTC	2	6	162541	162546	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	399995484
3110	NC_018299	TTC	2	6	162556	162561	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	399995484
3111	NC_018299	CGC	2	6	162570	162575	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995484
3112	NC_018299	TCG	3	9	162584	162592	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995484
3113	NC_018299	CGG	3	9	162612	162620	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995484
3114	NC_018299	CTT	2	6	162642	162647	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	399995484
3115	NC_018299	CGT	2	6	162696	162701	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995484
3116	NC_018299	CGA	2	6	162747	162752	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995484
3117	NC_018299	ACATG	2	10	162840	162849	40 %	20 %	20 %	20 %	399995484
3118	NC_018299	TCGACG	2	12	162863	162874	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	399995484
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3120	NC_018299	TCT	2	6	162924	162929	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	399995484
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3232	NC_018299	CT	3	6	168728	168733	0 %	50 %	0 %	50 %	399995489
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3237	NC_018299	GCG	2	6	168875	168880	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995489
3238	NC_018299	ACG	2	6	168902	168907	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995489
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3359	NC_018299	CG	3	6	175228	175233	0 %	0 %	50 %	50 %	399995492
3360	NC_018299	GGC	2	6	175254	175259	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995492
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3362	NC_018299	AGC	2	6	175307	175312	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995492
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3364	NC_018299	TCG	2	6	175511	175516	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995492
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3483	NC_018299	CAG	2	6	183068	183073	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995498
3484	NC_018299	CGG	2	6	183122	183127	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995498
3485	NC_018299	AGC	2	6	183147	183152	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995498
3486	NC_018299	CAG	2	6	183278	183283	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995498
3487	NC_018299	AGTCGG	2	12	183304	183315	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	399995498
3488	NC_018299	TTG	2	6	183321	183326	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	399995498
3489	NC_018299	GC	4	8	183378	183385	0 %	0 %	50 %	50 %	399995498
3490	NC_018299	CAT	2	6	183388	183393	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	399995498
3491	NC_018299	CCTT	2	8	183417	183424	0 %	50 %	0 %	50 %	399995498
3492	NC_018299	CTT	2	6	183442	183447	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	399995498
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3494	NC_018299	TCGT	2	8	183495	183502	0 %	50 %	25 %	25 %	399995498
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3496	NC_018299	AGC	2	6	183642	183647	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995498
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