MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Sinorhizobium fredii HH103 plasmid pSfHH103d

Total Repeats: 4644

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_018299	AGA	2	6	131372	131377	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	399995451
2502	NC_018299	TGT	2	6	131463	131468	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	399995451
2503	NC_018299	GAC	2	6	131470	131475	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995451
2504	NC_018299	ACG	2	6	131489	131494	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995451
2505	NC_018299	TCG	2	6	131520	131525	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995451
2506	NC_018299	AC	3	6	131565	131570	50 %	0 %	0 %	50 %	399995451
2507	NC_018299	CGT	2	6	131637	131642	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995451
2508	NC_018299	CAA	2	6	131683	131688	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	399995451
2509	NC_018299	CATC	2	8	131706	131713	25 %	25 %	0 %	50 %	399995451
2510	NC_018299	TCC	2	6	131735	131740	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	399995451
2511	NC_018299	GGC	2	6	131746	131751	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995451
2512	NC_018299	CGTC	2	8	131767	131774	0 %	25 %	25 %	50 %	399995451
2513	NC_018299	GCCG	2	8	131775	131782	0 %	0 %	50 %	50 %	399995451
2514	NC_018299	CG	3	6	131814	131819	0 %	0 %	50 %	50 %	399995451
2515	NC_018299	GAT	2	6	131896	131901	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	399995451
2516	NC_018299	CGG	2	6	131919	131924	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995451
2517	NC_018299	AGC	2	6	131936	131941	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995451
2518	NC_018299	TCC	2	6	132116	132121	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	399995451
2519	NC_018299	ACG	2	6	132146	132151	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995451
2520	NC_018299	GCC	2	6	132191	132196	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995451
2521	NC_018299	CAT	3	9	132226	132234	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	399995451
2522	NC_018299	GAC	2	6	132247	132252	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995451
2523	NC_018299	GGA	2	6	132296	132301	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	399995451
2524	NC_018299	CCG	2	6	132365	132370	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995451
2525	NC_018299	CAG	2	6	132375	132380	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995451
2526	NC_018299	GTA	2	6	132448	132453	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	399995451
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2528	NC_018299	CGA	2	6	132537	132542	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995451
2529	NC_018299	AGC	2	6	132593	132598	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995451
2530	NC_018299	CGG	2	6	132676	132681	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995451
2531	NC_018299	GGC	2	6	132760	132765	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995451
2532	NC_018299	CCG	3	9	132767	132775	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995451
2533	NC_018299	GTC	2	6	132790	132795	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995451
2534	NC_018299	GAG	2	6	132851	132856	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	399995451
2535	NC_018299	GC	3	6	132890	132895	0 %	0 %	50 %	50 %	399995451
2536	NC_018299	GCG	2	6	132919	132924	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995451
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2538	NC_018299	CGA	2	6	132987	132992	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995451
2539	NC_018299	CGGC	2	8	133115	133122	0 %	0 %	50 %	50 %	399995451
2540	NC_018299	TCC	2	6	133157	133162	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	399995451
2541	NC_018299	AGC	2	6	133214	133219	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995451
2542	NC_018299	GTA	2	6	133339	133344	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	399995451
2543	NC_018299	CGATC	2	10	133375	133384	20 %	20 %	20 %	40 %	399995451
2544	NC_018299	CCG	2	6	133406	133411	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995451
2545	NC_018299	GCC	2	6	133449	133454	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995451
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2550	NC_018299	CGT	2	6	133621	133626	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995452
2551	NC_018299	TCG	2	6	133706	133711	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995452
2552	NC_018299	GCT	2	6	133761	133766	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995452
2553	NC_018299	C	6	6	133772	133777	0 %	0 %	0 %	100 %	399995452
2554	NC_018299	CAGG	2	8	133942	133949	25 %	0 %	50 %	25 %	399995452
2555	NC_018299	CG	4	8	133964	133971	0 %	0 %	50 %	50 %	399995452
2556	NC_018299	TG	3	6	134088	134093	0 %	50 %	50 %	0 %	399995453
2557	NC_018299	GCC	2	6	134101	134106	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995453
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2559	NC_018299	GCA	2	6	134127	134132	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995453
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2561	NC_018299	GAA	2	6	134199	134204	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	399995453
2562	NC_018299	CCG	2	6	134207	134212	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995453
2563	NC_018299	CAT	2	6	134349	134354	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	399995454
2564	NC_018299	CAT	2	6	134358	134363	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	399995454
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2571	NC_018299	CCT	2	6	134618	134623	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	399995454
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2577	NC_018299	CAT	2	6	134781	134786	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	399995454
2578	NC_018299	CAT	2	6	134793	134798	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	399995454
2579	NC_018299	CAT	2	6	134808	134813	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	399995454
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2582	NC_018299	CCG	2	6	134852	134857	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995454
2583	NC_018299	CTT	2	6	134867	134872	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	399995454
2584	NC_018299	AAGCAT	2	12	134934	134945	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	399995454
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2587	NC_018299	CAT	2	6	135155	135160	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	399995455
2588	NC_018299	GCTT	2	8	135170	135177	0 %	50 %	25 %	25 %	399995455
2589	NC_018299	CGA	2	6	135179	135184	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995455
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2591	NC_018299	GCGA	2	8	135211	135218	25 %	0 %	50 %	25 %	399995455
2592	NC_018299	ACC	2	6	135232	135237	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	399995455
2593	NC_018299	TCC	2	6	135307	135312	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	399995455
2594	NC_018299	CATGGA	2	12	135320	135331	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	399995455
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2596	NC_018299	GTCG	2	8	135411	135418	0 %	25 %	50 %	25 %	399995455
2597	NC_018299	GCTG	2	8	135461	135468	0 %	25 %	50 %	25 %	399995455
2598	NC_018299	CGA	2	6	135491	135496	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995455
2599	NC_018299	GAC	2	6	135501	135506	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995455
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2601	NC_018299	ACC	2	6	135592	135597	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	399995455
2602	NC_018299	TCCA	2	8	135679	135686	25 %	25 %	0 %	50 %	399995455
2603	NC_018299	CGA	2	6	135710	135715	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995455
2604	NC_018299	CTC	2	6	135736	135741	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	399995455
2605	NC_018299	ACC	2	6	135754	135759	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	399995455
2606	NC_018299	GA	3	6	135760	135765	50 %	0 %	50 %	0 %	399995455
2607	NC_018299	CGG	2	6	135780	135785	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995455
2608	NC_018299	AGAT	2	8	135787	135794	50 %	25 %	25 %	0 %	399995455
2609	NC_018299	GAT	2	6	135798	135803	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	399995455
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2611	NC_018299	GCC	2	6	135872	135877	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995455
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2615	NC_018299	CAG	2	6	136032	136037	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995455
2616	NC_018299	CCAG	2	8	136046	136053	25 %	0 %	25 %	50 %	399995455
2617	NC_018299	GACG	2	8	136161	136168	25 %	0 %	50 %	25 %	399995455
2618	NC_018299	TCG	2	6	136189	136194	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995455
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2983	NC_018299	GCG	2	6	155469	155474	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995478
2984	NC_018299	CGA	2	6	155510	155515	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995478
2985	NC_018299	AGGAC	2	10	155816	155825	40 %	0 %	40 %	20 %	399995478
2986	NC_018299	CAC	2	6	155861	155866	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	399995478
2987	NC_018299	GCA	2	6	155901	155906	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995478
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2990	NC_018299	ACGTC	2	10	156086	156095	20 %	20 %	20 %	40 %	399995478
2991	NC_018299	GTC	2	6	156130	156135	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995478
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2993	NC_018299	TCCA	2	8	156223	156230	25 %	25 %	0 %	50 %	399995478
2994	NC_018299	CGG	2	6	156272	156277	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995478
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2999	NC_018299	GTC	3	9	156409	156417	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995478
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